stringtranslate.com

Луис М. Роча

Луис М. Роча — профессор системных наук имени Джорджа Дж. Клира в колледже инженерии и прикладных наук Томаса Дж. Уотсона, Университет Бингемтона ( Государственный университет Нью-Йорка ). Он был директором аспирантской программы NSF-NRT Complex Networks and Systems по информатике в Университете Индианы, Блумингтон , США. Он также является директором Центра социальной и биомедицинской сложности между Университетом Бингемтона и Университетом Индианы, Блумингтон, стипендиатом Фулбрайта и главным исследователем в Институте науки Гульбенкяна , Португалия. Его исследования посвящены сложным системам и сетям, [1] [2] [3] [4] вычислительной и системной биологии, [1] [5] [6] [7] [8] биомедицинской сложности и цифровому здравоохранению, [9] [10] [11] [12] и вычислительному интеллекту (включая искусственную жизнь и воплощенное познание). [13] [14] [15] [16] [17] [18] [19] [20] [21]

Биография

Он родился в Луанде , Ангола , переехал в Лиссабон , Португалия, в подростковом возрасте и получил степень лиценциата (BA плюс MS) по специальности «Механическая и системная инженерия» в Instituto Superior Técnico . Он получил степень доктора наук по системным наукам в 1997 году в Университете Бингемтона . С 1998 по 2004 год он был штатным научным сотрудником в Национальной лаборатории Лос-Аламоса , где он основал и возглавлял команду по моделированию сложных систем в 1998-2002 годах, а также был частью исследовательского сообщества Института Санта-Фе . Он был директором Междисциплинарной учебной программы NSF-NRT по сложным сетям и системам и профессором информатики в Школе информатики, вычислений и инженерии Ладди в Университете Индианы , где он был членом консультативного совета Института сетевых наук Университета Индианы и основным преподавателем Программы когнитивной науки. С 2005 по 2015 год он был директором Computational Biology Collaboratorium и руководителем программы PhD по Computational Biology в Instituto Gulbenkian de Ciencia , где он остается главным исследователем. Он организовал Десятую международную конференцию по моделированию и синтезу живых систем (Alife X) [22] и Девятую европейскую конференцию по искусственной жизни (ECAL 2007). [23]

Исследовать

Доктор Роча изучает системные свойства естественных и искусственных систем, которые позволяют им адаптироваться и развиваться. Он подошел к этой общей теме, исследуя, как информация и избыточность являются основополагающими для управления поведением и эволюционными возможностями сложных систем , [1] [15] [16] [17] , а также абстрагируя принципы от естественных систем для создания адаптивной информационной технологии. [18] [19] [21]

Приняв принцип самовоспроизведения фон Неймана и универсальные вычисления Тьюринга в качестве общего принципа для создания открытой сложности, которая охватывает естественный отбор , доктор Роча развил работу Говарда Патти , [24] Сидни Бреннера , [25] и других, которые считают вычисления и информацию основополагающими для понимания жизни, познания и других сложных систем ( хороший обзор - книга Глейка ). С этой точки зрения он подошел к нескольким вопросам: как клетки и коллективы клеток вычисляют? [1] Является ли язык эволюционной системой, работающей по тому же принципу? [13] [16] [17] Могут ли искусственные системы реализовать тот же принцип? [13] [15] А именно, может ли коллективный интеллект в сети стать суперорганизмом, реализующим этот принцип? [14] [18] [26] [27] Исходя из этих вопросов, он работал над различными конкретными исследовательскими проектами, начиная от анализа биомедицинской литературы и социальных сетей [9] [10] [6] [7] [8] до понимания избыточности, надежности, модульности и управления в сложных сетях , [1] [2] [3] [4] коллективного интеллекта в Интернете и социальных системах, [13] [14] [2] [18] [20] [26] [27] и основанных на агентах моделей эволюционных систем, таких как редактирование РНК [19] и искусственные иммунные системы . [21]

Философские взгляды

Роча является сторонником воплощенного и ситуативного познания и отстаивает обоснованную эпистемологическую позицию эволюционного конструктивизма. Он является сторонником точки зрения, что порог сложности, необходимый для открытой эволюции, требует взаимодействия между символической памятью и динамическими механизмами, т. е. строгого разделения генотипа и фенотипа. Эта идея была названа семиотическим замыканием [28] и, как правило, понимается как соответствующая области биосемиотики . Он отстаивал то, что этот принцип организации играет роль в познании и коллективном поведении человека, разработав веб-технологию для реализации этого принципа. [13] [14] [2] [15] [18] В дополнение к научной работе, часто упоминаемой в СМИ, он регулярно публикует статьи-мнения в популярных СМИ для распространения научного мышления. [29]

Ссылки

  1. ^ abcde AJ Gates, RB Correia, X. Wang, LM Rocha. "Эффективный график выявляет избыточность, канализацию и пути управления в биохимической регуляции и сигнализации" PNAS , 118 (12): e2022598118. doi:10.1371/journal.pone.0055946. 2013
  2. ^ abcd T. Simas, RB Correia и LM Rocha. «Расстояние магистрали сложных сетей». Журнал сложных сетей , 9 (6): cnab021, DOI:10.1093/comnet/cnab021, 2021
  3. ^ ab A. Kolchinsky, MP Van Den Heuvel, A. Griffa, P. Hagmann, LM Rocha, O. Sporns, J. Goni. "Многомасштабная интеграция и предсказуемость в состоянии покоя мозговой активности". Frontiers in Neuroinformatics , 8:66 . doi: 10.3389/fninf.2014.00066, 2014
  4. ^ ab Гейтс, А. и Л. М. Роча. «Управление сложными сетями требует как структуры, так и динамики». Scientific Reports. , 6 :24456. doi: 10.1038/srep244564, 2016
  5. ^ ME Wall, A. Rechtesteiner и LM Rocha, Разложение сингулярных значений и анализ главных компонент "Практический подход к анализу данных микрочипов". DP Berrar, W. Dubitzky и M. Granzow (редакторы). Kluwer Academic Publishers, стр. 91-109. 2003
  6. ^ ab А. Колчинский, А. Лоуренсо, Х. Ву, Л. Ли, Л. М. Роча. «Извлечение фармакокинетических доказательств взаимодействия лекарственных средств из литературы» PLoS ONE 10(5): e0122199. doi:10.1371/journal.pone.0122199. 2015.
  7. ^ ab A. Lourenco, M. Conover, A. Wong, A. Nematzadeh, F. Pan, H. Shatkay и LM Rocha, Линейный классификатор на основе инструментов распознавания сущностей и статистический подход к извлечению методов в литературе по взаимодействию белок-белок. "BMC Bioinformatics.12(Suppl 8):S12." 2011
  8. ^ ab A. Abi-Haidar, J. Kaur, A. Maguitman, P. Radivojac, A. Retchsteiner, K. Verspoor, Z. Wang и LM Rocha, Раскрытие взаимодействия белков в аннотациях и тексте с использованием новой линейной модели и сетей близости слов. "Genome Biology. 9(Suppl 2):S11" 2008
  9. ^ ab RB Correia, L. Li, LM Rocha "Мониторинг потенциальных лекарственных взаимодействий и реакций с помощью сетевого анализа лент пользователей Instagram". Тихоокеанский симпозиум по биовычислениям. , 21 :492-503. DOI: 10.1073/pnas.2022598118, 2021
  10. ^ ab IB Wood, PL Varela, J. Bollen, LM Rocha, J. Gonçalves-Sá "Сексуальные циклы человека управляются культурой и соответствуют коллективным настроениям". Scientific Reports. , 7 :17973. doi: 10.1038/s41598-017-18262-5, 2017
  11. ^ RB Correia, IB Wood, J. Bollen, LM Rocha «Извлечение данных социальных сетей для биомедицинских сигналов и поведения, связанного со здоровьем». Annual Review of Biomedical Data Science. , 3 (1): 433-458. DOI: 10.1146/annurev-biodatasci-030320-040844, 2020.
  12. ^ RB Correia, LP de Araújo, MM Mattos, LM Rocha «Общегородской анализ электронных медицинских карт выявляет гендерные и возрастные предубеждения при назначении известных лекарственных взаимодействий». npj Digital Medicine. , 2 : 74. DOI: 10.1038/s41746-019-0141-x, 2029.
  13. ^ abcde Кларк, А. Рожденные киборги: разум, технологии и будущее человеческого интеллекта. Oxford University Press, 2003.
  14. ^ abcd Старк, Д. Чувство диссонанса: оценки ценности в экономической жизни. Princeton University Press, 2011.
  15. ^ abcd LM Rocha. и W. Hordijk, Material Representations: From the Genetic Code to the Evolution of Cellular Automata. "Искусственная жизнь. 11 (1-2), стр. 189 - 214" 2005
  16. ^ abc LM Rocha, Эволюция с материальными символьными системами. "Биосистемы. Т. 60, стр. 95-121." 2001
  17. ^ abc LM Rocha, Selected Self-Organization and the Semiotics of Evolutionary Systems. "В: Evolutionary Systems: Biological and Epistemological Perspectives on Selection and Self-Organization". S. Salthe, G. Van de Vijver и M. Delpos (ред.). Kluwer Academic Publishers, стр. 341-358. 1998
  18. ^ abcde LM Rocha, Адаптивные рекомендации и открытый семиозис. "Kybernetes. Vol. 30, No. 5-6." 2001
  19. ^ abc C. Huang, J. Kaur, A. Maguitman, LM Rocha, Агентная модель редактирования генотипа. "Evolutionary Computation, 15(3): 253-89." 2007
  20. ^ ab LM Rocha, Evidence Sets: Modeling Subjective Categorys. "In: International Journal of General Systems. Vol. 27, pp. 457-494." 1997
  21. ^ abc A. Abi-Haidar и LM Rocha. "Коллективная классификация текстовых документов с помощью управляемой самоорганизации в динамике перекрестной регуляции Т-клеток". Evolutionary Intelligence . 4 (2):69-80, 2011
  22. ^ LM Rocha (редактор), LS Yaeger (редактор), MA Bedau (редактор), D. Floreano (редактор), RL Goldstone (редактор), A. Vespignani (редактор), «Искусственная жизнь X: Труды Десятой международной конференции по моделированию и синтезу живых систем (Bradford Books)». 2006
  23. ^ Ф. Алмейда и Коста, «Достижения в области искусственной жизни: 9-я Европейская конференция, ECAL 2007, Лиссабон, Португалия, 10–14 сентября 2007 г., Труды (Конспект лекций по информатике / Конспект лекций по искусственному интеллекту)». 2007
  24. ^ Роча, Луис М. (ред.) Физика и эволюция символов и кодов: размышления о работе Говарда Патти. BioSystems 60 (1-3), 2001.
  25. ^ Бреннер, Сидней. «Столетие Тьюринга: сценарий кода жизни». Nature 482 (7386) (22 февраля): 461-461, 2012.
  26. ^ ab Rocha, Luis M. и Johan Bollen. "Биологически мотивированные распределенные проекты для адаптивного управления знаниями". В: Принципы проектирования для иммунной системы и других распределенных автономных систем . L. Segel и I. Cohen (ред.) Серия Института Санта-Фе по наукам о сложности. Oxford University Press, стр. 305-334, 2001
  27. ^ ab GL Ciampaglia, P. Shiralkar, LM Rocha, J. Bollen, F. Menczer, A. Flammini. Вычислительная проверка фактов из сетей знаний. PLoS One . 10 (6): e0128193. doi:10.1371/journal.pone.0128193, 2015.
  28. ^ Патти, ХХ «Физика и метафизика биосемиотики». Журнал биосемиотики . 1 :281-301, 2005.
  29. ^ Луис М. Роча в новостях и СМИ

Внешние ссылки