stringtranslate.com

Шигелла флекснера

Shigella flexneri — это вид грамотрицательных бактерий рода Shigella , которые могут вызывать диарею у людей.Описано несколько различных серогрупп Shigella ; S. flexneri относится к группе B. Инфекции S. flexneri обычно можно лечить антибиотиками, хотя некоторые штаммы стали устойчивыми . Менее тяжелые случаи обычно не лечатся, посколькуони становятся более устойчивыми в будущем. [1] Shigella тесно связаны с Escherichia coli , но их можно отличить от E.coli на основе патогенности, физиологии (неспособность ферментировать лактозу или декарбоксилировать лизин) и серологии. [2]

Открытие

Вид был назван в честь американского врача Саймона Флекснера ; род Shigella назван в честь японского врача Киёси Сиги , который исследовал причину дизентерии. Сига поступил в Медицинскую школу Токийского императорского университета в 1892 году, во время которой он посетил лекцию доктора Сибасабуро Китасато. Сига был впечатлен интеллектом и уверенностью доктора Китасато, поэтому после окончания университета он пошел работать к нему в качестве научного сотрудника в Институт инфекционных заболеваний. В 1897 году Сига сосредоточил свои усилия на том, что японцы называли вспышкой «Секири» (дизентерии). Эти эпидемии были губительны для японского народа и часто случались в конце 19 века. Эпидемия секири 1897 года затронула >91 000 человек, а уровень смертности составил >20%. [3] Сига изучил 32 пациента с дизентерией и использовал постулаты Коха , чтобы успешно изолировать и идентифицировать бактерию, вызывающую заболевание. Он продолжал изучать и характеризовать бактерию, выявляя методы выработки ею токсина, например, токсина Шига , и неустанно работал над созданием вакцины от этой болезни.

Характеристика

Морфология

Shigella flexneri — палочковидная, нежгутиковая бактерия, которая использует актиновую подвижность. Она быстро и непрерывно производит белок актин, чтобы продвигаться вперед внутри и между клетками хозяина. [4] Эта бактерия — грамотрицательная, не образующая спор шигелла из серогруппы B. В этой серогруппе существует 6 серотипов. [2]

Серотип

Shigella flexneri относится к группе B (т.е. агглютинирует с антисывороткой B), которая далее подразделяется на шесть типоспецифических и четыре группоспецифических антисыворотки. До настоящего времени было идентифицировано и описано не менее 23 различных подсеротипов. [5] В настоящее время доступны методы молекулярного серотипирования на основе ПЦР, нацеленные на гены wzx1-5 (все, кроме серотипа 6) и gtr или wzx6 (только серотип 6). [6]

Вторжение

Shigella flexneri — это внутриклеточная бактерия, которая инфицирует эпителиальную выстилку кишечного тракта млекопитающих. Эта бактерия устойчива к кислоте и может выживать в условиях pH 2. Таким образом, она способна проникать в ротовую полость своего хозяина и выживать при прохождении через желудок в толстую кишку. [7] Попав в толстую кишку, S. flexneri может проникать в эпителий тремя способами: 1) Бактерия может изменять плотные соединения между эпителиальными клетками, что позволяет ей проникать в подслизистую оболочку. 2) Она может проникать в высокоэндоцитарные М-клетки , которые рассеяны в эпителиальном слое, и проникать в подслизистую оболочку. 3) После достижения подслизистой оболочки бактерии могут быть фагоцитированы макрофагами и вызвать апоптоз, гибель клеток. Это высвобождает цитокины , которые привлекают полиморфноядерные клетки (ПМН) в подслизистую оболочку. S. flexneri, все еще находящиеся в просвете толстой кишки, пересекают эпителиальную выстилку, когда ПМН проникают в инфицированную область. Приток клеток ПМН через эпителиальный слой в ответ на шигеллу нарушает целостность эпителия, позволяя бактериям из просвета проникать в подслизистую оболочку в механизме, независимом от М-клеток. [8] S. flexneri использует эти три метода, чтобы достичь подслизистой оболочки и проникнуть в эпителиальные клетки с базолатеральной стороны. У бактерии есть четыре известных антигена плазмиды вторжения: IpaA, IpaB, IpaC и IpaD. Когда S. flexneri вступает в контакт с базолатеральной стороной эпителиальной клетки, IpaC и IpaB сливаются вместе, образуя пору в мембране эпителиальной клетки. Затем он использует систему секреции типа III (T3SS) для вставки других белков Ipa в цитоплазму эпителиальной клетки. [8] S. flexneri может переходить в соседние эпителиальные клетки, используя свой собственный белок внешней мембраны IcsA, чтобы активировать механизм сборки актина хозяина. Белок IcsA сначала локализуется на одном полюсе бактерии, где он затем связывается с белком хозяина, белком синдрома Вискотта-Олдрича (N-WASP) . Затем этот комплекс IcsA/N-WASP активирует комплекс актин-связанного белка (Arp) 2/3 . Комплекс Arp 2/3 — это белок, отвечающий за быструю инициацию полимеризации актина и продвижение бактерий вперед. [8] [2] [9] Когда S. flexneri достигает прилегающей мембраны, он создает выступ в цитоплазму соседней клетки. Бактерия окружается двумя слоями клеточной мембраны. Затем он использует другой комплекс IpaBC, чтобы создать пору и проникнуть в следующую клетку. VacJ — это белок, который также необходим S. flexneriдля выхода из выступа. Его точная функция все еще изучается, но известно, что без него межклеточное распространение значительно ухудшается. [8] [10] Бактериальная репликация внутри эпителиальной клетки губительна для клетки, но предполагается, что гибель эпителиальной клетки в значительной степени обусловлена ​​собственной воспалительной реакцией хозяина. [8]

Генетика

Геномы S. flexneri и Escherichia coli практически неразличимы на уровне видов. У S. flexneri кольцевая хромосома с 4 599 354 парами оснований. Она меньше, чем у E. coli , но гены похожи. У S. flexneri в геноме около 4 084 известных генов. Предполагается, что обширное сходство между E. coli и S. flexneri обусловлено горизонтальным переносом . Все гены, необходимые для проникновения S. flexneri в эпителиальную оболочку толстой кишки, находятся на плазмиде вирулентности , называемой pINV. Геном pINV высококонсервативен между подвидами S. flexneri . У S. flexneri также есть две другие небольшие многокопийные плазмиды, но некоторые штаммы S. flexneri имеют больше плазмид, которые, как предполагается, обеспечивают устойчивость к антибиотикам. [11] Некоторые штаммы S. flexneri обладают устойчивостью к антибиотикам стрептомицину, ампициллину или триметоприму. [12] Было обнаружено, что хлорамфеникол, налидиксовая кислота и гентамицин по-прежнему являются эффективными антибиотиками для некоторых штаммов. [13]

Метаболизм

Shigella flexneri является гетеротрофом . Она использует пути Эмбдена-Мейерхофа-Парнаса (ЭМП) , Энтнера-Дудорова (ЭД) или пентозофосфатный путь (ПФП) для метаболизма сахаров. Продукты этих путей затем поступают в цикл лимонной кислоты (ЦТК) . S. flexneri может метаболизировать глюкозу и пируват. Дополнительный пируват обеспечивает наибольший рост и считается предпочтительным источником углерода. Пируват может поставляться собственным метаболизмом клетки или извлекаться из клетки-хозяина. S. flexneri является факультативным анаэробом , способным выполнять смешанно-кислотную ферментацию пирувата. [14] [2] S. flexneri не может ферментировать лактозу. [2] Эта бактерия оптимально растет при 37 °C, но может расти при температурах до 30 °C. [13]

Малая РНК

Бактериальные малые РНК играют важную роль во многих клеточных процессах. RnaG и RyhB sRNAs были хорошо изучены у S. flexneri . [15] Ssr1 sRNA, которая может играть роль в устойчивости к кислотному стрессу и регуляции вирулентности, как было показано, существует только у Shigella . [16]

Экология

Инфекционный цикл

Shigella flexneri содержит плазмиду вирулентности, которая кодирует три фактора вирулентности: систему секреции типа 3 (T3SS), белки антигена плазмиды вторжения (белки IPA) и IcsA (используется для распространения от клетки к клетке). [17]

При инфицировании S. flexneri вводит в цитоплазму клетки-хозяина белки ipa, используя T3SS — аппарат, похожий на иглу и шприц, распространенный среди многих грамотрицательных патогенов. Эти белки ipa вызывают «мембранное взъерошивание» клетки-хозяина. Мембранное взъерошивание создает мембранные карманы, которые захватывают и поглощают бактерии. Оказавшись внутри, S. flexneri использует актин клетки-хозяина для движения, чтобы напрямую перемещаться от клетки к клетке, используя клеточный механизм, известный как парацитофагия , [18] [19] аналогично бактериальному патогену Listeria monocytogenes .

Shigella flexneri способна подавлять острую воспалительную реакцию на начальной стадии инфекции [20] с помощью эффекторного белка OspI, который кодируется ORF169b на большой плазмиде Shigella и секретируется системой секреции типа III. Он подавляет воспалительную реакцию во время бактериальной инвазии, подавляя сигнальный путь, опосредованный фактором 6, ассоциированным с рецептором TNF-α ( TRAF6 ). [20] OspI обладает активностью глутаминдеамидазы и способен избирательно дезаминировать глутамин в положении 100 в UBC13 до глутамата , и это приводит к сбою конъюгирующей активности убиквитина E2, которая необходима для активации TRAF6. [20]

Ссылки

  1. ^ Райан К. Дж.; Рэй К. Г.; Шеррис Дж. К., ред. (2004). Sherris Medical Microbiology (4-е изд.). Нью-Йорк: McGraw-Hill . ISBN 978-0-8385-8529-0. LCCN  2003054180. OCLC  52358530.
  2. ^ abcde Хейл, Томас Л.; Кеуш, Джеральд Т. (1996), барон, Сэмюэл (редактор), «Шигелла», медицинская микробиология (4-е изд.), Медицинское отделение Техасского университета в Галвестоне, ISBN 978-0-9631172-1-2, PMID  21413292 , получено 2020-04-23
  3. ^ Трофа, Эндрю Ф.; Уэно-Олсен, Ханна; Оива, Руйко; Ёсикава, Масаносукэ (1 ноября 1999 г.). «Доктор Киёси Сига: первооткрыватель дизентерийной палочки». Клинические инфекционные болезни . 29 (5): 1303–1306. дои : 10.1086/313437 . ISSN  1058-4838. ПМИД  10524979.
  4. ^ Голдберг, Марсия Б. (декабрь 2001 г.). «Актиновая подвижность внутриклеточных микробных патогенов». Обзоры микробиологии и молекулярной биологии . 65 (4): 595–626. doi :10.1128/MMBR.65.4.595-626.2001. ISSN  1092-2172. PMC 99042. PMID 11729265  . 
  5. ^ Shahnaij, Mohammad; Latif, Hasan A.; Azmi, Ishrat J.; Amin, Mohammed Badrul; Luna, Sharmin J.; Islam, Mohammad Aminul; Talukder, Kaisar Ali (2018). «Характеристика серологически атипичной Shigella flexneri Z, выделенной у пациентов с диареей в Бангладеш, и предложенная серологическая схема для Shigella flexneri». PLOS ONE . 13 (8): e0202704. Bibcode : 2018PLoSO..1302704S. doi : 10.1371/journal.pone.0202704 . ISSN  1932-6203. PMC 6108489. PMID 30142163  . 
  6. ^ Бренги, Сильвина П.; Сунь, Цянчжэн; Боланьос, Хильда; Дуарте, Франциско; Дженкинс, Клэр; Пичел, Мариана; Шахнаидж, Мохаммед; Соуерс, Эванджелин Г.; Строкбайн, Нэнси; Талукдер, Кайсар А.; Дерадо, Гордана; Виньяс, Мария Роза; Кам, Кай Ман; Сюй, Цзяньго; Ондердонк, Эндрю Б. (2019). «Метод серотипирования Shigella flexneri на основе ПЦР: международная многоцентровая валидация». Журнал клинической микробиологии . 57 (4): e01592-18. дои : 10.1128/JCM.01592-18. ISSN  0095-1137. ПМК 6440786 . PMID  30700505. 
  7. ^ Багамбула, CF; Юттендале, М.; Дебевер, Дж. (2002). «Кислотоустойчивость Shigella sonnei и Shigella flexneri». Журнал прикладной микробиологии . 93 (3): 479–486. дои : 10.1046/j.1365-2672.2002.01714.x. ISSN  1365-2672. PMID  12174047. S2CID  44572279.
  8. ^ abcde Дженнисон, Эми В.; Верма, Нареш К. (2004-02-01). «Инфекция Shigella flexneri: патогенез и разработка вакцины». FEMS Microbiology Reviews . 28 (1): 43–58. doi :10.1016/j.femsre.2003.07.002. ISSN  0168-6445. PMID  14975529.
  9. ^ Эжиль, Кумаран; Луазель, Томас П.; Лоран, Валери; Ли, Ронг; Панталони, Доминик; Сансонетти, Филипп Ж.; Карлье, Мари-Франс (1999-09-20). «Активация эффектора Cdc42 N-Wasp белком Shigella flexneri Icsa способствует зарождению актина комплексом Arp2/3 и подвижности на основе бактериального актина». Журнал клеточной биологии . 146 (6): 1319–1332. doi : 10.1083/jcb.146.6.1319 . ISSN  0021-9525. PMC 2156126. PMID 10491394  . 
  10. ^ Карпентер, Чандра Д.; Кули, Бенджамин Дж.; Нидхэм, Бриттани Д.; Фишер, Кэролин Р.; Трент, М. Стивен; Гордон, Вернита; Пейн, Шелли М. (2014-02-01). «Транспортёр Vps/VacJ ABC необходим для межклеточного распространения Shigella flexneri». Инфекция и иммунитет . 82 (2): 660–669. doi :10.1128/IAI.01057-13. ISSN  0019-9567. PMC 3911398. PMID 24478081  . 
  11. ^ Wei, J.; Goldberg, MB; Burland, V.; Venkatesan, MM; Deng, W.; Fournier, G.; Mayhew, GF; Plunkett, G.; Rose, DJ; Darling, A.; Mau, B. (2003-05-01). "Полная последовательность генома и сравнительная геномика штамма Shigella flexneri серотипа 2a 2457T". Инфекция и иммунитет . 71 (5): 2775–2786. doi :10.1128/IAI.71.5.2775-2786.2003. ISSN  0019-9567. PMC 153260 . PMID  12704152. 
  12. ^ Pan, Jing-Cao; Ye, Rong; Meng, Dong-Mei; Zhang, Wei; Wang, Hao-Qiu; Liu, Ke-Zhou (2006-08-01). «Молекулярные характеристики интегронов класса 1 и класса 2 и их связь с устойчивостью к антибиотикам у клинических изолятов Shigella sonnei и Shigella flexneri». Журнал антимикробной химиотерапии . 58 (2): 288–296. doi :10.1093/jac/dkl228. ISSN  0305-7453. PMID  16766536.
  13. ^ ab Oaks, EV; Wingfield, ME; Formal, SB (1985-04-01). «Образование бляшек вирулентной Shigella flexneri». Инфекция и иммунитет . 48 (1): 124–129. doi :10.1128/IAI.48.1.124-129.1985. ISSN  0019-9567. PMC 261924. PMID  3884506 . 
  14. ^ Валигора, EA; Фишер, CR; Хановице, NJ; Роду, A.; Вайкофф, EE; Пейн, SM (2014-07-01). «Роль путей внутриклеточного метаболизма углерода в вирулентности Shigella flexneri». Инфекция и иммунитет . 82 (7): 2746–2755. doi :10.1128/IAI.01575-13. ISSN  0019-9567. PMC 4097621. PMID 24733092  . 
  15. ^ Пэн, Цзюньпин; Ян, Цзянь; Цзинь, Ци (2011-04-05). «Комплексный подход к поиску упущенных генов у шигелл». PLOS ONE . 6 (4): e18509. Bibcode : 2011PLoSO...618509P. doi : 10.1371/journal.pone.0018509 . ISSN  1932-6203. PMC 3071730. PMID 21483688  . 
  16. ^ Ван, Лигуй; Ян, Гуан; Ци, Лихуа; Ли, Сян; Цзя, Лейли; Се, Цзин; Цю, Шаофу; Ли, Пэн; Хао, Ронгчжан (2016-01-01). "Новая малая РНК регулирует толерантность и вирулентность Shigella flexneri, реагируя на изменения кислотности окружающей среды". Frontiers in Cellular and Infection Microbiology . 6 : 24. doi : 10.3389/fcimb.2016.00024 . ISSN  2235-2988. PMC 4782007 . PMID  27014636. 
  17. ^ Стивенс Дж.; Галёв Э.Э.; Стивенс М.П. (2006). «Актин-зависимое движение бактериальных патогенов». Nature Reviews Microbiology . 4 (2): 91–101. doi : 10.1038/nrmicro1320 . PMID  16415925. S2CID  30946244.
  18. ^ Огава М.; Ханда Й.; Ашида Х.; Сузуки М.; Сасакава К. (2008). «Универсальность эффекторов шигелл». Nature Reviews Microbiology . 6 (1): 11–16. doi :10.1038/nrmicro1814. PMID  18059288. S2CID  26214256.
  19. ^ Robbins JR; Barth AI; Marquis H; de Hostos EL; Nelson WJ; Theriot JA (1999). «Listeria monocytogenes использует нормальные процессы клетки-хозяина для распространения от клетки к клетке». Journal of Cell Biology . 146 (6): 1333–1350. doi :10.1083/jcb.146.6.1333. PMC 1785326 . PMID  10491395. 
  20. ^ abc Sanada T; Kim M; Mimuro H; Suzuki M; Ogawa M; Oyama A; Ashida H; Kobayashi T; Koyama T; Nagai S; Shibata Y; Gohda J; Inoue J; Mizushima T; Sasakawa C (2012). " Эффектор Shigella flexneri OspI деамидирует UBC13, чтобы ослабить воспалительную реакцию". Nature . 483 (7391): 623–6. Bibcode :2012Natur.483..623S. doi :10.1038/nature10894. PMID  22407319. S2CID  4371539.

нора https://microbenotes.com/biochemical-test-of-shigella-flexneri/

Внешние ссылки