Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
Активирующий белок Ran GTPase 1 — это фермент , который у людей кодируется геном RANGAP1 . [5] [6]
Функция
RanGAP1 — гомодимерный 65-кДа полипептид, который специфически индуцирует активность ГТФазы RAN , но не RAS более чем в 1000 раз. RanGAP1 — непосредственный антагонист RCC1 , регуляторной молекулы, которая удерживает RAN в активном, связанном с ГТФ состоянии. Ген RANGAP1 кодирует полипептид из 587 аминокислот. Последовательность не связана с последовательностью активаторов ГТФазы для других белков, связанных с RAS , но на 88% идентична Rangap1 (Fug1), мышиному гомологу дрожжевого Rna1p. RanGAP1 и RCC1 контролируют RAN-зависимый транспорт между ядром и цитоплазмой. RanGAP1 — ключевой регулятор цикла ГТФ/ГДФ RAN . [6]
Взаимодействия
RanGAP1 — это транспортный белок, который помогает транспортировать другие белки из цитоплазмы в ядро. Небольшой модификатор, связанный с убиквитином, должен быть связан с ним, прежде чем он сможет быть локализован в ядерной поре. [7]
Было показано, что RANGAP1 взаимодействует с:
- Ран , [8] [9] [10] и
- UBE2I . [11] [12] [13]
Ссылки
- ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000100401 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000022391 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Bischoff FR, Krebber H, Kempf T, Hermes I, Ponstingl H (апрель 1995 г.). «Человеческий белок, активирующий RanGTPase RanGAP1, является гомологом дрожжевого Rna1p, участвующего в обработке и транспорте мРНК». Proc Natl Acad Sci USA . 92 (5): 1749–53. Bibcode :1995PNAS...92.1749B. doi : 10.1073/pnas.92.5.1749 . PMC 42597 . PMID 7878053.
- ^ ab "Ген Энтреза: RANGAP1 Ran GTPase активирующий белок 1".
- ^ Хохштрассер М (2000). «Биохимия. Все в семействе убиквитина». Science . 289 (5479): 563–4. doi :10.1126/science.289.5479.563. PMID 10939967. S2CID 32469429.
- ^ Hillig RC, Renault L, Vetter IR, Drell T, Wittinghofer A, Becker J (июнь 1999 г.). «Кристаллическая структура rna1p: новая складка для белка, активирующего ГТФазу». Mol. Cell . 3 (6): 781–91. doi : 10.1016/S1097-2765(01)80010-1 . PMID 10394366.
- ^ Becker J, Melchior F, Gerke V, Bischoff FR, Ponstingl H, Wittinghofer A (май 1995 г.). «РНК1 кодирует активирующий ГТФазу белок, специфичный для Gsp1p, гомолога Ran/TC4 Saccharomyces cerevisiae». J. Biol. Chem . 270 (20): 11860–5. doi : 10.1074/jbc.270.20.11860 . PMID 7744835.
- ^ Bischoff FR, Klebe C, Kretschmer J, Wittinghofer A, Ponstingl H (март 1994). "RanGAP1 индуцирует активность ГТФазы ядерного Ras-связанного Ran". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 91 (7): 2587–91. Bibcode :1994PNAS...91.2587B. doi : 10.1073/pnas.91.7.2587 . PMC 43414 . PMID 8146159.
- ^ Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). "Крупномасштабное картирование взаимодействий белок-белок человека с помощью масс-спектрометрии". Mol. Syst. Biol . 3 : 89. doi :10.1038/msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931 .
- ^ Tatham MH, Kim S, Yu B, Jaffray E, Song J, Zheng J, Rodriguez MS, Hay RT, Chen Y (август 2003 г.). «Роль N-концевого участка Ubc9 в связывании и конъюгации SUMO-1, -2 и -3». Биохимия . 42 (33): 9959–69. doi :10.1021/bi0345283. PMID 12924945.
- ^ Книпшер П., Флото А., Клюг Х., Олсен Дж.В., ван Дейк В.Дж., Фиш А., Джонсон Э.С., Манн М., Сиксма Т.К., Пихлер А. (август 2008 г.). «Сумойлирование Ubc9 регулирует дискриминацию целей СУМО». Мол. Клетка . 31 (3): 371–82. doi : 10.1016/j.molcel.2008.05.022 . ПМИД 18691969.
Дальнейшее чтение
- Becker J, Melchior F, Gerke V, Bischoff FR, Ponstingl H, Wittinghofer A (1995). "РНК1 кодирует активирующий ГТФазу белок, специфичный для Gsp1p, гомолога Ran/TC4 Saccharomyces cerevisiae". J. Biol. Chem . 270 (20): 11860–5. doi : 10.1074/jbc.270.20.11860 . PMID 7744835.
- Bischoff FR, Klebe C, Kretschmer J, Wittinghofer A, Ponstingl H (1994). "RanGAP1 индуцирует активность ГТФазы ядерного Ras-связанного Ran". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 91 (7): 2587–91. Bibcode :1994PNAS...91.2587B. doi : 10.1073/pnas.91.7.2587 . PMC 43414 . PMID 8146159.
- Krebber H, Ponstingl H (1997). "Повсеместная экспрессия и специфическое для яичек альтернативное полиаденилирование мРНК для человеческого активатора Ran GTPase RanGAP1". Gene . 180 (1–2): 7–11. doi :10.1016/S0378-1119(96)00389-7. PMID 8973340.
- Matunis MJ, Coutavas E, Blobel G (1997). «Новая убиквитин-подобная модификация модулирует распределение активирующего Ran-GTPase белка RanGAP1 между цитозолем и комплексом ядерной поры». J. Cell Biol . 135 (6 Pt 1): 1457–70. doi :10.1083/jcb.135.6.1457. PMC 2133973. PMID 8978815 .
- Mahajan R, Delphin C, Guan T, Gerace L, Melchior F (1997). «Небольшой полипептид, связанный с убиквитином, участвующий в нацеливании RanGAP1 на комплексный белок ядерной поры RanBP2». Cell . 88 (1): 97–107. doi : 10.1016/S0092-8674(00)81862-0 . PMID 9019411.
- Гёрлих Д., Дабровски М., Бишофф Ф.Р., Кутай У., Борк П., Хартманн Е., Прен С., Изаурральде Е. (1997). «Новый класс RanGTP-связывающих белков». Дж. Клеточная Биол . 138 (1): 65–80. дои : 10.1083/jcb.138.1.65. ПМК 2139951 . ПМИД 9214382.
- Scheffzek K, Ahmadian MR, Kabsch W, Wiesmüller L, Lautwein A, Schmitz F, Wittinghofer A (1998). «Комплекс Ras-RasGAP: структурная основа активации GTPase и ее потери у онкогенных мутантов Ras». Science . 277 (5324): 333–8. doi :10.1126/science.277.5324.333. PMID 9219684.
- Махаджан Р., Джерасе Л., Мельхиор Ф. (1998). «Молекулярная характеристика модификации SUMO-1 RanGAP1 и ее роль в ассоциации ядерной оболочки». J. Cell Biol . 140 (2): 259–70. doi :10.1083/jcb.140.2.259. PMC 2132567. PMID 9442102 .
- Камитани Т, Кито К, Нгуен ХП, Фукуда-Камитани Т, Йе ЕТ (1998). «Характеристика второго члена семейства сентринов убиквитин-подобных белков». J. Biol. Chem . 273 (18): 11349–53. doi : 10.1074/jbc.273.18.11349 . PMID 9556629.
- Окума Т., Хонда Р., Итикава Г., Цумагари Н., Ясуда Х. (1999). «Модификация SUMO-1 in vitro требует двух ферментативных стадий: E1 и E2». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 254 (3): 693–8. дои : 10.1006/bbrc.1998.9995. ПМИД 9920803.
- Hillig RC, Renault L, Vetter IR, Drell T, Wittinghofer A, Becker J (1999). «Кристаллическая структура rna1p: новая складка для белка, активирующего ГТФазу». Mol. Cell . 3 (6): 781–91. doi : 10.1016/S1097-2765(01)80010-1 . PMID 10394366.
- Dunham I, Shimizu N, Roe BA, Chissoe S, Hunt AR, Collins JE, Bruskiewich R, Beare DM, Clamp M, Smink LJ, Ainscough R, Almeida JP, Babbage A, Bagguley C, Bailey J, Barlow K, Bates KN, Beasley O, Bird CP, Blakey S, Bridgeman AM, Buck D, Burgess J, Burrill WD, O'Brien KP (1999). "Последовательность ДНК человеческой хромосомы 22". Nature . 402 (6761): 489–95. Bibcode :1999Natur.402..489D. doi : 10.1038/990031 . PMID 10591208.
- Nagase T, Nakayama M, Nakajima D, Kikuno R, Ohara O (2001). «Предсказание кодирующих последовательностей неидентифицированных человеческих генов. XX. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». DNA Res . 8 (2): 85–95. doi : 10.1093/dnares/8.2.85 . PMID 11347906.
- Бернье-Вилламор В., Сэмпсон Д.А., Матунис М.Дж., Лима К.Д. (2002). «Структурная основа конъюгации SUMO, опосредованной E2, выявленная комплексом между убиквитин-конъюгирующим ферментом Ubc9 и RanGAP1». Cell . 108 (3): 345–56. doi : 10.1016/S0092-8674(02)00630-X . PMID 11853669.
- Joseph J, Tan SH, Karpova TS, McNally JG, Dasso M (2002). «SUMO-1 нацеливает RanGAP1 на кинетохоры и митотические веретена». J. Cell Biol . 156 (4): 595–602. doi :10.1083/jcb.200110109. PMC 2174074. PMID 11854305 .
- Zhang H, Saitoh H, Matunis MJ (2002). «Ферменты пути модификации SUMO локализуются в филаментах комплекса ядерной поры». Mol. Cell. Biol . 22 (18): 6498–508. doi :10.1128/MCB.22.18.6498-6508.2002. PMC 135644. PMID 12192048 .
- Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (2004). "Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 101 (33): 12130–5. Bibcode : 2004PNAS..10112130B. doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC 514446. PMID 15302935 .
- Macauley MS, Errington WJ, Okon M, Schärpf M, Mackereth CD, Schulman BA, McIntosh LP (2005). "Структурная и динамическая независимость изопептид-связанных RanGAP1 и SUMO-1". J. Biol. Chem . 279 (47): 49131–7. doi : 10.1074/jbc.M408705200 . PMID 15355965.