Nod-факторы ( факторы клубеньков или NF ) — это сигнальные молекулы, вырабатываемые почвенными бактериями, известными как ризобии, в ответ на выделение флавоноидов растениями в условиях дефицита азота. Nod-факторы инициируют установление симбиотических отношений между бобовыми и ризобиями, вызывая образование клубеньков. Nod-факторы вызывают дифференциацию растительной ткани в корневых волосках в клубеньки, где находятся бактерии, способные фиксировать азот из атмосферы для растения в обмен на фотосинтезирующие продукты и подходящую среду для фиксации азота. [1] Одной из важнейших особенностей, обеспечиваемых растением в этом симбиозе, является выработка леггемоглобина , который поддерживает низкую концентрацию кислорода и предотвращает ингибирование активности нитрогеназы .
Факторы Nod структурно представляют собой липохитоолигосахариды (ЛХО), которые состоят из цепи N -ацетил- D -глюкозамина, связанной через β-1,4 связь с жирной кислотой переменной идентичности, присоединенной к невосстанавливающему азоту в основной цепи с различными заменами функциональных групп на концевых или неконцевых остатках. [2]
Nod-факторы производятся в сложных смесях, отличающихся следующими характеристиками: [3]
Экспрессия гена Nod индуцируется присутствием определенных флавоноидов в почве, которые выделяются растением и действуют как аттрактант для бактерий и вызывают выработку фактора Nod. Флавоноиды активируют NodD, фактор транскрипции семейства LysR, который связывается с nod -боксом и инициирует транскрипцию генов nod, которые кодируют белки, необходимые для выработки широкого спектра LCO. [4]
Nod-факторы потенциально распознаются растительными рецепторами, состоящими из двух гистидинкиназ с внеклеточным доменом LysM , которые были идентифицированы у L. japonicus , сои и M. truncatula [5] . Связывание Nod-факторов с этими рецепторами деполяризует плазматическую мембрану корневых волосков посредством притока Ca2 + , который вызывает экспрессию генов раннего нодулина (ENOD) и набухание корневых волосков. У M. truncatula передача сигнала инициируется активацией dmi1, dmi2 и dmi3 , что приводит к деформации корневых волосков, ранней экспрессии нодулина, делению кортикальных клеток и бактериальной инфекции. Кроме того, гены nsp и hcl привлекаются позже и помогают в процессе ранней экспрессии клубеньков, делении кортикальных клеток и инфекции. [6] Было также обнаружено, что гены dmi1, dmi2 и dmi3 способствуют установлению взаимодействий между M. truncatula и арбускулярной микоризой , что указывает на то, что два совершенно разных симбиоза могут иметь некоторые общие механизмы. [7] Конечным результатом является клубень, структура, в которой фиксируется азот. Nod-факторы действуют, вызывая изменения в экспрессии генов в бобовых, наиболее примечательными из которых являются гены нодулина, необходимые для органогенеза клубеньков. [8]
Ризобии связываются со специфическими лектинами хозяина, присутствующими в корневых волосках, которые вместе с Nod-факторами приводят к образованию клубеньков. Nod-факторы распознаются определенным классом рецепторных киназ , которые имеют домены LysM в своих внеклеточных доменах. Две рецепторные киназы LysM (мотив лизина) (NFR1 и NFR5), которые, по-видимому, составляют рецептор Nod-фактора, были впервые выделены в модельном бобовом растении Lotus japonicus в 2003 году. Теперь они также выделены из сои и модельного бобового растения Medicago truncatula . У NFR5 отсутствует классическая активационная петля в домене киназы . В гене NFR5 отсутствуют интроны . Сначала клеточная мембрана деполяризуется, и корневые волоски начинают набухать, а деление клеток останавливается. Nod-фактор вызывает фрагментацию и перестройку актиновой сети, что в сочетании с восстановлением роста клеток приводит к завиванию корневых волосков вокруг бактерий. За этим следует локализованное разрушение клеточной стенки и инвагинация мембраны растительной клетки, что позволяет бактерии сформировать инфекционную нить. По мере роста инфекционной нити ризобии перемещаются по ее длине к месту расположения клубенька. Во время этого процесса клетки перицикла в растениях активируются, а клетки во внутренней коре начинают расти и становятся зачатком клубенька, где ризобии инфицируют и дифференцируются в бактероиды и фиксируют азот. Активация соседних клеток средней коры приводит к образованию меристемы клубенька. [5]