HNRPH1

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин H — это белок ^[5] , который у человека кодируется геном HNRNPH1 . ^{[6] [7]}

Этот ген принадлежит к подсемейству повсеместно экспрессируемых гетерогенных ядерных рибонуклеопротеинов (hnRNP). hnRNP являются белками, связывающими РНК, и они образуют комплекс с гетерогенной ядерной РНК (hnRNA). Эти белки связаны с пре-мРНК в ядре и, по-видимому, влияют на процессинг пре-мРНК и другие аспекты метаболизма и транспорта мРНК. Хотя все hnRNP присутствуют в ядре, некоторые, по-видимому, перемещаются между ядром и цитоплазмой. Белки hnRNP обладают различными свойствами связывания нуклеиновых кислот. Белок, кодируемый этим геном, имеет три повтора квази-RRM-доменов, которые связываются с РНК. Он очень похож на члена семейства HNRPF. Считается, что этот ген потенциально участвует в фенотипе наследственной лимфедемы I типа. ^[7]

Ссылки

1. GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000169045 – Ensembl , май 2017 г.
2. GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000007850 – Ensembl , май 2017 г.
3. "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
4. "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
5. Penumutchu S, Chiu LY, Meagher JL, Hansen AL, Stuckey JA, Tolbert BS (2018-08-18). "Дифференциальная конформационная динамика, кодируемая линкером Inter-qRRM hnRNP H". Журнал Американского химического общества . 140 (37): 11661–11673. doi :10.1021/jacs.8b05366. ISSN  0002-7863. PMC 6648666. PMID 30122033  . 
6. Оноре Б., Расмуссен Х.Х., Ворум Х., Дейгаард К., Лю Х, Громов П., Мэдсен П., Гессер Б., Томмеруп Н., Селис Дж.Э. (январь 1996 г.). «Гетерогенные ядерные рибонуклеопротеины H, H 'и F являются членами повсеместно экспрессируемого подсемейства родственных, но различных белков, кодируемых генами, картируемыми на разных хромосомах». J Биол Хим . 270 (48): 28780–9. дои : 10.1074/jbc.270.48.28780 . ПМИД  7499401.
7. "Ген Entrez: гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин H1 (H) HNRPH1".

Дальнейшее чтение

• Rasmussen HH, van Damme J, Puype M и др. (1993). «Микропоследовательности 145 белков, записанных в двумерной базе данных белков геля нормальных человеческих эпидермальных кератиноцитов». Электрофорез . 13 (12): 960–9. doi :10.1002/elps.11501301199. PMID  1286667. S2CID  41855774.
• Dawson SJ, White LA (1992). «Лечение эндокардита, вызванного Haemophilus aphrophilus, ципрофлоксацином». J. Infect . 24 (3): 317–20. doi :10.1016/S0163-4453(05)80037-4. PMID  1602151.
• Matunis MJ, Xing J, Dreyfuss G (1994). «Белок hnRNP F: уникальная первичная структура, свойства связывания нуклеиновых кислот и субклеточная локализация». Nucleic Acids Res . 22 (6): 1059–67. doi :10.1093/nar/22.6.1059. PMC  307930. PMID  7512260 .
• Gamberi C, Izaurralde E, Beisel C, Mattaj IW (1997). «Взаимодействие между комплексом белков, связывающих ядерный колпачок человека, и hnRNP F». Mol. Cell. Biol . 17 (5): 2587–97. doi :10.1128/MCB.17.5.2587. PMC  232108. PMID  9111328 .
• Chou MY, Rooke N, Turck CW, Black DL (1999). "hnRNP H является компонентом комплекса усилителя сплайсинга, который активирует альтернативный экзон c-src в нейрональных клетках". Mol. Cell. Biol . 19 (1): 69–77. doi :10.1128/MCB.19.1.69. PMC 83866.  PMID 9858532  .
• Эванс АЛ, Брайс Г, Сотирова В и др. (1999). «Картирование первичной врожденной лимфедемы в области 5q35.3». Am. J. Hum. Genet . 64 (2): 547–55. doi :10.1086/302248. PMC  1377764 . PMID  9973292.
• Honoré B, Vorum H, Baandrup U (1999). "hnRNP H, H' и F ведут себя по-разному в отношении посттрансляционного расщепления и субклеточной локализации". FEBS Lett . 456 (2): 274–80. doi : 10.1016/S0014-5793(99)00911-4 . PMID  10456323. S2CID  7617501.
• Markovtsov V, Nikolic JM, Goldman JA и др. (2000). «Кооперативная сборка комплекса hnRNP, индуцированная тканеспецифическим гомологом белка, связывающего полипиримидиновый тракт». Mol. Cell. Biol . 20 (20): 7463–79. doi :10.1128/MCB.20.20.7463-7479.2000. PMC  86300. PMID  11003644 .
• Andersen JS, Lyon CE, Fox AH и др. (2002). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека». Curr. Biol . 12 (1): 1–11. Bibcode : 2002CBio...12....1A. doi : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . PMID  11790298. S2CID  14132033.
• Jurica MS, Licklider LJ, Gygi SR и др. (2002). «Очистка и характеристика нативных сплайсосом, подходящих для трехмерного структурного анализа». РНК . 8 (4): 426–39. doi :10.1017/S1355838202021088. PMC  1370266 . PMID  11991638.
• Angenstein F, Evans AM, Settlage RE и др. (2002). «Рецептор активированной C-киназы является частью комплексов мессенджерных рибонуклеопротеинов, связанных с полиА-мРНК в нейронах». J. Neurosci . 22 (20): 8827–37. doi :10.1523/JNEUROSCI.22-20-08827.2002. PMC  6757688 . PMID  12388589.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
• Li J, Hawkins IC, Harvey CD и др. (2003). «Регулирование альтернативного сплайсинга SRrp86 и его взаимодействующими белками». Mol. Cell. Biol . 23 (21): 7437–47. doi :10.1128/MCB.23.21.7437-7447.2003. PMC 207616.  PMID 14559993  .
• Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных человеческих кДНК». Nat. Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID  14702039.
• Honoré B, Baandrup U, Vorum H (2004). «Гетерогенные ядерные рибонуклеопротеины F и H/H' демонстрируют дифференциальную экспрессию в нормальных и выбранных раковых тканях». Exp. Cell Res . 294 (1): 199–209. doi :10.1016/j.yexcr.2003.11.011. PMID  14980514.
• Brill LM, Salomon AR, Ficarro SB и др. (2004). «Надежное фосфопротеомное профилирование участков фосфорилирования тирозина из человеческих Т-клеток с использованием иммобилизованной металл-аффинной хроматографии и тандемной масс-спектрометрии». Anal. Chem . 76 (10): 2763–72. doi :10.1021/ac035352d. PMID  15144186.
• Босолей СА, Едриховски М, Шварц Д и др. (2004). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 101 (33): 12130–5. Bibcode : 2004PNAS..10112130B. doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC  514446. PMID  15302935 .
• Jin J, Smith FD, Stark C и др. (2004). «Протеомный, функциональный и основанный на доменах анализ in vivo 14-3-3 связывающих белков, участвующих в регуляции цитоскелета и клеточной организации». Curr. Biol . 14 (16): 1436–50. Bibcode : 2004CBio...14.1436J. CiteSeerX  10.1.1.323.5263 . doi : 10.1016/j.cub.2004.07.051 . PMID  15324660. S2CID  2371325.
• Lin KT, Lu RM, Tarn WY (2004). «Белки, содержащие домен WW, взаимодействуют с ранней сплайсосомой и участвуют в сплайсинге пре-мРНК in vivo». Mol. Cell. Biol . 24 (20): 9176–85. doi :10.1128/MCB.24.20.9176-9185.2004. PMC  517884. PMID  15456888 .