stringtranslate.com

Триходерма атровирид

Trichoderma atroviride — это нитчатый вид грибов , обычно встречающийся в почве. [1] Этот вид грибов представляет особый интерес для исследователей из-за множества вторичных метаболитов, которые он производит и которые используются в промышленности . [1] Род Trichoderma известен своей повсеместностью практически во всех почвах и простотой культивирования. Многие Trichoderma также являются авирулентными симбионтами растений . [2]

Таксономия

Этот организм имеет секвенированную ДНК и загружен в базу данных NCBI. Сокращенное таксономическое описание выглядит следующим образом: Eukaryota; Fungi; Dikarya; Ascomycota; Pezizomycotina; Sordariomycetes; Hypocreomycetidae; Hypocreales; Hypocreaceae; Trichoderma. Полный таксономический порядок можно найти на веб-сайте NCBI. [3] Первое описание рода Trichoderma датируется 1794 годом, но отдельные виды не были указаны, и только в 1969 году была установлена ​​структура для идентификации видов Trichoderma . [4] Trichoderma atroviride также имеет несколько синонимов и более старых названий, которые можно найти в поле видов. [5]

Описание

Изображения T. atroviride, растущего на чашках, показывают зеленые плодовые тела и светочувствительные конидии. На этих снимках их также можно увидеть растущими в концентрических круговых зонах на поверхности агара (см. изображение в рамке видов). [6] [4] Виды Trichoderma повсеместно описываются как имеющие длинные нитевидные гифы и способность прорастать на многих различных субстратах. Когда гриб растет, он сначала белый, но затем становится различных оттенков зеленого. Конидиеносцы, как правило, имеют неправильную форму и количество выделяемых конидий, а также светочувствительны и выделяются при воздействии света. [7] Наконец, Trichoderma известны своими быстрыми темпами роста и способностью колонизировать большинство субстратов. [7]

Среда обитания и экология

Trichoderma atroviride — довольно распространенные организмы, они встречаются в почвах как в тропических, так и в умеренных зонах по всему миру. [8] Этот грибок встречается на всех континентах, и обычно встречается в Европе, Северной и Южной Америке и Австралии (см. карту ареала). [9] T. atroviride — микопаразит-сапрофит, то есть он паразитирует на других грибах и получает пищу, поглощая растворенные органические вещества. [10] T. atroviride встречаются во многих субстратах, включая гниющую древесину и плодовые тела грибов, [11] и, как известно, могут использовать широкий спектр субстратов в качестве источников углерода и азота. Наконец, T. atroviride имеет широкий диапазон температур выживания от -1 до 35 °C. [12]

Отношение к людям

Trichoderma atroviride имеет множество применений, которые делают их важными для людей. Они используются в качестве природных агентов биологического контроля как для насекомых, так и для других грибов, [13] они могут поглощать загрязняющие вещества, содержащие тяжелые металлы, [14] и они используются в качестве модельных организмов для лучшего понимания генетического контроля механизмов, зависящих от света. [15]

Фунгицид

Насекомые и патогенные грибы представляют собой значительную угрозу для сельского хозяйства во всем мире. [16] К сожалению, синтетические пестициды и фунгициды могут быть вредны для окружающей среды и часто не очень эффективны в долгосрочной перспективе из-за эволюции. [17] T. atroviride является микопаразитом и, таким образом, эффективным организмом, помогающим бороться с грибковыми патогенами растений. В частности, T. atroviride может конкурировать за питательные вещества и вырабатывать ферменты, разрушающие клеточную стенку грибка, чтобы убить его гриб-хозяин. Кроме того, исследователи экспериментировали с геномом T. atroviride , чтобы заставить его экспрессировать еще более агрессивные фунгицидные агенты. [18] Кроме того, T. atroviride в настоящее время изучается как метод защиты сельскохозяйственных культур от насекомых из-за их способности вырабатывать природные инсектициды, которыми они защищают себя, поэтому их не едят. [13]

Биоремедиация

Загрязнители, вызванные промышленностью, представляют собой огромную экологическую проблему, решение которой требует больших затрат. Недавно было обнаружено, что T. atroviride обладает способностью поглощать некоторые из этих тяжелых металлов. Это наблюдалось in vitro на очистных сооружениях сточных вод и в исследовательских условиях на чашках Петри. Этот тип биоремедиации может сыграть важную роль в решении кризисов загрязнения тяжелыми металлами. [14]

Генетическая модель

Понимание биологических циркадных часов всегда было важно для изучения того, как организмы реагируют на стимулы. Хорошим модельным организмом для этого исследования является тот, который имеет четкую связь с абиотическим стимулом, который легко реплицировать и имеет легко манипулируемый геном. T. atroviride удовлетворяет обоим этим требованиям, поскольку он выпускает споры в ответ на свет и имеет консервативный геном, который можно редактировать с помощью известных генетических инструментов. Это позволило T. atroviride стать инструментальным модельным организмом в исследовании, направленном на понимание того, как организмы реагируют на стимулы. [11]

Ссылки

  1. ^ ab "Trichoderma Atroviride - обзор | Темы ScienceDirect". www.sciencedirect.com . Получено 05.05.2023 .
  2. ^ Харман, Гэри Э.; Хауэлл, Чарльз Р.; Витербо, Ада; Чет, Илан; Лорито, Маттео (2004). «Виды Trichoderma — оппортунистические, авирулентные симбионты растений». Nature Reviews Microbiology . 2 (1): 43–56. doi :10.1038/nrmicro797. ISSN  1740-1526. PMID  15035008. S2CID  17404703.
  3. ^ Шох, Конрад Л; Чуфо, Стейси; Домрачев Михаил; Хоттон, Кэрол Л.; Каннан, Сивакумар; Хованская, Рогнеда; Лейпе, Детлеф; Маквей, Ричард; О'Нил, Кэтлин; Робберце, Барбара; Шарма, Шобха; Сусов Владимир; Салливан, Джон П; Сунь, Лу; Тернер, Шон (01 января 2020 г.). «Таксономия NCBI: комплексная обновленная информация о курировании, ресурсах и инструментах». База данных . 2020 : baaa062. doi : 10.1093/database/baaa062. ISSN  1758-0463. ПМК 7408187 . ПМИД  32761142. 
  4. ^ ab Шустер, Андре; Шмолл, Моника (2010). «Биология и биотехнология Trichoderma». Прикладная микробиология и биотехнология . 87 (3): 787–799. doi :10.1007/s00253-010-2632-1. ISSN  0175-7598. PMC 2886115. PMID 20461510  . 
  5. ^ "Виды Fungorum - синонимика видов" . www.speciesfungorum.org . Проверено 6 мая 2023 г.
  6. ^ Шустер, Андре; Шмолл, Моника (2010-07-01). «Биология и биотехнология Trichoderma». Прикладная микробиология и биотехнология . 87 (3): 787–799. doi :10.1007/s00253-010-2632-1. ISSN  1432-0614. PMC 2886115. PMID 20461510  . 
  7. ^ ab "Trichoderma". Микология | Университет Аделаиды . Получено 2023-05-05 .
  8. ^ Кубичек, Кристиан П.; Эррера-Эстрелла, Альфредо; Зайдл-Зейбот, Верена; Мартинес, Диего А; Дружинина Ирина С; Тон, Майкл; Цайлингер, Сюзанна; Касас-Флорес, Серджио; Хорвиц, Бенджамин А; Мукерджи, Прасун К; Мукерджи, Мала; Кредич, Ласло; Алькарас, Луис Д; Аэртс, Андреа; Антал, Жужанна (2011). «Сравнительный анализ последовательности генома подчеркивает микопаразитизм как наследственный образ жизни триходермы». Геномная биология . 12 (4): 40 рандов. дои : 10.1186/gb-2011-12-4-r40 . ISSN  1474-760X. PMC 3218866. PMID  21501500 . 
  9. ^ Trichoderma atroviride P.Karst. в Секретариате GBIF (2022). Магистральная таксономия GBIF. Набор данных контрольного списка doi :10.15468/39omei, доступ через GBIF.org 06.05.2023.
  10. ^ Кубичек, Кристиан П.; Эррера-Эстрелла, Альфредо; Зайдл-Зейбот, Верена; Мартинес, Диего А; Дружинина Ирина С; Тон, Майкл; Цайлингер, Сюзанна; Касас-Флорес, Серджио; Хорвиц, Бенджамин А; Мукерджи, Прасун К; Мукерджи, Мала; Кредич, Ласло; Алькарас, Луис Д; Аэртс, Андреа; Антал, Жужанна (2011). «Сравнительный анализ последовательности генома подчеркивает микопаразитизм как наследственный образ жизни триходермы». Геномная биология . 12 (4): 40 рандов. дои : 10.1186/gb-2011-12-4-r40 . ISSN  1474-760X. PMC 3218866. PMID  21501500 . 
  11. ^ аб Энрикес-Уррутия, Марлен; Спаннер, Ребекка; Оливарес-Янес, Консуэло; Сегель-Авелло, Альдо; Перес-Лара, Родриго; Гильен-Алонсо, Эктор; Винклер, Роберт; Эррера-Эстрелла, Альфредо; Канесса, Пауло; Ларрондо, Луис Ф (11 августа 2022 г.). «Циркадные колебания атровирида Trichoderma и роль компонентов основных часов во вторичном метаболизме, развитии и микопаразитизме против фитопатогена Botrytis cinerea». электронная жизнь . 11 : е71358. дои : 10.7554/eLife.71358 . ISSN  2050-084X. ПМЦ 9427114 . PMID  35950750. S2CID  251493975. 
  12. ^ "Главная - Trichoderma atroviride SC1 v1.0". mycocosm.jgi.doe.gov . Получено 2023-05-06 .
  13. ^ ab Poveda, Jorge (2021). «Триходерма как средство биологической борьбы с вредителями: новые способы использования микопаразита». Биологический контроль . 159 : 104634. doi : 10.1016/j.biocontrol.2021.104634. hdl : 2454/41807 . S2CID  235522351.
  14. ^ ab Лопес Эрраскин, Э.; Васкес, К. (2003). «Переносимость и поглощение тяжелых металлов Trichoderma atroviride, выделенным из ила». Chemosphere . 50 (1): 137–143. Bibcode :2003Chmsp..50..137L. doi :10.1016/S0045-6535(02)00485-X. PMID  12656239.
  15. ^ Рокас, Антонис (2021-07-14). Оценка редактора: Циркадные колебания в Trichoderma atroviride и роль основных компонентов часов во вторичном метаболизме, развитии и микопаразитизме против фитопатогена Botrytis cinerea . doi : 10.7554/elife.71358.sa0 .
  16. ^ Новые направления биологических исследований в сельском хозяйстве. 1985-01-01. doi :10.17226/13. ISBN 978-0-309-07850-4. PMID  25032394.
  17. ^ Дэвис, Кэтрин Р.; Вольгемут, Франциска; Янг, Таран; Вайолет, Джозеф; Дикинсон, Мэтью; Сандерс, Ян-Виллем; Валлиерес, Синди; Эйвери, Саймон В. (2021). «Развивающиеся проблемы и стратегии борьбы с грибками в цепочке поставок продовольствия». Fungal Biology Reviews . 36 : 15–26. doi :10.1016/j.fbr.2021.01.003. PMC 8127832. PMID  34084209 . 
  18. ^ Бруннер, Курт; Цайлингер, Сюзанна; Силиенто, Розалия; Ву, Шеридиан Л.; Лорито, Маттео; Кубичек, Кристиан П.; Мах, Роберт Л. (2005). «Улучшение грибкового биоконтролирующего агента Trichoderma atroviride для усиления как антагонизма, так и индукции устойчивости растений к системным заболеваниям». Прикладная и экологическая микробиология . 71 (7): 3959–3965. Bibcode : 2005ApEnM..71.3959B. doi : 10.1128/AEM.71.7.3959-3965.2005. ISSN  0099-2240. PMC 1168994. PMID 16000810  .