Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
Гены Myb являются частью большого семейства генов факторов транскрипции , обнаруженных у животных и растений. У людей оно включает Myb протоонкоген подобный 1 и Myb-связанный белок B в дополнение к собственно MYB . [5] [6] Члены расширенного семейства SANT/Myb также включают домен SANT и другие похожие полностью спиральные гомеобокс -подобные домены.
Функция
Популярный
Семейство генов Myb названо в честь одноименного гена в вирусе миелобластоза птиц . Вирусный Myb (v-Myb, P01104 ) распознает последовательность 5'- Y AAC K G-3'. Он вызывает миелобластоз (миелоидный лейкоз) у кур. [7] По сравнению с нормальным животным клеточным Myb (c-myb), v-myb содержит делеции в C-концевом регуляторном домене, что приводит к аберрантной активации других онкогенов. [8]
Животные
Белок протоонкогена Myb является членом семейства факторов транскрипции MYB ( myelo blastosis ) . Белок содержит три домена: N -концевой ДНК-связывающий домен , центральный домен транскрипционной активации и C-концевой домен, участвующий в репрессии транскрипции . Он может играть роль в регуляции клеточного цикла. Как и вирусная версия, этот ген является онкогеном , и перестройки гена (часто включающие делецию в C-концевом домене) вызывают рак. [8]
Растения
Факторы MYB представляют собой семейство белков, включающее консервативный домен связывания ДНК MYB. Растения содержат подсемейство белков MYB, которое характеризуется доменом MYB типа R2R3. [9]
В кукурузе флобафены синтезируются в пути синтеза флавоноидов [10] из полимеризации флаван-4-олов [11] [12] , который кодирует R2R3 myb-подобный транскрипционный активатор [13] гена A1, кодирующего дигидрофлавонол-4-редуктазу (восстанавливающую дигидрофлавонолы до флаван-4-олов) [14] , в то время как другой ген (супрессор пигментации перикарпа 1 или SPP1) действует как супрессор . [15] Ген кукурузы P кодирует гомолог Myb, который распознает последовательность CCWACC, что резко контрастирует с YAACGG, связанным с белками Myb позвоночных. [16]
У сорго соответствующий ген желтого семени 1 (y1) [17] также кодирует белок домена Myb типа R2R3, который регулирует экспрессию генов халконсинтазы , халконизомеразы и дигидрофлавонолредуктазы, необходимых для биосинтеза 3-дезоксифлавоноидов . [18]
Ruby — это транскрипционный активатор MYB генов, которые производят антоциан в цитрусовых. В большинстве сортов цитрусовых Ruby нефункционален, но в кровавых апельсинах он повышает выработку антоциана, чтобы получить характерный красный цвет плода. [19]
Смотрите также
Ссылки
- ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000118513 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000019982 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Chen Y, Xu H, Liu J, Zhang C, Leutz A, Mo X (июль 2007 г.). «C-Myb функционирует как нисходящая цель сигнала выживания, опосредованного PDGF, в сосудистых гладкомышечных клетках». Biochem Biophys Res Commun . 360 (2): 433–6. doi :10.1016/j.bbrc.2007.06.078. PMID 17599807.
- ^ "Ген Энтреза: гомолог вирусного онкогена миелобластоза v-myb (птичий)".
- ^ Клемпнауэр KH, Саймондс G, Эван GI, Бишоп JM (июнь 1984). «Субклеточная локализация белков, кодируемых онкогенами вируса миелобластоза птиц и вируса лейкемии птиц E26 и геном курицы c-myb». Cell . 37 (2): 537–47. doi :10.1016/0092-8674(84)90384-2. PMID 6327074. S2CID 46196167.
- ^ ab George OL, Ness SA (октябрь 2014 г.). «Ситуационная осведомленность: регуляция фактора транскрипции myb в дифференциации, клеточном цикле и онкогенезе». Cancers . 6 (4): 2049–71. doi : 10.3390/cancers6042049 . PMC 4276956 . PMID 25279451.
- ^ Stracke R, Werber M, Weisshaar B (октябрь 2001 г.). «Семейство генов R2R3-MYB в Arabidopsis thaliana». Curr. Opin. Plant Biol . 4 (5): 447–56. Bibcode :2001COPB....4..447S. doi :10.1016/s1369-5266(00)00199-0. PMID 11597504.
- ^ Хими Э., Марес Д.Дж., Янагисава А., Нода К. (июль 2002 г.). «Влияние гена окраски зерна (R) на покой зерна и чувствительность эмбриона к абсцизовой кислоте (АБК) у пшеницы». J. Exp. Bot . 53 (374): 1569–74. doi : 10.1093/jxb/erf005 . PMID 12096095.
- ^ Winkel-Shirley B (июнь 2001 г.). «Биосинтез флавоноидов. Красочная модель для генетики, биохимии, клеточной биологии и биотехнологии». Plant Physiol . 126 (2): 485–93. doi :10.1104/pp.126.2.485. PMC 1540115. PMID 11402179 .
- ^ Chopra S, Cocciolone SM, Bushman S, Sangar V, McMullen MD, Peterson T (март 2003 г.). «Фактор нестабильности кукурузы для orange1 является доминирующим эпигенетическим модификатором специфического для ткани молчащего аллеля цвета перикарпия1». Genetics . 163 (3): 1135–46. doi :10.1093/genetics/163.3.1135. PMC 1462483 . PMID 12663550.
- ^ Структурный и транскрипционный анализ сложного кластера P1-wr в кукурузе. Вольфганг Геттель, Иоахим Мессинг. XVI конференция по геномам растений и животных. Архивировано 18 февраля 2012 г. на Wayback Machine
- ^ Dong X, Braun EL, Grotewold E (сентябрь 2001 г.). «Функциональная консервация вторичных метаболических ферментов растений, выявленная путем комплементации флавоноидных мутантов Arabidopsis с генами кукурузы» (PDF) . Plant Physiol . 127 (1): 46–57. doi :10.1104/pp.127.1.46. hdl :1811/48809. PMC 117961 . PMID 11553733.
- ^ Ли EA, Харпер V (2002). «Подавитель пигментации перикарпия 1 (SPP1), новый ген, участвующий в накоплении флобафена в перикарпиях кукурузы (Zea mays L.)». Maydica . 47 (1): 51–58. ИНИСТ 13772300
- ^ Grotewold E, Drummond BJ, Bowen B, Peterson T (1994). «Myb-гомологичный ген P контролирует пигментацию флобафена в цветочных органах кукурузы путем прямой активации подмножества генов биосинтеза флавоноидов». Cell . 76 (3): 543–554. doi :10.1016/0092-8674(94)90117-1. PMID 8313474. S2CID 42197232.
- ^ Boddu J, Svabek C, Ibraheem F, Jones AD, Chopra S (2005). «Характеристика делеционного аллеля гена сорго Myb yellow seedl, демонстрирующего потерю 3-дезоксифлавоноидов». Plant Science . 169 (3): 542–552. doi :10.1016/j.plantsci.2005.05.007. ИНИСТ 16983977
- ^ Boddu J, Jiang C, Sangar V, Olson T, Peterson T, Chopra S (январь 2006 г.). «Сравнительная структурная и функциональная характеристика дупликаций сорго и кукурузы, содержащих ортологичные регуляторы транскрипции myb биосинтеза 3-дезоксифлавоноидов». Plant Mol. Biol . 60 (2): 185–99. doi :10.1007/s11103-005-3568-1. PMID 16429259. S2CID 23841582.
- ^ Butelli E, Licciardello C, Zhang Y, Liu J, Mackay S, Bailey P, Reforgiato-Recupero G, Martin C (2012). «Ретротранспозоны контролируют специфичное для фруктов, зависящее от холода накопление антоцианов в кровавых апельсинах». Plant Cell . 24 (3): 1242–55. doi :10.1105/tpc.111.095232. PMC 3336134 . PMID 22427337.
Дальнейшее чтение
- Oh IH, Reddy EP (1999). «Семейство генов myb в росте клеток, дифференцировке и апоптозе». Oncogene . 18 (19): 3017–33. doi : 10.1038/sj.onc.1202839 . PMID 10378697.
- Nicolaides NC, Gualdi R, Casadevall C, Manzella L, Calabretta B (1991). "Положительная авторегуляция экспрессии c-myb через сайты связывания Myb в 5'-фланкирующей области гена c-myb человека". Mol. Cell. Biol . 11 (12): 6166–76. doi :10.1128/mcb.11.12.6166-6176.1991. PMC 361795. PMID 1944282 .
- Kalkbrenner F, Guehmann S, Moelling K (1990). «Транскрипционная активация генами c-myb и v-myb человека». Онкоген . 5 (5): 657–61. PMID 2189102.
- Westin EH, Gorse KM, Clarke MF (1990). «Альтернативный сплайсинг гена человека c-myb». Онкоген . 5 (8): 1117–24. PMID 2202948.
- Dasgupta P, Reddy EP (1990). «Идентификация альтернативно сплайсированных транскриптов для человеческого c-myb: молекулярное клонирование и анализ последовательностей экзона 9A человеческого c-myb». Онкоген . 4 (12): 1419–23. PMID 2687764.
- Janssen JW, Vernole P, de Boer PA, Oosterhuis JW, Collard JG (1986). «Сублокализация c-myb в 6q21----q23 путем гибридизации in situ и экспрессия c-myb в человеческой тератокарциноме с перестройками 6q». Cytogenet. Cell Genet . 41 (3): 129–35. doi :10.1159/000132217. PMID 3007038.
- Slamon DJ, Boone TC, Murdock DC, Keith DE, Press MF, Larson RA, Souza LM (1986). «Исследования гена c-myb человека и его продукта при острых лейкозах человека». Science . 233 (4761): 347–51. Bibcode :1986Sci...233..347S. doi :10.1126/science.3014652. PMID 3014652.
- Majello B, Kenyon LC, Dalla-Favera R (1987). "Протоонкоген человека c-myb: нуклеотидная последовательность кДНК и организация геномного локуса". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 83 (24): 9636–40. doi : 10.1073/pnas.83.24.9636 . PMC 387195 . PMID 3540945.
- Szczylik C, Skorski T, Ku DH, Nicolaides NC, Wen SC, Rudnicka L, Bonati A, Malaguarnera L, Calabretta B (1993). «Регуляция пролиферации и экспрессии цитокинов фибробластами костного мозга: роль c-myb». J. Exp. Med . 178 (3): 997–1005. doi :10.1084/jem.178.3.997. PMC 2191153. PMID 7688794 .
- Krieg J, Oelgeschläger M, Janknecht R, Lüscher B (1995). «Высокоаффинное связывание ДНК нативного полноразмерного c-Myb и дифференциальная протеолитическая чувствительность его N- и C-концевых доменов». Онкоген . 10 (11): 2221–8. PMID 7784067.
- Jacobs SM, Gorse KM, Westin EH (1994). «Идентификация второго промотора в человеческом протоонкогене c-myb». Онкоген . 9 (1): 227–35. PMID 8302584.
- Favier D, Gonda TJ (1994). «Обнаружение белков, которые связываются с мотивом лейциновой молнии c-Myb». Онкоген . 9 (1): 305–11. PMID 8302594.
- Glaser R, Lafuse WP, Bonneau RH, Atkinson C, Kiecolt-Glaser JK (1993). «Стресс-ассоциированная модуляция экспрессии протоонкогенов в лейкоцитах периферической крови человека». Behav. Neurosci . 107 (3): 525–9. doi :10.1037/0735-7044.107.3.525. PMID 8329139.
- Dash AB, Orrico FC, Ness SA (1996). «Мотив EVES опосредует как межмолекулярную, так и внутримолекулярную регуляцию c-Myb». Genes Dev . 10 (15): 1858–69. doi : 10.1101/gad.10.15.1858 . PMID 8756344.
- Vorbrueggen G, Lovrić J, Moelling K (1997). "Функциональный анализ фосфорилирования серина 532 человеческого c-Myb с помощью MAP-киназы". Biol. Chem . 377 (11): 721–30. doi :10.1515/bchm3.1996.377.11.721. PMID 8960373.
- Tavner FJ, Simpson R, Tashiro S, Favier D, Jenkins NA, Gilbert DJ, Copeland NG, Macmillan EM, Lutwyche J, Keough RA, Ishii S, Gonda TJ (1998). «Молекулярное клонирование показывает, что белок, связывающий Myb p160, является новым, преимущественно ядрышковым белком, который может играть роль в трансактивации Myb». Mol. Cell. Biol . 18 (2): 989–1002. doi :10.1128/MCB.18.2.989. PMC 108811. PMID 9447996 .
- Хедж СП, Кумар А, Куршнер К, Шапиро ЛХ (1998). "c-Maf взаимодействует с c-Myb, регулируя транскрипцию раннего миелоидного гена во время дифференциации". Mol. Cell. Biol . 18 (5): 2729–37. doi :10.1128/mcb.18.5.2729. PMC 110652. PMID 9566892 .
- Leverson JD, Koskinen PJ, Orrico FC, Rainio EM, Jalkanen KJ, Dash AB, Eisenman RN, Ness SA (1998). «Киназа Pim-1 и p100 взаимодействуют для повышения активности c-Myb». Mol. Cell . 2 (4): 417–25. doi : 10.1016/S1097-2765(00)80141-0 . PMID 9809063.
- Thompson MA, Rosenthal MA, Ellis SL, Friend AJ, Zorbas MI, Whitehead RH, Ramsay RG (1998). "Снижение экспрессии c-Myb связано с дифференцировкой клеток толстой кишки человека, апоптозом и снижением экспрессии Bcl-2". Cancer Res . 58 (22): 5168–75. PMID 9823328.
- Verbeek W, Gombart AF, Chumakov AM, Müller C, Friedman AD, Koeffler HP (1999). "C/EBPepsilon напрямую взаимодействует с доменом связывания ДНК c-myb и кооперативно активирует транскрипцию миелоидных промоторов". Blood . 93 (10): 3327–37. doi : 10.1182/blood.V93.10.3327 . PMID 10233885.
Внешние ссылки
В данной статье использован текст из Национальной медицинской библиотеки США , являющийся общественным достоянием .