Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
Афадин — это белок , который у людей кодируется геном AFDN . [ 5]
Функция
Афадин — это мишень Ras (см. HRAS; MIM 190020), которая регулирует межклеточные адгезии ниже активации Ras. Он сливается с MLL (MIM 159555) при лейкемиях, вызванных транслокациями t(6;11) (Taya et al., 1998). [предоставлено OMIM] [6]
Взаимодействия
Было показано, что Афадин взаимодействует с:
- Ген BCR , [7]
- ЭФБ3 , [8]
- Рецептор F11 , [9]
- HRAS [10] [11] и
- ЖМО2 , [12]
- ПВРЛ1 , [13]
- PVRL3 , [14] [15]
- Профилин 1 , [10]
- RAP1A , [10]
- RAP1GAP , [16]
- СОРБС1 , [17]
- SSX2IP , [18]
- Белок плотного соединения 1 , [11] и
- USP9X . [19] [20]
Ссылки
- ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000130396 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000068036 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Prasad R, Gu Y, Alder H, Nakamura T, Canaani O, Saito H, Huebner K, Gale RP, Nowell PC, Kuriyama K (декабрь 1993 г.). «Клонирование партнера слияния ALL-1, гена AF-6, участвующего в острых миелоидных лейкозах с транслокацией хромосомы t(6;11)». Cancer Research . 53 (23): 5624–8. PMID 8242616.
- ^ "Ген Entrez: миелоидный/лимфоидный или смешанный лейкоз MLLT4 (гомолог trithorax, Drosophila); транслоцирован в 4".
- ^ Радзивилл Г., Эрдманн РА, Маргелиш У., Мёллинг К. (июль 2003 г.). «Киназа Bcr подавляет сигнализацию Ras, фосфорилируя AF-6 и связываясь с его доменом PDZ». Молекулярная и клеточная биология . 23 (13): 4663–72. doi :10.1128/mcb.23.13.4663-4672.2003. PMC 164848. PMID 12808105 .
- ^ Hock B, Böhme B, Karn T, Yamamoto T, Kaibuchi K, Holtrich U, Holland S, Pawson T, Rübsamen-Waigmann H, Strebhardt K (август 1998 г.). "PDZ-домен-опосредованное взаимодействие Eph-связанного рецептора тирозинкиназы EphB3 и ras-связывающего белка AF6 зависит от киназной активности рецептора". Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (17): 9779–84. Bibcode : 1998PNAS ...95.9779H. doi : 10.1073/pnas.95.17.9779 . PMC 21413. PMID 9707552.
- ^ Ebnet K, Schulz CU, Meyer Zu Brickwedde MK, Pendl GG, Vestweber D (сентябрь 2000 г.). «Молекула соединительной адгезии взаимодействует с белками AF-6 и ZO-1, содержащими домен PDZ». Журнал биологической химии . 275 (36): 27979–88. doi : 10.1074/jbc.M002363200 . PMID 10856295.
- ^ abc Boettner B, Govek EE, Cross J, Van Aelst L (август 2000 г.). «Соединительный многодоменный белок AF-6 является связывающим партнером Rap1A GTPase и ассоциируется с актиновым цитоскелетным регулятором профилином». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (16): 9064–9. Bibcode : 2000PNAS ...97.9064B. doi : 10.1073/pnas.97.16.9064 . PMC 16822. PMID 10922060.
- ^ аб Ямамото Т., Харада Н., Кавано Ю., Тая С., Кайбучи К. (май 1999 г.). «Взаимодействие AF-6 in vivo с активированным Ras и ZO-1». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 259 (1): 103–7. дои : 10.1006/bbrc.1999.0731. ПМИД 10334923.
- ^ Бегай-Мюллер В., Ансье С., Лойц А. (июнь 2002 г.). «Белок домена LIM Lmo2 связывается с AF6, партнером по транслокации онкогена MLL». FEBS Letters . 521 (1–3): 36–8. doi :10.1016/s0014-5793(02)02814-4. PMID 12067721. S2CID 29461336.
- ^ Takahashi K, Nakanishi H, Miyahara M, Mandai K, Satoh K, Satoh A, Nishioka H, Aoki J, Nomoto A, Mizoguchi A, Takai Y (май 1999). "Нектин/PRR: молекула клеточной адгезии, подобная иммуноглобулину, привлекаемая к адгезивным соединениям на основе кадгерина посредством взаимодействия с афадином, белком, содержащим домен PDZ". The Journal of Cell Biology . 145 (3): 539–49. doi :10.1083/jcb.145.3.539. PMC 2185068 . PMID 10225955.
- ^ Satoh-Horikawa K, Nakanishi H, Takahashi K, Miyahara M, Nishimura M, Tachibana K, Mizoguchi A, Takai Y (апрель 2000 г.). «Нектин-3, новый член иммуноглобулин-подобных молекул клеточной адгезии, который проявляет гомофильную и гетерофильную активность клеточной адгезии». Журнал биологической химии . 275 (14): 10291–9. doi : 10.1074/jbc.275.14.10291 . PMID 10744716.
- ^ Реймонд Н., Борг Дж.П., Лекок Э., Аделаида Дж., Кампаделли-Фьюме Дж., Дюбрей П., Лопес М. (сентябрь 2000 г.). «Человеческий нектин3/PRR3: новый член семейства PVR/PRR/нектина, который взаимодействует с афадином». Джин . 255 (2): 347–55. дои : 10.1016/s0378-1119(00)00316-4. ПМИД 11024295.
- ^ Су Л, Хаттори М, Морияма М, Мурата Н, Харазаки М, Кайбучи К, Минато Н (апрель 2003 г.). «AF-6 контролирует опосредованную интегрином клеточную адгезию, регулируя активацию Rap1 посредством специфического привлечения Rap1GTP и SPA-1». Журнал биологической химии . 278 (17): 15232–8. дои : 10.1074/jbc.M211888200 . hdl : 2433/148462 . ПМИД 12590145.
- ^ Mandai K, Nakanishi H, Satoh A, Takahashi K, Satoh K, Nishioka H, Mizoguchi A, Takai Y (март 1999). "Ponsin/SH3P12: l-afadin- и винкулин-связывающий белок, локализованный в адгезивных соединениях клетка-клетка и клетка-матрикс". The Journal of Cell Biology . 144 (5): 1001–17. doi :10.1083/jcb.144.5.1001. PMC 2148189 . PMID 10085297.
- ^ Asada M, Irie K, Morimoto K, Yamada A, Ikeda W, Takeuchi M, Takai Y (февраль 2003 г.). "ADIP, новый белок, связывающий афадин и альфа-актинин, локализованный в межклеточных адгезионных соединениях". Журнал биологической химии . 278 (6): 4103–11. doi : 10.1074/jbc.M209832200 . PMID 12446711.
- ^ Taya S, Yamamoto T, Kanai-Azuma M, Wood SA, Kaibuchi K (декабрь 1999 г.). «Деубиквитинирующий фермент Fam взаимодействует с бета-катенином и стабилизирует его». Genes to Cells . 4 (12): 757–67. doi : 10.1046/j.1365-2443.1999.00297.x . PMID 10620020. S2CID 85747886.
- ^ Тая С., Ямамото Т., Кано К., Кавано Ю., Ивамацу А., Цучия Т., Танака К., Канаи-Адзума М., Вуд С.А., Мэттик Дж.С., Кайбучи К. (август 1998 г.). «Цель Ras AF-6 является субстратом фермента деубиквитинирования fam». Журнал клеточной биологии . 142 (4): 1053–62. дои : 10.1083/jcb.142.4.1053. ПМК 2132865 . ПМИД 9722616.
Дальнейшее чтение
- Такай Ю., Наканиси Х. (январь 2003 г.). «Нектин и афадин: новые организаторы межклеточных соединений». Журнал клеточной науки . 116 (Часть 1): 17–27. CiteSeerX 10.1.1.321.6596 . дои : 10.1242/jcs.00167. PMID 12456712. S2CID 6465469.
- Saha V, Lillington DM, Shelling AN, Chaplin T, Yaspo ML, Ganesan TS, Young BD (ноябрь 1995 г.). "Ген AF6 на хромосомной полосе 6q27 картируется дистальнее минимальной области делеции при эпителиальном раке яичников". Гены, хромосомы и рак . 14 (3): 220–2. doi :10.1002/gcc.2870140311. PMID 8589040. S2CID 23752846.
- Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода к облегчению открытия генов». Genome Research . 6 (9): 791–806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548.
- Мандай К., Наканиси Х., Сато А., Обаиси Х., Вада М., Нисиока Х., Ито М., Мидзогучи А., Аоки Т., Фудзимото Т., Мацуда Ю., Цукита С., Такай Ю. (октябрь 1997 г.). «Афадин: новый белок, связывающий актиновые филаменты, с одним доменом PDZ, локализованным в месте соединения адгезивов клеток на основе кадгерина». Журнал клеточной биологии . 139 (2): 517–28. дои : 10.1083/jcb.139.2.517. ПМК 2139800 . ПМИД 9334353.
- Joh T, Yamamoto K, Kagami Y, Kakuda H, Sato T, Yamamoto T, Takahashi T, Ueda R, Kaibuchi K, Seto M (октябрь 1997 г.). «Химерные продукты MLL с цитоплазматическим белком AF6, связывающим Ras, вовлеченным в лейкемию t(6;11) (q27;q23), локализующуюся в ядре». Oncogene . 15 (14): 1681–7. doi : 10.1038/sj.onc.1201332 . PMID 9349501.
- Saito S, Matsushima M, Shirahama S, Minaguchi T, Kanamori Y, Minami M, Nakamura Y (апрель 1998 г.). «Полная геномная структура ДНК-полиморфизмов и альтернативный сплайсинг гена AF-6 человека». DNA Research . 5 (2): 115–20. doi : 10.1093/dnares/5.2.115 . PMID 9679199.
- Hock B, Böhme B, Karn T, Yamamoto T, Kaibuchi K, Holtrich U, Holland S, Pawson T, Rübsamen-Waigmann H, Strebhardt K (август 1998 г.). "PDZ-домен-опосредованное взаимодействие Eph-связанной рецепторной тирозинкиназы EphB3 и ras-связывающего белка AF6 зависит от киназной активности рецептора". Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (17): 9779–84. Bibcode : 1998PNAS ...95.9779H. doi : 10.1073/pnas.95.17.9779 . PMC 21413. PMID 9707552.
- Тая С., Ямамото Т., Кано К., Кавано Ю., Ивамацу А., Цучия Т., Танака К., Канаи-Адзума М., Вуд С.А., Мэттик Дж.С., Кайбути К. (август 1998 г.). «Цель Ras AF-6 является субстратом фермента деубиквитинирования fam». Журнал клеточной биологии . 142 (4): 1053–62. дои : 10.1083/jcb.142.4.1053. ПМК 2132865 . ПМИД 9722616.
- Mandai K, Nakanishi H, Satoh A, Takahashi K, Satoh K, Nishioka H, Mizoguchi A, Takai Y (март 1999). "Ponsin/SH3P12: l-афадин- и винкулин-связывающий белок, локализованный в межклеточных и межклеточно-матриксных адгезионных соединениях". The Journal of Cell Biology . 144 (5): 1001–17. doi :10.1083/jcb.144.5.1001. PMC 2148189 . PMID 10085297.
- Linnemann T, Geyer M, Jaitner BK, Block C, Kalbitzer HR, Wittinghofer A, Herrmann C (май 1999). «Термодинамическая и кинетическая характеристика взаимодействия между доменом связывания Ras AF6 и членами подсемейства Ras». Журнал биологической химии . 274 (19): 13556–62. doi : 10.1074/jbc.274.19.13556 . PMID 10224125.
- Takahashi K, Nakanishi H, Miyahara M, Mandai K, Satoh K, Satoh A, Nishioka H, Aoki J, Nomoto A, Mizoguchi A, Takai Y (май 1999 г.). "Нектин/PRR: молекула клеточной адгезии, подобная иммуноглобулину, которая привлекается к адгезивным соединениям на основе кадгерина посредством взаимодействия с афадином, белком, содержащим домен PDZ". The Journal of Cell Biology . 145 (3): 539–49. doi :10.1083/jcb.145.3.539. PMC 2185068 . PMID 10225955.
- Ямамото Т., Харада Н., Кавано Ю., Тая С., Кайбути К. (май 1999 г.). «Взаимодействие AF-6 in vivo с активированным Ras и ZO-1». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 259 (1): 103–7. дои : 10.1006/bbrc.1999.0731. ПМИД 10334923.
- Минагути Т., Мацусима М., Сайто С., Канамори Ю., Сирахама С., Окамото С., Минами М., Такетани Ю., Накамура Ю. (апрель 1999 г.). «Полная последовательность ДНК и характеристика богатой VNTR области размером 330 т.п.н. на хромосоме 6q27, которая обычно удаляется при раке яичников». Исследования ДНК . 6 (2): 131–6. дои : 10.1093/dnares/6.2.131 . ПМИД 10382971.
- Quilliam LA, Castro AF, Rogers-Graham KS, Martin CB, Der CJ, Bi C (август 1999 г.). "M-Ras/R-Ras3, трансформирующий белок ras, регулируемый белком Sos1, GRF1 и активирующим ГТФазу белка p120 Ras, взаимодействует с предполагаемым эффектором Ras AF6". Журнал биологической химии . 274 (34): 23850–7. doi : 10.1074/jbc.274.34.23850 . PMID 10446149.
- Kawabe H, Hata Y, Takeuchi M, Ide N, Mizoguchi A, Takai Y (октябрь 1999 г.). "nArgBP2, новый нейронный член семейства ponsin/ArgBP2/vinexin, который взаимодействует с белком 90, ассоциированным с синапсом/белком постсинаптической плотности 95 (SAPAP)". Журнал биологической химии . 274 (43): 30914–8. doi : 10.1074/jbc.274.43.30914 . PMID 10521485.
- Шао Х, Кадоно-Окуда К, Финлин Б.С., Андрес ДА (ноябрь 1999 г.). «Биохимическая характеристика Ras-связанных ГТФаз Rit и Rin». Архивы биохимии и биофизики . 371 (2): 207–19. doi :10.1006/abbi.1999.1448. PMID 10545207.
- Asakura T, Nakanishi H, Sakisaka T, Takahashi K, Mandai K, Nishimura M, Sasaki T, Takai Y (октябрь 1999 г.). «Сходное и дифференциальное поведение между системами нектин-афадин-понсин и кадгерин-катенин во время формирования и нарушения поляризованного соединения в эпителиальных клетках». Genes to Cells . 4 (10): 573–81. doi : 10.1046/j.1365-2443.1999.00283.x . PMID 10583506. S2CID 24023429.
- Miyahara M, Nakanishi H, Takahashi K, Satoh-Horikawa K, Tachibana K, Takai Y (январь 2000 г.). «Взаимодействие нектина с афадином необходимо для его кластеризации в местах контакта клетка-клетка, но не для его цис-димеризации или транс-взаимодействия». Журнал биологической химии . 275 (1): 613–8. doi : 10.1074/jbc.275.1.613 . PMID 10617658.
- Bouchard MJ, Dong Y, McDermott BM, Lam DH, Brown KR, Shelanski M, Bellvé AR, Racaniello VR (апрель 2000 г.). «Дефекты ядерной и цитоскелетной морфологии и митохондриальной локализации в сперматозоидах мышей, лишенных нектина-2, компонента межклеточных адгезионных соединений». Молекулярная и клеточная биология . 20 (8): 2865–73. doi :10.1128/MCB.20.8.2865-2873.2000. PMC 85510. PMID 10733589 .