В молекулярной биологии домен GGDEF представляет собой белковый домен , который, по-видимому, повсеместно встречается у бактерий и часто связан с регуляторным доменом, таким как приемник фосфорилирования или домен, чувствительный к кислороду . Его функция заключается в том, чтобы действовать как дигуанилатциклаза и синтезировать циклический ди-ГМФ , который используется в качестве внутриклеточной сигнальной молекулы у самых разных бактерий . [1] [2] Ферментативная активность может сильно зависеть от соседних доменов . Процессы, регулируемые этим доменом, включают синтез экзополисахаридов , образование биопленки , подвижность и дифференцировку клеток .
Структурные исследования PleD из Caulobacter crescentus показывают, что этот домен образует пятицепочечный бета-слой , окруженный спиралями , похожий на каталитическое ядро аденилатциклазы . [3]
Ссылки
- ^ Paul R, Weiser S, Amiot NC, Chan C, Schirmer T, Giese B, Jenal U (март 2004 г.). «Динамическая локализация регулятора бактериального ответа, зависящая от клеточного цикла, с новым выходным доменом дигуанилатциклазы». Genes Dev . 18 (6): 715–27. doi :10.1101/gad.289504. PMC 387245. PMID 15075296 .
- ^ Рыженков ДА, Тарутина М, Москвин ОВ, Гомельский М (март 2005). «Циклический дигуанилат — это вездесущая сигнальная молекула у бактерий: взгляд на биохимию домена белка GGDEF». J. Bacteriol . 187 (5): 1792–8. doi : 10.1128/JB.187.5.1792-1798.2005. PMC 1064016. PMID 15716451.
- ^ Chan C, Paul R, Samoray D, Amiot NC, Giese B, Jenal U, Schirmer T (декабрь 2004 г.). «Структурная основа активности и аллостерический контроль дигуанилатциклазы». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 101 (49): 17084–9. Bibcode : 2004PNAS..10117084C. doi : 10.1073/pnas.0406134101 . PMC 535365. PMID 15569936 .
В статье использован текст из общедоступных источников Pfam и
InterPro : IPR000160
