stringtranslate.com

Томас Дженувейн

Томас Йенувайн (родился в 1956 году) — немецкий ученый, работающий в области эпигенетики , биологии хроматина , регуляции генов и функций генома .

Биография

Томас Йенувейн получил докторскую степень по молекулярной биологии в 1987 году в EMBL , работая над онкогенами fos в лаборатории Рольфа Мюллера [1] и Гейдельбергского университета , и провел постдокторские исследования (1987-1993) по усилителю тяжелой цепи иммуноглобулина (IgH) с Рудольфом Гроссшедлом [2] в Калифорнийском университете в Сан-Франциско (UCSF) . В качестве независимого руководителя группы (1993-2002), а затем в качестве старшего научного сотрудника (2002-2008) в Научно-исследовательском институте молекулярной патологии (IMP) в Вене [3] он сосредоточил свои исследования на регуляции хроматина . Благодаря этой работе он и его команда открыли первую гистон лизин метилтрансферазу (КМТ), которая была опубликована в 2000 году. [4] В настоящее время он является директором Института иммунобиологии и эпигенетики Макса Планка во Фрайбурге, Германия, где он возглавляет отдел эпигенетики. [5] С 2004 по 2009 год он координировал финансируемую ЕС сеть передового опыта «Эпигеном» [6] , которая объединяла более 80 лабораторий в Европе. Йенувейн также является соредактором первого учебника по «Эпигенетике» [7], который был опубликован издательством Cold Spring Harbor Laboratory Press в 2007 и 2015 годах. Он является послом по распространению науки и активно участвует в публичных лекциях [8] [9] и радио- и теледокументациях [10] [11], чтобы информировать широкую аудиторию об «Эпигенетике».

Карьера и исследования

Хроматин является физиологическим шаблоном нашей генетической информации , двойной спирали ДНК . Основные субъединицы хроматина , гистоновые белки, функционируют в упаковке двойной спирали ДНК и в контроле экспрессии генов посредством различных модификаций гистонов. Когда Дженувейн начал свою работу с хроматином в конце 1993 года, ферменты для модификаций гистонов не были известны. Он и его команда клонировали и охарактеризовали ортологи млекопитающих доминантных факторов-модификаторов Drosophila PEV , содержащих эволюционно консервативный домен SET , [12] [13], первоначально идентифицированный лабораторией Гюнтера Рейтера. [14] Домен SET присутствует в Su(var)3–9, усилителе белков zeste и Trithorax , все из которых были вовлечены в эпигенетическую регуляцию без доказательств ферментативной активности. Сверхэкспрессия человеческого SUV39H1 модулировала распределение фосфорилирования гистона H3 во время клеточного цикла зависимым от домена SET образом . [15] Это понимание, вместе с усовершенствованным биоинформационным исследованием, обнаружившим отдаленную связь домена SET с растительными метилтрансферазами, предложило критический эксперимент: протестировать рекомбинантный SUV39H1 на активность KMT на гистоновых субстратах. Этот эксперимент выявил надежную каталитическую активность домена SET рекомбинантного SUV39H1 в метилировании гистона H3 in vitro [4] и, как было показано, является селективным для положения лизина 9 гистона H3 ( H3K9me3 ). Это основополагающее открытие идентифицировало первую гистоновую лизиновую метилтрансферазу для эукариотического хроматина . [4] [16] [17] Важным последующим открытием было показать, что опосредованное SUV39H1 метилирование H3K9 генерирует сайт связывания для хромодомена гетерохроматинового белка 1 (HP1). [18] Вместе эти знаковые открытия установили биохимический путь для определения гетерохроматинаи охарактеризовал Suv39h-зависимый H3K9me3 как центральную эпигенетическую модификацию для подавления транскрипционной активности. Функция Suv39h KMT in vivo была продемонстрирована с помощью анализа мышей Suv39h double-null, у которых наблюдаются дефекты сегрегации хромосом и развивается лейкемия . [19] Вместе с Boehringer Ingelheim он идентифицировал первый ингибитор малых молекул для ферментов KMT с помощью скрининга химической библиотеки. [20] В последующие годы Йенувейн затем обратился к функции гетерохроматина в отношении транскрипционной регуляции и геномной организации , уделяя особое внимание анализу некодирующего генома. Первоначальная карта эпигенома мыши была создана с помощью кластерного анализа репрессивных модификаций гистонов в повторяющихся последовательностях [21] и обеспечила важную основу, значительно опередившую достижения глубокого секвенирования в профилировании эпигеномов . Геномные карты для Suv39h-зависимых меток H3K9me3 и секвенирование РНК Hiseq выявили новую роль Suv39h KMT в подавлении повторяющихся элементов (например, ретротранспозонов LINE и ERV ) в эмбриональных стволовых клетках мышей . [22] Демонстрация того, что перицентрические основные сателлитные повторы имеют встроенные сайты связывания факторов транскрипции (TF), которые имеют отношение к опосредованному TF рекрутированию ферментов Suv39h, предоставила общий механизм нацеливания для образования гетерохроматина . [23] В самых последних работах было выявлено, что повторяющиеся транскрипты РНК из основных сателлитных повторов в значительной степени остаются связанными с хроматином и образуют РНК- нуклеосомный каркас, который поддерживается гибридами РНК:ДНК. [24]

Значимость и влияние

Влияние открытия первого KMT и связанных с ним функций было настолько обширным, что оно стимулировало новые направления исследований, охватывающие почти все аспекты биологии хроматина и эпигенетического контроля как для фундаментальных, так и для прикладных вопросов. [25] Определение гетерохроматина системой SUV39H1-H3K9me3-HP1 оказалось действительным почти для всех модельных организмов. [26] Оно позволило провести функциональное разделение между метилированием гистонов и ДНК и интегрировало путь подавления РНК-интерференции с метилированием H3K9. [7] Метилирование лизина гистонов открыло молекулярные возможности для понимания организации неактивной Х-хромосомы , теломер и кластера рДНК и является важнейшим механизмом для регуляции генов, опосредованной Polycomb и Trithorax . [7] Метки метилирования лизина гистонов также определили двухвалентный хроматин в эмбриональных стволовых клетках и являются поучительными модификациями хроматина, которые используются для эпигеномного профилирования в нормальных и больных клетках. [7] Они также были важной предпосылкой для более поздних открытий гистоновых деметилаз (KDM). [27] Благодаря всем этим механистическим прозрениям стали возможны новые подходы в биологии рака, сложных человеческих расстройствах, старении клеток и перепрограммировании . Поскольку метки метилирования лизина гистонов (а также другие модификации гистонов ) обратимы, их ферментативные системы представляют собой идеальные цели для новых программ по поиску лекарств, которые значительно продвинули эпигенетическую терапию . Реакция хроматина на сигналы окружающей среды и ее возможное эпигенетическое наследование через зародышевую линию , скорее всего, также регулируется, по крайней мере частично, метилированием лизина гистонов .

Почести и награды

Йенувейн является членом нескольких научных обществ, таких как Европейская организация молекулярной биологии , Academia Europaea , Австрийская академия наук и Американская академия искусств и наук . Он был удостоен почетного профессорского звания в Венском университете (2003) и кооптационного профессорского звания с назначением на медицинский факультет Фрайбургского университета (2010). В 2005 году он получил медаль сэра Ганса Кребса от Общества FEBS , а в 2007 году — премию Эрвина Шредингера от Австрийской академии наук .

Ссылки

  1. ^ Jenuwein T, Müller R (1987). «Структурно-функциональный анализ белка fos: одно изменение аминокислоты активирует бессмертный потенциал v-fos». Cell . 48 (4): 647–657. doi :10.1016/0092-8674(87)90243-1. PMID  3028645. S2CID  11189628.
  2. ^ Jenuwein T, Forrester WC, Qiu RG, Grosschedl R (1993). «Ядро энхансера иммуноглобулина μ устанавливает доступ фактора в ядерном хроматине независимо от транскрипционной стимуляции». Genes & Development . 7 (10): 2016–2031. doi : 10.1101/gad.7.10.2016 . PMID  8406005.
  3. ^ "Томас Дженувейн | Научно-исследовательский институт молекулярной патологии".
  4. ^ abc Rea S, Eisenhaber F, O'Carroll D, Strahl B, Sun ZW, Schmid M, Opravil S, Mechtler M, Ponting CP, Allis CD, Jenuwein T (2000). "Регулирование структуры хроматина сайт-специфическими гистоновыми метилтрансферазами H3". Nature . 406 (6796): 593–599. Bibcode :2000Natur.406..593R. doi :10.1038/35020506. PMID  10949293. S2CID  205008015.
  5. ^ "Главная". www.ie-freiburg.mpg.de .
  6. ^ «Эпигеном NoE — сеть передового опыта в области эпигенома».
  7. ^ abcd "Эпигенетика, второе издание". cshlpress.com .
  8. ^ [1] .HSTalks .
  9. ^ [2] .www.mpg.de .
  10. ^ «Медиабиблиотека». www.ie-freiburg.mpg.de .
  11. ^ "Wie die Zelle unsere Gene Steuert" . WDR Нахрихтен . 1 июля 2016 г.
  12. ^ Laible G, Wolf A, Nislow L, Pillus L, Dorn R, Reuter G, Lebersorger A, Jenuwein T (1997). "Млекопитающие гомологи гена группы Polycomb Enhancer of zeste mediate gene silencing in Drosophila heterochromatin and at S.cerevisiae tebolum". The EMBO Journal . 16 (11): 3219–3232. doi :10.1093/emboj/16.11.3219. PMC 1169939. PMID  9214638 . 
  13. ^ Aagaard L, Laible G, Selenko P, Schmid M, Dorn R, Schotta G, Kuhfittig S, Wolf A, Lebersorger A, Singh PB, Reuter G, Jenuwein T (1999). "Функциональные гомологи млекопитающих модификатора Drosophila PEV Su(var)3–9 кодируют белки, связанные с центромерой, которые образуют комплекс с компонентом гетерохроматина M31". The EMBO Journal . 18 (7): 1923–1938. doi :10.1093/emboj/18.7.1923. PMC 1171278 . PMID  10202156. 
  14. ^ Tschiersch B, Hofmann A, Krauss V, Dorn R, Korge G, Reuter G (1994). «Белок, кодируемый геном-супрессором пестролистности Drosophila с эффектом положения Su(var)3–9, объединяет домены антагонистических регуляторов комплексов гомеозисных генов». The EMBO Journal . 13 (16): 3822–3831. doi :10.1002/j.1460-2075.1994.tb06693.x. PMC 395295 . PMID  7915232. 
  15. ^ Melcher M, Schmid M, Aagaard L, Selenko P, Laible G, Jenuwein T (2000). «Анализ структуры и функции SUV39H1 выявляет доминирующую роль в организации гетерохроматина, сегрегации хромосом и митотической прогрессии». Molecular and Cellular Biology . 20 (10): 3728–3741. doi :10.1128/mcb.20.10.3728-3741.2000. PMC 85674 . PMID  10779362. 
  16. ^ Jenuwein T (2006). «Эпигенетическая магия метилирования лизина гистонов». Журнал FEBS . 273 (14): 3121–3135. doi : 10.1111/j.1742-4658.2006.05343.x . PMID  16857008.
  17. ^ Патология, НИИ молекулярной патологии. "Истории выпускников | Отзывы | НИИ молекулярной патологии (ИМП)". НИИ молекулярной патологии .
  18. ^ Lachner M, O'Carroll D, Rea S, Mechtler K, Jenuwein T (2001). «Метилирование лизина 9 гистона H3 создает сайт связывания для белков HP1». Nature . 410 (6824): 116–120. Bibcode :2001Natur.410..116L. doi :10.1038/35065132. PMID  11242053. S2CID  4331863.
  19. ^ Peters AH, O'Caroll D, Scherthan H, Mechtler K, Sauer S, Schöfer C, Weipoltshammer C, Pagani M, Lachner M, Kohlmaier A, Opravil S, Doyle M, Sibilia M, Jenuwein T (2001). «Потеря гистоновых метилтрансфераз Suv39h ухудшает гетерохроматин млекопитающих и стабильность генома». Cell . 107 (3): 323–337. doi : 10.1016/s0092-8674(01)00542-6 . PMID  11701123. S2CID  6712563.
  20. ^ Kubicek S, O'Sullivan RJ, August EM, Hickey ER, Zhang Q, Teodoro ML, Rea S, Mechtler K, Kowalski JR, Hamon CA, Kelly TA, Jenuwein T (2007). «Обратное действие H3K9me2 с помощью ингибитора небольшой молекулы для метилтрансферазы гистонов G9a». Molecular Cell . 25 (3): 473–481. doi : 10.1016/j.molcel.2007.01.017 . PMID  17289593.
  21. ^ Martens JH, O'Sullivan R, Braunschweig U, Opravil S, Radolf M, Steinlein P, Jenuwein T (2005). «Профиль состояний метилирования лизина гистонов, ассоциированных с повторами, в эпигеноме мыши». The EMBO Journal . 24 (4): 800–812. doi :10.1038/sj.emboj.7600545. PMC 549616. PMID  15678104 . 
  22. ^ Bulut-Karslioglu A, De La Rosa-Velázquez IA, Ramirez F, Barenboim M, Onishi-Seebacher M, Arand J, Galán C, Winter GE, Engist B, Gerle B, O'Sullivan RJ, Martens JH, Walter J, Manke T, Lachner M, Jenuwein T (2014). "Suv39h-зависимый H3K9me3 маркирует интактные ретротранспозоны и подавляет элементы LINE в эмбриональных стволовых клетках мыши". Molecular Cell . 55 (2): 277–290. doi : 10.1016/j.molcel.2014.05.029 . PMID  24981170.
  23. ^ Булут-Карслиоглу А, Перрера В, Скаранаро М, де ла Роза-Веласкес ИА, ван де Нобелен С, Шукеир Н, Попов Дж, Герле Б, Оправил С, Пагани М, Мейдхоф С, Браблец Т, Манке Т, Лахнер М , Дженувейн Т. (2012). «Механизм образования гетерохроматина мыши, основанный на факторе транскрипции». Структурная и молекулярная биология природы . 19 (10): 1023–1030. дои : 10.1038/nsmb.2382. PMID  22983563. S2CID  22213983.
  24. ^ Веласкес Камачо О, Галан С, Свист-Росовска К, Чинг Р, Гамалинда М, Фетхуллах К, Де ла Роса-Веласкес И, Энгист Б, Кошорц Б, Шукейр Н, Ониши-Зеебахер М, ван де Нобелен С, Дженувейн Т (2017). "Основной сателлитный повтор РНК стабилизирует гетерохроматиновое удержание ферментов Suv39h за счет ассоциации РНК-нуклеосомы и образования гибрида РНК:ДНК". eLife . 6 . doi : 10.7554/eLife.25293 . PMC 5538826 . PMID  28760199. 
  25. ^ Allis CD, Jenuwein T (2016). «Молекулярные признаки эпигенетического контроля». Nature Reviews Genetics . 17 (8): 487–500. doi :10.1038/nrg.2016.59. hdl : 11858/00-001M-0000-002C-A8B7-5 . PMID  27346641. S2CID  3328936.
  26. ^ Allshire RC, Madhani HD (2018). «Десять принципов формирования гетерохроматина». Nature Reviews. Молекулярная клеточная биология . 19 (4): 229–244. doi :10.1038/nrm.2017.119. PMC 6822695. PMID  29235574 . 
  27. ^ Black JC, Van Rechem C, Whetstine JR (2012). «Динамика метилирования лизина гистонов: установление, регулирование и биологическое воздействие». Molecular Cell . 48 (4): 491–507. doi :10.1016/j.molcel.2012.11.006. PMC 3861058. PMID  23200123 . 

Внешние ссылки