ЛМО4

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Фактор транскрипции домена LIM LMO4 — это белок , который у людей кодируется геном LMO4 . [ ^5]

LIM domain only 4 — это богатый цистеином белок, содержащий два домена LIM, который может играть роль регулятора транскрипции или, возможно, онкогена. Его мРНК характеризуется богатой GC 5'-областью и несколькими мотивами ATTT в 3'-области. Был идентифицирован вариант транскрипта, в котором отсутствует часть 5'-области, но его нельзя подтвердить из-за богатой GC природы этой области. ^[5]

Взаимодействия

Было показано, что LMO4 взаимодействует с LDB1 , ^{[6] [7]} RBBP8 ^{[6] [8]} и BRCA1 . ^{[6] [8]}

Ссылки

1. GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000143013 – Ensembl , май 2017 г.
2. GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000028266 – Ensembl , май 2017 г.
3. "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
4. "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
5. "Ген Entrez: LMO4 LIM домен только 4".
6. Sutherland, Kate D; Visvader Jane E; Choong David YH; Sum Eleanor YM; Lindeman Geoffrey J; Campbell Ian G (октябрь 2003 г.). «Мутационный анализ гена LMO4, кодирующего белок, взаимодействующий с BRCA1, при карциномах молочной железы». Int. J. Cancer . 107 (1): 155–8. doi : 10.1002/ijc.11343 . ISSN  0020-7136. PMID  12925972.
7. Дин, Джанет Э.; Маккей Джоэл П.; Кван Энн Х.Й.; Сум Элинор Й.М.; Висвадер Джейн Э.; Мэтьюз Жаклин М. (май 2003 г.). «Структурная основа распознавания ldb1 N-концевыми доменами LIM LMO2 и LMO4». EMBO J . 22 (9): 2224–33. doi :10.1093/emboj/cdg196. ISSN  0261-4189. PMC 156068 . PMID  12727888. 
8. Sum, Eleanor YM; Peng Benjamin; Yu Xin; Chen Junjie; Byrne Jennifer; Lindeman Geoffrey J; Visvader Jane E (март 2002 г.). «Домен белка LIM LMO4 взаимодействует с кофактором CtIP и супрессором опухолей BRCA1 и ингибирует активность BRCA1». J. Biol. Chem . 277 (10): 7849–56. doi : 10.1074/jbc.M110603200 . ISSN  0021-9258. PMID  11751867.

Дальнейшее чтение

• Kenny DA, Jurata LW, Saga Y, Gill GN (1998). «Идентификация и характеристика LMO4, гена LMO с новым паттерном экспрессии во время эмбриогенеза». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 95 (19): 11257–62. Bibcode : 1998PNAS...9511257K. doi : 10.1073/pnas.95.19.11257 . PMC  21629. PMID  9736723.
• Рацевскис Дж., Дилл А., Спарано Дж.А., Руан Х. (1999). «Молекулярное клонирование LMO41, нового человеческого гена домена LIM». Biochim. Biophys. Acta . 1445 (1): 148–53. doi :10.1016/s0167-4781(99)00037-8. PMID  10209267.
• Tse E, Grutz G, Garner AA и др. (2000). «Характеристика гена Lmo4, кодирующего белок LIM-only: геномная организация и сравнительное хромосомное картирование». Mamm. Genome . 10 (11): 1089–94. doi :10.1007/s003359901167. PMID  10556429. S2CID  19479121.
• Sum EY, Peng B, Yu X и ​​др. (2002). «Белок LIM-домена LMO4 взаимодействует с кофактором CtIP и супрессором опухолей BRCA1 и подавляет активность BRCA1». J. Biol. Chem . 277 (10): 7849–56. doi : 10.1074/jbc.M110603200 . PMID  11751867.
• Deane JE, Visvader JE, Mackay JP, Matthew JM (2003). "1H, 15N и 13C назначения FLIN4, внутримолекулярного комплекса LMO4:ldb1". J. Biomol. ЯМР . 23 (2): 165–6. doi :10.1023/A:1016363414644. PMID  12153047. S2CID  30891765.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
• Vu D, Marin P, Walzer C и др. (2003). «Регулятор транскрипции LMO4 вмешивается в нейритогенез в клетках нейробластомы человека SH-SY5Y». Brain Res. Mol. Brain Res . 115 (2): 93–103. doi :10.1016/S0169-328X(03)00119-0. PMID  12877980.
• Manetopoulos C, Hansson A, Karlsson J, et al. (2003). «Белок LMO4, содержащий только LIM, модулирует транскрипционную активность HEN1». Biochem. Biophys. Res. Commun . 307 (4): 891–9. doi :10.1016/S0006-291X(03)01298-1. PMID  12878195.
• Sutherland KD, Visvader JE, Choong DY и др. (2003). «Мутационный анализ гена LMO4, кодирующего белок, взаимодействующий с BRCA1, при карциномах молочной железы». Int. J. Cancer . 107 (1): 155–8. doi : 10.1002/ijc.11343 . PMID  12925972.
• Colland F, Jacq X, Trouplin V и др. (2004). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека». Genome Res . 14 (7): 1324–32. doi :10.1101/gr.2334104. PMC  442148. PMID  15231748 .
• Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA и др. (2004). «Состояние, качество и расширение проекта NIH по полноразмерной ДНК: коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC  528928. PMID  15489334 .
• Новотны-Дирмайр В., Линь Б., Гу Л., Цао Х. (2005). «Модуляция комплекса гликопротеина 130 субъединицы рецептора интерлейкина-6 и его сигнализация взаимодействием LMO4». J. Biol. Chem . 280 (13): 12747–57. doi : 10.1074/jbc.M500175200 . PMID  15677447.
• Sun T, Patoine C, Abu-Khalil A и др. (2005). «Ранняя асимметрия транскрипции генов в левой и правой части коры головного мозга эмбриона человека». Science . 308 (5729): 1794–8. Bibcode :2005Sci...308.1794S. doi :10.1126/science.1110324. PMC  2756725 . PMID  15894532.
• Sum EY, Segara D, Duscio B и др. (2005). «Избыточная экспрессия LMO4 вызывает гиперплазию молочной железы, способствует инвазии клеток и является предиктором неблагоприятного исхода при раке молочной железы». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 102 (21): 7659–64. Bibcode :2005PNAS..102.7659S. doi : 10.1073/pnas.0502990102 . PMC  1140463 . PMID  15897450.
• Jeffries CM, Graham SC, Stokes PH и др. (2007). «Стабилизация бинарного белкового комплекса с помощью циклизации, опосредованной интеином». Protein Sci . 15 (11): 2612–8. doi :10.1110/ps.062377006. PMC  2242402. PMID  17001033 .