stringtranslate.com

Электронный ящик

E -box (enhancer box) — это элемент ответа ДНК , обнаруженный у некоторых эукариот , который действует как сайт связывания белка и, как было обнаружено, регулирует экспрессию генов в нейронах , мышцах и других тканях. [1] Его специфическая последовательность ДНК, CANNTG (где N может быть любым нуклеотидом ), с палиндромной канонической последовательностью CACGTG [2] распознается и связывается факторами транскрипции для инициирования транскрипции гена . Как только факторы транскрипции связываются с промоторами через E-box, другие ферменты могут связываться с промотором и облегчать транскрипцию с ДНК на мРНК .

Открытие

E-box был открыт в сотрудничестве между лабораториями Сусуму Тонегавы и Уолтера Гилберта в 1985 году как элемент управления в усилителе тяжелой цепи иммуноглобулина . [3] [4] Они обнаружили, что область из 140 пар оснований в тканеспецифичном элементе транскрипционного усилителя была достаточна для различных уровней усиления транскрипции в различных тканях и последовательностях. Они предположили, что белки, вырабатываемые определенными тканями, воздействовали на эти усилители, активируя наборы генов во время клеточной дифференциации.

В 1989 году лаборатория Дэвида Балтимора открыла первые два белка, связывающих E-box , E12 и E47. [5] Эти усилители иммуноглобулина могли связываться как гетеродимеры с белками через домены bHLH . В 1990 году был открыт еще один белок E, ITF-2A (позже переименованный в E2-2Alt), который может связываться с усилителями легкой цепи иммуноглобулина . [6] Два года спустя был открыт третий белок, связывающий E-box, HEB, путем скрининга библиотеки кДНК из клеток HeLa . [7] В 1997 году был обнаружен сплайс-вариант E2-2, который, как было обнаружено, ингибирует промотор специфичного для мышц гена. [8]

С тех пор исследователи установили, что E-box влияет на транскрипцию генов у нескольких эукариот, и обнаружили факторы связывания E-box, которые идентифицируют консенсусные последовательности E-box . [9] В частности, несколько экспериментов показали, что E-box является неотъемлемой частью цикла обратной связи транскрипции-трансляции, который включает циркадные часы .

Связывание

Белки, связывающие E-box, играют важную роль в регуляции транскрипционной активности. Эти белки обычно содержат основной структурный мотив белка спираль-петля-спираль , который позволяет им связываться как димеры . [10] Этот мотив состоит из двух амфипатических α-спиралей , разделенных небольшой последовательностью аминокислот , которые образуют один или несколько β-поворотов. Гидрофобные взаимодействия между этими α-спиралями стабилизируют димеризацию. Кроме того, каждый мономер bHLH имеет основную область, которая помогает опосредовать распознавание между мономером bHLH и E-box (основная область взаимодействует с большой бороздкой ДНК ) . В зависимости от мотива ДНК («CAGCTG» против «CACGTG») белок bHLH имеет различный набор основных остатков.

Относительное положение CTRR и E-Box

Связывание E-box модулируется Zn 2+ у мышей. CT-богатые регионы (CTRR), расположенные примерно на 23 нуклеотида выше E-box, важны для связывания E-box, трансактивации (увеличение скорости генетической экспрессии) и транскрипции циркадных генов комплексов BMAL1 / NPAS2 и BMAL1 / CLOCK . [11]

Специфичность связывания различных E-boxes оказывается существенной в их функции. E-boxes с различными функциями имеют разное количество и тип фактора связывания. [12]

Консенсусная последовательность E-box обычно CANTG; однако существуют и другие E-box'ы с похожими последовательностями, называемые неканоническими E-box'ами. Они включают в себя, но не ограничиваются:

Роль в циркадных часах

Связь между генами, регулируемыми E-box, и циркадными часами была обнаружена в 1997 году, когда Хао, Аллен и Хардин (Биологический факультет Техасского университета A&M ) проанализировали ритмичность в гене периода ( per ) у Drosophila melanogaster . [16] Они обнаружили циркадный транскрипционный энхансер выше гена per в 69-пн фрагменте ДНК. В зависимости от уровней белка PER энхансер обеспечивал высокие уровни транскрипции мРНК как в условиях LD (свет-темнота), так и в условиях DD (постоянная темнота). Было обнаружено, что энхансер необходим для экспрессии генов высокого уровня , но не для циркадной ритмичности. Он также работает независимо как мишень комплекса BMAL1/CLOCK.

E-box играет важную роль в циркадных генах; на данный момент идентифицировано девять циркадных генов, контролируемых E/E'BOX: PER1 , PER2, BHLHB2 , BHLHB3 , CRY1 , DBP , Nr1d1 , Nr1d2 и RORC. [17] Поскольку E-box связан с несколькими циркадными генами, возможно, что гены и белки, связанные с ним, являются «важнейшими и уязвимыми точками в (циркадной) системе». [18]

E-box является одним из пяти основных семейств факторов транскрипции, связанных с циркадной фазой, и обнаруживается в большинстве тканей. [19] Всего 320 генов, контролируемых E-box, обнаружены в SCN ( супрахиазматическом ядре ), печени , аорте , надпочечниках , WAT ( белой жировой ткани ), мозге , предсердиях , желудочках , префронтальной коре , скелетных мышцах , BAT ( бурой жировой ткани ) и костях свода черепа.

E-box, подобные CLOCK-связанным элементам (EL-box; GGCACGAGGC), также важны для поддержания циркадной ритмичности в генах, контролируемых часами. Подобно E-box, E-box, подобные CLOCK-связанные элементы, также могут индуцировать транскрипцию BMAL1/CLOCK, что затем может привести к экспрессии в других генах, содержащих EL-box (Ank, DBP, Nr1d1). [20] Однако существуют различия между EL-box и обычным E-box. Подавление DEC1 и DEC2 оказывает более сильное воздействие на E-box, чем на EL-box. Кроме того, HES1, который может связываться с другой консенсусной последовательностью (CACNAG, известный как N-box), показывает эффект подавления в EL-box, но не в E-box.

Как неканонические E-box, так и последовательности, подобные E-box, имеют решающее значение для циркадных колебаний. Недавние исследования в этой области формируют гипотезу о том, что либо канонический, либо неканонический E-box, за которым следует последовательность, подобная E-box, с интервалом в 6 пар оснований между ними, является необходимой комбинацией для циркадной транскрипции. [21] Анализ in silico также предполагает, что такой интервал существовал в других известных генах, контролируемых часами.


Роль белков, связывающихся с E-боксами

Существует несколько белков, которые связываются с E-box и влияют на транскрипцию генов.

Комплекс CLOCK-ARNTL

Комплекс CLOCK- ARNTL (BMAL1) является неотъемлемой частью циркадного цикла млекопитающих и имеет жизненно важное значение для поддержания циркадной ритмичности.

Зная, что связывание активирует транскрипцию гена per в промоторной области, исследователи обнаружили в 2002 году, что DEC1 и DEC2 (транскрипционные факторы bHLH) подавляют комплекс CLOCK-BMAL1 посредством прямого взаимодействия с BMAL1 и/или конкуренции за элементы E-box. Они пришли к выводу, что DEC1 и DEC2 являются регуляторами молекулярных часов млекопитающих. [22]

В 2006 году Риппергер и Шиблер обнаружили, что связывание этого комплекса с E-box запускает циркадную транскрипцию DBP и переходы хроматина (изменение от хроматина к факультативному гетерохроматину ). [23] Был сделан вывод, что CLOCK регулирует экспрессию DBP путем связывания с мотивами E-box в энхансерных областях, расположенных в первом и втором интронах .

MYC (c-Myc,онкоген)

Ген MYC ( c-Myc ), кодирующий фактор транскрипции Myc , играет важную роль в регуляции пролиферации и апоптоза клеток млекопитающих .

В 1991 году исследователи проверили, может ли c-Myc связываться с ДНК, димеризуя ее с E12. Димеры E6, химерного белка, были способны связываться с элементом E-box (GGCCACGTGACC), который распознавался другими белками HLH. [24] Экспрессия E6 подавляла функцию c-Myc, что показало связь между ними.

В 1996 году было обнаружено, что Myc гетеродимеризуется с MAX и что этот гетеродимерный комплекс может связываться с последовательностью E-box CAC(G/A)TG и активировать транскрипцию. [25]

В 1998 году был сделан вывод, что функция c-Myc зависит от активации транскрипции определенных генов через элементы E-box. [26]

МЙОД1(МиоД)

MyoD происходит из семейства Mrf bHLH , и его основная роль — миогенез , формирование мышечной ткани. [9] Другие члены этого семейства включают миогенин , Myf5 , Myf6 , Mist1 и Nex-1.

Когда MyoD связывается с мотивом E-box CANNTG, инициируется мышечная дифференцировка и экспрессия мышечно-специфичных белков. [27] Исследователи удалили различные части рекомбинантной последовательности MyoD и пришли к выводу, что MyoD использует охватывающие элементы для связывания E-box и тетраплексной структуры промоторной последовательности мышечно-специфичного гена интегрина α7 и саркомерного sMtCK .

MyoD регулирует HB-EGF ( гепарин-связывающий EGF-подобный фактор роста ), член семейства EGF ( эпидермальный фактор роста ), который стимулирует рост и пролиферацию клеток. [9] Он играет роль в развитии гепатоцеллюлярной карциномы , рака простаты , рака молочной железы , рака пищевода и рака желудка .

MyoD также может связываться с неканоническими E-боксами MyoG и регулировать его экспрессию. [28]

MyoG (миогенин)

MyoG принадлежит к семейству факторов транскрипции MyoD. Связывание MyoG-E-Box необходимо для формирования нервно-мышечных синапсов, поскольку был идентифицирован сигнальный путь HDAC-Dach2- миогенина в экспрессии генов скелетных мышц. [29] Снижение экспрессии MyoG было показано у пациентов с симптомом мышечной атрофии. [30]

Было также показано, что MyoG и MyoD участвуют в дифференцировке миобластов . [31] Они действуют путем трансактивации активности промотора катепсина B и индукции его экспрессии мРНК.

TCF3 (E47)

E47 продуцируется альтернативным сплайсингом E2A в специфических для E47 bHLH-кодирующих экзонах . Его роль заключается в регуляции экспрессии и дифференциации специфичных для тканей генов. Многие киназы связаны с E47, включая 3pk и MK2. Эти 2 белка образуют комплекс с E47 и снижают его транскрипционную активность. [32] Также показано, что CKII и PKA фосфорилируют E47 in vitro. [33] [34] [35]

Подобно другим белкам, связывающим E-box, E47 также связывается с последовательностью CANNTG в E-box. У гомозиготных мышей с нокаутом E2A развитие B-клеток останавливается до стадии расположения DJ, и B-клетки не созревают. [36] Было показано, что E47 связывается либо как гетеродимер (с E12) [37] , либо как гомодимер (но слабее). [38]

Недавние исследования

Хотя структурная основа того, как BMAL1/CLOCK взаимодействует с E-box, неизвестна, недавние исследования показали, что домены белка bHLH BMAL1/CLOCK очень похожи на другие белки, содержащие bHLH, например, Myc/Max, которые были кристаллизованы с E-box. [39] Предполагается, что для поддержки этого высокоаффинного связывания необходимы определенные основания . Кроме того, ограничения последовательности в области вокруг циркадного E-box не полностью поняты: считается, что необходимо, но недостаточно, чтобы E-box были случайным образом расположены друг от друга в генетической последовательности для того, чтобы происходила циркадная транскрипция. Недавние исследования, связанные с E-box, были направлены на попытку найти больше связывающих белков, а также обнаружить больше механизмов для ингибирования связывания.

Исследователи из Медицинской школы Нанкинского университета обнаружили, что амплитуда FBXL3 (белок F-box/Leucine Rich-Repeat) выражается через E-box. [40] Они изучали мышей с дефицитом FBXL3 и обнаружили, что он регулирует петли обратной связи в циркадных ритмах, влияя на продолжительность циркадного периода.

Исследование, опубликованное 4 апреля 2013 года исследователями Гарвардской медицинской школы, показало, что нуклеотиды по обе стороны от E-box влияют на то, какие факторы транскрипции могут связываться с самим E-box. [41] Эти нуклеотиды определяют трехмерное пространственное расположение цепи ДНК и ограничивают размер связывающих факторов транскрипции . Исследование также обнаружило различия в схемах связывания между цепями in vivo и in vitro .

Ссылки

  1. ^ Massari, ME; Murre, C. (2000). «Белки спираль-петля-спираль: регуляторы транскрипции в эукариотических организмах». Молекулярная и клеточная биология . 20 (2): 429–440. CiteSeerX  10.1.1.321.6077 . doi :10.1128 / mcb.20.2.429-440.2000. PMC  85097. PMID  10611221.
  2. ^ Чаудхари, Дж.; Скиннер, М. К. (май 1999 г.). «Базовые белки спираль-петля-спираль могут действовать в E-box внутри элемента ответа сыворотки промотора c-fos, влияя на гормон-индуцированную активацию промотора в клетках Сертоли». Mol Endocrinol . 13 (5): 774–786. doi : 10.1210/mend.13.5.0271 . PMID  10319327.
  3. ^ Эфрусси, А.; Чёрч, Г. М.; Тонегава, С.; Гилберт, В. (1985). «Взаимодействия усилителя иммуноглобулина, специфичные для линии B, с клеточными факторами in vivo». Science . 227 (4683): ​​134–140. Bibcode :1985Sci...227..134E. doi :10.1126/science.3917574. PMID  3917574.
  4. ^ Чёрч, GM; Эфрусси, A; Гилберт, W; Тонегава, S (1985). «Контакты с усилителями иммуноглобулинов в ядрах, специфичные для определенного типа клеток». Nature . 313 (6005): 798–801. Bibcode :1985Natur.313..798C. doi :10.1038/313798a0. PMID  3919308. S2CID  1878459.
  5. ^ Murre, C; Mc Caw, PS; Vaessin, H; et al. (август 1989). «Взаимодействия между гетерологичными белками спираль-петля-спираль генерируют комплексы, которые специфически связываются с общей последовательностью ДНК». Cell . 58 (3): 537–544. doi :10.1016/0092-8674(89)90434-0. PMID  2503252. S2CID  29339773.
  6. ^ Хенторн, П.; Киледжян, М.; Кадеш, Т. (1990). «Два различных фактора транскрипции, которые связывают усилитель иммуноглобулина microE5/kappa 2 мотив». Science . 247 (4941): 467–470. Bibcode :1990Sci...247..467H. doi :10.1126/science.2105528. PMID  2105528.
  7. ^ Hu SJ, Olson EN; Kingston, R E. (1992). "HEB". Mol Cell Biol . 12 (3): 1031–1042. doi :10.1128/MCB.12.3.1031. PMC 369535. PMID  1312219 . 
  8. ^ Чен, Б.; Лим, Р. В. (январь 1997 г.). «Физические и функциональные взаимодействия между ингибиторами транскрипции Id3 и ITF-2b. Доказательства нового механизма, регулирующего экспрессию мышечно-специфических генов». J Biol Chem . 272 ​​(4): 2459–2463. doi : 10.1074/jbc.272.4.2459 . PMID  8999959.
  9. ^ abc Mädge B.: E-Box. В: Schwab M. (ред.) Encyclopedia of Cancer. Springer-Verlag Berlin Heidelberg, 2009.
  10. ^ Элленбергер, Т.; Фасс, Д.; Арно, М.; Харрисон, С. К. (апрель 1994 г.). «Кристаллическая структура фактора транскрипции E47: распознавание E-box димером спираль-петля-спираль базовой области». Genes Dev . 8 (8): 970–980. doi : 10.1101/gad.8.8.970 . PMID  7926781.
  11. ^ Муньос, Эстела; Мишель Брюэр; Рубен Балер (2006). «Модуляция активности комплекса BMAL/CLOCK/E-Box богатым CT цис-действующим элементом». Молекулярная и клеточная эндокринология . 252 (1–2): 74–81. doi :10.1016/j.mce.2006.03.007. PMID  16650525. S2CID  38180029.
  12. ^ Бозе, Судип; Букфор, Фредрик Р. (2010). «Эпизоды экспрессии гена пролактина в клетках GH3 зависят от селективного связывания промотора с несколькими циркадными элементами». Эндокринология . 151 (5): 2287–2296. doi :10.1210/en.2009-1252. PMC 2869263. PMID 20215567  . 
  13. ^ Yoo, SH; Ko, CH; Lowrey, PL; et al. (2005). «Неканонический усилитель E-box управляет циркадными колебаниями Period2 у мышей in vivo». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 102 (7): 2608–2613. Bibcode :2005PNAS..102.2608Y. doi : 10.1073/pnas.0409763102 . PMC 548324 . PMID  15699353. 
  14. ^ Чжан, X.; Патель, SP; Маккарти, JJ; Рабчевский, AG; Голдхамер, DJ; Эссер, KA (2012). «Неканонический E-box в энхансере ядра MyoD необходим для циркадной экспрессии в скелетных мышцах». Nucleic Acids Res . 40 (8): 3419–3430. doi :10.1093/nar/gkr1297. PMC 3333858. PMID  22210883 . 
  15. ^ Салеро, Энрике; Хименес, Сесилио; Зафра, Франциско (15 марта 2003 г.). «Идентификация неканонического мотива E-box как регуляторного элемента в проксимальной области промотора гена аполипопротеина E». Биохимический журнал . 370 (3): 979–986. doi :10.1042/BJ20021142. PMC 1223214. PMID  12444925 . 
  16. ^ Хао, Х; Аллен, ДЛ; Хардин, П. Э. (июль 1997 г.). «Циркадный энхансер опосредует PER-зависимую мРНК-циклизацию у Drosophila melanogaster». Mol Cell Biol . 17 (7): 3687–3693. doi :10.1128/MCB.17.7.3687. PMC 232220. PMID  9199302 . 
  17. ^ Panda, S; Antoch MP; Miller BH; Su AI; Schook AB; Straume M; Schultz PG; Kay SA; Takahashi JS; Hogenesch JB (май 2002 г.). «Координированная транскрипция ключевых путей у мышей с помощью циркадных часов». Cell . 109 (3): 307–320. doi : 10.1016/S0092-8674(02)00722-5 . PMID  12015981.
  18. ^ Херцог, Эрик (октябрь 2007 г.). «Нейроны и сети в суточных ритмах». Nature Reviews Neuroscience . 8 (10): 790–802. doi :10.1038/nrn2215. PMID  17882255. S2CID  33687097.
  19. ^ Янь, Цзюнь; Хайфан Ван; Юйтин Лю; Чуньсюань Шао (октябрь 2008 г.). «Анализ сетей регуляции генов в циркадном ритме млекопитающих». PLOS Computational Biology . 4 (10): e1000193. Bibcode : 2008PLSCB...4E0193Y. doi : 10.1371/journal.pcbi.1000193 . PMC 2543109. PMID  18846204 . 
  20. ^ Уешима, Т; Кавамото Т; Хонда КК; Ноширо М; Фудзимото К; Накао С; Ичиносе Н; Хашимото С; Гото О; Като И (декабрь 2012 г.). «Идентификация нового элемента EL-box, связанного с часами, участвующего в циркадной регуляции с помощью BMAL1/CLOCK и HES1». Gene . 510 (2): 118–125. doi :10.1016/j.gene.2012.08.022. PMID  22960268.
  21. ^ Накахата, Y; Ёсида М; Такано А; Сома Х; Ямамото Т; Ясуда А; Накацу Т; Такуми Т (январь 2008 г.). «Прямой повтор элементов, подобных E-box, необходим для автономного в клетках циркадного ритма генов часов». BMC Mol Biol . 9 (1): 1. doi : 10.1186/1471-2199-9-1 . PMC 2254435. PMID  18177499 . 
  22. ^ Хонма, С; Кавамото, Т; Такаги, Y; Фудзимото, К; Сато, Ф; Ноширо, М; Като, Y; Хонма, К. (2002). «Dec1 и Dec2 являются регуляторами молекулярных часов млекопитающих». Nature . 419 (6909): 841–844. Bibcode :2002Natur.419..841H. doi :10.1038/nature01123. PMID  12397359. S2CID  4426418.
  23. ^ Риппергер, Дж. А.; Шиблер, У. (март 2006 г.). «Ритмическое связывание CLOCK-BMAL1 с несколькими мотивами E-box управляет циркадной транскрипцией Dbp и переходами хроматина» (PDF) . Nat. Genet . 38 (3): 369–374. doi :10.1038/ng1738. PMID  16474407. S2CID  13433446.
  24. ^ Прендергаст, GC; Зифф, E B. (январь 1991 г.). «Связывание ДНК, чувствительное к метилированию и специфичное к последовательности, с помощью основной области c-Myc». Science . 251 (4990): 186–189. Bibcode :1991Sci...251..186P. doi :10.1126/science.1987636. PMID  1987636.
  25. ^ Desbarats, L; Gaubatz, S; Eilers, M. (февраль 1996 г.). «Дискриминация между различными белками, связывающими E-box, в эндогенном целевом гене c-myc». Genes Dev . 10 (4): 447–460. doi : 10.1101/gad.10.4.447 . PMID  8600028.
  26. ^ Xiao, Q; Claassen, G; Shi, J; Adachi, S; Seivy, J; Hann, S R. (декабрь 1998 г.). «Трансактивационно-дефектный c-MycS сохраняет способность регулировать пролиферацию и апоптоз». Genes Dev . 12 (24): 3803–3808. doi :10.1101/gad.12.24.3803. PMC 317265. PMID  9869633 . 
  27. ^ Шкловер, Дж.; Этциони, С.; Вайсман-Шомер, П.; Яфе, А.; Бенгал, Э.; Фрай, М. (2007). «MyoD использует перекрывающиеся, но различные элементы для связывания E-box и тетраплексных структур регуляторных последовательностей мышечно-специфических генов». Nucleic Acids Res . 35 (21): 7087–7095. doi :10.1093/nar/gkm746. PMC 2175354. PMID  17942416 . 
  28. ^ Бергстром, ДА; Пенн, БХ; Стрэнд, А.; Перри, РЛ; Рудницки, МА; Тапскотт, СДЖ (2002). «Специфическая для промотора регуляция связывания MyoD и сигнальная трансдукция совместно формируют экспрессию генов». Mol. Cell . 9 (3): 587–600. doi : 10.1016/s1097-2765(02)00481-1 . PMID  11931766.
  29. ^ Тан, Х.; Голдман, Д. (2006). «Зависящая от активности регуляция генов в скелетных мышцах опосредуется каскадом передачи сигнала гистондеацетилаза (HDAC)-Dach2-миогенин». Proc Natl Acad Sci USA . 103 (45): 16977–16982. Bibcode : 2006PNAS..10316977T. doi : 10.1073/pnas.0601565103 . PMC 1636564. PMID  17075071 . 
  30. ^ Рамамурти, С.; Донохью, М.; Бак, М. (2009). «Снижение экспрессии Jun-D и миогенина при мышечной атрофии при кахексии у человека». Am J Physiol Endocrinol Metab . 297 (2): E392–401. doi :10.1152/ajpendo.90529.2008. PMC 2724118. PMID  19470832 . 
  31. ^ Jane, DT; Morvay, LC; Koblinski, J.; et al. (2002). «Доказательства того, что элементы промотора E-box и факторы транскрипции MyoD играют роль в индукции экспрессии гена катепсина B во время дифференциации миобластов человека». Biol. Chem . 383 (12): 1833–1844. doi :10.1515/BC.2002.207. PMID  12553720. S2CID  26010667.
  32. ^ Нойфельд, Бернд; Гросс-Вильде, Энн; Хоффмейер, Ангелика; Джордан, Брюс WM; Чен, Пейфенг; Динев, Драгомир; Людвиг, Стефан; Рапп, Ульф Р. (7 июля 2000 г.). «Серин/треониновые киназы 3pK и активируемая MAPK протеинкиназа 2 взаимодействуют с основным фактором транскрипции спираль-петля-спираль E47 и подавляют его транскрипционную активность». Журнал биологической химии . 275 (27): 20239–20242. doi : 10.1074/jbc.C901040199 . PMID  10781029.
  33. ^ Джонсон, Салли Э.; Ван, Сюэян; Харди, Серж; Тапаровски, Элизабет Дж.; Конечны, Стивен Ф. (апрель 1996 г.). «Казеинкиназа II увеличивает транскрипционную активность MRF4 и MyoD независимо от их прямого фосфорилирования». Молекулярная и клеточная биология . 16 (4): 1604–1613. doi :10.1128/MCB.16.4.1604. PMC 231146. PMID  8657135 . 
  34. ^ Слоан, Стивен Р.; Шен, Чун-Пин; Маккэррик-Уолмсли, Рут; Кадеш, Том (декабрь 1996 г.). «Фосфорилирование E47 как потенциальный детерминант специфической для В-клеток активности». Молекулярная и клеточная биология . 16 (12): 6900–6908. doi :10.1128/MCB.16.12.6900. PMC 231693. PMID  8943345 . 
  35. ^ Шен, Чун-Пин; Кадеш, Том (август 1995 г.). «Специфическое для В-клеток связывание ДНК гомодимером E47». Молекулярная и клеточная биология . 15 (8): 4518–4524. doi : 10.1128/MCB.15.8.4518. PMC 230691. PMID  7623842. 
  36. ^ Бэйн, Гретхен; Маандаг, Элс К.; Изон, Дэвид Дж.; Амсен, Дерк; Круисбек, Ада М.; Вайнтрауб, Беннетт К.; Кроп, Ян; Шлиссель, Марк С.; Фини, Энн Дж.; ван Роон, Мэриан; ван дер Валк, Мартин; те Риле, Хейн П.Дж.; Бернс, Антон; Мурре, Корнелиус (2 декабря 1994 г.). «Белки E2A необходимы для правильного развития B-клеток и инициации перестройки генов иммуноглобулинов». Клетка . 79 (5): 885–92. дои : 10.1016/0092-8674(94)90077-9. PMID  8001125. S2CID  34325904.
  37. ^ Лассар, Эндрю Б.; Дэвис, Роберт Л.; Райт, Вудринг Э.; Кадеш, Том; Мурре, Корнелиус; Воронова, Анна; Балтимор, Дэвид; Вайнтрауб, Гарольд (26 июля 1991 г.). «Функциональная активность миогенных белков HLH требует гетероолигомеризации с белками, подобными E12/E47, in vivo». Cell . 66 (2): 305–15. doi :10.1016/0092-8674(91)90620-E. PMID  1649701. S2CID  25957022.
  38. ^ Murre, Cornelius; McCaw, Patrick Schonleber; Vaessin, H.; Caudy, M.; Jan, LY; Jan, YN; Cabrera, Carlos V.; Buskin, Jean N.; Hauschka, Stephen D.; Lassar, Andrew B.; Weintraub, Harold; Baltimore, David (11 августа 1989 г.). «Взаимодействия между гетерологичными белками спираль-петля-спираль генерируют комплексы, которые специфически связываются с общей последовательностью ДНК». Cell . 58 (3): 537–44. doi :10.1016/0092-8674(89)90434-0. PMID  2503252. S2CID  29339773.
  39. ^ Муньос, Э.; Брюэр, М.; Балер, Р. (сентябрь 2002 г.). «Циркадная транскрипция: МЫШЛЕНИЕ ВНЕ E-BOX». J Biol Chem . 277 (39): 36009–36017. doi : 10.1074/jbc.m203909200 . PMID  12130638.
  40. ^ Ши, Г; Син, Л; Лю, З; и др. (2013). «Двойные роли FBXL3 в петлях циркадной обратной связи млекопитающих важны для определения периода и надежности часов». Proc Natl Acad Sci USA . 110 (12): 4750–5. Bibcode :2013PNAS..110.4750S. doi : 10.1073/pnas.1302560110 . PMC 3606995 . PMID  23471982. 
  41. ^ Gordân, R; Shen, N; Dror, I; Zhou, T; Horton, J; Rohs, R; Bulyk, ML. (Апр. 2013). «Геномные регионы, фланкирующие сайты связывания E-Box, влияют на специфичность связывания ДНК факторов транскрипции bHLH через форму ДНК». Cell Rep . 3 (4): 1093–104. doi :10.1016/j.celrep.2013.03.014. PMC 3640701. PMID  23562153 . 

Внешние ссылки