Домен белка
Домен гомологии Rel (RHD) — это белковый домен , обнаруженный в семействе эукариотических факторов транскрипции , [2] включая NF-κB и NFAT , среди прочих. Некоторые из этих факторов транскрипции, по-видимому, образуют мультибелковые ДНК -связанные комплексы. [3] Фосфорилирование RHD, по-видимому, играет роль в регуляции некоторых из этих факторов транскрипции, модулируя экспрессию их целевых генов. [4]
RHD состоит из двух субдоменов типа иммуноглобулина бета-бочки , которые захватывают ДНК в большой бороздке. N-концевой домен специфичности напоминает основной домен фактора транскрипции p53 и содержит петлю распознавания, которая взаимодействует с основаниями ДНК. В случае NF-κB субдомен димеризации C-конца определяет склонность к димеризации с другими белками семейства белков NF-κB /Rel. За субдоменом димеризации сразу следует последовательность ядерной локализации , которая также включает сайт для ингибирующих взаимодействий с IκB . [1]
Ссылки
- ^ ab PDB : 1SVC ; Müller CW, Rey FA, Sodeoka M, Verdine GL , Harrison SC (январь 1995). "Структура гомодимера NF-kappa B p50, связанного с ДНК". Nature . 373 (6512): 311–317. Bibcode :1995Natur.373..311M. doi :10.1038/373311a0. PMID 7830764. S2CID 4285677.
- ^ Biancalana M, Natan E, Lenardo MJ, Fersht AR (сентябрь 2021 г.). «NF-κB Rel subunit exchange on a psychology timescale». Protein Science . 30 (9): 1818–1832. doi :10.1002/pro.4134. PMC 8376415 . PMID 34089216.
- ^ Wolberger C (октябрь 1998 г.). «Комбинаторные факторы транскрипции». Current Opinion in Genetics & Development . 8 (5): 552–559. doi : 10.1016/S0959-437X(98)80010-5 . PMID 9794820.
- ^ Anrather J, Racchumi G, Iadecola C (январь 2005 г.). «цис-действующая, специфичная для элемента транскрипционная активность дифференциально фосфорилированного ядерного фактора каппа B». Журнал биологической химии . 280 (1): 244–252. doi : 10.1074/jbc.M409344200 . PMID 15516339.
В статье использован текст из общедоступных источников Pfam и
InterPro : IPR011539
