PROSITE — это база данных белков . [1] [2] Он состоит из записей, описывающих семейства белков , домены и функциональные сайты , а также структуры и профили аминокислот в них. Они вручную курируются командой Швейцарского института биоинформатики и тесно интегрированы в аннотацию белков Swiss-Prot . PROSITE был создан в 1988 году Амосом Байрохом , руководившим группой более 20 лет. С июля 2018 года директором PROSITE и Swiss-Prot является Алан Бридж.
Использование PROSITE включает идентификацию возможных функций недавно открытых белков и анализ известных белков на предмет ранее неопределенной активности. Свойства хорошо изученных генов могут быть переданы биологически родственным организмам, а для различных или плохо изученных генов можно предсказать биохимические функции на основе сходства. PROSITE предлагает инструменты для анализа последовательностей белков и обнаружения мотивов (см. Мотив последовательности , Паттерны PROSITE ). Он является частью серверов протеомного анализа ExPASy .
База данных ProRule основана на описаниях доменов PROSITE. [3] Он предоставляет дополнительную информацию о функционально или структурно важных аминокислотах. Правила содержат информацию о биологически значимых остатках, таких как активные центры, сайты связывания субстрата или кофактора , сайты посттрансляционной модификации или дисульфидные связи, чтобы помочь в определении функции. Они могут автоматически генерировать аннотации на основе мотивов PROSITE.
По состоянию на 26 февраля 2022 года [обновлять]версия 2022_01 содержит 1902 записи документации, 1311 шаблонов, 1336 профилей и 1352 ProRules.