stringtranslate.com

ЭМБОСС

EMBOSS — это бесплатный пакет программного обеспечения для анализа, разработанный для нужд сообщества пользователей молекулярной биологии и биоинформатики . [1] Программное обеспечение автоматически обрабатывает данные в различных форматах и ​​даже позволяет прозрачно извлекать данные о последовательностях из Интернета. Кроме того, поскольку в пакет включены обширные библиотеки, он представляет собой платформу, позволяющую другим ученым разрабатывать и выпускать программное обеспечение в истинно открытом духе. EMBOSS также объединяет ряд доступных в настоящее время пакетов и инструментов для анализа последовательностей в единое целое.

EMBOSS — это аббревиатура от European Molecular Biology Open Software Suite . ​Европейская часть названия намекает на более широкую сферу применения. Основные группы EMBOSS сотрудничают со многими другими группами для разработки новых приложений, которые нужны пользователям. С самого начала это было сделано с помощью EMBnet , Европейской сети молекулярной биологии. EMBnet имеет множество узлов по всему миру, большинство из которых являются национальными службами биоинформатики. EMBnet обладает опытом программирования. В сентябре 1998 года состоялся первый семинар, на котором 30 человек из EMBnet отправились в Хинкстон , чтобы узнать о EMBOSS и обсудить дальнейшие действия. [2]

Пакет EMBOSS содержит множество приложений для выравнивания последовательностей , быстрого поиска в базе данных по шаблонам последовательностей, идентификации белковых мотивов (включая анализ доменов) и многого другого.

Библиотеки AJAX и NUCLEUS выпускаются под лицензией GNU Library General Public License . Приложения EMBOSS выпускаются под лицензией GNU General Public License . [3]

Группы приложений EMBOSS

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Райс П., Лонгден I, Блисби А. (2000). «EMBOSS: Европейский пакет открытого программного обеспечения для молекулярной биологии». Тенденции в генетике . 16 (6): 276–277. дои : 10.1016/S0168-9525(00)02024-2. ПМИД  10827456.
  2. ^ Райс П., Блисби А. (1999). «EMBOSS: Европейский пакет открытого программного обеспечения для молекулярной биологии». Биохимик E-volution . 16 (6): 276–7. дои : 10.1016/s0168-9525(00)02024-2. ПМИД  10827456.
  3. ^ «1.1. Информация о лицензии» .

Внешние ссылки