stringtranslate.com

Празинофит

Празинофиты — группа одноклеточных зеленых водорослей . [3] К празинофитам относятся преимущественно морские планктонные виды, а также некоторые пресноводные представители. [3] [4] Празинофиты морфологически разнообразны, включая жгутиконосцы с одним-восемью жгутиками и неподвижные (кокковидные) одноклеточные. Клетки многих видов покрыты органическими чешуйками; другие голые. [4] Хорошо изученные роды включают Ostreococcus , считающийся самым маленьким (около 0,95 мкм ) свободноживущим эукариотом , [5] и Micromonas , оба из которых встречаются в морских водах по всему миру. Празинофиты имеют простую клеточную структуру, содержащую один хлоропласт и одну митохондрию . Геномы относительно малы по сравнению с другими эукариотами (около 12 МБП для Ostreococcus [ 6] [7] и 21 МБП для Micromonas [8] ). По крайней мере, один вид, антарктическая форма Pyramimonas gelidicola , способен к фагоцитозу и, следовательно, является миксотрофной водорослью. [9]

Некоторые авторы рассматривают празинофиты как полифилетическую группировку зеленых водорослей разных клад. Поскольку Tetraphytina появилась в составе Prasinophytes, недавно авторы включили ее, сделав ее монофилетической и эквивалентной хлорофитам. [10] [11]

Экология

Исследование разнообразия последовательностей фотосинтетических генов ( rbcL ) в Мексиканском заливе показало, что празинофиты особенно распространены в зоне подземного максимума хлорофилла (SCM) [12] , и в окружающей среде было обнаружено несколько различных экотипов Ostreococcus . [13] Считалось, что эти экотипы отличаются в окружающей среде своей адаптацией к интенсивности света. O. lucimarinus был изолирован в условиях яркого освещения [14] и наблюдался круглый год в прибрежной части северной части Тихого океана. [15] RCC141 считался слабоосвещенным, поскольку он был изолирован из нижней эвфотической зоны . Позже было показано, что эти штаммы или экотипы обитают в разных средах обитания (открытый океан или мезотрофные), и их распространение, по-видимому, не связано с доступностью света. [16] O. tauri был выделен из прибрежной лагуны и, по-видимому, является светополивалентным. Генетические данные показывают, что между обнаруженными различными экотипами существуют явные молекулярные различия. [17]

Празинофиты подвержены заражению крупными двухцепочечными ДНК-вирусами, принадлежащими к роду Prasinovirus семейства Phycodnaviridae , [18] [19] [20] , а также реовирусом . [21] Было подсчитано, что от 2 до 10% популяции Micromonas pusilla лизируется вирусами в день. [22]

Филогения

Недавние исследования подтверждают, что празинофиты не являются естественной группой, поскольку являются сильно парафилетическими . [4] [23] [24] [25] Отношения между группами, составляющими Chlorophyta, до конца не решены. Кладограмма , полученная Leliaert et al. 2011 [4] и некоторые модификации согласно Silar 2016, [26] Leliaert 2016 [27] и Lopes dos Santos et al. 2017 [1] показан ниже. Группы , заштрихованные синим цветом , традиционно относят или относили к Prasinophyceae [3] ). Было показано , что вид Mesostigma viride является представителем Streptophyta или базальных зеленых водорослей. Остальные относятся к Chlorophyta .

В статье 2020 года Palmophyllophyceae (клад VI празинофитов) помещен в новый тип помимо Chlorophyta и Streptophyta, Prasinodermophyta . [28]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ ab Лопес Дос Сантос А, Поллина Т, Гурвиль П, Корре Э, Мари Д, Гарридо ХЛ, Родригес Ф, Ноэль МХ, Воло Д, Эйкрем В (октябрь 2017 г.). «Chloropicophyceae, новый класс пикофитопланктонных празинофитов». Научные отчеты . 7 (1): 14019. Бибкод : 2017NatSR...714019L. дои : 10.1038/s41598-017-12412-5. ПМК  5656628 . ПМИД  29070840.
  2. ^ Линьчжоу Ли; Сибо Ван; Хунли Ван; Сунил Кумар Саху; Биргер Марин; Хаоюань Ли; Ян Сюй; Хунпин Лян; Чжэнь Ли; Шифэн Чен; Таня Редер; Зехра Чеби; Себастьян Виттек; Мортен Петерсен; Барбара Мелконян; Хунли Ду; Хуаньмин Ян; Цзянь Ван; Гейн Ка-Шу Вонг; Сюнь Сюй; Синь Лю; Ив Ван де Пер; Михаил Мелконян; Хуань Лю (22 июня 2020 г.). «Геном Prasinodermacoloniale раскрывает существование третьего типа зеленых растений». Экология и эволюция природы . 4 (9): 1220–1231. дои : 10.1038/s41559-020-1221-7. ПМЦ 7455551 . ПМИД  32572216. 
  3. ^ abc Sym, SD и Pienaar, RN 1993. Класс Prasinophyceae. В Раунде, Ф.Е. и Чепмен, DJ (ред.) Progress in Phycological Research , Vol. 9. Biopress Ltd., Бристоль, стр. 281-376.
  4. ^ abcd Лелиарт Ф., Вербрюгген Х., Зехман Ф.В. (сентябрь 2011 г.). «В глубину: новые открытия в основе филогении зеленых растений». Биоэссе . 33 (9): 683–92. doi :10.1002/bies.201100035. PMID  21744372. S2CID  40459076.
  5. ^ Кортис С., Вакер А., Трусселье М., Лотье Дж., Кретьенно-Дине М.Дж., Неве Дж. и др. (1994). «Маленький эукариотический организм». Природа . 370 (6487): 255. Бибкод : 1994Natur.370..255C. дои : 10.1038/370255a0 .
  6. ^ Дерелль Э, Ферраз С, Ромбо С, Рузе П, Уорден АЗ, Роббенс С, Партенски Ф, Дегроев С, Эшенье С, Кук Р, Саис Ю, Вуйтс Дж, Джаббари К, Боулер С, Пано О, Пьегу Б, Болл С.Г., Рал Дж.П., Буже Ф.Ю., Пигано Г., Де Баетс Б., Пикард А., Дельсени М., Демайль Дж., Ван де Пер Ю., Моро Х. (август 2006 г.). «Анализ генома самого маленького свободноживущего эукариота Ostreococcus tauri раскрывает множество уникальных особенностей». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 103 (31): 11647–52. Бибкод : 2006PNAS..10311647D. дои : 10.1073/pnas.0604795103 . ПМЦ 1544224 . ПМИД  16868079. 
  7. ^ Паленик Б., Гримвуд Дж., Аэртс А., Рузе П., Саламов А., Патнэм Н. и др. (май 2007 г.). «Крошечный эукариот Ostreococcus дает геномное представление о парадоксе видообразования планктона». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 104 (18): 7705–10. Бибкод : 2007PNAS..104.7705P. дои : 10.1073/pnas.0611046104 . ПМК 1863510 . ПМИД  17460045. 
  8. ^ Уорден А.З., Ли Дж.Х., Мок Т., Рузе П., Симмонс М.П., ​​Аэртс А.Л. и др. (апрель 2009 г.). «Зеленая эволюция и динамические адаптации, выявленные геномами морских пикоэукариот Micromonas». Наука . 324 (5924): 268–72. Бибкод : 2009Sci...324..268W. дои : 10.1126/science.1167222. PMID  19359590. S2CID  206516961.
  9. ^ Миксотрофия антарктической фитофлагелляты Pyramimonas gelidicola (Chlorophyta: Prasinophyceae)
  10. ^ Теватия Р., Ойлер Г.А. (2 января 2018 г.). «Эволюция DDB1-связывающего WD40 (DWD) у viridiplantae». ПЛОС ОДИН . 13 (1): e0190282. Бибкод : 2018PLoSO..1390282T. дои : 10.1371/journal.pone.0190282 . ПМЦ 5749748 . ПМИД  29293590. 
  11. ^ Роквелл, Северная Каролина, Мартин СС, Ли Ф.В., Мэтьюз С., Лагариас Дж.К. (май 2017 г.). «Фикоцианобилиновый хромофор фитохромов водорослей стрептофитов синтезируется HY2». Новый фитолог . 214 (3): 1145–1157. дои : 10.1111/nph.14422. ПМЦ 5388591 . ПМИД  28106912. 
  12. ^ Ваврик Б., Пол Дж. Х., Кэмпбелл Л., Гриффин Д., Хоучин Л., Фуэнтес-Ортега А., Мюллер-Каргер Ф. (2003). «Вертикальная структура сообщества фитопланктона, связанная с прибрежным шлейфом в Мексиканском заливе». Серия «Прогресс в области морской экологии ». 251 : 87–101. Бибкод : 2003MEPS..251...87W. дои : 10.3354/meps251087 .
  13. ^ Гийу Л., Эйкрем В., Кретьенно-Дине М.Дж., Ле Галль Ф., Массана Р., Ромари К., Педрос-Алио С., Вало Д. (июнь 2004 г.). «Разнообразие пикопланктонных празинофитов, оцененное с помощью прямого ядерного секвенирования рДНК SSU образцов окружающей среды и новых изолятов, полученных из океанических и прибрежных морских экосистем». Протист . 155 (2): 193–214. дои : 10.1078/143446104774199592. PMID  15305796. S2CID  15859454.
  14. ^ Уорден А.З., Нолан Дж.К., Паленик Б. (2004). «Оценка динамики и экологии морского пикофитопланктона: важность эукариотического компонента». Лимнология и океанография . 49 (1): 168–179. Бибкод : 2004LimOc..49..168W. дои : 10.4319/lo.2004.49.1.0168.
  15. ^ Уорден, АЗ (2006). «Разнообразие пикоэукариот в прибрежных водах Тихого океана» (PDF) . Водная микробная экология . 43 (2): 165–175. дои : 10.3354/ame043165 .
  16. ^ Демир-Хилтон Э, Судек С, Кувелье МЛ, Гентеманн КЛ, Зер Дж. П., Уорден АЗ (июль 2011 г.). «Глобальные закономерности распределения отдельных клад фотосинтезирующего пикоукариота Ostreococcus». Журнал ISME . 5 (7): 1095–107. дои : 10.1038/ismej.2010.209. ПМК 3146286 . ПМИД  21289652. 
  17. ^ Родригес Ф, Дерель Э, Гийу Л, Ле Галль Ф, Воло Д, Моро Х (июнь 2005 г.). «Экотипическое разнообразие морских пикоэукариот Ostreococcus (Chlorophyta, Prasinophyceae)». Экологическая микробиология . 7 (6): 853–9. дои : 10.1111/j.1462-2920.2005.00758.x. ПМИД  15892704.
  18. ^ Майер Дж. А., Тейлор Ф. Дж. (1979). «Вирус, лизирующий морские нанофлагелляты, Micromonas pusilla».". Nature . 281 (5729): 299–301. Бибкод : 1979Natur.281..299M. doi : 10.1038/281299a0. S2CID  4269889.
  19. ^ Коттрелл, М.Т., Саттл, Калифорния (1991). «Широко распространенное распространение и клональная изменчивость вирусов, вызывающих лизис космополитного эукариотического морского фитопланктера «Micromonas pusilla»». Серия «Прогресс в области морской экологии ». 78 : 1–9. Бибкод : 1991MEPS...78....1C. дои : 10.3354/meps078001 .
  20. ^ Беллек Л., Гримсли Н., Дерелл Э., Моро Х., Дедевайсес Ю. (апрель 2010 г.). «Численность, пространственное распределение и генетическое разнообразие вирусов Ostreococcus tauri в двух разных средах». Отчеты по экологической микробиологии . 2 (2): 313–21. дои : 10.1111/j.1758-2229.2010.00138.x. ПМИД  23766083.
  21. ^ Аттуи Х, Джаафар FM, Белуше М, де Микко П, де Ламбаллери X, Brussaard CP (май 2006 г.). «Реовирус Micromonas pusilla: новый член семейства Reoviridae, отнесенный к новому предлагаемому роду (Mimoreovirus)». Журнал общей вирусологии . 87 (Часть 5): 1375–83. дои : 10.1099/vir.0.81584-0 . ПМИД  16603541.
  22. ^ Коттрелл, М.Т., Саттл, Калифорния (1 июня 1995 г.). «Динамика литического вируса, заражающего фотосинтезирующую морскую пикофлагелляту «Micromonas pusilla»". Лимнология и океанография . 40 (4): 730–739. Бибкод : 1995LimOc..40..730C. CiteSeerX  10.1.1.517.2324 . doi : 10.4319/lo.1995.40.4.0730. ISSN  1939-5590.
  23. ^ Льюис Л.А., МакКорт Р.М. (октябрь 2004 г.). «Зеленые водоросли и происхождение наземных растений». Американский журнал ботаники . 91 (10): 1535–56. дои : 10.3732/ajb.91.10.1535. ПМИД  21652308.
  24. ^ Беккер Б, Марин Б (май 2009 г.). «Стрептофитные водоросли и происхождение эмбриофитов». Анналы ботаники . 103 (7): 999–1004. doi : 10.1093/aob/mcp044. ПМК 2707909 . ПМИД  19273476. 
  25. ^ Марин Б (сентябрь 2012 г.). «Вложенные в Chlorellales или независимый класс? Филогения и классификация Pedinophyceae (Viridiplantae), выявленная с помощью молекулярного филогенетического анализа полных ядерных и пластидно-кодируемых оперонов рРНК». Протист . 163 (5): 778–805. doi :10.1016/j.protis.2011.11.004. ПМИД  22192529.
  26. ^ Силар, Филипп (2016), «Protistes Eucaryotes: Origine, Evolution et Biologie des Microbes Eucaryotes», HAL Archives-ouvertes : 1–462
  27. ^ Лелиарт Ф., Тронхольм А., Лемье С., Турмель М., ДеПрист М.С., Бхаттачарья Д., Кароль К.Г., Фредерик С., Зехман Ф.В., Лопес-Баутиста Дж.М. (май 2016 г.). «Филогеномный анализ хлоропластов выявил самую глубокую разветвленную линию Chlorophyta, класса Palmophyllophyceae. nov». Научные отчеты . 6 (1): 25367. Бибкод : 2016NatSR...625367L. дои : 10.1038/srep25367. ПМК 4860620 . ПМИД  27157793. 
  28. ^ Линьчжоу Ли; Сибо Ван; Хунли Ван; Сунил Кумар Саху; Биргер Марин; Хаоюань Ли; Ян Сюй; Хунпин Лян; Чжэнь Ли; Шифэн Чен; Таня Редер; Зехра Чеби; Себастьян Виттек; Мортен Петерсен; Барбара Мелконян; Хунли Ду; Хуаньмин Ян; Цзянь Ван; Гейн Ка-Шу Вонг; Сюнь Сюй; Синь Лю; Ив Ван де Пер; Михаил Мелконян; Хуань Лю (22 июня 2020 г.). «Геном Prasinodermacoloniale раскрывает существование третьего типа зеленых растений». Экология и эволюция природы . 4 (9): 1220–1231. дои : 10.1038/s41559-020-1221-7 . ПМЦ 7455551 . ПМИД  32572216. 

Внешние ссылки