HNRPH3

Ген, кодирующий белок у человека

Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин H3 — белок , который у человека кодируется геном HNRNPH3 . ^{[5] [6]}

Этот ген принадлежит к подсемейству повсеместно экспрессируемых гетерогенных ядерных рибонуклеопротеинов (hnRNP). hnRNP представляют собой РНК- связывающие белки и образуют комплекс с гетерогенной ядерной РНК (hnRNA).

Эти белки связаны с пре-мРНК в ядре и, по-видимому, влияют на процессинг пре-мРНК и другие аспекты метаболизма и транспорта мРНК. Хотя все hnRNP присутствуют в ядре, некоторые, по-видимому, перемещаются между ядром и цитоплазмой . Белки hnRNP обладают отличными свойствами связывания нуклеиновых кислот .

Белок, кодируемый этим геном, имеет два повтора доменов квази-RRM, которые связываются с РНК. Локализуется в ядерных тельцах ядра. Этот белок участвует в процессе сплайсинга, а также участвует в ранней остановке сплайсинга, вызванной тепловым шоком, временно покидая комплексы hnRNP. По-видимому, для этого гена присутствует множество альтернативных вариантов транскриптов, и некоторые из них, по-видимому, имеют интронные области в мРНК. В настоящее время полностью описаны только два варианта транскрипта. ^[6]

Рекомендации

1. GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000096746 - Ensembl , май 2017 г.
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020069 - Ensembl , май 2017 г.
3. "Ссылка на Human PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
5. Маэ Д., Маль П., Гаттони Р., Фишер Н., Маттеи М.Г., Стивенин Дж., Фукс Дж.П. (февраль 1997 г.). «Клонирование гетерогенных ядерных рибонуклеопротеинов 2H9 человека. Связь со сплайсингом и ранней остановкой сплайсинга, вызванной тепловым шоком». J Биол Хим . 272 (3): 1827–36. дои : 10.1074/jbc.272.3.1827 . ПМИД  8999868.
6. «Ген Энтрез: гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин HNRPH3 H3 (2H9)» .

дальнейшее чтение

• Расмуссен Х.Х., Ван Дамм Дж., Пуйпе М. и др. (1993). «Микропоследовательности 145 белков, записанные в базе данных двумерных гелевых белков нормальных эпидермальных кератиноцитов человека». Электрофорез . 13 (12): 960–9. дои : 10.1002/elps.11501301199. PMID  1286667. S2CID  41855774.
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8. ПМИД  8125298.
• Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Дж.Ю. и др. (1996). «Метод «двойного адаптера» для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Анальный. Биохим . 236 (1): 107–13. дои : 10.1006/abio.1996.0138. ПМИД  8619474.
• Ю В., Андерссон Б., Уорли К.С. и др. (1997). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК». Геном Рез . 7 (4): 353–8. дои : 10.1101/гр.7.4.353. ПМК  139146 . ПМИД  9110174.
• Сузуки И., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3. ПМИД  9373149.
• Оноре Б (2000). «Ген hnRNP 2H9, который участвует в реакции сплайсинга, представляет собой ген многократного сплайсинга». Биохим. Биофиз. Акта . 1492 (1): 108–19. дои : 10.1016/s0167-4781(00)00092-0. ПМИД  10858537.
• Маэ Д., Фишер Н., Десимо Д., Фукс Дж. П. (2000). «Пространственно-временная регуляция экспрессии генов hnRNP M и 2H9 во время эмбрионального развития мыши». Биохим. Биофиз. Акта . 1492 (2–3): 414–24. дои : 10.1016/s0167-4781(00)00144-5. ПМИД  11004512.
• Ягуэ Х., Васкес Х., Лопес де Кастро Х.А. (2001). «Посттрансляционная модификация ядерных белков, N(G),N(G)-диметил-Arg, обнаруженная в природном пептидном лиганде HLA класса I». Белковая наука . 9 (11): 2210–7. дои : 10.1110/пс.9.11.2210. ПМК  2144492 . ПМИД  11152131.
• Андерсен Дж.С., Лион К.Э., Фокс А.Х. и др. (2002). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека». Курс. Биол . 12 (1): 1–11. Бибкод : 2002CBio...12....1A. дои : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . PMID  11790298. S2CID  14132033.
• Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M. дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК  139241 . ПМИД  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД  14702039.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504. ПМК  528928 . ПМИД  15489334.
• Раш Дж., Мориц А., Ли К.А. и др. (2005). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Нат. Биотехнология . 23 (1): 94–101. дои : 10.1038/nbt1046. PMID  15592455. S2CID  7200157.
• Андерсен Дж.С., Лам Ю.В., Люнг А.К. и др. (2005). «Динамика ядрышкового протеома». Природа . 433 (7021): 77–83. Бибкод : 2005Natur.433...77A. дои : 10.1038/nature03207. PMID  15635413. S2CID  4344740.
• Стельзл Ю., Ворм Ю., Лаловски М. и др. (2005). «Сеть белок-белкового взаимодействия человека: ресурс для аннотирования протеома». Клетка . 122 (6): 957–68. дои : 10.1016/j.cell.2005.08.029. hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0 . PMID  16169070. S2CID  8235923.
• Олсен Дж.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка . 127 (3): 635–48. дои : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID  17081983. S2CID  7827573.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии». Мол. Сист. Биол . 3 (1): 89. дои : 10.1038/msb4100134. ПМЦ  1847948 . ПМИД  17353931.