stringtranslate.com

ГОРЯЧИЙ ВОЗДУХ

HOTAIR ( антисмысловая РНК транскрипта HOX ) [3] представляет собой человеческий ген , расположенный между HOXC11 и HOXC12 на хромосоме 12 . Это первый пример РНК, экспрессируемой на одной хромосоме, которая, как было обнаружено, влияет на транскрипцию задних генов кластера HOXD, расположенных на хромосоме 2. Последовательность и функция HOTAIR различны у людей и мышей. [4] Анализ последовательности HOTAIR показал, что он существует у млекопитающих, имеет плохо консервативные последовательности и значительно консервативные структуры и эволюционировал быстрее, чем близлежащие гены HoxC. [5] Последующее исследование выявило, что HOTAIR имеет консервативный некодирующий элемент длиной 32 нуклеотида ( CNE ), который имеет паралогичную копию в области кластера HOXD (расположенной между HOXD11 и HOXD12), [6] предполагая, что консервативные последовательности HOTAIR предшествуют событиям дупликации всего генома в корень позвоночных. В то время как консервативная последовательность, паралогичная кластеру HOXD, имеет длину 32 нуклеотида, последовательность HOTAIR, консервативная от человека до рыбы, имеет длину около 200 нуклеотидов и отмечена признаками активного энхансера (двунаправленная транскрипция, пики H3K4me1 и H3K27ac ). [6]

Ген и транскрибируемый продукт РНК

Ген HOTAIR содержит 6232 п.н. и кодирует некодирующую молекулу РНК длиной 2,2 т.п.н. , которая контролирует экспрессию генов. Его исходная ДНК расположена в кластере генов HOXC . Он переносится с хромосомы 12 на хромосому 2 с помощью белка Suz-Twelve . [7]

Функция

5' - конец HOTAIR взаимодействует с белком группы Polycomb Repressive Complex 2 ( PRC2 ) и в результате регулирует состояние хроматина . Он необходим для подавления генов локуса HOXD с помощью PRC2. [8] [9] PRC2 необязателен для HOTAIR-опосредованного подавления транскрипции. [10] 3'- конец HOTAIR взаимодействует с деметилазой гистонов LSD1 . [9]

Это важный фактор эпигенетической дифференциации кожи на поверхности тела. Кожа с разных анатомических позиций различима, например, кожа век заметно отличается от кожи подошвы. [8] [11]

Клиническое значение

HOTAIR высоко экспрессируется при метастатическом раке молочной железы. Высокие уровни экспрессии в первичных опухолях молочной железы являются важным предиктором последующего метастазирования и смерти. Частично это связано с HOTAIR-опосредованной сверхэкспрессией онкогена HER2 за счет секвестрации миР-331-3p, которая является негативным регулятором экспрессии HER2. [12] В клетках, особенно в тех, которые чрезмерно экспрессируют PRC2 , предотвращение экспрессии HOTAIR приводит к снижению инвазивного потенциала этой клетки. [13] Он также участвует в развитии плоскоклеточного рака пищевода . [14]

Рекомендации

  1. ^ abc GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000228630 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ "Ссылка на Human PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  3. ^ "Запись о генных картах на HOTAIR" . Проверено 20 июля 2010 г.
  4. ^ Шордере П., Дюбул Д. (май 2011 г.). «Структурные и функциональные различия в длинной некодирующей РНК у мыши и человека». ПЛОС Генетика . 7 (5): e1002071. дои : 10.1371/journal.pgen.1002071 . ПМК 3102750 . ПМИД  21637793. 
  5. ^ Хэ С, Лю С, Чжу Х (апрель 2011 г.). «Последовательность, структура и эволюционные особенности HOTAIR у млекопитающих». Эволюционная биология BMC . 11 (1): 102. Бибкод : 2011BMCEE..11..102H. дои : 10.1186/1471-2148-11-102 . ПМК 3103462 . ПМИД  21496275. 
  6. ^ ab Непал C, Таранта А, Хаджиев Ю, Пундхир С, Майдель П, Ленхард Б и др. (апрель 2020 г.). «Дублированный по предкам консервативный некодирующий элемент предполагает двойную регуляторную роль HOTAIR в цис- и транс-цис». iScience . 23 (4): 101008. Бибкод : 2020iSci...23j1008N. doi : 10.1016/j.isci.2020.101008 . ПМЦ 7139118 . ПМИД  32268280. 
  7. ^ Петерик А (август 2008 г.). «Генетика: производственная линия». Природа . 454 (7208): 1042–5. дои : 10.1038/4541042а . ПМИД  18756228.
  8. ^ Аб Ринн Дж.Л., Кертес М., Ван Дж.К., Скваццо С.Л., Сюй X, Бругманн С.А. и др. (июнь 2007 г.). «Функциональное разграничение активных и молчащих доменов хроматина в локусах HOX человека с помощью некодирующих РНК». Клетка . 129 (7): 1311–23. дои : 10.1016/j.cell.2007.05.022. ПМК 2084369 . ПМИД  17604720. 
  9. ^ Аб Цай MC, Мэнор О, Ван Ю, Мосаммапараст Н, Ван Дж. К., Лан Ф и др. (август 2010 г.). «Длинная некодирующая РНК как модульный каркас комплексов модификации гистонов». Наука . 329 (5992): 689–93. Бибкод : 2010Sci...329..689T. doi : 10.1126/science.1192002. ПМЦ 2967777 . ПМИД  20616235. 
  10. ^ Портозо М., Рагаццини Р., Бренчич Ж., Мойани А., Мишо А., Васильев И. и др. (апрель 2017 г.). «PRC2 необязателен для репрессии транскрипции, опосредованной HOTAIR». Журнал ЭМБО . 36 (8): 981–994. дои : 10.15252/embj.201695335. ПМК 5391141 . ПМИД  28167697. 
  11. ^ Чуонг CM (январь 2003 г.). «Гены гомеобокса, заживление ран плода и региональная специфичность кожи». Журнал исследовательской дерматологии . 120 (1): 9–11. дои : 10.1046/j.1523-1747.2003.00002.x. ПМЦ 4383243 . ПМИД  12535191. 
  12. ^ Лю XH, Сунь М, Не FQ, Ge YB, Чжан EB, Инь ДД и др. (апрель 2014 г.). «Lnc РНК HOTAIR функционирует как конкурирующая эндогенная РНК, регулируя экспрессию HER2 путем поглощения миР-331-3p при раке желудка». Молекулярный рак . 13:92 . дои : 10.1186/1476-4598-13-92 . ПМК 4021402 . ПМИД  24775712. 
  13. ^ Гупта Р.А., Шах Н., Ван К.С., Ким Дж., Хорлингс Х.М., Вонг DJ и др. (апрель 2010 г.). «Длинная некодирующая РНК HOTAIR перепрограммирует состояние хроматина, способствуя метастазированию рака». Природа . 464 (7291): 1071–6. Бибкод : 2010Natur.464.1071G. дои : 10.1038/nature08975. ПМК 3049919 . ПМИД  20393566. 
  14. ^ Чен Ф.Дж., Сунь М., Ли С.К., Ву Ц.К., Цзи Л., Лю З.Л. и др. (Ноябрь 2013). «Повышение регуляции длинной некодирующей РНК HOTAIR способствует метастазированию плоскоклеточного рака пищевода и плохому прогнозу». Молекулярный канцерогенез . 52 (11): 908–15. дои : 10.1002/mc.21944. PMID  24151120. S2CID  12457373.

дальнейшее чтение

Внешние ссылки


  • в
  • т
  • е