stringtranslate.com

Эвриархеота

Эвриархеота (от древнегреческого εὐρύς eurús, «широкий , широкий») — тип архей . [3] Эвриархеоты очень разнообразны и включают метаногены , которые производят метан и часто встречаются в кишечнике, галобактерии , которые выживают при экстремальных концентрациях соли , а также некоторые чрезвычайно термофильные аэробы и анаэробы, которые обычно живут при температуре от 41 до 122 °C. Их отделяют от других архей главным образом на основе последовательностей рРНК и их уникальной ДНК-полимеразы. [4]

Описание

Эвриархеоты разнообразны по внешнему виду и метаболическим свойствам . Тип содержит организмы различной формы, включая палочки и кокки . Эвриархеоты могут проявляться как грамположительными , так и грамотрицательными в зависимости от того, присутствует ли псевдомуреин в клеточной стенке. [5] Эвриархеоты также демонстрируют разнообразный образ жизни, включая метаногенов, галофилов, сульфатредукторов и крайних термофилов в каждом из них. [5] Другие живут в океане, наполненные планктоном и бактериями. Хотя эти морские эвриархеоты трудно культивировать и изучать в лаборатории, геномное секвенирование позволяет предположить, что они являются подвижными гетеротрофами . [6]

Хотя ранее считалось, что эвриархеоты обитают только в экстремальных условиях (с точки зрения температуры, содержания соли и/или pH), статья Корженкова и др., опубликованная в январе 2019 года, показала, что эвриархеоты также живут в умеренных средах, таких как низкотемпературные кислые среды. В некоторых случаях количество эвриархей превышало численность присутствующих бактерий. [7] Эвриархеоты также были обнаружены в других умеренных средах, таких как водные источники, болота, почва и ризосферы . [8] Некоторые эвриархеоты хорошо адаптируются; Отряд под названием Halobacteriales обычно встречается в чрезвычайно соленой и богатой серой среде, но также может расти и при такой низкой концентрации соли, как морская вода (2,5%). [8] В ризосферах присутствие эвриархей, по-видимому, зависит от присутствия микоризных грибов ; более высокая популяция грибов коррелировала с более высокой частотой и разнообразием эвриархей, тогда как отсутствие микоризных грибов коррелировало с отсутствием эвриархеот. [8]

Филогения

Принятая в настоящее время таксономия основана на Списке названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) [9] и Национальном центре биотехнологической информации (NCBI) [10].

Третья филогения, 53 маркерных белка на основе GTDB 08-RS214. [17] [18] [19]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Woese CR, Кандлер О, Уилис МЛ (июнь 1990 г.). «На пути к естественной системе организмов: предложение для доменов архей, бактерий и эукариев». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 87 (12): 4576–9. Бибкод : 1990PNAS...87.4576W. дои : 10.1073/pnas.87.12.4576 . ПМК  54159 . ПМИД  2112744.
  2. ^ Кастель CJ, Банфилд JF (2018). «Основные новые группы микробов расширяют разнообразие и меняют наше понимание древа жизни». Клетка . 172 (6): 1181–1197. дои : 10.1016/j.cell.2018.02.016 . ПМИД  29522741.
  3. ^ Хоган CM (2010). Э. Моноссон, К. Кливленд (ред.). «Архея». Энциклопедия Земли . Национальный совет по науке и окружающей среде . Проверено 18 августа 2017 г.
  4. ^ Линкольн С.А., Вай Б., Эппли Дж.М., Черч М.Дж., Summons RE, DeLong EF (июль 2014 г.). «Планктонные эвриархеоты являются важным источником архейных тетраэфирных липидов в океане». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 111 (27): 9858–63. Бибкод : 2014PNAS..111.9858L. дои : 10.1073/pnas.1409439111 . ПМК 4103328 . ПМИД  24946804. 
  5. ^ ab Гаррити GM, Холт Дж.Г. (2015). «Euryarchaeota phy. nov.». В Whitman WB (ред.). Руководство Берджи по систематике архей и бактерий . Джон Уайли и сыновья . дои : 10.1002/9781118960608. ISBN 9781118960608.
  6. ^ Айверсон В., Моррис Р.М., Фразар К.Д., Бертиаум К.Т., Моралес Р.Л., Армбруст Е.В. (февраль 2012 г.). «Распутывание геномов из метагеномов: выявление некультивируемого класса морских эвриархей». Наука . 335 (6068): 587–90. Бибкод : 2012Sci...335..587I. дои : 10.1126/science.1212665. PMID  22301318. S2CID  31381073.
  7. ^ Корженков А.А., Тощаков С.В., Баржела Р., Гиббард Х., Феррер М., Теплюк А.В., Джонс Д.Л., Кубланов И.В., Голышин П.Н., Голышина О.В. (январь 2019 г.). «Археи доминируют в микробном сообществе в экосистеме с температурой от низкой до умеренной и чрезвычайной кислотностью». Микробиом . 7 (1): 11. дои : 10.1186/s40168-019-0623-8 . ПМК 6350386 . ПМИД  30691532. 
  8. ^ abc Бомберг М., Тимонен С. (октябрь 2007 г.). «Распределение крен- и эвриархеот в микоризосферах сосны обыкновенной и гумусе бореальных лесов». Микробная экология . 54 (3): 406–16. дои : 10.1007/s00248-007-9232-3. PMID  17334967. S2CID  19425171.
  9. ^ Эзеби JP. «Эвриархеота». Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN). Архивировано из оригинала 9 августа 2017 г. Проверено 9 августа 2017 г.
  10. ^ Сэйерс; и другие. «Эвриархеота». Браузер таксономии . База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 9 августа 2017 г.
  11. ^ "ЛТП" . Проверено 23 февраля 2021 г.
  12. ^ "Дерево LTP_all в формате Ньюика" . Проверено 23 февраля 2021 г.
  13. ^ «Примечания к выпуску LTP_12_2021» (PDF) . Проверено 23 февраля 2021 г.
  14. ^ ab Нина Домбровски, Джун-Хо Ли, Том А. Уильямс, Пьер Оффре, Аня Спан (2019). Геномное разнообразие, образ жизни и эволюционное происхождение архей DPANN. Природа.
  15. ^ ab Джордан Т. Берд, Бретт Дж. Бейкер, Александр Дж. Пробст, Мирча Подар, Карен Г. Ллойд (2017). Независимые от культур геномные сравнения выявляют адаптацию Altiarchaeales к окружающей среде. Границы.
  16. ^ аб Кавальер-Смит, Томас; Чао, Эма Э-Юнг (2020). «Мультидоменные рибосомальные белковые деревья и планктобактериальное происхождение неомуры (эукариоты, архебактерии)». Протоплазма . 257 (3): 621–753. дои : 10.1007/s00709-019-01442-7. ПМК 7203096 . ПМИД  31900730. 
  17. ^ "Выпуск GTDB 08-RS214" . База данных геномной таксономии . Проверено 6 декабря 2021 г.
  18. ^ "ar53_r214.sp_label". База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
  19. ^ «История таксона». База данных геномной таксономии . Проверено 6 декабря 2021 г.
  20. ^ Аня Спанг, Ева Ф. Касерес, Тейс Дж. Г. Эттема: Геномное исследование разнообразия, экологии и эволюции архейной области жизни. В: Science Volume 357 Issue 6351, eaaf3883, 11 августа 2017 г., doi:10.1126/science.aaf3883
  21. ^ Sometines с ошибкой в ​​написании Theinoarchaea: Кэтрин Бадель, Гаэль Эраузо, Анника Л. Гомес, Райан Кэтчпол, Матье Гонне, Жак Оберто, Патрик Фортер, Виолетт Да Кунья: Глобальное распространение и история эволюции семейства архейных плазмид pT26-2. В кн.: Экологическая микробиология. sfam 10 сентября 2019 г. doi:10.1111/1462-2920.14800
  22. ^ NCBI: Candidatus Poseidoniia (класс)

дальнейшее чтение

Внешние ссылки

Викискладе есть медиафайлы по теме эвриархеоты .