РНК SR1

В молекулярной биологии РНК SR1 представляет собой малую РНК (мРНК), вырабатываемую видами Bacillus и близкородственными бактериями . ^[1] Это РНК с двойной функцией , которая действует и как кодирующая белок РНК, и как регуляторная мРНК.

РНК SR1 участвует в регуляции катаболизма аргинина . РНК SR1 связывается с комплементарными участками мРНК ahrC (также известной как argR) и ингибирует трансляцию . ^{[2] [3]} AhrC эндодирует белок- репрессор аргинина , который подавляет синтез ферментов биосинтеза аргинина и активирует ферменты катаболизма аргинина посредством регуляции оперонов rocABC и rocDEF . ^{[4] [5] [6]}

Помимо действия в качестве sRNA, SR1 также кодирует небольшой пептид SR1P. SR1P связывается с глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназой (GapA) и стабилизирует мРНК оперона gapA. ^[7]

Экспрессия SR1 регулируется CcpA и CcpN. ^{[8] [9]}

Смотрите также

• Бактериальная малая РНК

Ссылки

1. Gimpel M, Preis H, Barth E, Gramzow L, Brantl S (13 октября 2012 г.). «SR1 — небольшая РНК с двумя замечательно консервативными функциями». Nucleic Acids Research . 40 (22): 11659–11672. doi :10.1093/nar/gks895. PMC  3526287. PMID  23034808 .
2. Heidrich N, Moll I, Brantl S (2007). «In vitro анализ взаимодействия между малой РНК SR1 и ее первичной целевой мРНК ahrC». Nucleic Acids Research . 35 (13): 4331–4346. doi :10.1093/nar/gkm439. PMC 1935000. PMID  17576690 . 
3. Heidrich N, Chinali A, Gerth U, Brantl S (октябрь 2006 г.). «Малая нетранслируемая РНК SR1 из генома Bacillus subtilis участвует в регуляции катаболизма аргинина». Молекулярная микробиология . 62 (2): 520–536. doi : 10.1111/j.1365-2958.2006.05384.x . PMID  17020585.
4. North AK, Smith MC, Baumberg S (1 августа 1989 г.). «Нуклеотидная последовательность регуляторного гена аргинина Bacillus subtilis и гомология его продукта с репрессором аргинина Escherichia coli». Gene . 80 (1): 29–38. doi :10.1016/0378-1119(89)90247-3. PMID  2507400.
5. Czaplewski LG, North AK, Smith MC, Baumberg S, Stockley PG (январь 1992 г.). «Очистка и начальная характеристика AhrC: регулятора генов метаболизма аргинина в Bacillus subtilis». Mol. Microbiol . 6 (2): 267–275. doi :10.1111/j.1365-2958.1992.tb02008.x. PMID  1312212. S2CID  3219261.
6. Dennis CA, Glykos NM, Parsons MR, Phillips SE (март 2002 г.). «Структура AhrC, белка-репрессора/активатора аргинина из Bacillus subtilis». Acta Crystallographica Section D. 58 ( Pt 3): 421–430. doi :10.1107/s0907444901021692. PMID  11856827.
7. Gimpel M, Heidrich N, Mäder U, Krügel H, Brantl S (май 2010 г.). "Двойная функция sRNA из B. subtilis: SR1 действует как пептид, кодирующий мРНК на опероне gapA" (PDF) . Molecular Microbiology . 76 (4): 990–1009. doi : 10.1111/j.1365-2958.2010.07158.x . PMID  20444087.
8. Licht A, Preis S, Brantl S (октябрь 2005 г.). «Влияние CcpN на регуляцию новой нетранслируемой РНК (SR1) в Bacillus subtilis». Молекулярная микробиология . 58 (1): 189–206. doi :10.1111/j.1365-2958.2005.04810.x. PMID  16164558. S2CID  29961832.
9. Licht A, Brantl S (октябрь 2009 г.). «Транскрипционный репрессор CcpN из Bacillus subtilis использует различные механизмы репрессии на различных промоторах». Журнал биологической химии . 284 (44): 30032–30038. doi : 10.1074/jbc.M109.033076 . PMC 2781557. PMID  19726675 .