Семино и др. (2004) предположили происхождение из Восточной Африки , заявив: «Как филогеография, так и микросателлитная дисперсия предполагают, что E-P2 и его производное, E-M35, вероятно, произошли из Восточной Африки» [2] .
Тромбетта и др. (2011) также предположили происхождение из Восточной Африки :
Новая топология, представленная здесь, имеет важные последствия для происхождения гаплогруппы E-P2. Используя принцип филогеографической экономии, разрешение трифуркации E-M215 в пользу общего предка E-M2 и E-M329 решительно поддерживает гипотезу о том, что гаплогруппа E-P2 возникла в Восточной Африке, как предполагалось ранее, и что хромосомы E-M2, так часто наблюдаемые в Африке к югу от Сахары, прослеживают свое происхождение от общего предка, присутствующего в Восточной Африке. [3]
Древняя ДНК
Было обнаружено, что образец из останков Натуфийцев содержал гаплогруппу E1b1 (1/5; 20%). [4]
В пещере Мота в Эфиопии были найдены останки древнего эфиопского мужчины, возраст которого был датирован 4500 г. до н.э., и в них содержалась отцовская гаплогруппа E1b1 и материнская гаплогруппа L3x2a . [5] [6]
Параклад, называемый E-P2*, включающий случаи, которые не относятся ни к E-V38, ни к E-M215, либо редки, либо отсутствуют, и до сих пор ни один из них не был обнаружен. [3]
Семино и др. (2004) обнаружили E-P2 (xM35,xM2) у 10,4% из 48 эфиопских амхара , 12,8% из 78 эфиопских оромо , 1,9% из 53 южноафриканских банту и 2,9% из 139 сенегальцев . [8]
Вуд и др. (2005) сообщили об обнаружении E-P2(xP1, xM35) у 11% (1/9) выборки оромо из Эфиопии, 11% (1/9) выборки иракв из Танзании, 10% (2/20) смешанной выборки носителей различных южносемитских языков из Эфиопии, 6% (1/18) выборки амхара из Эфиопии, 3% (1/30) выборки эве из Ганы, 3% (1/32) выборки фанте из Ганы и 3% (1/34) выборки волоф из Гамбии/Сенегала. [9]
Стеффлова и др. (2009) сообщили об одном человеке из выборки из 199 афроамериканских мужчин из Филадельфии с E-P2 (xM35, xM2). [10]
Кручиани и др. (2002) обнаружили E-P2 (xM35, xM2) у: 18% из 22 эфиопских евреев , 2% из 49 мосси из Буркина-Фасо , 3% из 37 римайбе также из Буркина-Фасо и 6% из 17 фульбе из Камеруна . [11]
Семино и др. (2002) обнаружили E-P2 (xM35, xM2) у 18,2% из 88 эфиопов. [12] [13]
Моран и др. (2004) обнаружили E-P2 (xM35, xM2) у эфиопских спортсменов и контрольных групп и сообщили о следующих результатах: общий контроль: 4% (4/95), контроль Арси: 8% (7/85), 5-10 км: 22% (5/23) и легкая атлетика: 11% (2/11). [14]
До 2002 года в академической литературе существовало по крайней мере семь систем наименования для филогенетического дерева Y-хромосомы. Это привело к значительной путанице. В 2002 году основные исследовательские группы объединились и сформировали Консорциум Y-хромосомы (YCC). Они опубликовали совместную статью, в которой было создано единое новое дерево, которое все согласились использовать. Позже группа гражданских ученых, интересующихся популяционной генетикой и генетической генеалогией, сформировала рабочую группу для создания любительского дерева, стремящегося прежде всего быть своевременным. В таблице ниже собраны все эти работы в точке знакового дерева YCC 2002 года. Это позволяет исследователю, просматривающему более старую опубликованную литературу, быстро перемещаться между номенклатурами.
Научные публикации
В создании дерева YCC приняли участие следующие исследовательские группы в соответствии с их публикациями.
α Джоблинг и Тайлер-Смит 2000 и Каладжиева 2001
β Андерхилл 2000
γ Молот 2001
δ Карафет 2001
ε Семино 2000
ζ Вс 1999
η Капелли 2001
Филогенетические деревья
Это филогенетическое дерево субкладов гаплогрупп основано на дереве YCC 2008 Карафета (2008) [15] и последующих опубликованных исследованиях.
Смотрите также
В Викицитатнике есть цитаты, связанные с гаплогруппой E-P2 .
^ ab Semino, Ornella; et al. (май 2004 г.). «Происхождение, диффузия и дифференциация гаплогрупп Y-хромосомы E и J: выводы о неолитизации Европы и более поздних миграционных событиях в районе Средиземноморья». American Journal of Human Genetics . 74 (5): 1023–1034. doi :10.1086/386295. ISSN 0002-9297. OCLC 4922408279. PMC 1181965 . PMID 15069642. 17859431.
^ abc Trombetta и др. (2011)
^ Мартиниано, Руи; Санктис, Бьянка Де; Халласт, Пилле; Дурбин, Ричард (20 декабря 2020 г.). «Дополнительный материал: размещение древних последовательностей ДНК в эталонных филогениях». Молекулярная биология и эволюция . 39 (2): 2020.12.19.423614. bioRxiv 10.1101/2020.12.19.423614 . doi : 10.1093/molbev/msac017. ПМЦ 8857924 . PMID 35084493. S2CID 229549849.
^ Льоренте, М. Гальего и др. (13 ноября 2015 г.). «Древний эфиопский геном обнаруживает обширную евразийскую примесь в Восточной Африке». Science . 350 (6262): 820–822. Bibcode :2015Sci...350..820L. doi :10.1126/science.aad2879. hdl : 2318/1661894 . PMID 26449472. S2CID 25743789.
^ Льоренте, М. Гальего и др. (13 ноября 2015 г.). «Дополнительные материалы: древний эфиопский геном обнаруживает обширную евразийскую примесь в Восточной Африке» (PDF) . Science . 350 (6262): 820–822. Bibcode :2015Sci...350..820L. doi :10.1126/science.aad2879. hdl : 2318/1661894 . PMID 26449472. S2CID 25743789.
^ Badro, Danielle A.; Douaihy, Bouchra; Haber, Marc; Youhanna, Sonia C.; Salloum, Angélique; Ghassibe-Sabbagh, Michella; Johnsrud, Brian; Khazen, Georges; Matisoo-Smith, Elizabeth; Soria-Hernanz, David F.; Wells, R. Spencer; Tyler-Smith, Chris; Platt, Daniel E.; Zalloua, Pierre A.; Consortium, The Genographic (2013-01-30). "Y-хромосома и генетика мтДНК выявляют значительные различия в сходстве современных популяций Ближнего Востока с европейскими и африканскими популяциями". PLOS ONE . 8 (1): e54616. Bibcode : 2013PLoSO...854616B. doi : 10.1371/journal.pone.0054616 . ISSN 1932-6203. PMC 559847 . PMID 23382925.
^ Семино и др. (2004)
^ Вуд и др. (2005)
^ Стеффлова и др. (2009)
^ Кручиани и др. (2002)
^ Семино и др. (2002)
^ Андерхилл и др. (2000)
^ Моран и др. (2004)
^ Карафет и др. (2008)
Библиография
Кручиани, Фульвио; Сантоламазца, Пьеро; Шен, Пейдун; Маколей, Винсент; Мораль, Педро; Олкерс, Антонель; Модиано, Дэвид; Холмс, Сьюзен; Дестро-Бисоль, Джованни; Койя, Валентина; Уоллес, Дуглас К.; Офнер, Питер Дж.; Торрони, Антонио; Кавалли-Сфорца, Л. Лука; Скоццари, Розария; Андерхилл, Питер А. (2002), «Обратная миграция из Азии в страны Африки к югу от Сахары поддерживается анализом гаплотипов Y-хромосомы человека с высоким разрешением», Американский журнал генетики человека , 70 (5): 1197–214. , doi : 10.1086/340257, PMC 447595 , PMID 11910562
Кручиани, Фульвио; Ла Фратта, Роберта; Сантоламазца, Пьеро; Селитто, Даниэле; Пасконе, Роберто; Мораль, Педро; Уотсон, Элизабет; Гуида, Валентина; Коломб, Элиан Беро; Захарова, Бориана; Лавинья, Жуан; Вона, Джузеппе; Аман, Рашид; Кали, Франческо; Акар, Неджат; Ричардс, Мартин; Торрони, Антонио; Новеллетто, Андреа; Скоццари, Розария (2004), «Филогеографический анализ хромосом Y гаплогруппы E3b (E-M215) выявляет множественные миграционные события в пределах и за пределами Африки», Американский журнал генетики человека , 74 (5): 1014–22, doi :10.1086 /386294, PMC 1181964 , PMID 15042509
Karafet, TM; Mendez, FL; Meilerman, MB; Underhill, PA; Zegura, SL; Hammer, MF (2008), «Новые бинарные полиморфизмы изменяют и повышают разрешение древа гаплогруппы Y-хромосомы человека», Genome Research , 18 (5): 830–8, doi :10.1101/gr.7172008, PMC 2336805 , PMID 18385274
Моран, Колин Н.; Скотт, Роберт А.; Адамс, Сьюзан М.; Уоррингтон, Саманта Дж.; Джоблинг, Марк А.; Уилсон, Ричард Х.; Гудвин, Уильям Х.; Георгиадес, Эвелина; Вольде, Безабхе; Питсиладис, Яннис П. (2004), "Гаплогруппы Y-хромосомы элитных эфиопских бегунов на выносливость", Генетика человека , 115 (6): 492–7, doi :10.1007/s00439-004-1202-y, PMID 15503146, S2CID 13960753
Семино, Орнелла; Сантакьяра-Бенерекетти, А. Сильвана; Фаласки, Франческо; Кавалли-Сфорца, Л. Лука; Андерхилл, Питер А. (2002), «Эфиопы и койсанцы разделяют самые глубокие клады филогении Y-хромосомы человека», Американский журнал генетики человека , 70 (1): 265–268, doi : 10.1086/338306, PMC 384897 , PMID 11719903
Семино, Орнелла; Магри, Кьяра; Бенуцци, Джорджия; Лин, Алиса А.; Аль-Захери, Надя; Батталья, Винченца; Макчиони, Лилиана; Триантафиллидис, Костас; Шен, Пейдун; Офнер, Питер Дж.; Животовский Лев А.; Кинг, Рой; Торрони, Антонио; Кавалли-Сфорца, Л. Лука; Андерхилл, Питер А.; Сантакьяра-Бенересетти, А. Сильвана (2004), «Происхождение, распространение и дифференциация гаплогрупп Y-хромосомы E и J: выводы о неолитизации Европы и более поздних миграционных событиях в районе Средиземноморья», Американский журнал генетики человека , 74 (5): 1023–34, doi : 10.1086/386295, PMC 1181965 , PMID 15069642
Stefflova, Klara; Dulik, Matthew C.; Pai, Athma A.; Walker, Amy H.; Zeigler-Johnson, Charnita M.; Gueye, Serigne M.; Schurr, Theodore G.; Rebbeck, Timothy R. (2009), Relethford, John (ред.), "Оценка группового генетического происхождения популяций из Филадельфии и Дакара в контексте полового смешения в Америке", PLOS ONE , 4 (11): e7842, Bibcode : 2009PLoSO...4.7842S, doi : 10.1371/journal.pone.0007842 , PMC 2776971 , PMID 19946364
Trombetta, Beniamino; Cruciani, Fulvio; Sellitto, Daniele; Scozzari, Rosaria (2011), MacAulay, Vincent (ред.), "Новая топология человеческой Y-хромосомной гаплогруппы E1b1 (E-P2), выявленная с помощью недавно охарактеризованных бинарных полиморфизмов", PLOS ONE , 6 (1): e16073, Bibcode : 2011PLoSO...616073T, doi : 10.1371/journal.pone.0016073 , PMC 3017091 , PMID 21253605
Андерхилл, Питер А.; Шен, Пейдун; Лин, Алиса А.; Джин, Ли; Пассарино, Джузеппе; Ян, Вэй Х.; Кауфман, Эрин; Бонне-Тамир, Батшева; Бертранпети, Жауме; Франкалаччи, Паоло; Ибрагим, Мунтасер; Дженкинс, Трефор; Кидд, Джудит Р.; Мехди, С. Касим; Зейлстад, Марк Т.; Уэллс, Р. Спенсер; Пьяцца, Альберто; Дэвис, Рональд В.; Фельдман, Маркус В.; Кавалли-Сфорца, Л. Лука; Офнер, Питер. J. (2000), «Изменение последовательности хромосомы Y и история человеческих популяций», Nature Genetics , 26 (3): 358–61, doi : 10.1038/81685, PMID 11062480, S2CID 12893406
Wood, Elizabeth T; Stover, Daryn A; Ehret, Christopher; Destro-Bisol, Giovanni; Spedini, Gabriella; McLeod, Howard; Louie, Leslie; Bamshad, Mike; Strassmann, Beverly I; Soodyall, Himla; Hammer, Michael F (2005), "Контрастные паттерны вариаций Y-хромосомы и мтДНК в Африке: доказательства демографических процессов, обусловленных полом", European Journal of Human Genetics , 13 (7): 867–76, doi : 10.1038/sj.ejhg.5201408 , PMID 15856073
Источники таблиц преобразования
Capelli, Cristian; Wilson, James F.; Richards, Martin; Stumpf, Michael PH; et al. (февраль 2001 г.). «Преимущественно коренное отцовское наследие для австронезийско-говорящих народов островной Юго-Восточной Азии и Океании». Американский журнал генетики человека . 68 (2): 432–443. doi : 10.1086/318205 . PMC 1235276. PMID 11170891 .
Хаммер, Майкл Ф.; Карафет, Татьяна М.; Редд, Алан Дж.; Джарджанази, Хамди; и др. (1 июля 2001 г.). «Иерархические закономерности глобального разнообразия Y-хромосомы человека». Молекулярная биология и эволюция . 18 (7): 1189–1203. doi : 10.1093/oxfordjournals.molbev.a003906 . PMID 11420360.
Джоблинг, Марк А.; Тайлер-Смит, Крис (2000), «Новые применения новых гаплотипов», Trends in Genetics , 16 (8): 356–62, doi :10.1016/S0168-9525(00)02057-6, PMID 10904265
Каладжиева, Люба; Калафель, Франческ; Джоблинг, Марк А; Ангеличева, Дора; и др. (февраль 2001 г.). «Закономерности меж- и внутригруппового генетического разнообразия у Vlax Roma, выявленные с помощью Y-хромосомы и линий митохондриальной ДНК». Европейский журнал генетики человека . 9 (2): 97–104. дои : 10.1038/sj.ejhg.5200597 . ПМИД 11313742.
Карафет, Татьяна; Сюй, Липин; Ду, Руофу; Ван, Уильям; и др. (сентябрь 2001 г.). «История отцовского населения Восточной Азии: источники, закономерности и микроэволюционные процессы». Американский журнал генетики человека . 69 (3): 615–628. doi : 10.1086/323299 . PMC 1235490. PMID 11481588 .
Semino, O.; Passarino, G; Oefner, PJ; Lin, AA; et al. (2000), «Генетическое наследие палеолитического Homo sapiens sapiens у современных европейцев: перспектива хромосомы AY», Science , 290 (5494): 1155–9, Bibcode : 2000Sci...290.1155S, doi : 10.1126/science.290.5494.1155, PMID 11073453
Су, Бин; Сяо, Цзюньхуа; Андерхилл, Питер; Дека, Ранджан; и др. (декабрь 1999 г.). «Y-хромосома: доказательства миграции современных людей на север в Восточную Азию во время последнего ледникового периода». Американский журнал генетики человека . 65 (6): 1718–1724. doi : 10.1086/302680 . PMC 1288383. PMID 10577926 .
Андерхилл, Питер А.; Шен, Пейдун; Линь, Элис А.; Цзинь, Ли; и др. (ноябрь 2000 г.). «Изменение последовательности Y-хромосомы и история человеческих популяций». Nature Genetics . 26 (3): 358–361. doi :10.1038/81685. PMID 11062480. S2CID 12893406.
Внешние ссылки
Y-ДНК гаплогруппа E и субклады из ISOGG
Проект ДНК Британских островов
E1b1.org – Международный проект Y-ДНК гаплогруппы E1b1 и ее субкладов. Архивировано 17 декабря 2014 г. на Wayback Machine.