ПРКД2

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Серин/треонин-протеинкиназа D2 или PKD2 — это фермент , который у людей кодируется геном PRKD2 . ^{[5] [6] [7]}

Функция

Белок, кодируемый этим геном, принадлежит к семейству протеинкиназы D (PKD) сериновых / треониновых протеинкиназ, подсемейству протеинкиназы C. Эта киназа может активироваться форболовыми эфирами , а также гастрином через рецептор холецистокинина B (CCKBR) в клетках рака желудка. Она может связываться с диацилглицерином (DAG) в транс-Гольджи сети (TGN) и может регулировать выход базолатерального мембранного белка из TGN. Альтернативный сплайсинг приводит к множественным вариантам транскриптов, кодирующим различные изоформы. ^[7]

Ссылки

1. GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000105287 – Ensembl , май 2017 г.
2. GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000041187 – Ensembl , май 2017 г.
3. "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
4. "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
5. Zhang QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J, Hu GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (ноябрь 2000 г.). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее не определенных генов, экспрессируемых в гемопоэтических стволовых/прогениторных клетках CD34+». Genome Res . 10 (10): 1546–60. doi :10.1101/gr.140200. PMC 310934. PMID  11042152. 
6. Sturany S, Van Lint J, Muller F, Wilda M, Hameister H, Hocker M, Brey A, Gern U, Vandenheede J, Gress T, Adler G, Seufferlein T (май 2001 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика человеческой протеинкиназы D2. Новый представитель семейства протеинкиназы D сериновых треониновых киназ». J Biol Chem . 276 (5): 3310–8. doi : 10.1074/jbc.M008719200 . PMID  11062248.
7. "Ген Энтреза: протеинкиназа D2 PRKD2".

Дальнейшее чтение

• Стурани С, Ван Линт Дж, Гилкрист А и др. (2002). «Механизм активации протеинкиназы D2(PKD2) рецептором CCK(B)/гастрина». J. Biol. Chem . 277 (33): 29431–6. doi : 10.1074/jbc.M200934200 . PMID  12058027.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
• Rey O, Yuan J, Rozengurt E (2003). «Внутриклеточное перераспределение протеинкиназы D2 в ответ на агонисты рецепторов, связанных с G-белком». Biochem. Biophys. Res. Commun . 302 (4): 817–24. doi :10.1016/S0006-291X(03)00269-9. PMID  12646243.
• Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных человеческих кДНК». Nat. Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID  14702039.
• Yeaman C, Ayala MI, Wright JR и др. (2004). «Протеинкиназа D регулирует выход базолатерального мембранного белка из транс-сети Гольджи». Nat. Cell Biol . 6 (2): 106–12. doi :10.1038/ncb1090. PMC 3372901.  PMID 14743217  .
• Mihailovic T, Marx M, Auer A и др. (2005). «Протеинкиназа D2 опосредует активацию ядерного фактора kappaB с помощью Bcr-Abl в клетках миелоидной лейкемии человека Bcr-Abl+». Cancer Res . 64 (24): 8939–44. doi : 10.1158/0008-5472.CAN-04-0981 . PMID  15604256.
• Parra M, Kasler H, McKinsey TA и др. (2005). «Протеинкиназа D1 фосфорилирует HDAC7 и индуцирует его ядерный экспорт после активации рецептора Т-клеток». J. Biol. Chem . 280 (14): 13762–70. doi : 10.1074/jbc.M413396200 . PMID  15623513.
• Auer A, von Blume J, Sturany S и др. (2006). «Роль регуляторного домена протеинкиназы D2 в связывании форболового эфира, каталитической активности и ядерно-цитоплазматическом челноке». Mol. Biol. Cell . 16 (9): 4375–85. doi :10.1091/mbc.E05-03-0251. PMC  1196345. PMID  15975900 .
• Kim JE, Tannenbaum SR, White FM (2005). «Глобальный фосфопротеом клеток аденокарциномы толстой кишки человека HT-29». J. Proteome Res . 4 (4): 1339–46. doi :10.1021/pr050048h. PMID  16083285.
• Кимура К, Вакамацу А, Сузуки Й и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: крупномасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов человеческих генов». Genome Res . 16 (1): 55–65. doi :10.1101/gr.4039406. PMC  1356129. PMID  16344560 .
• Jackson LN, Li J, Chen LA и др. (2006). «Сверхэкспрессия PKD2 дикого типа приводит к повышенной пролиферации и инвазии эндокринных клеток BON». Biochem. Biophys. Res. Commun . 348 (3): 945–9. doi :10.1016/j.bbrc.2006.07.142. PMC  2430871 . PMID  16899224.
• Chiu TT, Leung WY, Moyer MP и др. (2007). «Протеинкиназа D2 опосредует продукцию интерлейкина 8, индуцированную лизофосфатидной кислотой, в нетрансформированных эпителиальных клетках толстой кишки человека через NF-kappaB». Am. J. Physiol., Cell Physiol . 292 (2): C767–77. doi :10.1152/ajpcell.00308.2006. PMID  16928771. S2CID  2220790.
• Irie A, Harada K, Tsukamoto H и др. (2007). «Протеинкиназа D2 способствует либо регуляции промотора IL-2, либо индукции гибели клеток при стимуляции TCR в зависимости от ее активности в клетках Jurkat». Int. Immunol . 18 (12): 1737–47. doi : 10.1093/intimm/dxl108 . PMID  17077180.
• Olsen JV, Blagoev B, Gnad F и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Cell . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID  17081983. S2CID  7827573.
• Kollers S, Musilova P, Rubes J, Rocha D (2007). "Сравнительное картирование выявляет множественные перестройки между хромосомой 6 свиньи и 19q13 человека". Anim. Genet . 37 (6): 595–6. doi :10.1111/j.1365-2052.2006.01516.x. PMID  17121608.
• Wissing J, Jänsch L, Nimtz M и др. (2007). «Протеомный анализ протеинкиназ с помощью селективного предварительного фракционирования целевых классов и тандемной масс-спектрометрии». Mol. Cell. Proteomics . 6 (3): 537–47. doi : 10.1074/mcp.T600062-MCP200 . hdl : 10033/19756 . PMID  17192257.