stringtranslate.com

эЭФ-1

eEF-1 — два эукариотических фактора элонгации . Он образует два комплекса: гомолог EF-Tu EF-1A и гомолог EF-Ts EF-1B , фактор гуанидного обмена первого. [1] Оба также встречаются у архей . [2]

Состав

Номенклатура субъединиц eEF-1 несколько изменилась примерно в 2001 году, поскольку было признано, что комплексы EF-1A и EF-1B в некоторой степени независимы друг от друга. [1] Компоненты, признанные и названные в настоящее время, включают: [3]

Точный способ прикрепления субъединицы eEF1B к eEF1A зависит от органа и вида. [3] eEF1A также связывает актин . [3]

Другие виды

Различные виды зеленых , красных водорослей , хромальвеолатов и грибов лишены гена EF-1α, но вместо этого обладают родственным геном, называемым EFL (фактор элонгации). Хотя его функция не была глубоко изучена, он, по-видимому, аналогичен EF-1α.

По состоянию на 2009 год известно, что только два организма имеют как EF-1α, так и EFL: гриб Basidiobolus и диатомовая водоросль Thalassiosira . Эволюционная история EFL неясна. Это могло возникнуть один или несколько раз с последующей потерей EFL или EF-1α. Согласно обзору 2009 года, присутствие в трех различных группах эукариот (грибы, хромальвеолаты и архепластиды ) является результатом двух или более событий горизонтального переноса генов . [5] В отчете 2013 года обнаружено еще 11 видов с обоими генами и предложена альтернативная гипотеза о том, что предок эукариот может иметь оба гена. Во всех известных организмах, где присутствуют оба гена, EF-1α имеет тенденцию к репрессии транскрипции. Если гипотеза подтвердится, ученые ожидают найти организм с подавленным EFL и полностью функционирующим EF-1α. [6]

Обзор 2014 года об эукариотах, обладающих EF-1α/EFL, считает, что оба объяснения сами по себе недостаточны для объяснения сложного распределения этих двух белков у эукариот. [7]

У эукариот в терминации трансляции участвует родственная ГТФаза, называемая eRF3 . С другой стороны, архейный EF-1α выполняет все функции, выполняемые этими субфункциональными вариантами. [8]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ аб Андерсен Г. Р., Нюборг Дж (2001). «Структурные исследования факторов элонгации эукариот». Симпозиумы Колд-Спринг-Харбор по количественной биологии . 66 : 425–37. дои : 10.1101/sqb.2001.66.425. ПМИД  12762045.
  2. ^ Витальяно Л., Масулло М., Сика Ф., Загари А., Боккини В. (октябрь 2001 г.). «Кристаллическая структура фактора элонгации 1альфа Sulfolobus solfataricus в комплексе с GDP обнаруживает новые особенности связывания и обмена нуклеотидов». Журнал ЭМБО . 20 (19): 5305–11. дои : 10.1093/emboj/20.19.5305 . ПМК 125647 . ПМИД  11574461. 
  3. ^ abcde Сасикумар А.Н., Перес В.Б., Кинзи Т.Г. (2011). «Множество ролей эукариотического комплекса фактора элонгации 1». Междисциплинарные обзоры Wiley: РНК . 3 (4): 543–55. дои : 10.1002/wrna.1118. ПМЦ 3374885 . ПМИД  22555874. 
  4. ^ Каминска М, Гавриленко С, Декоттиньи П, Жилле С, Ле Марешаль П, Негруцкий Б, Миранд М (март 2009 г.). «Вскрытие структурной организации комплекса аминоацил-тРНК-синтетазы». Журнал биологической химии . 284 (10): 6053–60. дои : 10.1074/jbc.M809636200 . ПМИД  19131329.
  5. ^ Эллен Кокуит; Хероен Вербрюгген; Фредерик Лелиарт; Фредерик В. Зехман; Коэн Саббе; Оливье Де Клерк (2009), «Приобретение и потеря генов фактора элонгации у зеленых водорослей», BMC Evol. Биол. , 9 (1): 39, Bibcode : 2009BMCEE...9...39C, doi : 10.1186/1471-2148-9-39 , PMC 2652445 , PMID  19216746 
  6. ^ Камикава Р., Браун М.В., Нисимура Ю., Сако Ю., Хейсс А.А., Юбуки Н. и др. (Июнь 2013). «Параллельное ремоделирование функции EF-1α: дивергентные гены EF-1α встречаются одновременно с генами EFL у различных отдаленно родственных эукариот». Эволюционная биология BMC . 13 (1): 131. Бибкод : 2013BMCEE..13..131K. дои : 10.1186/1471-2148-13-131 . ПМК 3699394 . ПМИД  23800323. 
  7. ^ Михайлов К.В., Янушковец Ю., Тихоненков Д.В., Мирзаева Г.С., Дякин А.Ю., Симдянов Т.Г. и др. (сентябрь 2014 г.). «Сложное распределение GTPases семейства элонгации EF1A и EFL в базальных альвеолятных линиях». Геномная биология и эволюция . 6 (9): 2361–7. дои : 10.1093/gbe/evu186 . ПМК 4217694 . ПМИД  25179686. 
  8. ^ Сайто К., Кобаяши К., Вада М., Кикуно И., Такусагава А., Мотидзуки М. и др. (ноябрь 2010 г.). «Всемогущая роль архейного фактора элонгации 1 альфа (EF1α в трансляционной элонгации и терминации, а также контроле качества синтеза белка». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 107 (45): 19242–7. Bibcode : 2010PNAS..10719242S doi : 10.1073 /  pnas.1009599107 . PMC 2984191 . 

Внешние ссылки