ППЭФ1

Белкокодирующий ген у вида Homo sapiens

Серин/треонин-протеинфосфатаза с EF-руками 1 представляет собой фермент , который у человека кодируется геном PPEF1 . ^{[5] [6] [7]}

Функция

Этот ген кодирует члена серин/треонинового протеинфосфатазы с семейством мотивов EF-hand. Белок содержит каталитический домен протеинфосфатазы и по меньшей мере два кальцийсвязывающих мотива EF-hand на С-конце. Хотя его субстрат(ы) неизвестен, предполагается, что кодируемый белок играет роль в специфической функции и/или развитии сенсорных нейронов. Этот ген имеет большое сходство последовательности с геном дегенерации сетчатки сетчатки дрозофилы (rdgC). Описано несколько альтернативно сплайсированных вариантов транскриптов, каждый из которых кодирует отдельную изоформу. ^[7]

Взаимодействия

Было показано, что PPEF1 взаимодействует с кальмодулином 1 . ^[8]

Рекомендации

1. GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000086717 — Ensembl , май 2017 г.
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000062168 — Ensembl , май 2017 г.
3. "Ссылка на Human PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
5. Монтини Э., Ругарли Э.И., Ван де Воссе Э., Андольфи Г., Мариани М., Пука А.А., Консалес Г.Г., ден Даннен Дж.Т., Баллабио А., Франко Б. (июль 1997 г.). «Новая серин-треониновая фосфатаза человека, родственная гену дегенерации сетчатки сетчатки дрозофилы (rdgC), избирательно экспрессируется в сенсорных нейронах происхождения из нервного гребня». Молекулярная генетика человека . 6 (7): 1137–45. дои : 10.1093/hmg/6.7.1137 . ПМИД  9215685.
6. Шерман П.М., Сан Х., Маке Дж.П., Уильямс Дж., Смоллвуд П.М., Натанс Дж. (октябрь 1997 г.). «Идентификация и характеристика консервативного семейства белков серин/треонинфосфатаз, гомологичных дегенерации сетчатки C дрозофилы». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 94 (21): 11639–44. дои : 10.1073/pnas.94.21.11639 . ПМК 23563 . ПМИД  9326663. 
7. «Ген Entrez: протеинфосфатаза PPEF1, кальцийсвязывающий домен 1 EF-hand» .
8. Кутузов М.А., Соловьева О.В., Андреева А.В., Беннетт Н. (май 2002 г.). «Протеиновые Ser/Thr-фосфатазы PPEF взаимодействуют с кальмодулином». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 293 (3): 1047–52. дои : 10.1016/S0006-291X(02)00338-8. ПМИД  12051765.

дальнейшее чтение

• Херциг С., Нойман Дж. (январь 2000 г.). «Влияние серин/треониновых протеинфосфатаз на ионные каналы в возбудимых мембранах». Физиологические обзоры . 80 (1): 173–210. doi :10.1152/physrev.2000.80.1.173. PMID  10617768. S2CID  17770945.
• Хуан X, Хонканен Р.Э. (январь 1998 г.). «Молекулярное клонирование, экспрессия и характеристика новой серин/треониновой протеинфосфатазы человека, PP7, которая гомологична продукту гена дегенерации сетчатки сетчатки дрозофилы (rdgC)». Журнал биологической химии . 273 (3): 1462–8. дои : 10.1074/jbc.273.3.1462 . ПМИД  9430683.
• Рамулу П., Кеннеди М., Сюн В.Х., Уильямс Дж., Коуэн М., Блеш Д., Яу К.В., Херли Дж.Б., Натанс Дж. (декабрь 2001 г.). «Нормальная реакция на свет, целостность фоторецепторов и дефосфорилирование родопсина у мышей, у которых отсутствуют обе протеинфосфатазы с руками EF (PPEF-1 и PPEF-2)». Молекулярная и клеточная биология . 21 (24): 8605–14. дои : 10.1128/MCB.21.24.8605-8614.2001. ПМК  100021 . ПМИД  11713293.
• Кутузов М.А., Соловьева О.В., Андреева А.В., Беннетт Н. (май 2002 г.). «Протеиновые Ser/Thr-фосфатазы PPEF взаимодействуют с кальмодулином». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 293 (3): 1047–52. дои : 10.1016/S0006-291X(02)00338-8. ПМИД  12051765.
• Геварт К., Готалс М., Мартенс Л., Ван Дамм Дж., Стас А., Томас Г.Р., Вандекеркхове Дж. (май 2003 г.). «Изучение протеомов и анализ обработки белков путем масс-спектрометрической идентификации отсортированных N-концевых пептидов». Природная биотехнология . 21 (5): 566–9. дои : 10.1038/nbt810. PMID  12665801. S2CID  23783563.
• Хиллман Р.Т., Грин Р.Э., Бреннер С.Е. (2005). «Недооцененная роль надзора за РНК». Геномная биология . 5 (2): С8. дои : 10.1186/gb-2004-5-2-r8 . ПМЦ  395752 . ПМИД  14759258.
• Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хиродзан-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С., Лламосас Е., Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж., Зогби Х.И., Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. (октябрь 2005 г.). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R. дои : 10.1038/nature04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.