stringtranslate.com

Эшерихия коли O104:H4

Escherichia coli O104:H4 — это энтероагрегационный штамм Escherichia coli бактерии Escherichia coli , ставший причиной вспышки Escherichia coli O104:H4 в 2011 году . [1] Буква «О» в серологической классификации идентифицирует антиген липополисахарида клеточной стенки, а буква «Н» идентифицирует антиген жгутиков.

Анализ геномных последовательностей , полученных BGI Shenzhen, показывает, что штамм O104:H4, вызывающий вспышку, представляет собой энтероагрегативный тип E. coli (EAEC или EAggEC), который приобрел гены токсина Шига , предположительно, в результате горизонтального переноса генов . [2] [3] [4]

Сборка генома и анализ числа копий подтвердили, что две копии кластера генов профага шига-токсина stx2 являются отличительной характеристикой генома вспышки O104:H4. [5] [6] Штамм O104:H4 характеризуется следующими генетическими маркерами: [6] [7]

Комплексный подход Европейской комиссии (ЕК) к безопасности пищевых продуктов [8] определяет случай диареи, вызванной шига-токсин-продуцирующей E. coli (STEC) , вызванной O104:H4, острым началом диареи или кровавой диареей вместе с обнаружением шига-токсин 2 (Stx2) или ген шига stx2 . [9]

До вспышки 2011 года был зарегистрирован только один случай заболевания, идентифицированный как O104:H4, у женщины в Южной Корее в 2005 году. [10]

Патофизиология

E. coli O104 представляет собой кишечную палочку , продуцирующую шига-токсин (STEC). Токсины вызывают заболевание и связанные с ним симптомы, прилипая к клеткам кишечника и повреждая клетки кишечной стенки. [11] [12] Это, в свою очередь, может вызвать кровавый стул. Другим последствием этой бактериальной инфекции является гемолитико-уремический синдром (ГУС), состояние, характеризующееся разрушением эритроцитов, которое в течение длительного периода времени может вызвать почечную недостаточность. [13] Некоторыми распространенными симптомами ГУС являются рвота, кровавый понос и кровь в моче. [12]

Инфекционное заболевание

Распространенный путь заражения E. coli O104:H4 включает употребление в пищу зараженной фекалиями пищи; Таким образом, болезнь можно считать болезнью пищевого происхождения . Совсем недавно, в 2011 году, вспышка штамма O104:H4 в Германии привела к гибели нескольких человек, а сотни были госпитализированы. [14] [15] [12] Немецкие власти связали инфекцию с ростками пажитника , выращенными из зараженных семян, импортированных из Египта, но эти результаты обсуждаются. [ нужна цитата ]

Диагностика

Чтобы диагностировать заражение STEC, стул пациента (кал) можно проверить в лаборатории на наличие шига-токсина. Используемые методы тестирования включают прямое обнаружение токсина с помощью иммуноанализа или обнаружение гена stx2 или других генов факторов вирулентности с помощью ПЦР . Если инфекция STEC подтверждена, можно провести серотипирование штамма E. coli, чтобы определить наличие O104:H4. [11]

Уход

E. coli O104:H4 трудно поддается лечению, поскольку она устойчива ко многим антибиотикам, хотя и чувствительна к карбапенемам . [14]

Профилактика

Распространение кишечной палочки предотвращается простым мытьем рук с мылом, мытьем и гигиеничным приготовлением пищи, а также правильным разогревом/приготовлением пищи, что приводит к уничтожению бактерий. [16]

Рекомендации

  1. ^ Меллман, Александр; Хармсен, Д; Каммингс, Калифорния; и другие. (20 июля 2011 г.). «Проспективная геномная характеристика немецкой энтерогеморрагической вспышки Escherichia coli O104: H4 с помощью технологии быстрого секвенирования следующего поколения». ПЛОС Один . 6 (7): e22751. Бибкод : 2011PLoSO...622751M. дои : 10.1371/journal.pone.0022751 . ПМК 3140518 . ПМИД  21799941. 
  2. ^ «BGI секвенирует геном смертоносной кишечной палочки в Германии и обнаруживает новый супертоксичный штамм» . БГИ . 2011-06-02. Архивировано из оригинала 6 июня 2011 г. Проверено 2 июня 2011 г.
  3. ^ Дэвид Трайб (2 июня 2011 г.). «Новости секвенирования BGI: немецкий штамм EHEC - это химера, созданная путем горизонтального переноса генов». Биология усилена. Архивировано из оригинала 27 мая 2012 г. Проверено 2 июня 2011 г.
  4. ^ Маев Кеннеди и агентства (2 июня 2011 г.). «Вспышка кишечной палочки: ВОЗ заявляет, что бактерия — это новый штамм» . Лондон: Guardian.co.uk . Проверено 4 июня 2011 г.
  5. ^ «BGI публикует полную карту генома немецкой E. coli O104 и относит этот штамм к категории энтероагрегативной Escherichia coli, продуцирующей шига-токсин (STpEAEC)» . БГИ . 16 июня 2011 г. Проверено 20 июня 2011 г.
  6. ^ ab «Анализ количества копий немецкого штамма E. coli EHEC O104: H4» . Университет Иоганна Кеплера в Линце . 11 июня 2011 г. Проверено 15 июня 2011 г.
  7. ^ «Характеристика EHEC O104:H4» (PDF) . Институт Роберта Коха . 03.06.2011. Архивировано из оригинала (PDF) 25 марта 2012 г. Проверено 15 июня 2011 г.
  8. ^ «Комплексный подход ЕС к безопасности пищевых продуктов».
  9. ^ «Определение случая диареи и гемолитико-уремического синдрома, вызванного O104:H4» (PDF) . Европейская комиссия . 03.06.2011 . Проверено 16 июня 2011 г.
  10. ^ Бэ, ВК; Ли, Ю.К.; Чо, М.С.; и другие. (30 июня 2006 г.). «Случай гемолитико-уремического синдрома, вызванного Escherichia coli O104:H4». Медицинский журнал Йонсей . 47 (3): 473–479. дои : 10.3349/ymj.2006.47.3.437. ПМК 2688167 . ПМИД  16807997. 
  11. ^ аб Франк, С; Вербер, Д; Крамер, JP; и другие. (26 октября 2011 г.). «Эпидемический профиль вспышки Escherichia coli O104:H4, продуцирующей шигатоксин, в Германии». Медицинский журнал Новой Англии . 365 (19): 1771–1780. дои : 10.1056/NEJMoa1106483 . PMID  21696328. S2CID  205093464.<http://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMoa1106483>
  12. ^ abc Рейнберг, Стивен. «Немецкий штамм E. Coli, особенно смертельный — инфекционные заболевания: причины, типы, профилактика, лечение и факты на MedicineNet.com». Medicinenet.com. MedicineNet Inc, 22 июня 2011 г. Интернет. 8 ноября 2011 г. <http://www.medicinenet.com/script/main/art.asp?articlekey=146119. Архивировано 18 января 2012 г. на Wayback Machine >.
  13. ^ Европейское управление по безопасности пищевых продуктов. «Э. Coli, продуцирующая шигатоксин (STEC) O104:H4, 2011 г. Вспышки в Европе:». Журнал EFSA. Европейское управление по безопасности пищевых продуктов, 3 ноября 2011 г. Интернет. 8 ноября 2011 г. <http://www.efsa.europa.eu/en/efsajournal/pub/2390>.
  14. ^ Аб Горман, Кристина. «Э. Coli на марше: Scientific American». Новости науки, статьи и информация | Научный американец. Scientific American, 7 августа 2011 г. Интернет. 8 ноября 2011 г. <http://www.scientificamerican.com/article.cfm?id=e-coli-on-the-march>.
  15. ^ «8 июля 2011 г.: Вспышка инфекций E. Coli O104, продуцирующих шига-токсин (STEC O104: H4), связанных с поездками в Германию | E. Coli». Центры по контролю и профилактике заболеваний. Центр по контролю и профилактике заболеваний, 8 июля 2011 г. Интернет. 8 ноября 2011 г. <https://www.cdc.gov/ecoli/2011/ecolio104/>.
  16. ^ «CDC — Escherichia coli O157:H7, Общая информация — NCZVED». Центры по контролю и профилактике заболеваний. Центры по контролю и профилактике заболеваний, 8 июля 2011 г. Интернет. 08 ноября 2011 г.