В иммунологии линейный эпитоп (также последовательный эпитоп ) — это эпитоп — участок связывания на антигене , который распознается антителами по его линейной последовательности аминокислот (т. е. первичной структуре ). Напротив, большинство антител распознают конформационный эпитоп , который имеет определенную трехмерную форму ( третичную структуру ).
Антиген — это любое вещество, которое иммунная система может распознать как чужеродное и которое вызывает иммунный ответ . Поскольку антигены обычно представляют собой белки, которые слишком велики, чтобы целиком связываться с любым рецептором , только определенные сегменты, которые образуют антиген, связываются с определенным антителом. Такие сегменты называются эпитопами . Аналогично, только паратоп антитела вступает в контакт с эпитопом.
Белки состоят из повторяющихся азотсодержащих субъединиц, называемых аминокислотами . Линейная последовательность аминокислот, составляющих белок, называется его первичной структурой , которая обычно не представлена в виде простой линии последовательных белков (скорее как узел, чем как прямая нить). Но когда антиген расщепляется в лизосоме , он дает небольшие пептиды , которые можно распознать по аминокислотам, которые лежат непрерывно в линии, и поэтому называются линейными эпитопами . [1]
При проведении молекулярных анализов с использованием антител, таких как вестерн-блот , иммуногистохимия и ИФА , следует тщательно выбирать антитела, распознающие линейные или конформационные эпитопы. [2] [3] [4]
Например, если образец белка кипятят, обрабатывают бета-меркаптоэтанолом и запускают в SDS-PAGE для вестерн-блота, белки по существу денатурируют и, следовательно, не могут принять свои естественные трехмерные конформации. Поэтому для иммунодетекции выбирают антитела, которые распознают линейные эпитопы вместо конформационных. Напротив, в иммуногистохимии, где структура белка сохраняется, предпочтительны антитела, которые распознают конформационные эпитопы.