stringtranslate.com

Гаплогруппа E-V38

Гаплогруппа E-V38 , также известная как E1b1a-V38 , является основной гаплогруппой ДНК Y-хромосомы человека . E-V38 в основном распространяется в Африке . E-V38 имеет две базальные ветви: E-M329 и E-M2 . [2] [a] [b] E-M329 — субклад, который в основном встречается в Восточной Африке . [2] E-M2 — преобладающий субклад в Западной Африке , Центральной Африке , Южной Африке и районе Великих африканских озер ; он также встречается с умеренной частотой в Северной Африке , Западной Азии и Южной Европе .

Происхождение

Открытие двух SNP (V38 и V100) Тромбеттой и др. (2011) существенно переопределили филогенетическое древо E-V38. Это заставило авторов предположить, что E-V38 мог возникнуть в Восточной Африке. V38 присоединяется к E-M2, связанному с Западной Африкой, и E-M329, связанному с Северо-Восточной Африкой, с более ранним общим предком, который, как и E-P2, возможно, также произошел из Восточной Африки . [2] SNP E-M180, расположенный ниже по течению, возможно, возник во влажной саванне / лугах южной и центральной Сахары в Северной Африке между 14 000 и 10 000 лет назад. [4] [5] [6] [7] По данным Wood et al. (2005) и Роза и др. (2007), такие перемещения населения изменили ранее существовавшее хромосомное разнообразие Y популяции в Центральной , Южной и Юго-Восточной Африке , заменив предыдущие частоты гаплогрупп (гаплогруппы A и B-M60 ) в этих областях на ныне доминирующие линии E1b1a1 . Однако сегодня в этих регионах можно наблюдать следы более ранних жителей по наличию гаплогрупп Y-ДНК A1a , A1b, A2, A3 и B-M60 , которые распространены в определенных популяциях, таких как мбути и койсан . [8] [9] [10] Шрайнер и др. (2018) также предполагает, что гаплогруппа E1b1a-V38 мигрировала через Зеленую Сахару с востока на запад около 19 000 лет назад, откуда E1b1a1-M2 могла впоследствии возникнуть в Западной или Центральной Африке . Шрайнер и др. (2018) также прослеживает эту миграцию посредством серповидноклеточной мутации , которая, вероятно, возникла в период Зеленой Сахары. [3]

Древняя ДНК

Гад и др. (2021) указывает на то, что древнеегипетские мумии Рамсеса III и Неизвестного человека E, возможно, Пентавера , несли гаплогруппу E1b1a. [11]

В Кабесу-да-Аморейра, в Португалии , порабощенный западноафриканец , который, возможно, был родом из сенегамбийского прибрежного региона Гамбии , Мавритании или Сенегала и носил гаплогруппы E1b1a и L3b1a , был похоронен среди обломков ракушек между 16 веком н. э. 18 век нашей эры. [12]

Распределение

Частота и разнообразие E-V38 являются самыми высокими в Западной Африке. В Африке E-V38 демонстрирует клинальное распространение с запада на восток, а также с юга на север. Другими словами, частота гаплогруппы уменьшается по мере продвижения от западной и южной Африки к восточной и северной частям Африки. [13]

Субклады

Э-М2

E1b1a1 определяется маркерами DYS271/M2/SY81, M291, P1/PN1, P189, P293, V43 и V95. E-M2 — разнообразная гаплогруппа со множеством ответвлений.

Э-М329

E1b1a2 определяется мутацией SNP M329. [c] E-M329 в основном встречается в Восточной Африке . [2] E-M329 также часто встречается в Юго-Западной Эфиопии , особенно среди населения, говорящего на языке омот . [14] [15]

Филогенетика

Филогенетическая история

До 2002 года в научной литературе существовало как минимум семь систем наименования филогенетического дерева Y-хромосомы. Это привело к значительной путанице. В 2002 году основные исследовательские группы объединились и сформировали Консорциум Y-хромосомы (YCC). Они опубликовали совместный документ, в котором было создано единое новое дерево, которое все согласились использовать. Позже группа гражданских ученых, интересующихся популяционной генетикой и генетической генеалогией, сформировала рабочую группу для создания любительского дерева, стремясь, прежде всего, быть своевременным. В таблице ниже собраны все эти работы, относящиеся к знаковому дереву YCC 2002 года. Это позволяет исследователю, просматривающему старую опубликованную литературу, быстро перемещаться между номенклатурами.

Научные публикации

Следующие исследовательские группы в соответствии с их публикациями были представлены при создании дерева YCC.

Филогенетические деревья

Это филогенетическое древо субкладов гаплогрупп основано на дереве Y-Chromosome Consortium (YCC) 2008, [16] дереве гаплогруппы E ISOGG Y-ДНК, [5] и последующих опубликованных исследованиях.

Смотрите также

В Wikiquote есть цитаты, связанные с гаплогруппой E-V38 .

Генетика

Субклады Y-ДНК E

Основополагающее дерево Y-ДНК

Примечания

  1. ^ E-M329 ранее был известен как E1b1c и E1b1 *.
  2. ^ E-M2 ранее был известен как E3a и E1b1a.
  3. ^ E-M329 ранее был известен как E1b1c.

Рекомендации

  1. ^ ab "E-V38 YTree".
  2. ^ abcde Тромбетта, Бениамино; Фульвио Кручиани; Даниэле Селитто; Розария Скоццари (6 января 2011 г.). Маколей, Винсент (ред.). «Новая топология гаплогруппы E1b1 (E-P2) Y-хромосомы человека, выявленная с помощью недавно охарактеризованных бинарных полиморфизмов». ПЛОС ОДИН . 6 (1): e16073. Бибкод : 2011PLoSO...616073T. дои : 10.1371/journal.pone.0016073 . ПМК 3017091 . ПМИД  21253605. 
  3. ^ аб Шрайнер, Дэниел; Ротими, Чарльз (2018). «Гаплотипы, основанные на полногеномных последовательностях, раскрывают единое происхождение аллели серпа во время влажной фазы голоцена». Американский журнал генетики человека . 102 (4). Ам Дж Хум Женет: 547–556. дои : 10.1016/j.ajhg.2018.02.003. ПМЦ 5985360 . ПМИД  29526279. 
  4. ^ "E-V43 YTree" .
  5. ^ ab Международное общество генетической генеалогии (3 февраля 2010 г.). «Гаплогруппа E Y-ДНК и ее субклады - 2010» . Проверено 17 декабря 2010 г.
  6. ^ Адамс, Джонатан. «Африка за последние 150 000 лет». Архивировано из оригинала 1 мая 2006 года . Проверено 26 января 2011 г.
  7. ^ Монтано, Валерия; Джанмарко Ферри; Вероника Маркари; Кьяра Батини; Окори Аньяэле; Джованни Дестро-Бисоль; Дэвид Комас (1 июля 2011 г.). «Экспансия банту вновь обратилась к новому анализу вариаций Y-хромосомы в Центральной Западной Африке». Молекулярная экология . 20 (13): 2693–2708. дои : 10.1111/j.1365-294X.2011.05130.x. PMID  21627702. S2CID  9951365.
  8. ^ Роза, Александра; Каролина Орнелас; Марк Джоблинг; Антонио Брем; Ричард Виллемс (27 июля 2007 г.). «Y-хромосомное разнообразие населения Гвинеи-Бисау: многоэтническая перспектива». Эволюционная биология BMC . 7 :124. дои : 10.1186/1471-2148-7-124 . ЧВК 1976131 . ПМИД  17662131. 
  9. ^ Вуд, Элизабет Т; Дэрин А. Стовер, Кристофер Эрет, Джованни Дестро-Бисоль, Габриэлла Спедини, Ховард Маклеод, Лесли Луи, Майк Бэмшад, Беверли И Страссманн, Химла Судьял и Майкл Ф. Хаммер (27 апреля 2005 г.). «Контрастные закономерности вариаций Y-хромосомы и мтДНК в Африке: свидетельства демографических процессов с предвзятостью по признаку пола». Европейский журнал генетики человека . 13 (7): 867–876. дои : 10.1038/sj.ejhg.5201408 . ПМИД  15856073.{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  10. ^ Андерхилл, Пенсильвания; Пассарино Дж., Лин А.А., Шен П., Мирасон Лар М., Фоли Р.А., Офнер П.Дж., Кавалли-Сфорца Л.Л. (январь 2001 г.). «Филогеография бинарных гаплотипов Y-хромосомы и происхождение современных человеческих популяций». Анналы генетики человека . 65 (1): 43–62. дои : 10.1046/j.1469-1809.2001.6510043.x . PMID  11415522. S2CID  9441236.{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  11. ^ Гад, Йехия Z; и другие. (2021). «Результаты древнего анализа ДНК египетских человеческих мумий: ключ к разгадке болезней и родства». Молекулярная генетика человека . 30 (R1): R24–R28. дои : 10.1093/hmg/ddaa223 . ISSN  0964-6906. OCLC  8681412353. PMID  33059357. S2CID  222824170.
  12. ^ Пейротео-Стьерна, Рита; и другие. (21 февраля 2022 г.). «Мультидисциплинарное расследование выявило человека западноафриканского происхождения, похороненного в португальской мезолитической раковине, заваленной четыре столетия назад». Журнал археологической науки: отчеты . 42 : 103370. doi : 10.1016/j.jasrep.2022.103370 . OCLC  1337974923. S2CID  247045502.
  13. ^ Луис, младший; DJRowold (март 2004 г.). «Левант против Африканского Рога: свидетельства двунаправленных коридоров миграции людей». Американский журнал генетики человека . 74 (3): 532–544. дои : 10.1086/382286. ПМЦ 1182266 . ПМИД  14973781. 
  14. ^ Пластер и др. Субклады Y-ДНК E
  15. ^ Калифорния, Гипс (28 сентября 2011 г.). «Вариации Y-хромосомы, митохондриальной ДНК и идентификационных меток в Эфиопии». Discovery.ucl.ac.uk . Проверено 27 июня 2018 г.
  16. ^ Карафет, Татьяна М.; Фернандо Л. Мендес; Моника Б. Мейлерман; Питер А. Андерхилл; Стивен Л. Зегура; Майкл Ф. Хаммер (май 2008 г.). «Новые бинарные полиморфизмы изменяют форму и увеличивают разрешение дерева гаплогруппы Y-хромосомы человека». Геномные исследования . 18 (5): 830–838. дои :10.1101/гр.7172008. ПМК 2336805 . ПМИД  18385274. 

Источники таблиц преобразования

Внешние ссылки