stringtranslate.com

Apache cTAKES

Apache cTAKES: система клинического анализа текста и извлечения знаний — это система обработки естественного языка (NLP) с открытым исходным кодом , которая извлекает клиническую информацию из неструктурированного текста электронных медицинских карт . Она обрабатывает клинические заметки, определяя типы клинических именованных сущностей — лекарства, заболевания/расстройства, признаки/симптомы, анатомические участки и процедуры. Каждая именованная сущность имеет атрибуты для текстового диапазона, кода сопоставления онтологии, контекста (семейный анамнез, текущий, не связанный с пациентом) и отрицается/не отрицается. [1]

cTAKES был создан с использованием фреймворка UIMA Unstructured Information Management Architecture и набора инструментов обработки естественного языка OpenNLP . [2] [3]

Компоненты

Компоненты cTAKES специально обучены для клинической области и создают богатые лингвистические и семантические аннотации, которые могут использоваться в системах поддержки клинических решений и клинических исследованиях. [4]

Эти компоненты включают в себя:

История

Разработка cTAKES началась в клинике Mayo в 2006 году. Команда разработчиков под руководством доктора Герганы Савовой и доктора Кристофера Чута включала врачей, компьютерных ученых и инженеров-программистов. После развертывания cTAKES стал неотъемлемой частью инфраструктуры управления клиническими данными Mayo, обработав более 80 миллионов клинических заметок. [5]

Когда в начале 2010 года доктор Савова переехала в Бостонскую детскую больницу , основная команда разработчиков расширилась и включила членов оттуда. Дальнейшее внешнее сотрудничество включает: [5]

Такое сотрудничество расширило возможности cTAKES в других областях, таких как временное обоснование, ответы на клинические вопросы и разрешение кореферентности для клинической области. [5]

В 2010 году cTAKES был принят программой i2b2 и стал центральным компонентом SHARP Area 4. [5]

В 2013 году cTAKES выпустили свой первый релиз в качестве инкубаторского проекта Apache Software Foundation : cTAKES 3.0. [ необходима ссылка ]

В марте 2013 года cTAKES стал проектом верхнего уровня Apache Software Foundation (TLP). [5]

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ Денеке, Керстин (2015-08-31). "Инструменты и ресурсы для извлечения информации". Health Web Science: данные социальных сетей для здравоохранения . Springer. стр. 67. ISBN 978-3-319-20582-3– через Google Книги.
  2. ^ Халифа, Абдулрахман; Мейстр, Стефан (2015-12-01). «Адаптация существующих ресурсов обработки естественного языка для идентификации факторов риска сердечно-сосудистых заболеваний в клинических заметках». Журнал биомедицинской информатики . Труды 2014 i2b2/UTHealth Shared-Tasks и семинара по проблемам обработки естественного языка для клинических данных. 58 (Приложение): S128–S132. doi :10.1016/j.jbi.2015.08.002. PMC 4983192. PMID  26318122 . 
  3. ^ Худайри, Салли (25.04.2017). «Apache Software Foundation объявляет о выпуске Apache® cTAKES™ v4.0» (пресс-релиз). Форест-Хилл, Мэриленд: Apache Software Foundation. Globe Newswire . Получено 20.09.2017 .
  4. ^ Савова, Гергана К.; Масанц, Джеймс Дж.; Огрен, Филип В.; Чжэн, Цзяпин; Сон, Сонгхван; Киппер-Шулер, Карин К.; Шюте, Кристофер Г. (2010). «Система анализа и извлечения клинических текстов Mayo (cTAKES): архитектура, оценка компонентов и приложения». Журнал Американской ассоциации медицинской информатики . 17 (5): 507–513. doi :10.1136/jamia.2009.001560. ISSN  1067-5027. PMC 2995668. PMID 20819853  . 
  5. ^ abcde "История". Apache cTAKES™ - система извлечения клинических текстовых знаний . 2015-06-22 . Получено 2018-01-11 .

Внешние ссылки