Группа птиц
Neoaves — это клада , которая состоит из всех современных птиц (Neornithes или Aves), за исключением Palaeognathae (бескилевые и родственные им) и Galloanserae (утки, куры и родственные им). [4] Эта группа определена в PhyloCode Джорджем Сангстером и его коллегами в 2022 году как «наиболее инклюзивная коронная клада, включающая Passer domesticus , но не Gallus gallus ». [5] Почти 95% из примерно 10 000 известных видов современных птиц принадлежат к Neoaves. [6]
Ранняя диверсификация различных групп неоавианов произошла очень быстро в период мел-палеогенового вымирания [7] [8], и попытки разрешить их взаимоотношения друг с другом изначально привели к многочисленным спорам. [9] [10]
Филогения
Ранняя диверсификация различных групп неоавиан произошла очень быстро около мел-палеогенового вымирания . [11] В результате быстрой радиации попытки разрешить их взаимоотношения дали противоречивые результаты, некоторые довольно спорные, особенно в более ранних исследованиях. [12] [13] [14] Тем не менее, некоторые недавние крупные филогеномные исследования Neoaves привели к значительному прогрессу в определении отрядов и надпорядковых групп внутри Neoaves. Тем не менее, исследования не смогли прийти к консенсусу относительно общей топологии высокого порядка этих групп. [ 15] [16] [ 17 ] [14] Геномное исследование 48 таксонов, проведенное Джарвисом и коллегами в 2014 году, разделило Neoaves на две основные клады, Columbea и Passerea , но анализ 198 таксонов, проведенный Прамом и коллегами в 2015 году, выявил различные группировки для самого раннего разделения в Neoaves. [15] [16] Повторный анализ с расширенным набором данных, проведенный Редди и коллегами в 2017 году, показал, что это было связано с типом данных о последовательностях, при этом кодирующие последовательности благоприятствовали топологии Prum. [17] Разногласия по топологии даже при крупных филогеномных исследованиях привели Александра Су в 2016 году к предложению жесткой политомии девяти клад в качестве основы Neoaves. [18] Анализ, проведенный Хоудом и коллегами в 2019 году, выявил Columbea и сокращенную жесткую политомию шести клад в пределах Passerea. [19]
Несмотря на другие разногласия, эти исследования сходятся во мнении относительно ряда надотрядных групп, которые Редди и его коллеги в 2017 году окрестили «великолепной семеркой», которая вместе с тремя «сиротскими отрядами» составляет Neoaves. [17] Примечательно, что они оба включают большую кладу водоплавающих птиц ( Aequornithes ) и большую кладу наземных птиц ( Telluraves ). Группы, определенные Редди и его коллегами (2017), следующие:
- «Великолепная семерка» надпорядковых кладов:
- Теллуравы (наземные птицы)
- Aequornithes (водоплавающие птицы)
- Phaethontimorphae ( солнечные щипы , кагу и фаэтоны )
- Otidimorphae ( турако , дрофы и кукушки )
- Стрижи ( козодои , стрижи , колибри и их союзники)
- Голубеобразные ( мезиты , рябки и голуби )
- Mirandornithes ( фламинго и поганки )
Сравнение различных предложений по неоавианской радиации
Подробная кладограмма
Следующая кладограмма иллюстрирует предполагаемые взаимоотношения между всеми кладами неоавианских птиц. [24]
Ссылки
- ^ Ksepka, Daniel T.; Stidham, Thomas A.; Williamson, Thomas E. (25 июля 2017 г.). «Наземные птицы раннего палеоцена поддерживают быструю филогенетическую и морфологическую диверсификацию кроновых птиц после массового вымирания K–Pg». Труды Национальной академии наук . 114 (30): 8047–8052. Bibcode : 2017PNAS..114.8047K. doi : 10.1073/pnas.1700188114 . PMC 5544281. PMID 28696285 .
- ^ ab Kuhl., H.; Frankl-Vilches, C.; Bakker, A.; Mayr, G.; Nikolaus, G.; Boerno, ST; Klages, S.; Timmermann, B.; Gahr, M. (2021). «Беспристрастный молекулярный подход с использованием 3'UTR разрешает древо жизни на уровне семейства птиц». Молекулярная биология и эволюция . 38 : 108–127. doi : 10.1093/molbev/msaa191 . PMC 7783168. PMID 32781465 .
- ^ Field, Daniel J.; Benito, Juan; Chen, Albert; Jagt, John WM; Ksepka, Daniel T. (март 2020 г.). «Позднемеловой неорнитин из Европы освещает происхождение коронованных птиц». Nature . 579 (7799): 397–401. Bibcode :2020Natur.579..397F. doi :10.1038/s41586-020-2096-0. ISSN 0028-0836. PMID 32188952. S2CID 212937591.
- ^ ab Jarvis, ED; et al. (2014). «Анализ всего генома выявляет ранние ветви в древе жизни современных птиц». Science . 346 (6215): 1320–1331. Bibcode :2014Sci...346.1320J. doi : 10.1126/science.1253451 . ISSN 0036-8075. PMC 4405904 . PMID 25504713.
- ^ Сангстер, Джордж; Браун, Эдвард Л.; Йоханссон, Ульф С.; Кимбалл, Ребекка Т.; Майр, Джеральд; Сух, Александр (2022-01-01). "Филогенетические определения 25 высокоуровневых названий клад птиц" (PDF) . Avian Research . 13 : 100027. Bibcode :2022AvRes..1300027S. doi : 10.1016/j.avrs.2022.100027 . ISSN 2053-7166.
- ^ Эриксон, Пер ГП; и др. (2006). «Диверсификация Neoaves: интеграция данных о молекулярных последовательностях и ископаемых» (PDF) . Biology Letters . 2 (4): 543–547. doi :10.1098/rsbl.2006.0523. PMC 1834003 . PMID 17148284. Архивировано из оригинала (PDF) 2009-03-25 . Получено 2019-08-29 .
- ^ МакКормак, Дж. Э. и др. (2013). «Филогения птиц на основе более 1500 локусов, собранных с помощью целевого обогащения и высокопроизводительного секвенирования». PLOS ONE . 8 (1): e54848. arXiv : 1210.1604 . Bibcode :2013PLoSO...854848M. doi : 10.1371/journal.pone.0054848 . PMC 3558522 . PMID 23382987.
- ^ Claramunt, S.; Cracraft, J. (2015). «Новое дерево времени раскрывает отпечаток истории Земли на эволюции современных птиц». Sci Adv . 1 (11): e1501005. Bibcode : 2015SciA....1E1005C. doi : 10.1126/sciadv.1501005. PMC 4730849. PMID 26824065 .
- ^ Mayr, G (2011). «Metaves, Mirandornithes, Strisores и другие новинки — критический обзор филогении высшего уровня неорнитиновых птиц». J Zool Syst Evol Res . 49 : 58–76. doi : 10.1111/j.1439-0469.2010.00586.x .
- ^ Мацке, А. и др. (2012) Паттерны вставки ретропозонов у неоавианских птиц: весомые доказательства обширной эпохи неполной сортировки линий Mol. Biol. Evol.
- ^ Claramunt, S.; Cracraft, J. (2015). «Новое дерево времени раскрывает отпечаток истории Земли на эволюции современных птиц». Sci Adv . 1 (11): e1501005. Bibcode : 2015SciA....1E1005C. doi : 10.1126/sciadv.1501005. PMC 4730849. PMID 26824065 .
- ^ Mayr, G (2011). «Metaves, Mirandornithes, Strisores и другие новинки — критический обзор филогении высшего уровня неорнитиновых птиц». J Zool Syst Evol Res . 49 : 58–76. doi : 10.1111/j.1439-0469.2010.00586.x .
- ^ Мацке, А. и др. (2012) «Паттерны вставки ретропозонов у неоавианских птиц: весомые доказательства обширной эпохи неполной сортировки линий» Mol. Biol. Evol.
- ^ ab Braun, Edward L.; Cracraft, Joel; Houde, Peter (2019). «Разрешение птичьего древа жизни сверху донизу: обещание и потенциальные границы филогеномной эры». Геномика птиц в экологии и эволюции . С. 151–210. doi :10.1007/978-3-030-16477-5_6. ISBN 978-3-030-16476-8. S2CID 198399272.
- ^ ab Jarvis, ED; et al. (2014). «Анализ всего генома выявляет ранние ветви в древе жизни современных птиц». Science . 346 (6215): 1320–1331. Bibcode :2014Sci...346.1320J. doi :10.1126/science.1253451. PMC 4405904 . PMID 25504713.
- ^ ab Prum, Richard O.; Berv, Jacob S.; Dornburg, Alex; Field, Daniel J.; Townsend, Jeffrey P.; Lemmon, Emily Moriarty; Lemmon, Alan R. (2015). «Комплексная филогения птиц (Aves) с использованием целевого секвенирования ДНК следующего поколения». Nature . 526 (7574): 569–573. Bibcode :2015Natur.526..569P. doi :10.1038/nature15697. ISSN 0028-0836. PMID 26444237. S2CID 205246158.
- ^ abcd Reddy, Sushma; Kimball, Rebecca T.; Pandey, Akanksha; Hosner, Peter A.; Braun, Michael J.; Hackett, Shannon J.; Han, Kin-Lan; Harshman, John; Huddleston, Christopher J.; Kingston, Sarah; Marks, Ben D.; Miglia, Kathleen J.; Moore, William S.; Sheldon, Frederick H.; Witt, Christopher C.; Yuri, Tamaki; Braun, Edward L. (2017). «Почему наборы филогеномных данных дают противоречивые деревья? Тип данных влияет на птичье древо жизни больше, чем выборка таксонов». Systematic Biology . 66 (5): 857–879. doi : 10.1093/sysbio/syx041 . ISSN 1063-5157. PMID 28369655.
- ^ ab Suh, Alexander (2016). «Филогеномный лес птичьих деревьев содержит жесткую политомию в корне Neoaves». Zoologica Scripta . 45 : 50–62. doi : 10.1111/zsc.12213 . ISSN 0300-3256.
- ^ ab Houde, Peter; Braun, Edward L.; Narula, Nitish; Minjares, Uriel; Mirarab, Siavash (2019). «Филогенетический сигнал инделей и неовианская радиация». Разнообразие . 11 (7): 108. doi : 10.3390/d11070108 . ISSN 1424-2818.
- ^ Prum, RO; et al. (2015). «Комплексная филогения птиц (Aves) с использованием целевого секвенирования ДНК следующего поколения». Nature . 526 (7574): 569–573. Bibcode :2015Natur.526..569P. doi :10.1038/nature15697. PMID 26444237. S2CID 205246158.
- ^ Браун, Эдвард Л.; Кимбалл, Ребекка Т. (2021). «Типы данных и филогения Neoaves». Птицы . 2 (1): 1–22. doi : 10.3390/birds2010001 .
- ^ Wu, S.; Rheindt, FE; Zhang, J.; Wang, J.; Zhang, L.; Quan, C.; Zhiheng, L.; Wang, M.; Wu, F.; Qu, Y; Edwards, SV; Zhou, Z.; Liu, L. (2024). «Геномы, окаменелости и одновременное возникновение современных птиц и цветковых растений в позднем мелу». Труды Национальной академии наук . 121 (8). doi : 10.1073/pnas.2319696121 . PMC 10895254 .
- ^ Стиллер, Дж.; Фэн, С.; Чоудхури, А.А.; и др. (2024). «Сложность эволюции птиц, выявленная геномами на уровне семейств». Nature : в печати. doi : 10.1038/s41586-024-07323-1 . PMC 11111414 .
- ^ Стиллер, Дж., Фэн, С., Чоудхури, А.А. и др. Сложность эволюции птиц, выявленная геномами на уровне семейств. Nature (2024). https://doi.org/10.1038/s41586-024-07323-1