stringtranslate.com

Международный кодекс номенклатуры прокариотов

Международный кодекс номенклатуры прокариот ( ICNP ) или Прокариотический кодекс , ранее известный как Международный кодекс номенклатуры бактерий ( ICNB ) или Бактериологический кодекс ( BC ), регулирует научные названия бактерий и архей . [1] [2] Обозначает правила наименования таксонов бактерий в соответствии с их относительным рангом. Как таковой это один из номенклатурных кодов биологии .

Первоначально Международный кодекс ботанической номенклатуры касался бактерий, и в нем сохранялись ссылки на бактерии до тех пор, пока они не были исключены на Международном ботаническом конгрессе 1975 года . Ранний Кодекс номенклатуры бактерий был одобрен на 4-м Международном конгрессе по микробиологии в 1947 году, но позже был отменен.

Последней версией, напечатанной в виде книги, является редакция 1990 года [3] , но книга не отражает действующие правила. Редакции 2008 и 2022 годов были опубликованы в Международном журнале систематической и эволюционной микробиологии (IJSEM). [2] Правила поддерживаются Международным комитетом по систематике прокариотов (ICSP; бывший Международный комитет по систематической бактериологии, ICSB).

Базой для названий бактерий являются Утвержденные списки [4] с отправной точкой в ​​1980 году. Новые названия бактерий рассматриваются ICSP как соответствующие Правилам номенклатуры и публикуются в IJSEM .

Цианобактерии

С 1975 года большинство бактерий подпадало под бактериологический код. Однако цианобактерии по-прежнему подпадали под действие ботанического кодекса. Начиная с 1999 года, цианобактерии были включены как в ботанический, так и в бактериологический кодексы. Эта ситуация вызвала номенклатурные проблемы для цианобактерий. [5] [6] К 2020 году появилось три предложения по разрешению ситуации:

  1. Исключить цианобактерии из бактериологического кода. [7]
  2. Примените бактериологический код ко всем цианобактериям. [8]
  3. Считайте действительную публикацию по ботаническому кодексу как действительную публикацию по бактериологическому кодексу. [9]

В 2021 году ICSP провел официальное голосование по трем предложениям, и был выбран третий вариант. [10]

Тип штамма

С 2001 года при описании нового вида бактерий или архей необходимо обозначать типовой штамм. [11] Типовой штамм представляет собой живую культуру, к которой формально прикреплено научное название этого организма. Чтобы новое название вида было действительно опубликовано, типовой штамм должен быть депонирован в общественной коллекции культур как минимум в двух разных странах. [12] До 2001 года вид также можно было типизировать с помощью описания, сохранившегося экземпляра или иллюстрации. [11] Для каждого вида прокариот существует один тип штамма, но разные коллекции культур могут давать уникальное название одному и тому же штамму. Например, типовой штамм E. coli (первоначально штамм U5/41) называется ATCC 11775 Американской коллекцией типовых культур , DSM 30083 Немецкой коллекцией микроорганизмов и клеточных культур , JCM 1649 Японской коллекцией микроорганизмов и LMG 2092 Бельгийской координированной коллекции микроорганизмов . [13] [14] Если вид прокариот не может быть культивирован в лаборатории (и, следовательно, не может быть депонирован в коллекции культур), ему может быть присвоено предварительное название «кандидат» , но это не считается действительно опубликованным. [15]

Версии

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ «Дом». the-icsp.org .
  2. ^ ab PHA Sneath, 2003. Краткая история URL-адреса бактериологического кода. Архивировано 24 мая 2012 г. в Wayback Machine.
  3. ^ Лапаж, SP; Снит, PHA; Лессель, Э.Ф.; Скерман, ВБД; Силигер, HPR; Кларк, Вашингтон (5 марта 1992 г.). Правила номенклатуры с рекомендациями. ASM Press – через ncbi.nlm.nih.gov.
  4. ^ VBD Скерман, Вики Макгоуэн и PHA Снит, 1989. Утвержденные списки названий бактерий, исправленное издание, Вашингтон (округ Колумбия): ASM Press .
  5. ^ Орен, А. (2011). «Систематика и номенклатура цианобактерий, представленная в Международном бюллетене бактериологической номенклатуры и таксономии / Международном журнале систематической бактериологии / Международном журнале систематической и эволюционной микробиологии». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 61 (1): 10–15. дои : 10.1099/ijs.0.018838-0 . PMID  21097637. S2CID  206169872.
  6. ^ Орен А., Вентура С. (2017). «Современное состояние номенклатуры цианобактерий по «прокариотическому» и «ботаническому» коду». Антони ван Левенгук . 110 (10): 1257–1269. дои : 10.1007/s10482-017-0848-0. PMID  28243951. S2CID  23489558.
  7. ^ Орен А., генеральный директор Гаррити. (2014). «Предложение об изменении Общего соображения 5 и Принципа 2 Международного кодекса номенклатуры прокариот». Int J Syst Evol Microbiol . 64 (1): 309–10. дои : 10.1099/ijs.0.059568-0. ПМИД  24408952.
  8. ^ Пиневич А.В. (2015). «Предложение последовательно применять Международный кодекс номенклатуры прокариот (ICNP) к названиям оксигенных фотосинтезирующих бактерий (цианобактерий), включая те, которые действительно опубликованы в соответствии с Международным кодексом ботанической номенклатуры (ICBN)/Международным кодексом номенклатуры водорослей, грибов и растений (ICN) и предложение изменить Принцип 2 ICNP». Int J Syst Evol Microbiol . 65 (3): 1070–4. дои : 10.1099/ijs.0.000034 . ПМИД  25505344.
  9. ^ Орен А. (2020). «Три альтернативных предложения о внесении изменений в Правила Международного кодекса номенклатуры прокариот для урегулирования статуса цианобактерий в прокариотической номенклатуре». Int J Syst Evol Microbiol . 70 (7): 4406–4408. дои : 10.1099/ijsem.0.004268 . PMID  32602831. S2CID  220270571.
  10. ^ Орен А., Арахал Д.Р., Росселло-Мора Р., Сатклифф IC, Мур ERB. (2021). «Поправка к общим соображениям 5 и правилам 18a, 24a и 30 Международного кодекса номенклатуры прокариот для определения статуса цианобактерий в номенклатуре прокариот». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 71 (8): 004939. doi : 10.1099/ijsem.0.004939 . PMID  34342563. S2CID  236884663.
  11. ^ ab Прокариотический Кодекс (редакция 2008 г.), Правило 18a.
  12. ^ Кодекс прокариот (редакция 2008 г.), Правило 30.
  13. ^ Эзеби JP, Парте AC. "Кишечная палочка". Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) . Проверено 21 июня 2022 г.
  14. ^ Реймер LC, Сарда Карбасс Дж., Коблиц Дж., Эбелинг С., Подставка А., Оверманн Дж. «Escherichia coli U5/41». БакДайв . Проверено 21 июня 2022 г.
  15. ^ Кодекс прокариот (редакция 2008 г.), Приложение 11.

Внешние ссылки