ПОЛРМТ

Белкокодирующий ген у вида Homo sapiens

ДНК-направленная митохондриальная РНК-полимераза — фермент , который у человека кодируется геном POLRMT . ^{[5] [6]}

Функция

Этот ген кодирует митохондриальную ДНК -направленную РНК-полимеразу . Генный продукт отвечает за экспрессию митохондриального гена, а также за предоставление праймеров РНК для инициации репликации митохондриального генома. Хотя этот полипептид имеет ту же функцию, что и три ядерные ДНК-направленные РНК-полимеразы, он более тесно связан с РНК-полимеразами бактериофага (включая РНК-полимеразу Т7 ), митохондриальными полимеразами низших эукариот , а также хлоропластическими полимеразами RpoT. ^[6]

Состав

Структура фермента раскрыта. Он имеет общую структуру, аналогичную структуре фаговой РНКП, но механизм инициации отличается тем, что ему необходимы факторы инициации TFAM (только у млекопитающих) и TFB2M . ^[7] Для удлинения требуется коэффициент удлинения TEFM. ^[8] Точный процесс завершения менее понятен, но считается, что MTERF1 играет определенную роль. ^[9]

Рекомендации

1. GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000099821 - Ensembl , май 2017 г.
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020329 - Ensembl , май 2017 г.
3. "Ссылка на Human PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
5. Тиранти В., Савойя А., Форти Ф., Д'Аполито М.Ф., Центра М., Рокки М., Зевиани М. (июль 1997 г.). «Идентификация гена, кодирующего митохондриальную РНК-полимеразу человека (h-mtRPOL), путем киберскрининга базы данных Expressed Sequence Tags». Хум Мол Жене . 6 (4): 615–25. дои : 10.1093/хмг/6.4.615 . ПМИД  9097968.
6. «Ген Энтрез: митохондриальная полимераза (РНК) POLRMT (направленная ДНК)» .
7. Хиллен, HS; Морозов Ю.И.; Сарфаллах, А; Темяков Д; Крамер, П. (16 ноября 2017 г.). «Структурная основа инициации митохондриальной транскрипции». Клетка . 171 (5): 1072–1081.e10. дои : 10.1016/j.cell.2017.10.036. ПМК 6590061 . ПМИД  29149603. 
8. Хиллен, Хауке С.; Паршин Андрей Владимирович; Агаронян, Карен; Морозов Ярослав Игоревич; Грабер, Джеймс Дж.; Чернев, Александр; Швинхаммер, Кэтрин; Урлауб, Хеннинг; Аникин, Михаил; Крамер, Патрик; Темяков, Дмитрий (ноябрь 2017 г.). «Механизм антитерминации транскрипции в митохондриях человека». Клетка . 171 (5): 1082–1093.e13. дои : 10.1016/j.cell.2017.09.035. ПМЦ 5798601 . ПМИД  29033127. 
9. Д'Суза, Арканзас; Минчук, М (20 июля 2018 г.). «Митохондриальная транскрипция и трансляция: обзор». Очерки по биохимии . 62 (3): 309–320. дои : 10.1042/EBC20170102. ПМК 6056719 . ПМИД  30030363. 

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8. ПМИД  8125298.
• Сузуки И., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3. ПМИД  9373149.
• Фалькенберг М. , Гаспари М., Рантанен А. и др. (2002). «Митохондриальные факторы транскрипции B1 и B2 активируют транскрипцию мтДНК человека». Нат. Жене . 31 (3): 289–94. дои : 10.1038/ng909. PMID  12068295. S2CID  11164308.
• Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M. дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК  139241 . ПМИД  12477932.
• Маккалок В., Шадель Г.С. (2003). «Человеческий митохондриальный фактор транскрипции B1 взаимодействует с С-концевой областью активации h-mtTFA и стимулирует транскрипцию независимо от его активности РНК-метилтрансферазы». Мол. Клетка. Биол . 23 (16): 5816–24. дои : 10.1128/MCB.23.16.5816-5824.2003. ПМК  166325 . ПМИД  12897151.
• Гримвуд Дж., Гордон Л.А., Олсен А. и др. (2004). «Последовательность ДНК и биология 19 хромосомы человека». Природа . 428 (6982): 529–35. Бибкод : 2004Natur.428..529G. дои : 10.1038/nature02399 . ПМИД  15057824.
• Гразиевич М.А., Лонгли М.Дж., Бинсток Р.Дж. и др. (2004). «Структурно-функциональные дефекты митохондриальной ДНК-полимеразы человека при аутосомно-доминантной прогрессирующей наружной офтальмоплегии ». Нат. Структура. Мол. Биол . 11 (8): 770–6. дои : 10.1038/nsmb805. PMID  15258572. S2CID  12460199.
• Гаспари М., Фалькенберг М., Ларссон Н.Г., Густафссон К.М. (2005). «Митохондриальная РНК-полимераза вносит решающий вклад в специфичность промотора в клетках млекопитающих». ЭМБО Дж . 23 (23): 4606–14. дои : 10.1038/sj.emboj.7600465. ПМК  533051 . ПМИД  15526033.
• Кравченко Ю.Е., Рогозин И.Б., Кунин Е.В., Чумаков П.М. (2005). «Транскрипция информационных РНК млекопитающих с помощью ядерной РНК-полимеразы митохондриального происхождения». Природа . 436 (7051): 735–9. Бибкод : 2005Natur.436..735K. дои : 10.1038/nature03848. ПМК  1352165 . ПМИД  16079853.
• Ван З., Котни Дж., Шадель Г.С. (2007). «Человеческий митохондриальный рибосомальный белок MRPL12 напрямую взаимодействует с митохондриальной РНК-полимеразой, модулируя экспрессию митохондриальных генов». Ж. Биол. Хим . 282 (17): 12610–8. дои : 10.1074/jbc.M700461200 . ПМК  2606046 . ПМИД  17337445.

Внешние ссылки

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : O00411 (ДНК-ориентированная РНК-полимераза человека, митохондриальная (POLRMT)) в PDBe-KB .