stringtranslate.com

Пропионигениум модестум

Propionigenium modestum — вид грамотрицательных , строго анаэробных бактерий. [1] Он имеет форму палочки и размер около 0,5–0,6 x 0,5–2,0 мкм. [1] Он важен для выяснения механизма АТФ-синтазы .

Этимология

Слово propionigenium происходит от латинского слова acidum propionicum, что означает пропионовая кислота, а gener — от латинского слова «делать» или «производить». [1] Modestus происходит от латинского слова, означающего «скромный», что относится к чрезвычайно скромному типу метаболизма. [1]

Таксономическая информация

Текущая классификация Propionigenium modestum — Bacteria, Fusobacteria, Fusobacteria, Fusobacteriales, Fusobacteriaceae, Propionigenium, Modestum. Propionigenium modestum  и  Propionigenium maris в настоящее время являются единственными двумя видами, принадлежащими к роду  Propionigenium . [2] Оба они обитают в морской среде. [3] Было обнаружено, что P. modestum  более тесно связан с  Ilyobacter insuetus  , чем с  P. maris.  P. modestum и I. insuetus разделяют 97±4 - 98±5% 16S рРНК (рибосомальная рибонуклеиновая кислота) , в то время как P. modestum и P. maris разделяют только 96±5 - 96±8%. [4] Только два вида в семействе Fusobacteriaceae полностью секвенировали свои геномы; один из них — llyobacter polytropus . [5]

Открытие

P. modestum был выделен Бернхардом Шинком и Норбертом Пфеннингом в 1982 году. [ 1] Впервые он был выделен из черной анаэробной грязи из Канале Гранде в Венеции, Италия, а затем был выделен из человеческой слюны. [1] Первоначальная изоляция P. modestum была получена с помощью сукцинатной среды, которая использовалась в качестве основного источника энергии. Сообщалось, что на каждый моль сукцината, который был ферментирован P. modesetum , было от 2,1 до 2,4 граммов сухого веса клеток, выделенных из среды. [1]

Характеристики

P. modestum — неспороносная и неподвижная бактерия . [1] Оптимум ее роста — pH 7,1–7,7 и температура 33 °C. [1] Содержание G+C составляет 33,9%. [1] Для роста она использует сукцинат, фумарат, малат, аспартат, оксалоацетат и пируват, а также ферментирует их до пропионата (ацетата) и углекислого газа (CO2 ) . [1] Этот организм оптимально растет в пресной и соленой воде, а также в слюне человека в анаэробных условиях. [1] Propionigenium modestum преобразует сукцинат (а также другие источники энергии) в пропионат для получения энергии. [6] Преобразование имеет небольшое изменение свободной энергии, поэтому нет цепи переноса электронов или связанного с субстратом фосфорилирования. [1]

Важность

АТФазы F-типа (аденилпирофосфатаза) обычно используют протоны в качестве единственного связывающего иона, но АТФаза F1F0 из Propionigenium modestum является первой обнаруженной, которая использует ионы натрия (Na + ) . [7] [8]

Открытие АТФазы в P. modestum важно, поскольку оно продемонстрировало, что теория хемиосмоса , предложенная Питером Д. Митчеллом, была неверной. Митчелл предположил, что H + потребляется в синтезе АТФ путем прямой реакции с O 2 , преобразуя его в H 2 O, при этом производя АТФ из АДФ. [9] Вместо этого АТФаза F-типа P. modestum использует только Na + для управления реакцией, демонстрируя, что производство H 2 O из O 2 во время синтеза АТФ не потребляет H + , используемый всеми другими известными АТФазами F-типа. [7] Таким образом, демонстрируя, что именно градиент H + управляет АТФ-синтазой .

Активность

АТФаза P. modestum действует примерно в 6 раз сильнее, чем бактериальные мембраны, при 6,6 единицах/мг белка. [10] АТФаза состоит из субъединиц a, b и c. Было обнаружено, что субъединица c чрезвычайно стабильна и не диссоциирует во время электрофореза в геле SDS (додецилсульфат натрия) до 120 °C. [10]

Ссылки

  1. ^ abcdefghijklm Шинк, Бернхард; Пфенниг, Норберт (1982). "Propionigenium Modestum Gen. Nov. Sp. Nov. новая строго анаэробная, неспорообразующая бактерия, растущая на сукцинате" (PDF) . Архив микробиологии . 133 (3): 209–216. doi :10.1007/bf00415003. S2CID  12948118.
  2. ^ Шинк, Бернхард (2006). «Род Propionigenium». Прокариоты . 7 : 955–959. дои : 10.1007/0-387-30747-8_41. ISBN 9780387254975.
  3. ^ Янссен, Питер Х.; Лизак, Вернер (1995). «Декарбоксилирование сукцината Propionigenium maris sp. nov., новой анаэробной бактерией из эстуарного осадка». Arch Microbiol . 164 (1): 29–35. doi :10.1007/s002030050232. PMID  7646317.
  4. ^ Брюн, Андреас; Людвиг, Вольфганг; Кайм, Георг; Шинк, Бернхард; Эверс, Стефан (2002). «Ilyobacter insuetus Sp. Nov., ферментативная бактерия, специализирующаяся на деградации гидроароматических соединений». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 52 (2): 429–432. doi : 10.1099/00207713-52-2-429 . PMID  11931152.
  5. ^ Сикорский, Йоханнес; Чертков, Ольга; Лапидус, Алла; и др. (2010). «Полная последовательность генома штамма типа Ilyobacter polytropus (CuHbu1T)». Стандарты в геномных науках . 3 (3): 304–314. doi : 10.4056 /sigs.1273360. PMC 3035301. PMID  21304735. 
  6. ^ Хильперт, Вильгельм; Шинк, Бернхард; Димрот, Питер (1984). «Жизнь по новому механизму сохранения энергии, зависящему от декарбоксилирования, с Na+ в качестве связывающего иона». Журнал EMBO . 3 (8): 1655–1670. doi :10.1002/j.1460-2075.1984.tb02030.x. PMC 557580. PMID  16453537 . 
  7. ^ ab Laubinger, Werner; Dimroth, Peter (1988). "Характеристика АТФ-синтазы Propionigenium modestum как первичного натриевого насоса". Биохимия . 27 (19): 7531–7537. doi :10.1021/bi00419a053. PMID  2905167. Werner Laubinger и Peter Dimroth
  8. ^ Кайм, Георг (2001). «Na-транслоцирующая F1F0 АТФ-синтаза Propionigenium Modestum: механохимические идеи о моторе F0, который управляет синтезом АТФ». Биоэнергетика . 1505 (1): 94–107. doi : 10.1016/s0005-2728(00)00280-2 . PMID  11248192.
  9. ^ Митчелл, Питер Д. (1974). «Хемиосмотический молекулярный механизм для протон-транслоцирующих аденозинтрифосфатаз». FEBS Lett . 43 (2). Амстердам: North Holland Publishing Company: 189–94. doi : 10.1016/0014-5793(74)80997-x . PMID  4277328. S2CID  12695073.
  10. ^ ab Laubinger, Werner; Dimroth, Peter (1988). «Характеристика АТФ-синтазы Propionigenium modestum как первичного натриевого насоса». Биохимия . 27 (19): 7531–7537. doi :10.1021/bi00419a053. PMID  2905167.

митчелл фебс летт 43 189

Дальнейшее чтение

Внешние ссылки