Семейства структурно подобных белков или FSSP — это база данных структурно наложенных белков, созданная с использованием алгоритма «Distance-matrix ALIgnment» (DALI) . В настоящее время база данных содержит расширенное структурное семейство для каждой из 330 репрезентативных белковых цепей. Каждый набор данных содержит структурные выравнивания одной структуры поиска со всеми другими структурно существенно похожими белками в репрезентативном наборе (удалённые гомологи, < 30% идентичности последовательностей), а также все структуры в Protein Data Bank с 70-30% идентичностью последовательностей относительно структуры поиска (средние гомологи). Очень близкие гомологи (выше 70% идентичности последовательностей) исключаются, поскольку они редко имеют выраженные структурные различия. Выравнивания удалённых гомологов являются результатом попарных структурных сравнений «все против всех» в наборе из 330 репрезентативных белковых цепей. Все такие сравнения основаны исключительно на трёхмерных координатах белков и выводятся с помощью автоматических (объективных) программ сравнения структур. Значимость структурного сходства оценивается на основе статистических критериев. База данных FSSP доступна в электронном виде на файловом сервере EMBL и по анонимному ftp (протокол передачи файлов). [1] База данных полезна для сравнения структур белков .