ТРИМ6

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Белок 6, содержащий трехкомпонентный мотив, представляет собой белок , который у людей кодируется геном TRIM6 . ^{[5] [6]}

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства трехкомпонентных мотивов (TRIM). Мотив TRIM включает три домена связывания цинка , RING , B-box типа 1 и B-box типа 2, а также область спиральной спирали .

Белок локализуется в ядре , но его конкретная функция не была идентифицирована. Этот ген картирован на хромосоме 11p15, где он находится в кластере генов TRIM. Для этого гена были обнаружены два альтернативно сплайсированных варианта транскрипта, кодирующих различные изоформы . Наблюдался сквозной транскрипт, транскрибированный с этого гена и TRIM34. ^[6]

Ссылки

1. GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000121236 – Ensembl , май 2017 г.
2. GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000072244 – Ensembl , май 2017 г.
3. "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
4. "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
5. Реймонд А, Мерони Г, Фантоцци А, Мерла Г, Каир С, Лузи Л, Риганелли Д, Занария Е, Мессали С, Кайнарка С, Гуффанти А, Минуччи С, Пеличчи П.Г., Баллабио А (май 2001 г.). «Семейство трехсторонних мотивов идентифицирует клеточные отсеки». ЭМБО Дж . 20 (9): 2140–51. дои : 10.1093/emboj/20.9.2140. ПМК 125245 . ПМИД  11331580. 
6. "Ген Entrez: трехкомпонентный мотив TRIM6, содержащий 6".

Дальнейшее чтение

• Ли X, Голд Б., О'хУиджин С. и др. (2007). «Уникальные особенности TRIM5alpha среди близкородственных членов человеческого семейства TRIM». Вирусология . 360 (2): 419–33. doi : 10.1016/j.virol.2006.10.035 . PMID  17156811.
• Чжан Ф., Хатзиоанну Т., Перес-Кабальеро Д. и др. (2006). «Антиретровирусный потенциал человеческого трехкомпонентного мотива-5 и родственных белков». Вирусология . 353 (2): 396–409. doi : 10.1016/j.virol.2006.05.035 . PMID  16828831.
• Li X, Li Y, Stremlau M и др. (2006). «Функциональная замена доменов RING, B-box 2 и coiled-coil трехкомпонентного мотива 5альфа (TRIM5альфа) гетерологичными доменами TRIM». J. Virol . 80 (13): 6198–206. doi :10.1128/JVI.00283-06. PMC  1488960 . PMID  16775307.
• Woo JS, Imm JH, Min CK и др. (2006). «Структурное и функциональное понимание домена B30.2/SPRY». EMBO J . 25 (6): 1353–63. doi :10.1038/sj.emboj.7600994. PMC  1422157 . PMID  16498413.
• Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA и др. (2004). «Состояние, качество и расширение проекта NIH по полноразмерной ДНК: коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC  528928. PMID  15489334 .
• Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных человеческих кДНК». Nat. Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID  14702039.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
• Orimo A, Tominaga N, Yoshimura K и др. (2001). «Молекулярное клонирование белка кольцевого пальца 21 (RNF21)/белка пальца, реагирующего на интерферон (ifp1), который обладает двумя доменами RING-B box-coiled coil в тандеме». Genomics . 69 (1): 143–9. doi :10.1006/geno.2000.6318. PMID  11013086.