stringtranslate.com

Ген, стимулируемый интерфероном

Ген , стимулируемый интерфероном (ISG), — это ген , который может быть экспрессирован в ответ на стимуляцию интерфероном . [1] [2] Интерфероны связываются с рецепторами на поверхности клетки, инициируя сигнальные пути белка внутри клетки. Это взаимодействие приводит к экспрессии подмножества генов, участвующих в реакции врожденной иммунной системы . [1] ISG обычно экспрессируются в ответ на вирусную инфекцию, но также во время бактериальной инфекции и в присутствии паразитов. [2] [1] В настоящее время подсчитано, что 10% генома человека регулируется интерферонами (IFN). [3] Гены, стимулируемые интерфероном, могут действовать как начальный ответ на вторжение патогена, замедляя репликацию вируса и увеличивая экспрессию иммунных сигнальных комплексов. [4] Известно три типа интерферона. [5] Приблизительно 450 генов высоко экспрессируются в ответ на интерферон типа I. [3] Интерферон I типа состоит из INF-α , INF-β , INF-ω и экспрессируется в ответ на вирусную инфекцию. [6] ISG, индуцированные интерфероном I типа, связаны с подавлением репликации вируса и повышением экспрессии иммунных сигнальных белков. [7] Интерферон II типа состоит только из INF-γ и связан с контролем внутриклеточных патогенов и генов-супрессоров опухолей. Интерферон III типа состоит из INF-λ и связан с вирусным иммунным ответом и играет ключевую роль в противогрибковом нейтрофильном ответе. [8]

Выражение

ISG — это гены, экспрессия которых может стимулироваться интерфероном, но также может стимулироваться другими путями. [1] Интерфероны — это тип белка, называемого цитокином , который вырабатывается в ответ на инфекцию. [9] При высвобождении они сигнализируют инфицированным клеткам и другим близлежащим клеткам о присутствии патогена. [9]

Этот сигнал передается от одной клетки к другой путем связывания интерферона с рецептором клеточной поверхности наивной клетки. [10] Рецептор и интерферон попадают внутрь клетки, будучи связанными, чтобы инициировать экспрессию ISG. [10]

Активация ИСГ интерфероном использует сигнальный путь JAK-STAT для индукции транскрипции ИСГ. ИСГ можно разделить на основе того, каким классом интерферона они активируются: интерферон типа I , типа II или типа III . [1] Белковые продукты ИСГ контролируют патогенные инфекции.

В частности, интерфероны типа I и типа III являются противовирусными цитокинами, запускающими ISG, которые борются с вирусными инфекциями. [11] Интерфероны типа I также участвуют в бактериальных инфекциях; однако они могут оказывать как полезные, так и вредные эффекты. [12] Класс интерферонов типа II имеет только один цитокин ( IFN-γ ), который обладает некоторой противовирусной активностью, но более важен для установления клеточного иммунитета посредством активации макрофагов и стимулирования главного комплекса гистосовместимости (MHC) класса II . [13]

Все пути стимуляции ISG приводят к образованию факторов транскрипции. [2] [10] Интерфероны типа I и типа III производят белковый комплекс, называемый ISGF3, который действует как фактор транскрипции и связывается с последовательностью промотора, называемой ISRE (элемент ответа, стимулируемый интерфероном). [2] [10] Интерфероны типа II производят фактор транскрипции, называемый GAF, который связывается с последовательностью промотора, называемой GAS. [2] [10] Эти взаимодействия инициируют экспрессию генов. [1] Эти пути также обычно инициируются Toll-подобным рецептором (TLR) на поверхности клетки. [2] Количество и тип ISG, экспрессируемых в ответ на инфекцию, специфичны для инфицирующего патогена. [2]

Семейство генов, стимулируемых интерфероном

Семейство генов, стимулируемых интерфероном, IFIT

Семейство IFIT ISGs расположено на хромосоме 10 у людей и гомологично у млекопитающих, птиц и рыб. [5] Семейство IFIT обычно индуцируется интерфероном типа I и типа III. [3] [5] Экспрессия гена IFIT наблюдалась в ответ на вирусную инфекцию как ДНК, так и РНК. Гены IFIT подавляют вирусную инфекцию, в первую очередь, ограничивая репликацию вирусной РНК и ДНК. [5] Белки IFIT 1,2,3 и 5 могут напрямую связываться с двухцепочечной трифосфатной РНК. Эти белки IFIT образуют комплекс, который разрушает вирусную РНК. [3] [5] IFIT 1 и IFIT 2 напрямую связывают эукариотический фактор инициации 3 , который снижает более 60% трансляции белка в целевой клетке. [5]

Белки IFIT связываются с двухцепочечной трифосфатной РНК и разрушают РНК
Белки IFIT связываются с двухцепочечной трифосфатной РНК и разрушают РНК

Функция

У ISG есть широкий спектр функций, используемых для борьбы с инфекцией на всех этапах жизни патогена. [1] Для вирусной инфекции примерами являются: предотвращение проникновения вируса в неинфицированные клетки, остановка репликации вируса и предотвращение выхода вируса из инфицированной клетки. [1]

Другая функция ISG — регулирование чувствительности клетки к интерферону. [1] Экспрессия рецепторов распознавания образов , таких как TLR, или общих сигнальных белков, таких как те, что обнаружены в пути JAK-STAT, может регулироваться интерферонами, что делает клетку более чувствительной к интерферонам. [10]

Поскольку большая часть генома человека связана с интерфероном, ISG имеют широкий спектр функций. ISG необходимы для борьбы с вирусными, бактериальными и паразитарными патогенами. [14] Интерферон стимулирует гены, которые помогают активному иммунному ответу и подавляют инфекцию практически на всех стадиях инфекции. [3]

ингибирование вирусной РНК

Существует 21 известный ISG, который ингибирует репликацию РНК-вируса. [15] В первую очередь ISG связываются с РНК и разрушают ее, чтобы предотвратить трансляцию вирусных инструкций в вирусные белки. Эти ISG могут специфически воздействовать на двухцепочечную трифосфатную РНК, которая отличается от одноцепочечной РНК, присутствующей в клетках человека. [3] ISG также может неспецифически воздействовать на мРНК и разрушать ее. Деградация мРНК в масштабах клетки предотвращает выработку как вирусных, так и хозяйских белков. мРНК INF-α и других ключевых иммунных белков устойчивы к этой деградации в масштабах клетки, что позволяет иммунным сигналам продолжаться, пока трансляция ингибируется. [15]

Апоптотические эффекты

Известно 15 ISG, которые помогают индуцировать апоптоз . [16] Вероятно, что ни один из этих генов не запускает апоптоз в одиночку, но их экспрессия связана с апоптозом. Более высокая экспрессия ISG делает клетку более восприимчивой к естественным клеткам-киллерам. [16]

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ abcdefghi Schneider WM, Chevillotte MD, Rice CM (2014-03-21). «Стимулируемые интерфероном гены: сложная сеть защит хозяина». Annual Review of Immunology . 32 (1): 513–45. doi :10.1146/annurev-immunol-032713-120231. PMC  4313732. PMID  24555472 .
  2. ^ abcdefg Сен GC, Саркар SN (2007). "Интерферон-стимулированные гены: мишени прямой сигнализации интерферонов, двухцепочечной РНК и вирусов". Интерферон: 50-я годовщина . Текущие темы микробиологии и иммунологии. Том 316. С. 233–50. doi :10.1007/978-3-540-71329-6_12. ISBN 978-3-540-71328-9. PMID  17969451.
  3. ^ abcdef Schoggins, John W. (29.09.2019). «Гены, стимулируемые интерфероном: что они все делают?». Annual Review of Virology . 6 (1): 567–584. doi : 10.1146/annurev-virology-092818-015756 . ISSN  2327-056X. PMID  31283436. S2CID  195844135.
  4. ^ Ван, Вэньши; Сюй, Лэй; Су, Цзюньхун; Пеппеленбош, Майкель П.; Пан, Цювэй (2017-07-01). «Транскрипционная регуляция генов, стимулированных противовирусным интерфероном». Trends in Microbiology . 25 (7): 573–584. doi :10.1016/j.tim.2017.01.001. ISSN  0966-842X. ​​PMC 7127685. PMID 28139375.  S2CID 3995163  . 
  5. ^ abcdef Чжоу, Сян; Михал, Дженнифер Дж.; Чжан, Лифан; Дин, Бо; Ланни, Джоан К.; Лю, Банг; Цзян, Чжихуа (2013). «Гены семейства IFIT, индуцированные интерфероном, в противовирусной защите хозяина». Международный журнал биологических наук . 9 (2): 200–208. doi :10.7150/ijbs.5613. ISSN  1449-2288. PMC 3584916. PMID 23459883.  S2CID 17545167  . 
  6. ^ Леви, Дэвид Э.; Мари, Изабель Дж.; Дурбин, Джоан Э. (декабрь 2011 г.). «Индукция и функция интерферона I и III типа в ответ на вирусную инфекцию». Current Opinion in Virology . 1 (6): 476–486. doi :10.1016/j.coviro.2011.11.001. ISSN  1879-6257. PMC 3272644. PMID  22323926 . 
  7. ^ Шенборн, Джейми Р.; Уилсон, Кристофер Б. (2007), Регуляция интерферона-γ во время врожденных и адаптивных иммунных реакций , Достижения в иммунологии, т. 96, Elsevier, стр. 41–101, doi :10.1016/s0065-2776(07)96002-2, ISBN 9780123737090, PMID  17981204
  8. ^ Гаффен, Сара (11 октября 2017 г.). «Рекомендация факультетского мнения о том, что интерферон III типа является критическим регулятором врожденного противогрибкового иммунитета». doi : 10.3410/f.731931654.793537605 . {{cite journal}}: Цитировать журнал требует |journal=( помощь )
  9. ^ ab Lazear HM, Schoggins JW, Diamond MS (апрель 2019 г.). «Общие и различные функции интерферонов типа I и типа III». Иммунитет . 50 (4): 907–923. doi : 10.1016/j.immuni.2019.03.025 . PMC 6839410. PMID  30995506 . 
  10. ^ abcdef Hoffmann HH, Schneider WM, Rice CM (март 2015 г.). «Интерфероны и вирусы: эволюционная гонка вооружений молекулярных взаимодействий». Trends in Immunology . 36 (3): 124–38. doi :10.1016/j.it.2015.01.004. PMC 4384471. PMID  25704559 . 
  11. ^ Schoggins JW (2018-03-12). "Последние достижения в области противовирусной интерферон-стимулированной генной биологии". F1000Research . 7 : 309. doi : 10.12688/f1000research.12450.1 . PMC 5850085. PMID  29568506 . 
  12. ^ Ивашкив Л.Б., Донлин Л.Т. (январь 2014 г.). «Регуляция реакций интерферона I типа». Nature Reviews. Иммунология . 14 (1): 36–49. doi :10.1038/nri3581. PMC 4084561. PMID  24362405 . 
  13. ^ Takaoka A, Yanai H (июнь 2006 г.). «Сигнальная сеть интерферона во врожденной защите». Cellular Microbiology . 8 (6): 907–22. doi :10.1111/j.1462-5822.2006.00716.x. PMID  16681834. S2CID  2130730.
  14. ^ de Veer, Michael J.; Holko, Michelle; Frevel, Mathias; Walker, Eldon; Der, Sandy; Paranjape, Jayashree M.; Silverman, Robert H.; Williams, Bryan RG (2003). «Функциональная классификация генов, стимулируемых интерфероном, идентифицированных с помощью микрочипов». Journal of Leukocyte Biology . 69 (6): 912–920. doi : 10.1189/jlb.69.6.912 . ISSN  0741-5400. PMID  11404376. S2CID  1714991.
  15. ^ ab Yang, Emily; Li, Melody MH (2020). «Все о РНК: стимулированные интерфероном гены, которые мешают вирусным процессам РНК». Frontiers in Immunology . 11 : 605024. doi : 10.3389/fimmu.2020.605024 . ISSN  1664-3224. PMC 7756014. PMID 33362792  . 
  16. ^ ab Чавла-Саркар, М.; Линднер, DJ; Лю, Y.-F.; Уильямс, BR; Сен, GC; Сильверман, RH; Борден, EC (2003-06-01). «Апоптоз и интерфероны: роль генов, стимулируемых интерфероном, как медиаторов апоптоза». Апоптоз . 8 (3): 237–249. doi : 10.1023/A:1023668705040 . ISSN  1573-675X. PMID  12766484. S2CID  29138124.