РАБ5А

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Белок Rab-5A, родственный Ras, — это белок , который у людей кодируется геном RAB5A . [ ^{5] [6]}

Функция

RAB5A локализуется в ранних эндосомах , где он участвует в привлечении RAB7A и созревании этих компартментов в ранние эндосомы. ^[7] Он управляет созреванием эндосом, транспортируя вакуолярные (H+)-АТФазы (V-АТФазы) из транс-сети Гольджи в эндоцитарные везикулы. ^[8]

Взаимодействия

Было показано, что RAB5A взаимодействует с:

• ЧМЛ , ^{[9] [10]}
• RABEP1 , ^{[11] [12] [13] [14]}
• СДКБП , ^[15] и
• ZFYVE20 ^[16]

Ссылки

1. GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000144566 – Ensembl , май 2017 г.
2. GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000017831 – Ensembl , май 2017 г.
3. "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
4. "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
5. Rousseau-Merck MF, Zahraoui A, Touchot N, Tavitian A, Berger R (февраль 1991 г.). «Распределение хромосом четырех генов RAB, связанных с RAS». Генетика человека . 86 (4): 350–4. doi :10.1007/BF00201831. PMID  1999336. S2CID  30730416.
6. "Ген Entrez: RAB5A RAB5A, член семейства онкогенов RAS".
7. Huotari J, Helenius A (август 2011 г.). «Созревание эндосом». The EMBO Journal . 30 (17): 3481–500. doi :10.1038/emboj.2011.286. PMC 3181477. PMID  21878991 . 
8. Чжан C, Ли A, Чжан X, Сяо H (март 2011 г.). «Новый комплекс белка TIP30 регулирует сигнализацию рецептора EGF и эндоцитарную деградацию». Журнал биологической химии . 286 (11): 9373–81. doi : 10.1074/jbc.M110.207720 . PMC 3058969. PMID  21252234 . 
9. Anant JS, Desnoyers L, Machius M, Demeler B, Hansen JC, Westover KD, Deisenhofer J, Seabra MC (сентябрь 1998 г.). «Механизм геранилгеранирования Rab: образование каталитического тройного комплекса». Биохимия . 37 (36): 12559–68. doi :10.1021/bi980881a. PMID  9730828.
10. Cremers FP, Armstrong SA, Seabra MC, Brown MS, Goldstein JL (январь 1994 г.). "REP-2, белок-эскорт Rab, кодируемый геном, подобным хороидеремии". Журнал биологической химии . 269 (3): 2111–7. doi : 10.1016/S0021-9258(17)42142-9 . PMID  8294464.
11. Xiao GH, Shoarinejad F, Jin F, Golemis EA, Yeung RS (март 1997). «Продукт гена туберозного склероза 2, туберин, функционирует как белок, активирующий ГТФазу Rab5 (GAP) при модуляции эндоцитоза». Журнал биологической химии . 272 ​​(10): 6097–100. doi : 10.1074/jbc.272.10.6097 . hdl : 20.500.12613/9244 . PMID  9045618.
12. Vitale G, Rybin V, Christoforidis S, Thornqvist P, McCaffrey M, Stenmark H, Zerial M (апрель 1998 г.). «Отдельные домены связывания Rab опосредуют взаимодействие Rabaptin-5 с GTP-связанными Rab4 и Rab5». The EMBO Journal . 17 (7): 1941–51. doi :10.1093/emboj/17.7.1941. PMC 1170540. PMID  9524117 . 
13. Stenmark H, Vitale G, Ullrich O, Zerial M (ноябрь 1995). «Рабаптин-5 является прямым эффектором малой ГТФазы Rab5 при слиянии эндоцитарных мембран». Cell . 83 (3): 423–32. doi : 10.1016/0092-8674(95)90120-5 . PMID  8521472. S2CID  18768939.
14. Valsdottir R, Hashimoto H, Ashman K, Koda T, Storrie B, Nilsson T (ноябрь 2001 г.). «Идентификация рабаптина-5, рабекса-5 и GM130 как предполагаемых эффекторов rab33b, регулятора ретроградного трафика между аппаратом Гольджи и ER». FEBS Letters . 508 (2): 201–9. doi : 10.1016/s0014-5793(01)02993-3 . PMID  11718716. S2CID  21545088.
15. Tomoda T, Kim JH, Zhan C, Hatten ME (март 2004 г.). «Роль Unc51.1 и его партнеров по связыванию в росте аксонов ЦНС». Genes & Development . 18 (5): 541–58. doi :10.1101/gad.1151204. PMC 374236 . PMID  15014045. 
16. Nielsen E, Christoforidis S, Uttenweiler-Joseph S, Miaczynska M, Dewitte F, Wilm M, Hoflack B, Zerial M (октябрь 2000 г.). «Rabenosyn-5, новый эффектор Rab5, комплексируется с hVPS45 и привлекается к эндосомам через домен пальца FYVE». Журнал клеточной биологии . 151 (3): 601–12. doi :10.1083/jcb.151.3.601. PMC 2185588. PMID  11062261 . 

Дальнейшее чтение

• Bucci C, Parton RG, Mather IH, Stunnenberg H, Simons K, Hoflack B, Zerial M (сентябрь 1992 г.). «Малая ГТФаза rab5 функционирует как регуляторный фактор в раннем эндоцитозном пути». Cell . 70 (5): 715–28. doi : 10.1016/0092-8674(92)90306-W . PMID  1516130.
• Zahraoui A, Touchot N, Chardin P, Tavitian A (июль 1989). «Гены Rab человека кодируют семейство GTP-связывающих белков, связанных с продуктами дрожжей YPT1 и SEC4, участвующими в секреции». Журнал биологической химии . 264 (21): 12394–401. doi : 10.1016/S0021-9258(18)63872-4 . PMID  2501306.
• Farnsworth CC, Seabra MC, Ericsson LH, Gelb MH, Glomset JA (декабрь 1994 г.). "Rabgeranylgeranyl transferase catalyzes the geranylgeranylation of neighboring cysteines in the small GTPases Rab1A, Rab3A, and Rab5A". Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 91 (25): 11963–7. Bibcode :1994PNAS...9111963F. doi : 10.1073/pnas.91.25.11963 . PMC  45356 . PMID  7991565.
• Cremers FP, Armstrong SA, Seabra MC, Brown MS, Goldstein JL (январь 1994 г.). "REP-2, белок-эскорт Rab, кодируемый геном, подобным хороидеремии". Журнал биологической химии . 269 (3): 2111–7. doi : 10.1016/S0021-9258(17)42142-9 . PMID  8294464.
• Stenmark H, Vitale G, Ullrich O, Zerial M (ноябрь 1995 г.). «Рабаптин-5 является прямым эффектором малой ГТФазы Rab5 при эндоцитозном слиянии мембран». Cell . 83 (3): 423–32. doi : 10.1016/0092-8674(95)90120-5 . PMID  8521472. S2CID  18768939.
• Vita F, Soranzo MR, Borelli V, Bertoncin P, Zabucchi G (сентябрь 1996 г.). «Субклеточная локализация малой GTPase Rab5a в покоящихся и стимулированных нейтрофилах человека». Experimental Cell Research . 227 (2): 367–73. doi :10.1006/excr.1996.0286. PMID  8831575.
• Xiao GH, Shoarinejad F, Jin F, Golemis EA, Yeung RS (март 1997). «Продукт гена туберозного склероза 2, туберин, функционирует как белок, активирующий ГТФазу Rab5 (GAP) при модулировании эндоцитоза». Журнал биологической химии . 272 ​​(10): 6097–100. doi : 10.1074/jbc.272.10.6097 . hdl : 20.500.12613/9244 . PMID  9045618.
• Симонсен А., Липпе Р., Христофоридис С., Голье Дж. М., Брех А., Каллаган Дж., То Б. Х., Мерфи С., Зериал М., Стенмарк Х. (июль 1998 г.). «EEA1 связывает функцию PI (3) K с регуляцией Rab5 слияния эндосом». Природа . 394 (6692): 494–8. Бибкод : 1998Natur.394..494S. дои : 10.1038/28879. PMID  9697774. S2CID  4305220.
• Anant JS, Desnoyers L, Machius M, Demeler B, Hansen JC, Westover KD, Deisenhofer J, Seabra MC (сентябрь 1998 г.). «Механизм геранилгеранилирования Rab: образование каталитического тройного комплекса». Биохимия . 37 (36): 12559–68. doi :10.1021/bi980881a. PMID  9730828.
• Bucci C, Chiariello M, Lattero D, Maiorano M, Bruni CB (май 1999). «Взаимодействующее клонирование и характеристика кДНК, кодирующей человеческий пренилированный акцептор rab (PRA1)». Biochemical and Biophysical Research Communications . 258 (3): 657–62. doi :10.1006/bbrc.1999.0651. PMID  10329441.
• Callaghan J, Nixon S, Bucci C, Toh BH, Stenmark H (октябрь 1999 г.). «Прямое взаимодействие EEA1 с Rab5b». European Journal of Biochemistry . 265 (1): 361–6. doi : 10.1046/j.1432-1327.1999.00743.x . PMID  10491193.
• Шишева А., Чинни СР., ДеМарко С. (сентябрь 1999 г.). «Общая роль ингибитора диссоциации GDP 2 в высвобождении белков Rab из мембраны: модуляции его функциональных взаимодействий структурными модификациями in vitro и in vivo». Биохимия . 38 (36): 11711–21. doi :10.1021/bi990200r. PMID  10512627.
• Masuda ES, Luo Y, Young C, Shen M, Rossi AB, Huang BC, Yu S, Bennett MK, Payan DG, Scheller RH (март 2000 г.). «Rab37 — это новая специфичная для тучных клеток ГТФаза, локализованная в секреторных гранулах». FEBS Letters . 470 (1): 61–4. doi :10.1016/S0014-5793(00)01288-6. PMID  10722846. S2CID  38218555.
• Hoffenberg S, Liu X, Nikolova L, Hall HS, Dai W, Baughn RE, Dickey BF, Barbieri MA, Aballay A, Stahl PD, Knoll BJ (август 2000 г.). «Новый заякоренный на мембране взаимодействующий белок Rab5, необходимый для гомотипического слияния эндосом». Журнал биологической химии . 275 (32): 24661–9. doi : 10.1074/jbc.M909600199 . PMID  10818110.
• Nielsen E, Christoforidis S, Uttenweiler-Joseph S, Miaczynska M, Dewitte F, Wilm M, Hoflack B, Zerial M (октябрь 2000 г.). «Рабенозин-5, новый эффектор Rab5, комплексируется с hVPS45 и привлекается к эндосомам через домен пальца FYVE». Журнал клеточной биологии . 151 (3): 601–12. doi :10.1083/jcb.151.3.601. PMC  2185588. PMID  11062261 .
• Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием in vitro сайт-специфической рекомбинации». Genome Research . 10 (11): 1788–95. doi :10.1101/gr.143000. PMC  310948. PMID  11076863 .
• Lanzetti L, Rybin V, Malabarba MG, Christoforidis S, Scita G, Zerial M, Di Fiore PP (ноябрь 2000 г.). «Белок Eps8 координирует сигнализацию рецептора EGF через Rac и транспортировку через Rab5». Nature . 408 (6810): 374–7. Bibcode :2000Natur.408..374L. doi :10.1038/35042605. PMID  11099046. S2CID  4405293.
• Wolf RM, Wilkes JJ, Chao MV, Resh MD (октябрь 2001 г.). «Фосфорилирование тирозина p190 RhoGAP с помощью Fyn регулирует дифференциацию олигодендроцитов». Журнал нейробиологии . 49 (1): 62–78. doi :10.1002/neu.1066. PMID  11536198.
• Seachrist JL, Laporte SA, Dale LB, Babwah AV, Caron MG, Anborgh PH, Ferguson SS (январь 2002 г.). «Ассоциация Rab5 с рецептором ангиотензина II типа 1A способствует связыванию Rab5 GTP и везикулярному слиянию». Журнал биологической химии . 277 (1): 679–85. doi : 10.1074/jbc.M109022200 . PMID  11682489.