Белковый домен, участвующий в связывании ДНК
В молекулярной биологии HMG -бокс ( групповой блок высокой подвижности ) представляет собой белковый домен , который участвует в связывании ДНК . [1] Домен состоит примерно из 75 аминокислотных остатков, которые в совокупности опосредуют ДНК-связывание белков с высокой подвижностью, связанных с хроматином. HMG-боксы присутствуют во многих факторах транскрипции и комплексах ремоделирования хроматина, где они могут опосредовать непоследовательность или специфичность связывания ДНК. [2]
Состав
Структура домена HMG-box содержит три альфа-спирали , разделенные петлями (см. рисунок справа). [3]
Функция
Белки, содержащие HMG-бокс, связывают только конформации ДНК не B-типа (перекрученные или размотанные) с высоким сродством. [1] Домены HMG-бокса обнаружены в некоторых группах белков с высокой подвижностью , которые участвуют в регуляции ДНК-зависимых процессов, таких как транскрипция , репликация и репарация ДНК , все из которых требуют изменения конформации хроматина . [3]
Белки HMG с одинарным и двойным ящиком изменяют архитектуру ДНК, вызывая изгибы при связывании. [4] [5]
Рекомендации
- ^ аб Строс М., Лаунхольт Д., Грассер К.Д. (октябрь 2007 г.). «HMG-бокс: универсальный белковый домен, встречающийся в самых разных ДНК-связывающих белках». Клетка. Мол. Наука о жизни . 64 (19–20): 2590–606. дои : 10.1007/s00018-007-7162-3. PMID 17599239. S2CID 28156847.
- ^ Штрос, М.; Лаунхольт, Д.; Грассер, К.Д. (октябрь 2007 г.). «HMG-бокс: универсальный белковый домен, встречающийся в самых разных ДНК-связывающих белках». Клеточные и молекулярные науки о жизни . 64 (19–20): 2590–2606. дои : 10.1007/s00018-007-7162-3 . Проверено 18 февраля 2023 г.
- ^ аб Томас Д.О. (август 2001 г.). «HMG1 и 2: архитектурные ДНК-связывающие белки». Биохим. Соц. Транс . 29 (Часть 4): 395–401. дои : 10.1042/BST0290395. ПМИД 11497996.
- ^ Д. Муругесапиллай и др ., Соединение мостиков и петель ДНК с помощью HMO1 обеспечивает механизм стабилизации безнуклеосомного хроматина, Nucleic Acids Res (2014) 42 (14): 8996-9004.
- ^ Д. Муругесапиллай и др ., Одномолекулярные исследования высокомобильных белков, изгибающих архитектурную ДНК группы B, Biophys Rev (2016) doi: 10.1007/s12551-016-0236-4
Внешние ссылки
