stringtranslate.com

SroB РНК

РНК sroB (также известная как MicM, rybC или ChiX) — это некодирующий ген РНК длиной 90 нуклеотидов. sroB обнаружен у нескольких видов энтеробактерий, но его функция неизвестна. [1] [2] SroB обнаружен в межгенной области на противоположной цепи генов ybaK и ybaP. [1] SroB экспрессируется в стационарной фазе. [1] Эксперименты показали, что SroB представляет собой связывающую Hfq sRNA . [2] [3]

Дальнейшие доказательства показали, что SroB негативно регулирует белок внешней мембраны YbfM, секвестрируя сайт связывания рибосомы мРНК ybfM посредством антисмыслового взаимодействия. [4] SroB также регулирует двухкомпонентную систему DpiA/DpiB . [5] Более того, сам SroB, по-видимому, является целью некодирующего транскрипта из межгенной области chbBC. [6] [7] [8]

Ссылки

  1. ^ abc Vogel J, Bartels V, Tang TH и др. (2003). «RNomics in Escherichia coli обнаруживает новые виды sRNA и указывает на параллельный транскрипционный выход у бактерий». Nucleic Acids Res . 31 (22): 6435–6443. doi :10.1093/nar/gkg867. PMC  275561. PMID  14602901 .
  2. ^ ab Zhang A, Wassarman KM, Rosenow C, Tjaden BC, Storz G, Gottesman S (ноябрь 2003 г.). «Глобальный анализ малых РНК и мРНК-мишеней Hfq». Mol. Microbiol . 50 (4): 1111–1124. doi : 10.1046/j.1365-2958.2003.03734.x . PMID  14622403. S2CID  40056275.
  3. ^ Sittka A, Lucchini S, Papenfort K и др. (2008). Burkholder WF (ред.). "Глубокий анализ секвенирования малых некодирующих РНК и мРНК-мишеней глобального посттранскрипционного регулятора Hfq". PLOS Genet . 4 (8): e1000163. doi : 10.1371/journal.pgen.1000163 . PMC 2515195. PMID  18725932 . 
  4. ^ Rasmussen AA, Johansen J, Nielsen JS, Overgaard M, Kallipolitis B, Valentin-Hansen P (апрель 2009 г.). «Консервативная малая РНК способствует подавлению внешнего мембранного белка YbfM». Mol. Microbiol . 72 (3): 566–577. doi :10.1111/j.1365-2958.2009.06688.x. PMID  19400782. S2CID  24575908.
  5. ^ Mandin, P.; Gottesman, S. (2009). «Генетический подход к поиску малых РНК-регуляторов интересующих генов идентифицирует RybC как регулятор двухкомпонентной системы DpiA/DpiB». Молекулярная микробиология . 72 (3): 551–565. doi :10.1111/j.1365-2958.2009.06665.x. PMC 2714224. PMID  19426207 . 
  6. ^ Овергаард М., Йохансен Дж., Меллер-Йенсен Дж., Валентин-Хансен П. (2009). «Выключение регуляции малых РНК с помощью ловушки-мРНК». Мол Микробиол . 73 (5): 790–800. дои : 10.1111/j.1365-2958.2009.06807.x . ПМИД  19682266.
  7. ^ Vogel J (июль 2009 г.). «РНК-ловушка помогает бактериям извлечь максимальную выгоду из хитосахаров». Mol. Microbiol . 73 (5): 737–741. doi :10.1111/j.1365-2958.2009.06806.x. PMID  19659640. S2CID  26358452. Архивировано из оригинала 05.01.2013.
  8. ^ Фигероа-Босси Н., Валентини М., Маллерет Л., Фиорини Ф., Босси Л. (2009). «Пойманный на своей собственной игре: регуляторная малая РНК, инактивированная индуцируемым транскриптом, имитирующим ее цель». Genes Dev . 23 (17): 2004–2015. doi :10.1101/gad.541609. PMC 2751969. PMID  19638370 . 

Дальнейшее чтение

Внешние ссылки

  • в
  • т
  • е