Цитидиндезаминаза

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Цитидиндезаминаза — это фермент , который у человека кодируется геном CDA . [ ^{5] [6] [7]}

Этот ген кодирует фермент, участвующий в утилизации пиримидина . Кодируемый белок образует гомотетрамер, который катализирует необратимое гидролитическое дезаминирование цитидина и дезоксицитидина в уридин и дезоксиуридин соответственно. Это одна из нескольких дезаминаз, ответственных за поддержание клеточного пула пиримидина. Мутации в этом гене связаны с пониженной чувствительностью к аналогу нуклеозида цитозина цитозина арабинозиду, используемому при лечении некоторых детских лейкозов. ^[7] Большинство цитидиндезаминаз действуют на РНК , а те немногие, которые действуют на ДНК, требуют одноцепочечной ДНК . ^[8]

Родственная активационная (цитидиновая) деаминаза (AID) регулирует диверсификацию антител , особенно процесс соматической гипермутации .

Интерактивная карта маршрутов

Нажмите на гены, белки и метаболиты ниже, чтобы перейти к соответствующим статьям. ^{[§ 1]}

1. Интерактивную карту путей можно редактировать на WikiPathways: «FluoropyrimidineActivity_WP1601».

Ссылки

1. GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000158825 – Ensembl , май 2017 г.
2. GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000028755 – Ensembl , май 2017 г.
3. "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
4. "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
5. Кюн К, Бертлинг ВМ, Эммрих Ф (январь 1993). «Клонирование функциональной кДНК для человеческой цитидиндезаминазы (CDD) и ее использование в качестве маркера дифференциации моноцитов/макрофагов». Biochemical and Biophysical Research Communications . 190 (1): 1–7. doi :10.1006/bbrc.1993.1001. PMID  8422236.
6. Демонтис С., Терао М., Бривио М., Занотта С., Бруски М., Гараттини Э. (декабрь 1998 г.). «Выделение и характеристика гена, кодирующего цитидиндезаминазу человека». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) – Структура и экспрессия генов . 1443 (3): 323–33. дои : 10.1016/s0167-4781(98)00235-8. ПМИД  9878810.
7. "Ген Энтреза: CDA цитидиндезаминаза".
8. Komor AC, Kim YB, Packer MS, Zuris JA, Liu DR (май 2016 г.). «Программируемое редактирование целевой базы в геномной ДНК без расщепления двухцепочечной ДНК». Nature . 533 (7603): 420–4. Bibcode :2016Natur.533..420K. doi :10.1038/nature17946. PMC 4873371 . PMID  27096365. 

Дальнейшее чтение

• Wentworth DF, Wolfenden R (ноябрь 1975 г.). «О взаимодействии 3,4,5,6-тетрагидроуридина с цитидиндезаминазой печени человека». Биохимия . 14 (23): 5099–105. doi :10.1021/bi00694a012. PMID  53069.
• Laliberté J, Momparler RL (октябрь 1994 г.). «Человеческая цитидиндезаминаза: очистка фермента, клонирование и экспрессия его комплементарной ДНК». Cancer Research . 54 (20): 5401–7. PMID  7923172.
• Сакконе С., Бесати С., Андреоцци Л., Делла Валле Дж., Гараттини Э., Терао М. (август 1994 г.). «Отнесение гена цитидиндезаминазы человека (CDA) к полосе p35-p36.2 хромосомы 1». Геномика . 22 (3): 661–2. дои : 10.1006/geno.1994.1448. ПМИД  8001985.
• Gran C, Bøyum A, Johansen RF, Løvhaug D, Seeberg EC (июнь 1998 г.). «Ингибирование роста колониеобразующих клеток гранулоцитов-макрофагов человеческой цитидиндезаминазой требует каталитической функции белка». Blood . 91 (11): 4127–35. doi :10.1182/blood.V91.11.4127. PMID  9596658.
• Somasekaram A, Jarmuz A, How A, Scott J, Navaratnam N (октябрь 1999 г.). «Внутриклеточная локализация человеческой цитидиндезаминазы. Идентификация функционального сигнала ядерной локализации». Журнал биологической химии . 274 (40): 28405–12. doi : 10.1074/jbc.274.40.28405 . PMID  10497201.
• Wistow G, Bernstein SL, Wyatt MK, Behal A, Touchman JW, Bouffard G и др. (июнь 2002 г.). «Анализ экспрессируемых последовательностей хрусталика глаза взрослого человека для проекта NEIBank: более 2000 неизбыточных транскриптов, новых генов и вариантов сплайсинга». Molecular Vision . 8 : 171–84. PMID  12107413.
• Taysi S, Polat MF, Sari RA, Bakan E (май 2002 г.). «Активность аденозиндезаминазы и цитидиндезаминазы в сыворотке у пациентов с системной красной волчанкой». Клиническая химия и лабораторная медицина . 40 (5): 493–5. doi :10.1515/CCLM.2002.085. PMID  12113294. S2CID  32965037.
• Bransteitter R, Pham P, Scharff MD, Goodman MF (апрель 2003 г.). «Цитидиндезаминаза, индуцированная активацией, дезаминирует дезоксицитидин на одноцепочечной ДНК, но требует действия РНКазы». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 100 (7): 4102–7. Bibcode : 2003PNAS..100.4102B. doi : 10.1073 /pnas.0730835100 . PMC  153055. PMID  12651944.
• Сунь ZQ, Цзян Б, Чжао XS, Бао Л, Ву Т, Лу XJ и др. (июнь 2003 г.). «[Экспрессия мРНК цитидиндезаминазы в клетках костного мозга пациентов с острым лейкозом]». Чжунго Ши Янь Сюэ Е Сюэ За Чжи . 11 (3): 246–50. ПМИД  12844405.
• Винченцетти С., Костанци С., Кристалли Г., Мариани П., Квадрини Б., Каммертони Н., Вита А (2003). «Межсубъединичные взаимодействия в цитидиндезаминазе человека». Нуклеозиды, нуклеотиды и нуклеиновые кислоты . 22 (5–8): 1535–8. дои : 10.1081/NCN-120023028. PMID  14565460. S2CID  8626156.
• Costanzi S, Vincenzetti S, Vita A, Lambertucci C, Taffi S, Volpini R и др. (2003). «Человеческая цитидиндезаминаза: понимание каталитического механизма». Nucleosides, Nucleotides & Nucleic Acids . 22 (5–8): 1539–43. doi :10.1081/NCN-120023029. PMID  14565461. S2CID  6849333.
• Ge Y, Jensen TL, Stout ML, Flatley RM, Grohar PJ, Ravindranath Y и др. (январь 2004 г.). «Роль мутаций цитидиндезаминазы и GATA1 в повышенной чувствительности к цитозинарабинозиду миелобластов и линий лейкозных клеток при синдроме Дауна». Cancer Research . 64 (2): 728–35. doi : 10.1158/0008-5472.CAN-03-2456 . PMID  14744791.
• Винченцетти С., Де Санктис Г., Костанци С., Кристалли Г., Мариани П., Мей Г. и др. (декабрь 2003 г.). «Функциональные свойства взаимодействий субъединиц цитидиндезаминазы человека». Белковая инженерия . 16 (12): 1055–61. дои : 10.1093/протеин/gzg117 . ПМИД  14983087.
• Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, Shenmen CM, Grouse LH, Schuler G и др. (октябрь 2004 г.). «Состояние, качество и расширение проекта NIH по полноразмерной ДНК: коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Research . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC  528928 . PMID  15489334.
• Chung SJ, Fromme JC, Verdine GL (февраль 2005 г.). «Структура человеческой цитидиндезаминазы, связанной с мощным ингибитором». Журнал медицинской химии . 48 (3): 658–60. doi :10.1021/jm0496279. PMID  15689149.
• Винченцетти С., Мариани П.Л., Каммертони Н., Ползонетти В., Наталини П., Квадрини Б. и др. (декабрь 2004 г.). «Изоферментативные формы цитидиндезаминазы человека». Белковая инженерия, проектирование и отбор . 17 (12): 871–7. дои : 10.1093/протеин/гж101 . ПМИД  15713780.
• Costanzi S, Vincenzetti S, Cristalli G, Vita A (сентябрь 2006 г.). «Человеческая цитидиндезаминаза: трехмерная гомологическая модель тетрамерного металлофермента, выведенная из кристаллической структуры отдаленно родственного димерного гомолога». Журнал молекулярной графики и моделирования . 25 (1): 10–6. doi :10.1016/j.jmgm.2005.10.008. PMID  16303324.

Внешние ссылки

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P32320 (цитидиндезаминаза) на сайте PDBe-KB .