Финал Кубка Интертото УЕФА 1999 года выиграли Монпелье , Ювентус и Вест Хэм Юнайтед . Все три команды вышли в Кубок УЕФА .
«Вентспилс» выиграл со счетом 2:1 по сумме двух матчей.
Синт-Трейден выиграл по сумме двух матчей со счетом 8–1.
«Полония» Варшава выиграла со счетом 4:0 по сумме двух матчей.
4–4 по сумме двух матчей. Победа выиграла 4–3 по пенальти.
Со счетом 2:2 по сумме двух матчей Рудар Веленье выиграл по правилу забитых мячей на выезде.
МШК Жилина выиграла со счетом 4:0 по сумме двух матчей.
«Арарат Ереван» выиграл со счетом 2:0 по сумме двух матчей.
Вартекс выиграл со счетом 4–3 по сумме двух матчей.
Васас выиграл со счетом 7–1 по сумме двух матчей.
«Невшатель Ксамакс» выиграл со счетом 2:0 по сумме двух матчей.
Чахлэул Пятра Нямц выиграл со счетом 2:0 по сумме двух матчей.
1:1 по сумме двух матчей, «Гомель» выиграл 3:1 по пенальти.
«Ньюри Таун» выиграл со счетом 2:1 по сумме двух матчей.
По сумме двух матчей со счетом 2:2 «Карабах» выиграл по правилу выездного гола.
«Цементарница 55» выиграла со счетом 8–2 по сумме двух матчей.
«Базель» выиграл со счетом 6:0 по сумме двух матчей.
«Единство Бихач» выиграло со счетом 3–1 по сумме двух матчей.
«Флориана» выиграла со счетом 4–3 по сумме двух матчей.
ÍA выиграла со счетом 6–3 по сумме двух матчей.
«Йокерит» выиграл со счетом 7–1 по сумме двух матчей.
«Перуджа» выиграла со счетом 1:0 по сумме двух матчей.
Дуйсбург выиграл со счетом 2:1 по сумме двух матчей.
«Базель» выиграл со счетом 4:2 по сумме двух матчей.
«Ростсельмаш» выиграл со счетом 3:2 по сумме двух матчей.
3–3 по сумме двух матчей; Вартекс выиграл 5–4 по пенальти
Аустрия Лустенау выиграла со счетом 4–2 по сумме двух матчей.
Локерен выиграл со счетом 6–2 по сумме двух матчей.
«Мец» выиграл со счетом 4–2 по сумме двух матчей.
«Полония» Варшава выиграла со счетом 4–1 по сумме двух матчей.
Хаммарбю выиграл со счетом 6–2 по сумме двух матчей.
Коджаэлиспор выиграл по сумме двух матчей со счетом 3–1.
Коджаэлиспор выиграл по сумме двух матчей со счетом 9:0.
Синт-Трейден выиграл по сумме двух матчей со счетом 5–1.
Васас выиграл со счетом 3:0 по сумме двух матчей.
«Йокерит» выиграл со счетом 3:0 по сумме двух матчей.
Чахлэул Пятра Нямц выиграл по сумме двух матчей со счетом 5–2.
«Монпелье» выиграл со счетом 4–1 по сумме двух матчей.
По сумме двух матчей со счетом 1:1 «Ювентус» выиграл по правилу выездного гола.
Игра была остановлена на 114-й минуте дополнительного времени из-за того, что на поле были брошены какие-то предметы, некоторые из которых даже попали в судью. УЕФА наложила запрет на «Перуджу» и присудила победу со счетом 3:0 «Трабзонспору».
«Трабзонспор» выиграл со счетом 4–2 по сумме двух матчей.
«Вест Хэм Юнайтед» выиграл со счетом 2:1 по сумме двух матчей.
Херенвен выиграл по сумме двух матчей со счетом 4–0.
По сумме двух матчей со счетом 2:2 «Ренн» выиграл по правилу выездного гола.
По сумме двух матчей со счетом 3–3 «Гамбург» выиграл по правилу выездного гола.
«Аустрия Вена» выиграла со счетом 3:2 по сумме двух матчей.
По сумме двух матчей со счетом 2:2 «Ростсельмаш» одержал победу по правилу выездного гола.
Дуйсбург выиграл со счетом 3:0 по сумме двух матчей.
По сумме двух матчей со счетом 2:2 «Мец» выиграл по правилу выездного гола.
«Полония» Варшава выиграла со счетом 4–1 по сумме двух матчей.
«Монпелье» выиграл со счетом 3–1 по сумме двух матчей.
«Гамбург» выиграл со счетом 6–3 по сумме двух матчей.
«Ювентус» выиграл со счетом 9:1 по сумме двух матчей.
«Ренн» выиграл со счетом 4–2 по сумме двух матчей.
«Вест Хэм Юнайтед» выиграл со счетом 2:0 по сумме двух матчей.
«Мец» выиграл со счетом 6–2 по сумме двух матчей.
2–2 по сумме двух матчей; Монпелье выиграл 3–0 по пенальти
«Вест Хэм Юнайтед» выиграл со счетом 3:2 по сумме двух матчей.
«Ювентус» выиграл со счетом 4–2 по сумме двух матчей.