stringtranslate.com

Фаустовирус

Отрицательное окрашивание очищенной суспензии "Faustovirus ST1", показывающее икосаэдрическую частицу размером 200 нм. Масштабная линейка 100 нм.

Faustovirus — это род гигантских вирусов , которые заражают амебы, связанные с людьми. Вирус был впервые выделен в 2015 году [2] и, как было показано, имеет диаметр около 0,2 микрометра с двухцепочечным ДНК- геномом из 466 килобаз, который, как предполагается, кодирует 451 белок. Хотя фаустовирусы классифицируются как ядерно-цитоплазматический большой ДНК-вирус (NCLDV), они разделяют менее четверти своих генов с другими NCLDV; однако ~46% гомологичны бактериальным генам, а остальные являются генами-сиротами (ORFans). [3] В частности, ген, кодирующий основной капсидный белок (MCP) фаустовируса, отличается от гена его наиболее близкородственного гигантского вируса, асфивируса , а также других NCLDV. У асфивируса ген, кодирующий MCP, представляет собой один геномный фрагмент длиной около 2000 пар оснований (пн), [1] однако у фаустовируса MCP кодируется 13 экзонами, разделенными 12 большими интронами . [4] Экзоны имеют среднюю длину 149 пн, а интроны имеют среднюю длину 1273 пн. [4] Наличие интронов в генах фаустовирусов крайне необычно для вирусов. [1]

Репликация

Стратегия репликации фаустовируса в амебе похожа на стратегию мимивируса . Цикл репликации, длящийся от 18 до 20 часов, начинается с того, что амеба поглощает отдельные вирусные частицы посредством процесса, известного как фагоцитоз . Примерно через 2–4 часа после заражения вирусные частицы интернализуются через фагоцитарные вакуоли и обнаруживаются хозяином. Хотя частицы появляются вблизи ядра хозяина, нет никаких доказательств того, что вирус находится внутри ядра или взаимодействует с ядерной мембраной. [2] Подобно мимивирусу, в котором создается канал для перемещения белков частиц и ДНК, частицы фаустовируса опорожняют свои внутренние отсеки в цитоплазму амебы . В обоих вирусах слияние приводит к фазе затмения , в которой содержимое частиц становится невидимым внутри цитоплазмы хозяина. Однако фаза затмения фаустовируса длиннее, чем у мимивируса, и длится от 4 до 6 часов после заражения. [2] Характеризующаяся потерей сферической формы и уменьшением площади поверхности, клетка-хозяин амебы претерпевает реорганизацию, так что через 8–10 часов после заражения появляются новые частицы в области, образующей форму бублика. Эта область является вирусной фабрикой ; она отличается от ядра и окружена митохондриями . Между 12 и 18 часами после заражения вирусная фабрика занимает всю цитоплазму, которая полностью заполнена новыми вирусными частицами. Через 18–20 часов после заражения вирусные частицы высвобождаются посредством лизиса клеток . [2]

Патогенность

Фаустовирус поражает амебу, связанную с окружающей средой человека, например, Vermamoeba vermiformis ; эта конкретная амеба была обнаружена в водопроводных сетях больниц, питьевой воде, образцах кала человека и контактных линзах пациентов с кератитом , поэтому она может быть возможным переносчиком вирусов. [5] Фаустовирусы были обнаружены в сточных водах из различных географических мест, таких как Сенегал, Франция, Ливан и Саудовская Аравия. [2] [6] Изолированные штаммы вируса были обнаружены у грызунов, крупного рогатого скота, лихорадящих и здоровых людей, а также в колодезной воде и реках. Хотя фаустовирус был обнаружен у людей, неизвестно, оказывает ли он патогенное воздействие на людей; необходимы дополнительные исследования, чтобы определить способ заражения и последствия заражения, если таковые существуют. [6]

Ссылки

  1. ^ abc Klose T, Reteno DG, Benamar S, Hollerbach A, Colson P, La Scola B, Rossmann MG (31 мая 2016 г.). «Структура фаустовируса, большого вируса dsDNA». Proc Natl Acad Sci USA . 113 (22): 6206–11. Bibcode : 2016PNAS..113.6206K. doi : 10.1073/pnas.1523999113 . PMC  4896704. PMID  27185929 .
  2. ^ abcde Ретено Д.Г., Бенамар С., Халил Дж.Б., Андреани Дж., Армстронг Н., Клозе Т., Россманн М., Колсон П., Рауль Д., Ла Скола Б. (июль 2015 г.). «Фаустовирус, новая линия гигантских вирусов, связанная с асфарвирусом, поражающая амебы». Дж Вирол . 89 (13): 6585–94. дои : 10.1128/JVI.00115-15. ПМЦ 4468488 . ПМИД  25878099. 
  3. ^ Чаттерджи А., Сичериц-Понтен Т., Ядав Р., Кондабагил К. (март 2019 г.). «Геномные и метагеномные сигнатуры гигантских вирусов повсеместно присутствуют в образцах воды из сточных вод, внутреннего озера, очистных сооружений и муниципального водоснабжения в Мумбаи, Индия». Scientific Reports . 9 (1): 3690. Bibcode :2019NatSR...9.3690C. doi :10.1038/s41598-019-40171-y. PMC 6403294 . PMID  30842490. 
  4. ^ ab Шериф Луазани А, Батист Э, Левассер А, Колсон П, Ла Скола Б (23 октября 2018 г.). "Анализ транскриптома Faustovirus E12 выявляет сложный сплайсинг в гене капсида". Frontiers in Microbiology . 9 : 2534. doi : 10.3389/fmicb.2018.02534 . PMC 6247863. PMID  30487777 . 
  5. ^ Роллан С, Андреани Дж, Луазани А, Ахерфи С, Фрэнсис Р, Родригес Р, Сильва Л.С., Сахми Д, Мугари С, Челха Н, Беклиз М, Силва Л, Ассис Ф, Дорнас Ф, Халил Дж, Панье И, Десню C, Левассер А, Колсон П., Абраао Дж., Ла Скола Б. (30 марта 2019 г.). «Открытие и дальнейшие исследования вирусов Gian в Средиземноморском университете IHU. Инфекция, изменившая восприятие виросферы». Вирусы . 11 (4): 312. дои : 10.3390/v11040312 . ПМК 6520786 . ПМИД  30935049. 
  6. ^ ab Теммам С, Монтей-Бушар С, Самбу М, Адбади-Ладрикс М, Азза С, Делокеман П, Бу Халил Дж, Бодуэн П, Жардо П, Робер С, Ла Скола Б, Медианников О, Рауль Д, Десню С ( 16 декабря 2015 г.). «Фаустовирусоподобный асфарвирус у гематофагов-мокрецов и их позвоночных хозяев». Границы микробиологии . 6 : 1406. дои : 10.3389/fmicb.2015.01406 . ПМЦ 4679923 . ПМИД  26733117. 

Внешние ссылки