stringtranslate.com

IndExs - Индекс Exsiccatae

IndExs – Index of Exsiccatae – это онлайновая биологическая база данных , которая играет ключевую роль в документировании более 2200 исторических и текущих серий exsiccatae и работ, подобных exsiccata. Управляемая Botanische Staatssammlung München в Мюнхене , IndExs служит всеобъемлющим хранилищем данных для этих серий, предоставляя подробные названия с информацией о более чем 1300 редакторах, библиографическую информацию, номера exsiccatae, временные интервалы публикации, диапазоны, информацию о предыдущих и последующих сериях и издателях. Exsiccatae, организованные серии биологических образцов , распределенные по биологическим коллекциям , являются важными ресурсами, обнаруженными в основных гербариях по всему миру. Открытый доступ к общей информации об exsiccatae облегчает глобальное научное взаимодействие и исследования. [1] [2] [3]

История и цель

Запущенная в 2001 году, IndExs стала незаменимой для гербариев, фунгариев и инициатив по оцифровке, удовлетворяя их меняющиеся потребности в научном контенте. [4] [5] База данных классифицирует exsiccata и образцы, которые они распространяют, уделяя особое внимание основным группам организмов в ботанике и микологии . Эта категоризация улучшена изображениями образцовых этикеток образцов из более чем 70 гербариев со ссылкой на их аббревиатуры Index Herbariorum . [6] [7] IndExs стандартизирует соглашения об именовании для серий exsiccata. [8]

IndExs использует модуль DiversityExsiccatae фреймворка Diversity Workbench в качестве системы управления базами данных. [9] Недавно начались усилия по согласованию его технической инфраструктуры с концепциями Wikidata , что указывает на движение к более интегрированным и семантическим методам управления данными на основе веб-технологий. Основное внимание уделяется устранению неоднозначности имен более 1300 редакторов и интеграции информации по 2200 сериям exsiccata в семантическую сеть. Этот шаг включает принятие идентификаторов Wikidata для точной идентификации редакторов, внесение дополнительных сведений в существующие записи Wikidata об их научной работе и создание новых записей при необходимости. Предлагаемое новое свойство, «IndExs Exsiccata ID», направлено на прямую связь с IndExs, позволяя включать информацию о сериях exsiccata в Wikidata. Эта интеграция облегчает связанную среду данных, гарантируя, что значительный вклад ботанических и микологических редакторов и их работа будут более доступны и точно представлены в глобальных репозиториях данных. [10] [11]

Приложения

Практическое применение IndExs подчеркивается его использованием в каталогизации и анализе коллекции бриофитов в Национальном гербарии в Претории (PRE), Южная Африка. В этом проекте IndExs использовался для составления первого каталога эксиккат для коллекции PRE и предоставил необходимую структуру и справочный материал для идентификации и классификации 66 серий эксиккат, представленных в коллекции. С помощью IndExs команда проекта смогла идентифицировать и задокументировать значимые эксиккаты в коллекции PRE, включая редкие наборы, такие как Musci Austro-Africani Антона Рехмана и Bryophyta Antarctica exsiccata под редакцией Рышарда Охиры . Этот случай показывает, как IndExs облегчает документирование и изучение ботанических образцов, позволяя создать первый всеобъемлющий каталог эксиккат в крупной гербарной коллекции. С помощью IndExs исследователи могут получить доступ к информации об exsiccatae, внося вклад в ботанические исследования, таксономию и историю ботанических исследований и обмена. [12] Аналогичным образом, IndExs был предложен для использования в качестве справочного списка при оцифровке немецких гербарных образцов и связанных с ними проектов по информатике биоразнообразия . [13] IndExs признан полезным ресурсом для объяснения сокращений и ссылок, которые можно найти на рукописных и печатных гербарных этикетках (schedae). [14]

Ссылки

  1. ^ Трибель, Д. и Шольц, П. 2001–2024 IndExs – Индекс Exsiccatae . – Botanische Staatssammlung München: http://indexs.botanischestaatssammlung.de. – Мюнхен, Германия.
  2. ^ re3data.org: IndExs – Index of Exsiccatae ; статус редактирования 2023-10-25; re3data.org - Реестр репозиториев исследовательских данных. http://doi.org/10.17616/R38K85 последний доступ: 2024-03-31.
  3. ^ FAIRsharing.org: IndExs ; Индекс Exsiccatae ; FAIRsharing.org. http://doi.org/10.25504/FAIRsharing.naAm6C последний доступ: 2024-04-02.
  4. ^ Глобальная инициатива по растениям: Индекс Exsiccatae ; статус редактирования 2012-04-19; Глобальная инициатива по растениям (GPI). https://gpi.myspecies.info/content/index-exsiccatae. последний доступ: 2024-04-02.
  5. ^ Холстейн, Н., Карин, М., Сезар, Э., Эллис, Л. и др. 2022. Bound Volumes and Exsiccatae in the Botanical Collections at the Natural History Museum, London [Набор данных]. Музей естественной истории. https://doi.org/10.5519/swp7oysf последний доступ: 2024-04-02.
  6. ^ Triebel, D.; Scholz, P.; Hagedorn, G.; Weiss, M. (2004). «История эксиккатных серий в криптогамной ботанике и микологии, отраженная в веб-доступной базе данных эксиккат «IndExs – Index of Exsiccatae». В Döbbeler, P.; Rambold, G. (ред.). Вклад в лихенологию. Юбилейный сборник в честь Ханнеса Хертеля . Bibliotheca Lichenologia. Т. 88. С. 671–690.
  7. ^ Трибель, Д. и Шольц, П. 2001–2024b IndExs - Индекс Exsiccatae. О . – Botanische Staatssammlung München: http://www.botanischestaatssammlung.de/DatabaseClients/IndExs/About.jsp. – Мюнхен, Германия.
  8. ^ Фойерер, Тассило; Шифельбейн, Ульф (2017). «Бедность лихенологических интернет-источников». Графис Скрипта . 29 (1–2): 49–56.
  9. ^ bio.tools.org: DiversityExsiccatae ; bio.tools.org. https://bio.tools/DiversityExsiccatae последний доступ: 2024-04-04.
  10. ^ Трибель, Дагмар; Урибе-Ольгин, Камила; Зайферт, Стефан; Вайс, Маркус; Шольц, Питер (23 августа 2022 г.). «Связь редакторов IndExs и идентификаторов exsiccata с Викиданными для устранения неоднозначности имен людей и работы в ботанических и микологических коллекциях». Биоразнообразие Информационная наука и стандарты . 6 . doi : 10.3897/biss.6.93585 .
  11. ^ Сейферт, Стефан; Трибель, Дагмар (2024). «IndExs как пилотный проект по взаимосвязи реляционных баз данных и графовых баз данных». Zenodo . doi : 10.5281/zenodo.12802884 .
  12. ^ Ван Рой, Дж. (2013). «Exsiccatae в коллекции мохообразных Национального гербария Претории». Боталия . 43 (1): 55–65. дои : 10.4102/abc.v43i1.86 .
  13. ^ Борш, Томас; Стивенс, Альберт-Дитер; Хеффнер, Ева; Гюнтш, Антон; Берендзон, Вальтер Г.; Аппельханс, Марк; и др. (2020). «Полная оцифровка немецких гербариев возможна, разумна и должна быть начата сейчас». Идеи и результаты исследований . 6. doi : 10.3897/rio.6.e50675 .
  14. ^ Шредер, Кристоф Николаус (21 февраля 2019 г.). «Каталог der auf Herbarbelegen gebräuchlichen Abkürzungen Catalogus Abbreviationum in Schedis Herbariorum usitatorum». Кочиа . 12 : 37–67.