stringtranslate.com

Streptomyces антибиотик

Streptomyces antibioticus (ранее известный как Actinomyces antibioticus ) — грамположительная бактерия, открытая в 1941 году лауреатом Нобелевской премии Селманом Ваксманом и Х. Бойдом Вудраффом . [1] [2] Её название происходит от греческого «strepto-», что означает «скрученный», что указывает нацепочечное спорообразование этого рода , [3] и « antibioticus », что указывает на обширное производство антибиотиков этим видом . [ 2 ] После первой характеристики было отмечено, что S. antibioticus производит отчетливый запах почвы. [2]

Открытие

Streptomyces antibioticus был открыт Селманом Ваксманом и Х. Бойдом Вудраффом, которые назвали бактерию Actinomyces antibioticus. [2] В своей публикации 1941 года Ваксман и Вудрафф описывают использование ими «метода бактериального агара», в котором они смешивали суспензию E. coli с промытым агаром, содержащим 1,5% NaCl и 0,5% K 3 PO 4 . [2] К этой смеси они добавляли «свежую полевую или садовую почву», разбавленную стерильной водопроводной водой, и высевали на чашки свою окончательную смесь. [2] Они пришли к выводу, что «бактериальные антагонисты», то есть организмы, продуцирующие антибиотики , будут образовывать прозрачные пятна на агаре. [2] С помощью этого метода они выделили и охарактеризовали Actinomyces antibioticus . [2] Два года спустя Ваксман переименовал организм в Streptomyces antibioticus. [3]

Характеристики

Филогения

Streptomyces antibioticus принадлежит к семейству Streptomycetacae [3] , которое содержит два других рода: Micromonospora [3] и Kitasatospora [4] . Филогения на основе гена 16S рРНК показывает, что в пределах клады Streptomyces вид S. antibioticus более тесно связан со Streptomyces griseorubor, чем с любым другим видом Streptomyces [5] . Одно исследование показало, что эти два вида образуют поздно расходящуюся кладу в пределах филогенетического дерева рода Streptomyces [5] .

Геномика

GenBank NCBI содержит тысячи последовательностей ДНК для генов S. antibioticus , частичные последовательности генома и три полные последовательности генома. [6] В настоящее время доступные геномы S. antibioticus имеют размер от 8 до 10 миллионов пар оснований. [ 6] Как и у других представителей актиномицетов , геном S. antibioticus , как известно, имеет высокое содержание GC (>55%). [1]

Физиология и экология

Виды Streptomyces производят дифференцированные , ветвистые структуры, известные как гифы , которые в совокупности составляют мицелий организма (множественное число мицелий). [7] Для Streptomyces antibioticus , как и для других видов Streptomyces , мицелий можно разделить на два типа: воздушный и субстратный. [7] Субстратный мицелий формируется для вегетативного роста, тогда как воздушный мицелий формируется с целью производства спор. [7] Воздушные гифы разветвляются от субстратного мицелия и впоследствии дифференцируются в цепочки спор. [7]

Streptomyces antibioticus , как известно, является аэробным микроорганизмом, который обитает в почвенных сообществах. [3] Было показано, что S. antibioticus растет при температуре в диапазоне 28–37 °C. [2] Как актиномицет, этот микроб, как предполагается, ведет себя как мезофил в лабораторных условиях, имея оптимальную температуру роста в диапазоне 25–30 °C. [1] Как член рода Streptomyces , S. antibioticus , как предполагается, живет за счет органического вещества в почве и обладает способностью разлагать крупные полимеры, такие как хитин и кератин . [1] Было показано, что S. antibioticus растет на нескольких типах сред, включая желатин , лакмусовое молоко , агар Чапека и пептонную среду. [2]

Медицинская значимость

Уникальной чертой Streptomyces antibioticus является его способность производить несколько антибиотиков разных классов. [8] [9] После его открытия было обнаружено, что S. antibioticus производит новое на тот момент вещество под названием актиномицин . [2] Затем это вещество было разделено на два соединения: актиномицин А и актиномицин В. [2] Было обнаружено, что актиномицин А обладает высокой бактериостатической активностью (подавляет бактерии) в отношении всех бактерий, с которыми он был протестирован. [2] Актиномицин В проявил небольшую бактериостатическую активность, но показал высокую бактерицидность (убивает бактерии), особенно в отношении грамположительных бактерий. [2] Известно также, что актиномицин проявляет противогрибковые свойства. [2]

Антибиотик боромицин также вырабатывается S. antibioticus . [10] Это соединение было впервые выделено из штамма S. antibioticus , обнаруженного в образце африканской почвы. [10] Боромицин активен против грамположительных бактерий, но неактивен против грамотрицательных бактерий. [10] Было также показано, что боромицин обладает противогрибковыми и противопротозойными свойствами. [10]

Некоторые штаммы Streptomyces antibioticus продуцируют антибиотики, которые еще не получили названия и не были тщательно охарактеризованы, например, упомянутый в исследовании 1998 года из Калькуттского университета . [9] Было обнаружено, что описанный антибиотик проявляет антимикробную активность против грамотрицательных бактерий, грамположительных бактерий и патогенных грибов. [9]

В дополнение к производству антибиотиков, было обнаружено, что один штамм S. antibioticus побуждает другой вид Streptomyces производить антибиотики. [11] Исследования, проведенные Ли и др. из Университета Осаки, изучали штамм S. antibioticus , который производил молекулу, способную побуждать организм Streptomyces virginiae производить антибиотик виргиниамицин . [11]

В настоящее время бактериальные заболевания остаются существенной причиной смерти во всем мире. [12] Чтобы еще больше усугубить эту проблему, постоянно растет число обнаруженных штаммов бактерий, устойчивых к антибиотикам , что повышает спрос на новые антибиотики. [12] В настоящее время более двух третей антибиотиков, назначаемых в клинике, производятся видами рода Streptomyces . [12] С недавним появлением полных геномных последовательностей виды Streptomyces , известные тем, что производят антибиотики, изучаются на предмет потенциальных новых антибиотиков, которые могут присутствовать в их геномах, но еще не охарактеризованы. [13]

Ссылки

  1. ^ abcd M Goodfellow, and; Williams, ST (2003-11-28). "Экология актиномицетов". Annual Review of Microbiology . 37 : 189–216. doi :10.1146/annurev.mi.37.100183.001201. PMID  6357051.
  2. ^ abcdefghijklmno Waksman, SA; Woodruff, HB (1941-08-01). "Actinomyces antibioticus, новый почвенный организм, антагонистичный патогенным и непатогенным бактериям". Journal of Bacteriology . 42 (2): 231–249. doi : 10.1128 /jb.42.2.231-249.1941. ISSN  0021-9193. PMC 374755. PMID  16560451. 
  3. ^ abcde Waksman, SA; Henrici, AT (1943-10-01). "Номенклатура и классификация актиномицетов". Журнал бактериологии . 46 (4): 337–341. doi :10.1128/jb.46.4.337-341.1943. ISSN  0021-9193. PMC 373826. PMID 16560709  . 
  4. ^ Гао, Бейле; Гупта, Радхей С. (2012-03-01). «Филогенетические рамки и молекулярные сигнатуры для основных кладов типа актинобактерий». Обзоры микробиологии и молекулярной биологии . 76 (1): 66–112. doi :10.1128/MMBR.05011-11. ISSN  1098-5557. PMC 3294427. PMID 22390973  . 
  5. ^ ab Labeda, DP; Goodfellow, M.; Brown, R.; Ward, AC; Lanoot, B.; Vanncanneyt, M.; Swings, J.; Kim, S.-B.; Liu, Z. (2012-01-01). "Филогенетические исследования видов в пределах семейства Streptomycetaceae". Antonie van Leeuwenhoek . 101 (1): 73–104. doi :10.1007/s10482-011-9656-0. ISSN  1572-9699. PMID  22045019. S2CID  254229111.
  6. ^ ab Benson, Dennis A.; Karsch-Mizrachi, Ilene; Lipman, David J.; Ostell, James; Sayers, Eric W. (01.01.2011). "GenBank". Nucleic Acids Research . 39 (выпуск базы данных): D32–37. doi :10.1093/nar/gkq1079. ISSN  1362-4962. PMC 3013681. PMID 21071399  . 
  7. ^ abcd Мантека, Анхель; Фернандес, Марисоль; Санчес, Хесус (2006-03-01). "Цитологические и биохимические доказательства раннего события демонтажа клеток в поверхностных культурах Streptomyces antibioticus". Исследования в области микробиологии . 157 (2): 143–152. doi : 10.1016/j.resmic.2005.07.003 . ISSN  0923-2508. PMID  16171979.
  8. ^ Бенедикт, РГ (1953). «Антибиотики, продуцируемые актиномицетами». Botanical Review . 19 (5): 229–320. Bibcode : 1953BotRv..19..229B. doi : 10.1007/bf02861819. JSTOR  4353501. S2CID  8764259.
  9. ^ abc Haque, SF; Laskar, S.; Sen, SK; Pal, SC (1998). "Физико-химические свойства неароматического антибиотика широкого спектра действия Streptomyces antibioticus Sr15. 4". Microbiological Research . 153 (2): 153–156. doi :10.1016/s0944-5013(98)80034-7.
  10. ^ abcd Чен, Том СС; Чанг, Чинг-Джер; Флосс, Хайнц Г. (1981-06-01). «Биосинтез боромицина». Журнал органической химии . 46 (13): 2661–2665. doi :10.1021/jo00326a010. ISSN  0022-3263.
  11. ^ ab Ли, Ван; Нихира, Такуя; Сакуда, Шохей; Нисида, Такуо; Ямада, Ясухиро (1992). «Новые индуцирующие факторы для производства виргиниамицина из Streptomyces antibioticus». Журнал ферментации и биоинженерии . 74 (4): 214–217. doi :10.1016/0922-338x(92)90112-8.
  12. ^ abc de Lima Procópio, Руди Эмерсон; Сильва, Ингрид Рейс да; Мартинс, Майра Кассавара; Азеведу, Жоау Лусиу де; Араужо, Джанете Магали де (2012). «Антибиотики, производимые Streptomyces». Бразильский журнал инфекционных заболеваний . 16 (5): 466–471. дои : 10.1016/j.bjid.2012.08.014 . ПМИД  22975171.
  13. ^ Чжан, Хунъюй; Ван, Хунбо; Ван, Ипэн; Цуй, Хунли; Се, Цзэпин; Пу, Ян; Пэй, Шицянь; Ли, Фучао; Цинь, Сун (2012-07-01). «Открытие новых антибиотиков ангуциклинона на основе геномной последовательности из морских Streptomyces sp. W007». FEMS Microbiology Letters . 332 (2): 105–112. doi : 10.1111/j.1574-6968.2012.02582.x . ISSN  0378-1097. PMID  22536997.