stringtranslate.com

Боковая цепь

Определение ИЮПАК

Боковая цепь
.
Боковая ветвь.
Олигомерное или полимерное ответвление макромолекулярной цепи .

Примечания

  1. Олигомерную ветвь можно назвать ветвью с короткой цепью .
  2. Полимерную ветвь можно назвать длинноцепочечной ветвью . [1]

В органической химии и биохимии боковая цепь — это химическая группа , которая присоединена к основной части молекулы, называемой «главной цепью» или остовом . Боковая цепь — это углеводородный разветвляющийся элемент молекулы, который присоединен к более крупному углеводородному остову. Это один из факторов, определяющих свойства и реакционную способность молекулы. [2] Боковая цепь также известна как боковая цепь , но боковая группа (боковая группа) имеет другое определение.

Конвенции

Заполнитель R часто используется как общий заполнитель для боковых цепей алкильных (насыщенных углеводородных) групп в структурных диаграммах . Для обозначения других неуглеродных групп в структурных диаграммах часто используются X , Y или Z.

История

Символ R был введен французским химиком 19 века Шарлем Фредериком Герхардтом , который выступал за его принятие на том основании, что он будет широко узнаваемым и понятным, учитывая его соответствие во многих европейских языках начальной букве слов «корень» или «остаток»: французское racine («корень») и résidu («остаток»), соответствующие английские переводы этих терминов вместе с радикалом (само по себе произошедшим от латинского radix ниже), латинским radix («корень») и residuum («остаток»), и немецким Rest («остаток» и, в контексте химии, как «остаток», так и «радикал»). [3]

Использование

Органическая химия

В полимерной науке боковая цепь олигомерного или полимерного ответвления простирается от основной цепи полимера. Боковые цепи оказывают заметное влияние на свойства полимера, в основном на его кристалличность и плотность . Олигомерную ветвь можно назвать короткоцепочечной ветвью, а полимерную ветвь можно назвать длинноцепочечной ветвью. Боковые группы отличаются от боковых цепей; они не являются ни олигомерными, ни полимерными. [4]

Биохимия

В белках , которые состоят из аминокислотных остатков, боковые цепи присоединены к альфа-углеродным атомам амидного остова . Боковая цепь, присоединенная к альфа-углероду, специфична для каждой аминокислоты и отвечает за определение заряда и полярности аминокислоты. Боковые цепи аминокислот также отвечают за многие взаимодействия, которые приводят к правильному сворачиванию и функционированию белка. [5] Аминокислоты с одинаковой полярностью обычно притягиваются друг к другу, в то время как неполярные и полярные боковые цепи обычно отталкиваются друг от друга. Неполярные/полярные взаимодействия все еще могут играть важную роль в стабилизации вторичной структуры из-за относительно большого их количества, встречающегося по всему белку. [6] Пространственное положение атомов боковой цепи можно предсказать на основе геометрии белкового остова с использованием вычислительных инструментов для реконструкции боковой цепи. [7]

Таблица аминокислот

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ Дженкинс, А.Д.; Кратохвил, П.; Степто, Р.Ф.Т.; Сутер, У.В. (1996). «Глоссарий основных терминов в полимерной науке (Рекомендации ИЮПАК 1996 г.)» (PDF) . Чистая и прикладная химия . 68 (12): 2287–2311. doi :10.1351/pac199668122287. S2CID  98774337.
  2. ^ Wade, LG (2010). Органическая химия, 7-е издание . Upper Saddle River, NJ: Pearson Prentice Hall. стр. 70–78. ISBN 978-0-321-59231-6.
  3. ^ Дженсен В.Б. , Журнал химического образования 87 , 360 (2010)
  4. ^ Химия, Международный союз теоретической и прикладной химии. Сборник химических терминов ИЮПАК. ИЮПАК. doi :10.1351/goldbook.B00720. {{cite book}}: |website=проигнорировано ( помощь )
  5. ^ Voet, Дональд; Voet, Джудит; Pratt, Шарлотта (2013). Основы биохимии: жизнь на молекулярном уровне (четвертое издание). Хобокен, Нью-Джерси: John Wiley & Sons, Inc. ISBN 9781118129180.
  6. ^ Andrew, CD; Penel, S.; Jones, GR; Doig, AJ (2001-12-01). "Стабилизация неполярных/полярных взаимодействий боковой цепи в альфа-спирали". Proteins . 45 (4): 449–455. doi :10.1002/prot.1161. ISSN  0887-3585. PMID  11746692. S2CID  25739520.
  7. ^ Бадачевска-Давид, Александра Э.; Колински, Анджей; Кмиецик, Себастьян (2019-12-26). «Вычислительная реконструкция атомистических структур белков из крупнозернистых моделей». Computational and Structural Biotechnology Journal . 18 : 162–176. doi : 10.1016/j.csbj.2019.12.007. ISSN  2001-0370. PMC 6961067. PMID 31969975  .