stringtranslate.com

Гаплогруппа E-P2

Гаплогруппа E-P2 , также известная как E1b1 , является гаплогруппой ДНК Y-хромосомы человека . E-P2 имеет две базальные ветви, E-V38 и E-M215 . E-P2 издревле присутствовала в Восточной Африке и Леванте ; в настоящее время она в основном распространена в Африке, где, возможно, и возникла, и встречается с меньшей частотой на Ближнем Востоке и в Европе .

Происхождение

Семино и др. (2004) предположили происхождение из Восточной Африки , заявив: «Как филогеография, так и микросателлитная дисперсия предполагают, что E-P2 и его производное, E-M35, вероятно, произошли из Восточной Африки» [2] .

Тромбетта и др. (2011) также предположили происхождение из Восточной Африки :

Новая топология, представленная здесь, имеет важные последствия для происхождения гаплогруппы E-P2. Используя принцип филогеографической экономии, разрешение трифуркации E-M215 в пользу общего предка E-M2 и E-M329 решительно поддерживает гипотезу о том, что гаплогруппа E-P2 возникла в Восточной Африке, как предполагалось ранее, и что хромосомы E-M2, так часто наблюдаемые в Африке к югу от Сахары, прослеживают свое происхождение от общего предка, присутствующего в Восточной Африке. [3]

Древняя ДНК

Было обнаружено, что образец из останков Натуфийцев содержал гаплогруппу E1b1 (1/5; 20%). [4]

В пещере Мота в Эфиопии были найдены останки древнего эфиопского мужчины, возраст которого был датирован 4500 г. до н.э., и в них содержалась отцовская гаплогруппа E1b1 и материнская гаплогруппа L3x2a . [5] [6]

Распределение

Основные субклады E1b1 (E-P2): E1b1a (E-V38) и E1b1b (E-M215) в данных популяциях. [7]

E-P2 в настоящее время встречается в основном в Африке , в основном в форме его преобладающих субкладов E-M215 и E-V38 . E-M215 чаще встречается в Северной Африке и на Африканском Роге , а также встречается с более низкими частотами на Ближнем Востоке , в Европе и Южной Африке . E-V38 чаще встречается в Западной Африке , Центральной Африке , Южной Африке и Великих африканских озерах и встречается с более низкими частотами в Северной Африке и на Ближнем Востоке.

Параклад, называемый E-P2*, включающий случаи, которые не относятся ни к E-V38, ни к E-M215, либо редки, либо отсутствуют, и до сих пор ни один из них не был обнаружен. [3]

Семино и др. (2004) обнаружили E-P2 (xM35,xM2) у 10,4% из 48 эфиопских амхара , 12,8% из 78 эфиопских оромо , 1,9% из 53 южноафриканских банту и 2,9% из 139 сенегальцев . [8]

Вуд и др. (2005) сообщили об обнаружении E-P2(xP1, xM35) у 11% (1/9) выборки оромо из Эфиопии, 11% (1/9) выборки иракв из Танзании, 10% (2/20) смешанной выборки носителей различных южносемитских языков из Эфиопии, 6% (1/18) выборки амхара из Эфиопии, 3% (1/30) выборки эве из Ганы, 3% (1/32) выборки фанте из Ганы и 3% (1/34) выборки волоф из Гамбии/Сенегала. [9]

Стеффлова и др. (2009) сообщили об одном человеке из выборки из 199 афроамериканских мужчин из Филадельфии с E-P2 (xM35, xM2). [10]

Кручиани и др. (2002) обнаружили E-P2 (xM35, xM2) у: 18% из 22 эфиопских евреев , 2% из 49 мосси из Буркина-Фасо , 3% из 37 римайбе также из Буркина-Фасо и 6% из 17 фульбе из Камеруна . [11]

Семино и др. (2002) обнаружили E-P2 (xM35, xM2) у 18,2% из 88 эфиопов. [12] [13]

Моран и др. (2004) обнаружили E-P2 (xM35, xM2) у эфиопских спортсменов и контрольных групп и сообщили о следующих результатах: общий контроль: 4% (4/95), контроль Арси: 8% (7/85), 5-10 км: 22% (5/23) и легкая атлетика: 11% (2/11). [14]

Субклады

Э-М215

Гаплогруппа E-M215 является субкладом гаплогруппы E-P2. [1]

E-V38

Гаплогруппа E-V38 является субкладом гаплогруппы E-P2. [1]

Э-М329

Основная статья: Гаплогруппа E-M329

Гаплогруппа E-M329 является субкладом гаплогруппы E-P2. [1]

Филогенетика

Филогенетическая история

До 2002 года в академической литературе существовало по крайней мере семь систем наименования для филогенетического дерева Y-хромосомы. Это привело к значительной путанице. В 2002 году основные исследовательские группы объединились и сформировали Консорциум Y-хромосомы (YCC). Они опубликовали совместную статью, в которой было создано единое новое дерево, которое все согласились использовать. Позже группа гражданских ученых, интересующихся популяционной генетикой и генетической генеалогией, сформировала рабочую группу для создания любительского дерева, стремящегося прежде всего быть своевременным. В таблице ниже собраны все эти работы в точке знакового дерева YCC 2002 года. Это позволяет исследователю, просматривающему более старую опубликованную литературу, быстро перемещаться между номенклатурами.

Научные публикации

В создании дерева YCC приняли участие следующие исследовательские группы в соответствии с их публикациями.

Филогенетические деревья

Это филогенетическое дерево субкладов гаплогрупп основано на дереве YCC 2008 Карафета (2008) [15] и последующих опубликованных исследованиях.

Смотрите также

Генетика

Y-ДНК E субклады

Y-ДНК остовное дерево

Ссылки

  1. ^ abcde "E-P177 YTree".
  2. ^ ab Semino, Ornella; et al. (май 2004 г.). «Происхождение, диффузия и дифференциация гаплогрупп Y-хромосомы E и J: выводы о неолитизации Европы и более поздних миграционных событиях в районе Средиземноморья». American Journal of Human Genetics . 74 (5): 1023–1034. doi :10.1086/386295. ISSN  0002-9297. OCLC  4922408279. PMC 1181965 . PMID  15069642. 17859431. 
  3. ^ abc Trombetta и др. (2011)
  4. ^ Мартиниано, Руи; Санктис, Бьянка Де; Халласт, Пилле; Дурбин, Ричард (20 декабря 2020 г.). «Дополнительный материал: размещение древних последовательностей ДНК в эталонных филогениях». Молекулярная биология и эволюция . 39 (2): 2020.12.19.423614. bioRxiv 10.1101/2020.12.19.423614 . doi : 10.1093/molbev/msac017. ПМЦ 8857924 . PMID  35084493. S2CID  229549849.  
  5. ^ Льоренте, М. Гальего и др. (13 ноября 2015 г.). «Древний эфиопский геном обнаруживает обширную евразийскую примесь в Восточной Африке». Science . 350 (6262): 820–822. Bibcode :2015Sci...350..820L. doi :10.1126/science.aad2879. hdl : 2318/1661894 . PMID  26449472. S2CID  25743789.
  6. ^ Льоренте, М. Гальего и др. (13 ноября 2015 г.). «Дополнительные материалы: древний эфиопский геном обнаруживает обширную евразийскую примесь в Восточной Африке» (PDF) . Science . 350 (6262): 820–822. Bibcode :2015Sci...350..820L. doi :10.1126/science.aad2879. hdl : 2318/1661894 . PMID  26449472. S2CID  25743789.
  7. ^ Badro, Danielle A.; Douaihy, Bouchra; Haber, Marc; Youhanna, Sonia C.; Salloum, Angélique; Ghassibe-Sabbagh, Michella; Johnsrud, Brian; Khazen, Georges; Matisoo-Smith, Elizabeth; Soria-Hernanz, David F.; Wells, R. Spencer; Tyler-Smith, Chris; Platt, Daniel E.; Zalloua, Pierre A.; Consortium, The Genographic (2013-01-30). "Y-хромосома и генетика мтДНК выявляют значительные различия в сходстве современных популяций Ближнего Востока с европейскими и африканскими популяциями". PLOS ONE . 8 (1): e54616. Bibcode : 2013PLoSO...854616B. doi : 10.1371/journal.pone.0054616 . ISSN  1932-6203. PMC 559847 . PMID  23382925. 
  8. ^ Семино и др. (2004)
  9. ^ Вуд и др. (2005)
  10. ^ Стеффлова и др. (2009)
  11. ^ Кручиани и др. (2002)
  12. ^ Семино и др. (2002)
  13. ^ Андерхилл и др. (2000)
  14. ^ Моран и др. (2004)
  15. ^ Карафет и др. (2008)

Библиография

Источники таблиц преобразования

Внешние ссылки