stringtranslate.com

Усть-Ишимский мужчина

57°44′38″с.ш. 71°12′00″в.д. / 57.744°с.ш. 71.200°в.д. / 57.744; 71.200

Усть-ишимский человек — это термин, данный 45 000-летним останкам одного из ранних современных людей , населявших Западную Сибирь . [1] Ископаемое примечательно тем, что оно имело неповрежденную ДНК, что позволило провести полную расшифровку его генома , одного из старейших современных геномов человека , который был расшифрован таким образом. [1] [2]

Останки состоят из одной кости — левой бедренной кости — мужчины -охотника-собирателя , которая была обнаружена в 2008 году [3] торчащей из берега реки Иртыш Николаем Перистовым, российским скульптором, специализирующимся на резьбе по бивню мамонта . [1] Перистов показал окаменелость судебно-медицинскому эксперту, который предположил, что она может иметь человеческое происхождение. [1] Окаменелость была названа в честь Усть-Ишимского района Сибири, где она была обнаружена. [1]

Секвенирование генома

Окаменелость была исследована палеоантропологами в Институте эволюционной антропологии Макса Планка , расположенном в Лейпциге , Германия . Радиоуглеродное датирование показало, что окаменелость датируется 45 000 лет назад, что делает ее старейшей человеческой окаменелостью, датированной таким образом. [1] Ученые обнаружили, что ДНК не повреждена, и смогли секвенировать полный геном усть-ишимского человека в соответствии с современными стандартами качества. [1]

Y-ДНК и мтДНК

Усть-ишимский мужчина принадлежит к Y-ДНК гаплогруппе K2 . Два субклада K2 — K2a и K2b, и было обнаружено, что он является положительным по некоторым, но не всем SNP субклада K2a (или NO*), например M2308. [4] [5] [6] В оригинальной статье он был классифицирован только как гаплогруппа K-M9 (KxLT). [6] [7] [8]

Он принадлежал к митохондриальной ДНК-гаплогруппе R* , отличающейся от корневой последовательности R одной мутацией.

Обе эти гаплогруппы и их потомки в настоящее время встречаются среди популяций по всей Евразии , Океании и Америке , хотя прямых потомков конкретных линий усть-ишимцев среди современных популяций не обнаружено.

Изучение секвенированного генома показывает, что усть-ишимский человек жил в промежуток времени между первой волной анатомически современных людей (270 000 лет назад), которые мигрировали из Африки, и расхождением этой популяции на отдельные популяции (45 000 лет назад) с точки зрения аутосомной ДНК в разных частях Евразии. [3] Следовательно, усть-ишимский человек не более тесно связан с первыми двумя основными миграциями Homo Sapiens на восток из Африки в Азию: группой, которая мигрировала вдоль побережья Южной Азии , или группой, которая двигалась на северо-восток через Центральную Азию . [9] По сравнению с другими древними останками усть-ишимский человек более тесно связан с точки зрения аутосомной ДНК с тяньюаньским человеком , найденным недалеко от Пекина и датируемым 42 000–39 000 лет назад; Мальтийский мальчик (или МА-1), ребенок, живший 24 000 лет назад вдоль реки Большая Белая близ современного Иркутска в Сибири, или; человек из Ла-Браньи — охотник-собиратель, живший в Ла-Бранье (современная Испания ) около 8 000 лет назад. [10] [11] [12]

Связь с неандертальцами

Анализ современных человеческих геномов показывает, что люди скрещивались с неандертальцами между 86 000 и 37 000 лет назад, [13] в результате чего ДНК современных людей за пределами Африки содержит от 1,5 до 2,1 процента ДНК неандертальского происхождения. [14] ДНК неандертальцев у современных людей встречается в разорванных фрагментах; однако ДНК неандертальцев у усть-ишимского человека встречается в кластерах, что указывает на то, что усть-ишимский человек жил сразу после генетического обмена. [10] Геномное секвенирование усть-ишимского человека привело к уточнению предполагаемой даты спаривания между двумя видами гомининов до 52 000 и 58 000 лет назад. [10]

Родство между денисовцами и усть-ишимцами не установлено, хотя у денисовцев есть потомки в Океании и Азии.

Связь с современными популяциями человека

Усть-Ишим был в равной степени связан с современными жителями Восточной Азии , Океании и некоторыми древними популяциями Западной Евразии , такими как образец Гойета . [16] [10] Современные европейцы более тесно связаны с другими древними останками. [17] «Вывод о том, что индивидуум Усть-Ишима в равной степени тесно связан с современными азиатами и с 8000-24000-летними индивидуумами из Западной Евразии, но не с современными европейцами, совместим с гипотезой о том, что современные европейцы получили часть своего происхождения от популяции, которая не участвовала в первоначальном расселении современных людей в Европе и Азии». [18]

В исследовании 2016 года современные тибетцы были идентифицированы как современная популяция, которая имеет наибольшее количество аллелей, общих с усть-ишимским человеком. [19] Согласно исследованию 2017 года, «сибирские и восточноазиатские популяции разделяют 38% своего происхождения» с усть-ишимским человеком. [20] Исследование 2021 года утверждает, что индивидуумы Усть-Ишима и Оазе 1 не показали большего сродства с какими-либо современными западными или восточными евразийскими популяциями, что позволяет предположить, что они не внесли свой вклад в происхождение более поздних евразийских популяций, как было показано ранее. [21]

В 2022 году исследование определило, что усть-ишимский человек был частью начальной волны верхнего палеолита (>45 тыс. лет назад), «приписываемой движению населения с единообразными генетическими признаками и материальной культурой» ( древние восточные евразийцы ), и разделял глубокую родословную с Бачо Киро и тяньюаньским человеком , а также с предками современных папуасов (австралазийцев). Усть-ишимский человек лучше всего описывается как базальный для всех современных восточноевразийских популяций, и отделился от своего предка вскоре после расхождения с древними западными евразийцами (представленными образцом Костенки-14 ). [22]

Ссылки

  1. ^ abcdefg Callaway, Ewen & Nature magazine (23 октября 2014 г.). «Геном 45000-летнего человека секвенирован». Scientific American . Получено 24 октября 2014 г. .
  2. ^ Прюфер, Кей; Пост, Козимо; Ю, Хэ; Стессель, Александр; Спиру, Мария А.; Девизе, Тибо; Маттонаи, Марко; Рибекини, Эрика; Хайэм, Томас; Велеминский, Петр; Бружек, Ярослав; Краузе, Йоханнес (2021). «Последовательность генома черепа современного человека возрастом более 45 000 лет из Златы-Куна в Чехии». Экология и эволюция природы . 5 (6): 820–825. Бибкод : 2021NatEE...5..820P. дои : 10.1038/s41559-021-01443-x. ISSN  2397-334Х. ПМЦ 8175239 . PMID  33828249. 
  3. ^ ab "Самый ранний современный человек, секвенированный". Max-Planck-Gesellschaft . 22 октября 2014 г. Получено 30 октября 2014 г.
  4. ^ "K-M2308 YTree".
  5. ^ "K-Y28299 YTree".
  6. ^ аб Позник, Г.Д.; Сюэ, Ю; Мендес, Флорида; Виллемс, Т.Ф; Массайя, А; Уилсон Сейрес, Массачусетс; Аюб, К; Маккарти, SA; Наречания, А; Кашин С; Чен, Ю; Банерджи, Р; Родригес-Флорес, Дж.Л.; Сересо, М; Шао, Х; Гимрек, М; Малхотра, А; Лузада, С; Десаль, Р; Ричи, Дж. Р.; Сервейра, Э; Фицджеральд, Т.В.; Гаррисон, Э; Маркетта, А; Миттельман, Д; Романович, М; Чжан, К; Чжэн-Брэдли, X; Абекасис, Г.Р.; и др. (2016). «Пунктуированные всплески в демографии мужчин, выведенные из 1244 последовательностей Y-хромосомы по всему миру». Nature Genetics . 48 (6): 593–599. doi :10.1038/ng.3559. PMC 4884158 . PMID  27111036. 
  7. ^ YFull Haplogroup YTree v5.06 на 25 сентября 2017 г.
  8. ^ Кармин, Моника; Сааг, Лаури; Висенте, Марио; и др. (2015). "", "Недавнее узкое место разнообразия Y-хромосомы совпадает с глобальным изменением в культуре". Genome Research . 25 (4): 459–466. doi :10.1101/gr.186684.114. PMC 4381518 . PMID  25770088. 
  9. ^ Цяомей Фу, Хэн Ли, Прия Мурджани, Флора Джей, Сергей М. Слепченко, Алексей А. Бондарев, Филип Л. Ф. Джонсон, Айинуэр Аксиму-Петри, Кей Прюфер, Чезаре де Филиппо, Матиас Мейер, Николас Цвинс, Доминго К. Салазар- Гарсиа, Ярослав Кузьмин, Сьюзен Дж. Китс, Павел А. Косинцев, Дмитрий И. Ражев, Майкл П. Ричардс, Николай В. Перистов, Майкл Лахманн, Катерина Дука, Томас Ф.Г. Хайэм, Монтгомери Слаткин, Жан-Жак Юблин, Дэвид Райх, Джанет Келсо, Т. Бенс Виола и Сванте Пяабо (23 октября 2014 г.). «Последовательность генома современного человека возрастом 45 000 лет из Западной Сибири». Nature . 514 (7523): 445–449. Bibcode :2014Natur.514..445F. doi :10.1038/nature13810. hdl :10550/42071. PMC 4753769 . PMID  25341783. {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  10. ^ abcd Уэйд, Лиззи (22 октября 2014 г.). «Самый древний человеческий геном раскрывает, когда наши предки занимались сексом с неандертальцами». Наука . Американская ассоциация содействия развитию науки . Получено 24 октября 2014 г. .
  11. ^ Балтер, Майкл (25 октября 2013 г.). «Древняя ДНК связывает коренных американцев с Европой». Science . 342 (6157): 409–410. Bibcode :2013Sci...342..409B. doi : 10.1126/science.342.6157.409 . PMID  24159019.
  12. ^ Балтер, Майкл (26 января 2014 г.). «Как фермерство изменило наши геномы». Наука . Американская ассоциация содействия развитию науки . Получено 25 октября 2014 г.
  13. ^ Чой, Чарльз К. (4 октября 2012 г.). «Люди прекратили неандертальский секс после открытия Евразии». LiveScience . Получено 25 октября 2014 г.
  14. ^ Чой, Чарльз К. (18 декабря 2013 г.). «Геном неандертальской женщины раскрывает неизвестную человеческую родословную». LiveScience . Получено 25 октября 2014 г.
  15. ^ Гакухари, Такаши; Накагоме, Шигеки; Расмуссен, Саймон; Аллентофт, Мортен Э. (25 августа 2020 г.). «Анализ последовательности древнего генома Дзёмон проливает свет на закономерности миграции ранних популяций Восточной Азии». Communications Biology . 3 (1): Рис.1 A, B. doi :10.1038/s42003-020-01162-2. hdl : 20.500.12000/50006 . ISSN  2399-3642.
  16. ^ Фу, Цяомэй; Ли, Хэн; Мурджани, Прия; Джей, Флора; Слепченко Сергей М.; Бондарев Алексей А.; Джонсон, Филип Л.Ф.; Аксиму-Петри, Айинуэр; Прюфер, Кей; де Филиппо, Чезаре; Мейер, Матиас; Цвинс, Николас; Саласар-Гарсия, Доминго К.; Кузьмин Ярослав Васильевич; Китс, Сьюзен Г.; Косинцев Павел А.; Ражев Дмитрий Иванович; Ричардс, Майкл П.; Перистов Николай Владимирович; Лахманн, Майкл; Дука, Катерина; Хайэм, Томас Ф.Г.; Слаткин, Монтгомери; Юблин, Жан-Жак; Райх, Дэвид; Келсо, Джанет; Виола, Т. Бенс; Паабо, Сванте (2014-10-23). ​​"Геномная последовательность 45000-летнего современного человека из Западной Сибири". Nature . 514 (7523): 445–449. Bibcode :2014Natur.514..445F. doi : 10.1038/nature13810. ISSN  0028-0836. PMC 4753769. PMID 25341783  . 
  17. ^ Гиббонс, Энн (4 сентября 2014 г.). «Трехкомпонентное происхождение европейцев». Наука . Американская ассоциация содействия развитию науки. Архивировано из оригинала 11 октября 2014 г. Получено 30 октября 2014 г.
  18. ^ Фу, Цяомэй; Ли, Хэн; Мурджани, Прия; Джей, Флора; Слепченко Сергей М.; Бондарев Алексей А.; Джонсон, Филип Л.Ф.; Петри, Айинуэр А.; Прюфер, Кей; де Филиппо, Чезаре; Мейер, Матиас; Цвинс, Николас; Саласар-Гарсия, Доминго К.; Кузьмин Ярослав Васильевич; Китс, Сьюзен Г. (23 октября 2014 г.). «Последовательность генома современного человека возрастом 45 000 лет из Западной Сибири». Природа . 514 (7523): 445–449. Бибкод : 2014Natur.514..445F. дои : 10.1038/nature13810. ISSN  0028-0836. PMC 4753769. PMID  25341783 . 
  19. ^ Лу, Донгшенг и др. (1 сентября 2016 г.). «Происхождение предков и генетическая история тибетских горцев». Американский журнал генетики человека . 99 (3): 580–594. doi :10.1016/j.ajhg.2016.07.002. PMC 5011065. PMID  27569548 . 
  20. ^ Вонг, Эмили ХМ; Хрунин, Андрей; Николс, Лариса; Пушкарев, Дмитрий; Хохрин, Денис; Вербенко, Дмитрий; Евграфов, Олег; Ноулз, Джеймс; Новембре, Джон (2017-01-01). "Реконструкция генетической истории сибирских и северо-восточных европейских популяций". Genome Research . 27 (1): 1–14. doi :10.1101/gr.202945.115. ISSN  1088-9051. PMC 5204334 . PMID  27965293. 
  21. ^ Hajdinjak, Mateja; Mafessoni, Fabrizio; Skov, Laurits; Vernot, Benjamin; Hübner, Alexander; Fu, Qiaomei; Essel, Elena; Nagel, Sarah; Nickel, Birgit; Richter, Julia; Moldovan, Oana Teodora; Constantin, Silviu; Endarova, Elena; Zahariev, Nikolay; Spasov, Rosen (апрель 2021 г.). "Initial Upper Palaeolithic people in Europe had recently Neanderthal ancestry". Nature . 592 (7853): 253–257. Bibcode :2021Natur.592..253H. doi :10.1038/s41586-021-03335-3. ISSN  1476-4687. PMC 8026394 . PMID  33828320. 
  22. ^ «Генетика и материальная культура подтверждают повторные экспансии в палеолитическую Евразию из центра расселения в Африке». academic.oup.com . Получено 10 ноября 2023 г.