stringtranslate.com

Трансмембранный белок 205

Трансмембранный белок 205 (TMEM205) — это белок, кодируемый на хромосоме 19 геном TMEM205 .

Ген

TMEM205 расположен на минус-цепи хромосомы 19 от пары оснований 11 453 452 до 11 456 981. В непосредственной близости от TMEM205 CCDC159 расположен немного выше, а RAB3D немного ниже последовательности генома.

Гомология

TMEM205 не имеет известных паралогов в геноме человека. Используя геномный браузер UCSC BLAT [5] против последовательности человеческого белка, было обнаружено, что ближайшим родственником человека, содержащим паралог гена TMEM205 в своем геноме, является Bushbaby . Однако TMEM205 имеет большой диапазон ортологичных последовательностей.

Белок

Человеческий гомолог TMEM205 имеет длину 189 аминокислот и молекулярную массу 21,2 кДа. Он содержит 4 гидрофобных спиральных домена, которые, как предполагается, являются трансмембранными доменами.

Выражение

Было показано, что TMEM205 экспрессируется в больших количествах в тканях, которые имеют секреторную функцию. К таким тканям относятся щитовидная железа, надпочечники, поджелудочная железа и молочная железа. [17] Также было показано, что этот белок имеет повышенную экспрессию в опухолевой ткани, которая стала устойчивой к химиотерапевтическим препаратам на основе платины.

Функция

Считается, что TMEM205 является многопроходным трансмембранным белком. Было показано, что он находится на плазматической мембране в тканях человека и перемещается в ядерную оболочку, когда клетки становятся устойчивыми к цисплатину. [17] Он содержит четыре домена, которые, как предполагается, являются трансмембранными доменами по анализу TMHMM.

Взаимодействующие белки

Было показано, что TMEM205 локализуется совместно с RAB8 — известной ГТФазой, участвующей в везикулярном транспорте. [18]

Клиническое значение

Было показано, что TMEM205 участвует в резистентности к цисплатину . Цисплатин — это химиотерапевтический препарат , который обычно используется для лечения солидных злокачественных новообразований, таких как карциномы , саркомы и лимфомы . Помимо участия в резистентности к цисплатину, появляется все больше доказательств того, что этот белок также участвует в таких заболеваниях, как тиреоидит и простатит.

Примечания

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000105518 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000040883 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Кент У. Дж. (апрель 2002 г.). «BLAT — инструмент выравнивания, подобный BLAST». Genome Research . 12 (4): 656–64. doi : 10.1101/gr.229202. PMC 187518. PMID  11932250. 
  6. ^ «Древо времени».
  7. ^ "NCBI BLAST".
  8. ^ "Белок NCBI: AAH91472.1".
  9. ^ "Белок NCBI: XP_003316117.1".
  10. ^ "Белок NCBI: NP_001124814.1".
  11. ^ "Белок NCBI: XP_004060075.1".
  12. ^ "Белок NCBI: XP_002761800.1".
  13. ^ "Белок NCBI: BAA92792764.1".
  14. ^ "NCBI Нуклеотид: XP_003760487.1".
  15. ^ "NCBI Нуклеотид: AFJ51753.1".
  16. ^ "NCBI Нуклеотид: NP_001037942.1".
  17. ^ ab Shen DW, Ma J, Okabe M, Zhang G, Xia D, Gottesman MM (ноябрь 2010 г.). «Повышенная экспрессия TMEM205, гипотетического мембранного белка, связана с устойчивостью к цисплатину». Journal of Cellular Physiology . 225 (3): 822–8. doi :10.1002/jcp.22287. PMC 2971691 . PMID  20589834. 
  18. ^ Shen DW, Gottesman MM (март 2012 г.). «RAB8 усиливает резистентность к цисплатину, опосредованную TMEM205». Pharmaceutical Research . 29 (3): 643–50. doi :10.1007/s11095-011-0562-y. PMC 3288766. PMID  21969054 .