ГПР98

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

ADGRV1 , также известный как рецептор 98, связанный с G-белком ( GPR98 ) или очень большой рецептор 1, связанный с G-белком ( VLGR1 ), представляет собой белок , который у людей кодируется геном GPR98 . [ ^5] Было описано несколько альтернативно сплайсированных транскриптов. ^[5]

Адгезия GPCR VLGR1 является крупнейшим известным GPCR, размером 6300 аминокислот и состоящим из 90 экзонов. ^[6] Существует 8 вариантов сплайсинга VlgR1, названных VlgR1a-1e и Mass1.1-1.3. N-конец состоит из 5800 аминокислот, содержащих 35 доменов Calx-beta, один домен пентраксина и один повтор, связанный с эпилепсией. Было показано, что мутации VlgR1 приводят к синдрому Ашера. Было показано, что нокауты Vlgr1 у мышей фенокопируют синдром Ашера и приводят к аудиогенным припадкам.

Функция

Этот ген кодирует член семейства рецепторов адгезии-GPCR . ^[7] Белок связывает кальций и экспрессируется в центральной нервной системе. Он также известен как очень большой рецептор 1, связанный с G-белком , поскольку имеет длину 6300 остатков. Он содержит C-концевой 7-трансмембранный домен рецептора, тогда как большой N-концевой сегмент (5900 остатков) включает 35 связывающих кальций доменов Calx-beta и 6 доменов EAR.

Эволюция

В геноме морского ежа имеется гомолог VLGR1. ^[8]

Клиническое значение

Мутации в этом гене связаны с синдромом Ашера 2 и семейными фебрильными судорогами. ^[5]

Ссылки

1. GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000164199 – Ensembl , май 2017 г.
2. GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000069170 – Ensembl , май 2017 г.
3. "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
4. "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
5. "Ген Entrez: рецептор 98, связанный с G-белком GPR98".
6. Sun JP, Li R, Ren HZ, Xu AT, Yu X, Xu ZG (май 2013 г.). «Очень большой рецептор, связанный с G-белком (Vlgr1) в волосковых клетках». Журнал молекулярной нейронауки . 50 (1): 204–214. doi :10.1007/s12031-012-9911-5. PMID  23180093. S2CID  16730555.
7. Стейси М., Йона С. (2011). Адгезия GPCR: структура к функции (достижения в экспериментальной медицине и биологии) . Берлин: Springer. ISBN 978-1-4419-7912-4.
8. Whittaker CA, Bergeron KF, Whittle J, Brandhorst BP, Burke RD, Hynes RO (декабрь 2006 г.). «Адгесома иглокожих». Developmental Biology . 300 (1): 252–266. doi :10.1016/j.ydbio.2006.07.044. PMC 3565218. PMID  16950242 . 

Дальнейшее чтение

• Staub E, Pérez-Tur J, Siebert R, Nobile C, Moschonas NK, Deloukas P и др. (сентябрь 2002 г.). «Новый повтор EPTP определяет суперсемейство белков, вовлеченных в эпилептические расстройства». Trends in Biochemical Sciences . 27 (9): 441–444. doi :10.1016/S0968-0004(02)02163-1. PMID  12217514.
• Ishikawa K, Nagase T, Suyama M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H и др. (июнь 1998 г.). «Предсказание кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. X. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro». DNA Research . 5 (3): 169–176. doi : 10.1093/dnares/5.3.169 . PMID  9734811.
• Накаяма Дж., Хамано К., Ивасаки Н., Накахара С., Хоригоме И., Сайто Х. и др. (январь 2000 г.). «Важные доказательства связи фебрильных судорог с хромосомой 5q14-q15». Молекулярная генетика человека . 9 (1): 87–91. дои : 10.1093/hmg/9.1.87 . ПМИД  10587582.
• Пике-Даль С., Мёллер К.Г., Келли П.М., Астуто Л.М., Кремерс К.В., Горин М.Б. и др. (апрель 2000 г.). «Генетическая гетерогенность синдрома Ашера II типа: локализация в хромосоме 5q». Журнал медицинской генетики . 37 (4): 256–262. doi :10.1136/jmg.37.4.256. PMC  1734554. PMID  10745043 .
• Nikkila H, McMillan DR, Nunez BS, Pascoe L, Curnow KM, White PC (сентябрь 2000 г.). «Сходство последовательностей между новым предполагаемым рецептором, связанным с G-белком, и обменниками Na+/Ca2+ определяет домен связывания катионов». Молекулярная эндокринология . 14 (9): 1351–1364. doi :10.1210/me.14.9.1351. PMID  10976914.
• Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W и др. (март 2001 г.). «К каталогу человеческих генов и белков: секвенирование и анализ 500 новых полных кодирующих белок человеческих кДНК». Genome Research . 11 (3): 422–435. doi :10.1101/gr.GR1547R. PMC  311072 . PMID  11230166.
• Skradski SL, Clark AM, Jiang H, White HS, Fu YH, Ptácek LJ (август 2001 г.). «Новый ген, вызывающий менделевскую аудиогенную эпилепсию у мышей». Neuron . 31 (4): 537–544. doi : 10.1016/S0896-6273(01)00397-X . PMID  11545713. S2CID  14468960.
• McMillan DR, Kayes-Wandover KM, Richardson JA, White PC (январь 2002 г.). «Очень большой рецептор-1, связанный с G-белком, крупнейший известный белок клеточной поверхности, высоко экспрессируется в развивающейся центральной нервной системе». Журнал биологической химии . 277 (1): 785–792. doi : 10.1074/jbc.M108929200 . PMID  11606593.
• Nagase T, Kikuno R, Ohara O (декабрь 2001 г.). «Предсказание кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XXII. Полные последовательности 50 новых клонов кДНК, кодирующих большие белки». DNA Research . 8 (6): 319–327. doi :10.1093/dnares/8.6.319. PMID  11853319.
• Nakayama J, Fu YH, Clark AM, Nakahara S, Hamano K, Iwasaki N и др. (ноябрь 2002 г.). «Нессенс-мутация гена MASS1 в семье с фебрильными и афебрильными судорогами». Annals of Neurology . 52 (5): 654–657. doi :10.1002/ana.10347. PMID  12402266. S2CID  36357793.
• Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, Otsuki T, Sugiyama T, Irie R и др. (январь 2004 г.). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных человеческих кДНК». Nature Genetics . 36 (1): 40–45. doi : 10.1038/ng1285 . PMID  14702039.
• Weston MD, Luijendijk MW, Humphrey KD, Möller C, Kimberling WJ (февраль 2004 г.). «Мутации в гене VLGR1 вовлекают сигнализацию G-белка в патогенез синдрома Ашера II типа». American Journal of Human Genetics . 74 (2): 357–366. doi :10.1086/381685. PMC  1181933 . PMID  14740321.
• Бьярнадоттир Т.К., Фредрикссон Р., Хёглунд П.Дж., Глориам Д.Е., Лагерстрём М.К., Шиот Х.Б. (июль 2004 г.). «Репертуар семейства адгезивных рецепторов, связанных с G-белком, человека и мыши». Геномика . 84 (1): 23–33. дои : 10.1016/j.ygeno.2003.12.004. ПМИД  15203201.
• Fu GK, Wang JT, Yang J, Au-Young J, Stuve LL (июль 2004 г.). «Круговая быстрая амплификация концов кДНК для высокопроизводительного клонирования частичных генов». Genomics . 84 (1): 205–210. doi :10.1016/j.ygeno.2004.01.011. PMID  15203218.
• Schwartz SB, Aleman TS, Cideciyan AV, Windsor EA, Sumaroka A, Roman AJ и др. (февраль 2005 г.). «Проявление заболевания при синдроме Ашера, вызванное мутацией гена VLGR1 (USH2C) и сравнение с фенотипом USH2A». Investigative Ophthalmology & Visual Science . 46 (2): 734–743. doi :10.1167/iovs.04-1136. PMID  15671307.
• Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, Ota T, Nishikawa T, Yamashita R и др. (январь 2006 г.). «Диверсификация транскрипционной модуляции: крупномасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов человеческих генов». Genome Research . 16 (1): 55–65. doi :10.1101/gr.4039406. PMC  1356129. PMID  16344560 .

Внешние ссылки

• Запись GeneReviews/NCBI/NIH/UW о синдроме Ашера типа II