stringtranslate.com

Гаплогруппа E-M215

E-M215 или E1b1b , ранее известная как E3b , является основной гаплогруппой ДНК Y-хромосомы человека . E-M215 имеет две базальные ветви, E-M35 и E-M281. E-M35 в основном распространена в Северной Африке и на Африканском Роге , а также встречается с умеренной частотой на Ближнем Востоке , в Европе и Южной Африке . E-M281 встречается с низкой частотой в Эфиопии .

Происхождение

Происхождение E-M215 было датировано Кручиани в 2007 году примерно 22 400 лет назад в Восточной Африке . [3] [Примечание 1]

Карта происхождения E1b1b1

Древняя ДНК

Согласно Лазаридису и др. (2016), натуфийские скелетные останки из древнего Леванта в основном несли гаплогруппу Y-ДНК E1b1b. Из пяти натуфийских образцов, проанализированных на предмет отцовских линий, три принадлежали к субкладам E1b1b1b2(xE1b1b1b2a, E1b1b1b2b), E1b1(xE1b1a1, E1b1b1b1) и E1b1b1b2(xE1b1b1b2a, E1b1b1b2b) (60%). Гаплогруппа E1b1b также была обнаружена с умеренной частотой среди ископаемых из последующей докерамической неолитической культуры B, при этом субклады E1b1b1 и E1b1b1b2(xE1b1b1b2a, E1b1b1b2b) наблюдались в двух из семи образцов PPNB (~29%). Ученые предполагают, что левантийские ранние земледельцы могли распространиться на юг в Восточную Африку, принеся с собой западно-евразийские и базально-евразийские предковые компоненты, отдельные от тех, которые позже прибыли в Северную Африку.

Кроме того, гаплогруппа E1b1b1 была обнаружена в древнеегипетской мумии, раскопанной на археологическом объекте Абусир-эль-Мелек в Среднем Египте, который датируется периодом между поздним Новым царством и римской эпохой . [6] Окаменелости на иберомаврийском объекте Ифри-н-Амр-у-Мусса в Марокко , которые были датированы примерно 5000 г. до н. э., также несли гаплотипы, связанные с субкладом E1b1b1b1a (E-M81). Эти древние люди несли автохтонный магрибский геномный компонент, который достигает пика среди современных североафриканцев , что указывает на то, что они были предками популяций в этом районе. [7] Гаплогруппа E1b1b также была обнаружена в древних окаменелостях гуанчей , раскопанных на Гран-Канарии и Тенерифе на Канарских островах , которые были датированы радиоуглеродным методом между 7 и 11 веками н. э. Индивиды, несущие клады, которые были проанализированы на отцовскую ДНК, были захоронены на месте раскопок на Тенерифе, и все эти образцы оказались принадлежащими к субкладу E1b1b1b1a1 или E-M183 (3/3; 100%). [8]

Loosdrecht et al. (2018) проанализировали данные по всему геному семи древних иберомавров из пещеры Grotte des Pigeons около Тафоральта в восточном Марокко. Окаменелости были напрямую датированы возрастом от 15 100 до 13 900 калиброванных лет до настоящего времени. Ученые обнаружили, что пять мужских особей с достаточной сохранностью ядерной ДНК принадлежали к субкладу E1b1b1a1 (M78), причем один скелет имел родительскую линию E1b1b1a1b1 к E-V13, другой мужской особь принадлежал к E1b1b (M215*). [9]

Распределение

В Африке E-M215 распространен с наибольшей частотой в районе Африканского Рога и Северной Африки , в частности в странах Сомали и Марокко , откуда он за последние тысячелетия распространился на юг до Южной Африки и на север в Западную Азию и Европу (особенно в Средиземноморье и на Балканах ). [10] [11] [12] [13] E-M281 был обнаружен в Эфиопии . [11]

Почти все мужчины E-M215 также находятся в E-M35. В 2004 году было обнаружено, что M215 старше, чем M35, когда были обнаружены люди с мутацией M215, но без мутации M35. [10] В 2013 году Ди Кристофаро и др. (2013) обнаружили одного человека в Хорасане, северо-восточный Иран, который был положительным по M215, но отрицательным по M35. [14]

E-M215 и E-M35 довольно распространены среди носителей афразийских языков . Лингвистическая группа и носители линии E-M35 с высокой вероятностью возникли и расселились вместе из афразийской прародины . [15] Среди популяций с афразийско-говорящей историей значительная часть еврейских мужских линий относится к E-M35. [16] Гаплогруппа E-M35, на долю которой приходится приблизительно 18% [11] - 20% [17] [18] ашкенази и 8,6% [19] - 30% [11] сефардских Y -хромосом, по-видимому , является одной из основных основополагающих линий еврейского населения. [20] [Примечание 2]

Связь E-M215 с выносливостью

Моран и др. (2004) наблюдали, что среди кладов Y-ДНК (отцовских), принадлежащих элитным спортсменам на выносливость в Эфиопии, гаплогруппа E3b1 отрицательно коррелировала с элитными спортивными показателями на выносливость [21], тогда как гаплогруппы E* , E3* , K*(xP) [ 21] и J*(xJ2) встречались значительно чаще среди элитных спортсменов на выносливость [21] .

Субклады

Э-М35

Гаплогруппа E-M35 является субкладом E-M215.

Э-М281

Гаплогруппа E-M281 является субкладом E-M215.

Филогенетика

Филогенетическая история

До 2002 года в академической литературе существовало по крайней мере семь систем наименований для филогенетического дерева Y-хромосомы. Это привело к значительной путанице. В 2002 году основные исследовательские группы объединились и сформировали Консорциум Y-хромосомы (YCC). Они опубликовали совместную статью, в которой было создано единое новое дерево, которое все согласились использовать. Позже группа гражданских ученых, интересующихся популяционной генетикой и генетической генеалогией, сформировала рабочую группу для создания любительского дерева, стремящегося прежде всего быть своевременным. В таблице ниже собраны все эти работы в точке знакового дерева YCC 2002 года. Это позволяет исследователю, просматривающему более старую опубликованную литературу, быстро перемещаться между номенклатурами.

Научные публикации

В создании YCC Tree приняли участие следующие исследовательские группы в соответствии с их публикациями.

Обсуждение

E-M215 и E1b1b1 являются в настоящее время принятыми названиями, найденными в предложениях Консорциума Y-хромосомы (YCC), для кладов, определенных мутацией M215 и M35 соответственно, которые также могут называться E-M215 и E-M35. [22] Номенклатура E3b (E-M215) и E3b1 (E-M35) соответственно были определенными YCC названиями, которые использовались для обозначения тех же гаплогрупп в более старой литературе с ответвлением E-M35 в качестве отдельного субклада E-M215 в 2004 году. [10] До 2002 года эти гаплогруппы не были обозначены последовательным образом, как и их связь с другими родственными кладами в пределах гаплогруппы E и гаплогруппы DE . Но в нестандартных или старых терминологиях E-M215, например, примерно то же самое, что и «гаплотип V», все еще используемый в таких публикациях, как Gérard et al. (2006). [23]

Филогенетические деревья

Кладограмма с основными субкладами:

Следующее филогенетическое дерево основано на дереве YCC 2008 и последующих опубликованных исследованиях, обобщенных ISOGG. Оно включает все известные субклады по состоянию на июнь 2015 года (Trombetta et al. 2015) [24] [22] [23]

Смотрите также

Генетика

Y-ДНК E субклады

Y-ДНК остовное дерево

Примечания

  1. ^ Cruciani et al. (2004): "Несколько наблюдений указывают на Восточную Африку как на родину гаплогруппы E3b, то есть, она имела (1) наибольшее количество различных клад E3b (таблица 1), (2) высокую частоту этой гаплогруппы и высокое разнообразие микросателлитов, и, наконец, (3) исключительное присутствие недифференцированной парагруппы E3b* ". Как упоминалось выше, "E3b" - это старое название E-M215. Semino et al. (2004): "Этот вывод дополнительно подтверждается наличием дополнительной диверсификации линий Hg E и самой высокой частотой E-P2* и E-M35* в том же регионе. Распространение E-P2*, по-видимому, ограничено восточноафриканскими народами. Линия E-M35* показывает свою самую высокую частоту (19,2%) у эфиопских оромо, но с более широким диапазоном распространения, чем E-P2*". Для E-M215 Кручиани и др. (2007) снизили свою оценку до 22 400 с 25 600 в Кручиани и др. (2004), повторно откалибровав те же данные.
  2. ^ "Парагруппа E-M35 * и гаплогруппа J-12f2a* соответствуют критериям основных линий-основателей AJ, поскольку они широко распространены как в популяциях AJ, так и в популяциях Ближнего Востока, и встречаются с гораздо более низкой частотой в европейских нееврейских популяциях". Бехар и др. (2004)

Ссылки

  1. ^ ab Trombetta 2015.
  2. ^ Хабер М., Джонс А. Л., Коннел Б. А., Асан, Арсиеро Э., Хуанминг И., Томас М. Г., Сюэ И., Тайлер-Смит К. (июнь 2019 г.). «Редкая глубоко укоренившаяся африканская Y-хромосомная гаплогруппа D0 и ее значение для экспансии современных людей из Африки». Генетика . 212 (4): 1421–1428. doi : 10.1534/genetics.119.302368 . PMC 6707464. PMID  31196864 . 
  3. ^ ab Cruciani и др. (2007)
  4. ^ "E-M215 YTree".
  5. ^ Кручиани и др. (2004).
  6. ^ Шуенеманн, Верена Дж.; и др. (2017). «Геномы древних египетских мумий предполагают увеличение африканского происхождения к югу от Сахары в постримский период». Nature Communications . 8 : 15694. Bibcode :2017NatCo...815694S. doi :10.1038/ncomms15694. PMC 5459999 . PMID  28556824. 
  7. ^ Фрегель и др. (2018). «Древние геномы из Северной Африки свидетельствуют о доисторических миграциях в Магриб как из Леванта, так и из Европы». bioRxiv 10.1101/191569 . 
  8. ^ Родригес-Варела и др. (2017). «Геномный анализ останков человека до европейского завоевания с Канарских островов выявил близкое родство с современными североафриканцами». Current Biology . 27 (1–7): 3396–3402.e5. Bibcode : 2017CBio...27E3396R. doi : 10.1016/j.cub.2017.09.059 . hdl : 2164/13526 . PMID  29107554.
  9. ^ Ван де Лосдрехт, Марике; Бузуггар, Абдельджалил; Хамфри, Луиза; Пост, Козимо; Бартон, Ник; Аксиму-Петри, Айинуэр; Никель, Биргит; Нагель, Сара; Талби, Эль-Хасан; Эль-Хаджрауи, Мохаммед Абдельджалил; Амзази, Саид; Хублин, Жан-Жак; Паабо, Сванте; Шиффельс, Стефан; Мейер, Маттиас; Хаак, Вольфганг; Чонг, Чунгвон; Краузе, Йоханнес (4 мая 2018 г.). «Плейстоценовые североафриканские геномы связывают популяции людей Ближнего Востока и Африки к югу от Сахары». Science . 360 (6388): 548–552. Bibcode :2018Sci...360..548V. doi : 10.1126/science.aar8380 . PMID  29545507. S2CID  206666517.
  10. ^ abc Cruciani и др. (2004)
  11. ^ abcd Семино и др. (2004)
  12. ^ Россер и др. (2000)
  13. ^ Фирасат и др. (2006)
  14. ^ Ди Кристофаро, Джули и др. (18 октября 2013 г.). «Афганский Гиндукуш: где сходятся потоки генов Евразийского субконтинента». PLOS ONE . 8 (10): e76748. Bibcode : 2013PLoSO...876748D. doi : 10.1371 /journal.pone.0076748 . ISSN  1932-6203. OCLC  5534533323. PMC 3799995. PMID  24204668. S2CID  16455960. 
  15. ^ Эрет, Кейта и Ньюман (2004); Кейта и Бойс (2005); Кейта (2008).
  16. ^ Бехар и др. (2003)
  17. ^ Бехар и др. (2004)
  18. ^ Шен и др. (2004)
  19. ^ Адамс и др. (2008)
  20. ^ Небель и др. (2001)
  21. ^ abc Moran, Colin N.; et al. (2004). "Y-хромосомные гаплогруппы элитных эфиопских бегунов на выносливость". Human Genetics . 115 (6): 492–7. doi :10.1007/s00439-004-1202-y. PMID  15503146. S2CID  13960753 . Получено 6 февраля 2017 г. .
  22. ^ ab Карафет и др. (2008)
  23. ^ ab Консорциум Y-хромосомы "YCC" (2002)
  24. ^ ИСОГГ (2011)
  25. ^ abc ISOGG 2015

Библиография

Источники таблиц преобразования