WDR5

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Белок 5, содержащий повторы WD, представляет собой белок , который у людей кодируется геном WDR5 . ^{[5] [6]}

Этот ген кодирует член семейства белков повторов WD. Повторы WD представляют собой минимально консервативные области из приблизительно 40 аминокислот, обычно заключенные в скобки gly-his и trp-asp (GH-WD), что может способствовать образованию гетеротримерных или мультипротеиновых комплексов. Члены этого семейства участвуют в различных клеточных процессах, включая прогрессию клеточного цикла, передачу сигнала, апоптоз и регуляцию генов. Этот белок содержит 7 повторов WD. Были идентифицированы альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие тот же белок. ^[6]

Взаимодействия

Было показано, что WDR5 взаимодействует с фактором клетки-хозяина C1 ^{[7] [8]} и MLL . ^[7] Он также взаимодействует с длинной некодирующей РНК HOTTIP и с lncRNA NeST. ^{[9] [10]} WDR5 является ключевым фактором, определяющим присоединение MYC к хроматину ^[11]

Ссылки

1. GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000196363 – Ensembl , май 2017 г.
2. GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000026917 – Ensembl , май 2017 г.
3. "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
4. "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
5. Gori F, Divieti P, Demay MB (декабрь 2001 г.). «Клонирование и характеристика нового белка с повтором WD-40, который значительно ускоряет дифференциацию остеобластов». J Biol Chem . 276 (49): 46515–22. doi : 10.1074/jbc.M105757200 . PMID  11551928.
6. "Ген Entrez: WDR5 WD повторяющийся домен 5".
7. Yokoyama, Akihiko; Wang Zhong; Wysocka Joanna; Sanyal Mrinmoy; Aufiero Deborah J; Kitabayashi Issay; Herr Winship; Cleary Michael L (июль 2004 г.). "Leukemia proto-oncoprotein MLL forms a SET1-like histone methyltransferase complex with menin to regulation Hox gene expression". Mol. Cell. Biol . 24 (13): 5639–49. doi :10.1128/MCB.24.13.5639-5649.2004. ISSN  0270-7306. PMC 480881. PMID 15199122  . 
8. Высоцка, Джоанна; Майерс Майкл П; Лаэрти Кэрол Д; Эйзенман Роберт Н; Герр Уиншип (апрель 2003 г.). "Человеческая деацетилаза Sin3 и метилтрансфераза гистона H3-K4, связанная с тритораксом Set1/Ash2, селективно связаны с фактором пролиферации клеток HCF-1". Genes Dev . 17 (7): 896–911. doi :10.1101/gad.252103. ISSN  0890-9369. PMC 196026. PMID 12670868  . 
9. Уэллс, Александрия К.; Побезинская, Елена Л.; Побезинский, Леонид А. (апрель 2020 г.). «Некодирующие РНК в биологии Т-клеток CD8». Молекулярная иммунология . 120 : 67–73. doi :10.1016/j.molimm.2020.01.023. ISSN  1872-9142. PMC 7093237 . PMID  32085976. 
10. Wang KC, Yang YW, Liu B, Sanyal A, Corces-Zimmerman R, Chen Y и др. (2011). «Длинная некодирующая РНК поддерживает активный хроматин для координации гомеозисной экспрессии генов». Nature . 472 (7341): 120–4. Bibcode :2011Natur.472..120W. doi :10.1038/nature09819. PMC 3670758 . PMID  21423168. 
11. Томас, Л. Р.; Танси, В. П. (2015). «Взаимодействие с WDR5 способствует распознаванию целевых генов и возникновению опухолей MYC». Molecular Cell . 58 (3): 1–13. doi :10.1016/j.molcel.2015.02.028. PMC 4427524 . PMID  25818646. 

Дальнейшее чтение

• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
• Wysocka J, Myers MP, Laherty CD и др. (2003). "Человеческая деацетилаза Sin3 и метилтрансфераза гистона H3-K4, связанная с тритораксом Set1/Ash2, селективно связаны с фактором пролиферации клеток HCF-1". Genes Dev . 17 (7): 896–911. doi :10.1101/gad.252103. PMC  196026. PMID  12670868 .
• Gori F, Demay MB (2004). "BIG-3, новый белок с повтором WD-40, экспрессируется в развивающейся пластинке роста и ускоряет дифференциацию хондроцитов in vitro". Эндокринология . 145 (3): 1050–4. doi : 10.1210/en.2003-1314 . PMID  14657013.
• Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных человеческих кДНК». Nat. Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID  14702039.
• Yokoyama A, Wang Z, Wysocka J, et al. (2004). "Протоонкопротеин лейкемии MLL образует комплекс метилтрансферазы гистонов типа SET1 с менином для регуляции экспрессии гена Hox". Mol. Cell. Biol . 24 (13): 5639–49. doi : 10.1128/MCB.24.13.5639-5649.2004. PMC  480881. PMID  15199122.
• Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA и др. (2004). «Состояние, качество и расширение проекта NIH по полноразмерной ДНК: коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC  528928. PMID  15489334 .
• Andersen JS, Lam YW, Leung AK и др. (2005). «Динамика ядрышкового протеома». Nature . 433 (7021): 77–83. Bibcode :2005Natur.433...77A. doi :10.1038/nature03207. PMID  15635413. S2CID  4344740.
• Wysocka J, Swigut T, Milne TA и др. (2005). «WDR5 ассоциируется с гистоном H3, метилированным в K4, и необходим для метилирования H3 K4 и развития позвоночных». Cell . 121 (6): 859–72. doi : 10.1016/j.cell.2005.03.036 . PMID  15960974. S2CID  17521631.
• Dou Y, Milne TA, Tackett AJ и др. (2005). "Физическая ассоциация и функция координат метилтрансферазы H3 K4 MLL1 и ацетилтрансферазы H4 K16 MOF". Cell . 121 (6): 873–85. doi : 10.1016/j.cell.2005.04.031 . PMID  15960975. S2CID  14717470.
• Rual JF, Venkatesan K, Hao T и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Nature . 437 (7062): 1173–8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Gori F, Friedman L, Demay MB (2006). «Wdr5, новый белок с повтором WD, регулирует дифференцировку остеобластов и хондроцитов in vivo». Журнал Musculoskeletal & Neuronal Interactions . 5 (4): 338–9. PMID  16340128.
• Lim J, Hao T, Shaw C и др. (2006). «Сеть взаимодействия белок-белок при наследственных атаксиях и расстройствах дегенерации клеток Пуркинье у человека». Cell . 125 (4): 801–14. doi : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . PMID  16713569. S2CID  13709685.
• Ruthenburg AJ, Wang W, Graybosch DM и др. (2006). «Распознавание и презентация гистона H3 модулем WDR5 комплекса MLL1». Nat. Struct. Mol. Biol . 13 (8): 704–12. doi :10.1038/nsmb1119. PMC  4698793. PMID  16829959 .
• Кутюр JF, Коллазо E, Тривел RC (2006). «Молекулярное распознавание гистона H3 белком WD40 WDR5». Nat. Struct. Mol. Biol . 13 (8): 698–703. doi :10.1038/nsmb1116. PMID  16829960. S2CID  26165068.
• Dou Y, Milne TA, Ruthenburg AJ и др. (2006). «Регулирование активности метилтрансферазы MLL1 H3K4 ее основными компонентами». Nat. Struct. Mol. Biol . 13 (8): 713–9. doi :10.1038/nsmb1128. PMID  16878130. S2CID  12849159.
• Schuetz A, Allali-Hassani A, Martín F и др. (2006). «Структурная основа молекулярного распознавания и презентации гистона H3 с помощью WDR5». EMBO J. 25 ( 18): 4245–52. doi :10.1038/sj.emboj.7601316. PMC  1570438. PMID  16946699 .
• Ewing RM, Chu P, Elisma F и др. (2007). "Крупномасштабное картирование взаимодействий белок-белок человека с помощью масс-спектрометрии". Mol. Syst. Biol . 3 (1): 89. doi :10.1038/msb4100134. PMC  1847948 . PMID  17353931.
• Bryan AF, Wang J, Howard GC и др. (2020). «WDR5 — это консервативный регулятор экспрессии генов синтеза белка». Nucleic Acids Research . 48 (6): 2924–2941. doi : 10.1093/nar/gkaa051 . PMC  7102967. PMID  31996893 .