Takifugu Rubripes , широко известный как японский фугу , тигровый фугу или торафугу ( по-японски :虎河豚), — рыба-фугу из рода Takifugu . Он отличается очень маленьким геномом , который был полностью секвенирован из-за его использования в качестве модельного вида и широко используется в качестве эталона в геномике. [3]
В литературе по геномике этот вид часто называют Fugu Rubripes . Род Fugu является синонимом предпочитаемого в настоящее время Takifugu . [4] Такифугу по-японски означает «фугу», а «рубрипес» происходит от латинского «рубер » и «pēs» , что означает «румяная нога». [ нужна цитата ]
Вид известен от Японского , Восточно-Китайского и Желтого морей на север до южного Сахалина , на глубинах 10–135 м (33–443 фута). Это демерсальный вид. Нерест происходит в устьях рек ; молодая рыба может переносить широкий диапазон солености и остается в устьях рек и лагунах, созревая в течение одного года, прежде чем навсегда мигрировать в открытый океан. [1]
Особенностью этого вида является то, что он имеет очень маленький геном , который используется в качестве «эталона» для идентификации генов и других элементов в геномах человека и других позвоночных. Геном был опубликован в 2002 году Международным консорциумом генома фугу посредством полногеномного секвенирования. После запуска в 1989 году это был первый геном позвоночных после генома человека , который стал общедоступным. [5] Он остается одним из самых маленьких известных геномов позвоночных; его количество пар оснований составляет ~6%, а количество ранее известных генов, кодирующих белки, ~13% от генома человека, хотя количество хромосом (22) сравнимо с человеческим (23). Это делает его особенно полезным для сравнительных исследований. Текущие оценки показывают в общей сложности 392 376 244 пары оснований , 1138 известных и 18 093 новых гена , кодирующих белки , и 593 гена РНК . [6]
Один тип торафугу, 22-сейки фугу (что означает «фугу 22-го века»), был генетически модифицирован путем удаления четырех генов рецепторов лептина , которые контролируют аппетит. В результате увеличился аппетит и прибавка в весе, растущая в среднем в 1,9 раза быстрее, чем у обычного торафугу. Его продают в коммерческих целях как еду. [7] [8]
Как и у некоторых других рыб-фугу, некоторые органы японского фугу содержат тетродотоксин и очень токсичны. Токсин имеет высокую концентрацию в печени и яичниках, незначительно присутствует в кишечнике и плоти и отсутствует в коже и семенниках. [1]
Японский фугу классифицируется МСОП как находящийся под угрозой исчезновения . Это одна из самых ценных промысловых рыб в Японии, и хотя нынешние уловы (101 тонна в год в 2004 году по сравнению с пиком в 2000 тонн в 1987 году) невелики по сравнению с уловами многих других промысловых видов, таких как сардины и анчоусы , они кажутся неустойчивыми и препятствуют восстановлению вида после прежней чрезмерной эксплуатации. Для содействия восстановлению рекомендованы ограничения на снасти (большая часть уловов приходится на ярусный промысел ) и корректировка промысловых сезонов для защиты молоди. Этот вид широко выращивается в аквакультуре . [1]
